Desenvolvimento e execução automática de testes funcionais do SIGI.

Desenvolvimento de testes funcionais: técnicas de teste; casos de teste. Ferramenta para automação de testes: diretrizes para utilização do Vermont; problemas e soluções.

Cobertura de testes unitários no SIGI.

Técnicas de teste. Ferramenta para cobertura de testes unitários. Diretrizes para utilização da Discover. Cobertura dos testes unitários do SIGI.

Utilizando a Vermont para automação de testes funcionais no SIGI.

Técnicas de testes. Ferramenta para automação de testes. Diretrizes para utilização da Vermont. Configuração da Vermont. Procedimento para criação de um script. Procedimento para execução da Vermont via linha de comando.

Coordinated activation of candidate proto-oncogenes and cancer testes antigens via promoter demethylation in head and neck cancer and lung cancer.

BACKGROUND: Epigenetic alterations have been implicated in the pathogenesis of solid tumors, however, proto-oncogenes activated by promoter demethylation have been sporadically reported. We used an integrative method to analyze expression in primary head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) and pharmacologically demethylated cell lines to identify aberrantly demethylated and expressed candidate proto-oncogenes and cancer testes antigens in HNSCC. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: We noted coordinated promoter demethylation and simultaneous transcriptional upregulation of proto-oncogene candidates with promoter homology, and phylogenetic footprinting of these promoters demonstrated potential recognition sites for the transcription factor BORIS. Aberrant BORIS expression correlated with upregulation of candidate proto-oncogenes in multiple human malignancies including primary non-small cell lung cancers and HNSCC, induced coordinated proto-oncogene specific promoter demethylation and expression in non-tumorigenic cells, and transformed NIH3T3 cells. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Coordinated, epigenetic unmasking of multiple genes with growth promoting activity occurs in aerodigestive cancers, and BORIS is implicated in the coordinated promoter demethylation and reactivation of epigenetically silenced genes in human cancers.

Differences In Metabolic Profile In the Testes of Streptozotocin Induced Diabetes Mellitus Mice As Detected By 1H NMR

Contrary to the traditional view, recent studies suggest that diabetes mellitus has an adverse influence on male reproductive function. Our aim was to determine the affect of diabetes on the testicular environment by identifying and then assessing perturbations in small molecule metabolites. Testes were obtained from control and streptozotocin induced diabetic C57BL/6 mice, two, four and eight weeks post treatment. Diabetic status was confirmed by HbA1c, non fasting blood glucose, physiological condition and body weight. Protein free, low molecular weight, water soluble extracts were assessed using 1H NMR spectroscopy. Principal Component Analysis of the derived profiles was used to classify any variations and specific metabolites were identified based on their spectral pattern. Characteristic metabolite profiles were identified for control and diabetic animals with the most distinctive being from mice with the greatest physical deterioration and loss of bodyweight. Eight streptozotocin treated animals did not develop diabetes and displayed profiles similar to controls. Diabetic mice had decreases in creatine, choline and carnitine and increases in lactate, alanine and myo-inositol. Betaine levels were found to be increased in the majority of diabetic mice but decreased in two animals with severe loss of body weight and physical condition. The association between perturbations in a number of small molecule metabolites known to be influential in sperm function, with diabetic status and physiological condition, adds further impetus to the proposal that diabetes influences important spermatogenic pathways and mechanisms in a subtle and previously unrecognised manner.

Prediction of Scattered Dose to the Testes in Abdominopelvic Radiotherapy.

Radical abdominal radiotherapy in men runs the risk of impairing their fertility owing to scattered dose to the testes, outside of the treated volume. In patients for whom this is a concern it is important to be able to predict the dose to the testes before treatment in order to determine whether semen cryopreservation should be undertaken and testicular shielding performed during treatment. Measurements have been made on an anthropomorphic phantom to determine the magnitude of these doses for a four-field treatment consisting of an anterior-posterior parallel pair and a lateral parallel pair. A dataset is presented, which, together with a correction for patients size, allows an estimate of testicular dose to be made given only the photon energy, interfield distances and the distance from the testes to the nearest beam edge. Thermoluminescent dosimetry has been carried out in 17 patients to validate the use of the data tables. The results indicate that testicular doses may be estimated with a standard deviation corresponding to 1%-2% of the tumour dose, which is sufficient for the purpose of determining whether fertility is threatened by a planned treatment.

Metabolic profile changes in the testes of mice with streptozotocin-induced type 1 diabetes mellitus

Contrary to the traditional view, recent studies suggest that diabetes mellitus has an adverse influence on male reproductive function. Our aim was to determine the effect of diabetes on the testicular environment by identifying and then assessing perturbations in small molecule metabolites. Testes were obtained from control and streptozotocin-induced diabetic C57BL/6 mice, 2, 4 and 8 weeks post-treatment. Diabetic status was confirmed by glycated haemoglobin, non-fasting blood glucose, physiological condition and body weight. A novel extraction procedure was utilized to obtain protein free, low-molecular weight, water soluble extracts which were then assessed using H-1 nuclear magnetic resonance spectroscopy. Principal component analysis of the derived profiles was used to classify any variations, and specific metabolites were identified based on their spectral pattern. Characteristic metabolite profiles were identified for control and type 1 diabetic animals with the most distinctive being from mice with the largest physical deterioration and loss of body weight. Eight streptozotocin-treated animals did not develop diabetes and displayed profiles similar to controls. Diabetic mice had decreases in creatine, choline and carnitine and increases in lactate, alanine and myo-inositol. Betaine levels were found to be increased in the majority of diabetic mice but decreased in a few animals with severe loss of body weight and physical condition. The association between perturbations in a number of small molecule metabolites known to be influential in sperm function, with diabetic status and physiological condition, adds further impetus to the proposal that diabetes influences important spermatogenic pathways and mechanisms in a subtle and previously unrecognized manner.

A saúde mental, função executiva e capacidade para o trabalho: a influência da sintomatologia psiquiátrica na capacidade para o trabalho: um estudo em trabalhadores portugueses

O presente trabalho tem como principal objetivo, estudar a relação entre a presença de vulnerabilidade para a manifestação de sintomatologia psiquiátrica e a sua relação com a capacidade para o trabalho e, como objetivo secundário, estudar o impacto da função cognitiva executiva na capacidade para o trabalho. Os problemas de saúde mental são comuns na população em geral, sendo estimado que uma em cada cinco pessoas pode apresentar sintomatologia de algum distúrbio mental ao longo de um ano. Por seu lado, a doença mental apresenta um impacto bastante significativo ao nível do absentismo laboral, tendo como consequência um custo bastante significativo ao nível do desempenho laboral (produtividade), bem como ao nível da saúde física e mental (Wu, Chi, Chen, Wang & Jin, 2009). O excessivo Stress Ocupacional experienciado pelos trabalhadores tem sido fortemente associado com o aparecimento de doenças e prejuízo da saúde mental interferindo na sua capacidade para o trabalho, produtividade, bem estar e qualidade de vida. A uma amostra de 125 trabalhadores foram aplicadas as escalas WAI (escala de índice de capacidade para o trabalho), BSI (Inventário de sintomas psicopatológicos) e o ESI (Inventário de Externalização versão reduzida) e, numa subamostra de 30 trabalhadores, foram aplicados os testes neuropsicológicos pela seguinte ordem: CAT (Halstead Category Test), WCST (Wisconci Card Sort), e a TH (Tower of Hanoi). Foram confirmadas todas as hipóteses do estudo o que sugere que existe, de facto, uma relação entre a presença de vulnerabilidade para manifestação de sintomatologia psiquiátrica com a capacidade para o trabalho e, também, que as funções executivas manifestam grande impacto na capacidade para o trabalho. Assim, a implementação de um programa de promoção para o trabalho e prevenção de risco nos trabalhadores torna-se crucial para o aumento da produtividade dos trabalhadores e, consequentemente, da própria organização.

As NEE no ensino básico : caso específico da dislexia

O objetivo do estudo em epígrafe foi o de analisar se a dislexia em crianças do ensino básico é identificada e se a intervenção é atempada. A tese centra-se nas seguintes hipóteses: 1) Nem todos os casos de dislexia são identificados no ensino básico público de Portugal continental; 2) O número relativo de crianças identificadas com dislexia não difere entre as zonas geográficas de Portugal continental; 3) A maior parte das crianças identificadas com dislexia, que frequentam o ensino básico em Portugal continental, estão abrangidas pela educação especial. Os instrumentos de recolha de dados utilizados foram questionários eletrónicos e entrevistas, que possibilitaram uma análise quantitativa e qualitativa dos dados. Esta análise foi realizada mediante a aplicação de testes paramétricos e não paramétricos, tendo em conta as características da distribuição dos dados. Para o efeito, utilizámos o programa estatístico SPSS, versão 20. Para a realização da análise de conteúdo das entrevistas, empregámos o programa WebQDA. A amostra foi constituída por 535 professores coordenadores de educação especial e por 256 diretores de agrupamentos de escolas, pertencentes às cinco zonas NUTS II de Portugal continental. As entrevistas foram realizadas em três agrupamentos de escolas, três hospitais e um centro de saúde, referentes a uma parte da região Centro, tendo sido feitas a cinquenta profissionais da área da educação e da saúde, a saber: oito médicos de família, seis médicos pediatras, dezoito professores de educação especial, onze psicólogos e sete terapeutas da fala. Os resultados indicam que as crianças com dislexia não estão todas identificadas, existindo dificuldades na realização do diagnóstico e na intervenção, essencialmente por falta de formação dos profissionais neste domínio e por dificuldades na articulação entre os diversos grupos de profissionais da educação e da saúde. Atinente ao número de crianças identificadas com dislexia, pela aplicação do teste Kruskal Wallis, os dados sugerem que existem diferenças, estatisticamente significativas, entre as cinco zonas NUTS II do continente português, demonstrando que nas zonas Centro e Norte há menos crianças identificadas com dislexia do que nas restantes.

Testes com novos fármacos no tratamento do parasita de peixes Amyloodinium ocellatum

O Amyloodinium ocellatum é um parasita dinoflagelado que aparece em aquaculturas por todo o mundo, infectando as brânquias e o tegumento dos peixes. Esta parasita é particularmente relevante na aquacultura mediterrânica onde os surtos causam perdas consideráveis. Apesar de já terem sido experimentados vários tratamentos, nenhum deles se revelou efectivo na erradicação do parasita e ainda alguns dos químicos utilizados podem ter importantes efeitos nocivos sobre o ambiente. Deste modo, o objectivo deste estudo foi testar novos fármacos para impedir o desenvolvimento e/ou eliminar o parasita em peixes já infectados. Os fármacos utilizados neste estudo foram endoperóxidos, uma recente classe de antimaláricos. Na primeira parte deste estudo realizaram-se ensaios in vitro onde se testaram os efeitos de diferentes concentrações (0,1mM; 1 mM; 2mM e 2,5mM) dos fármacos NAD17, NAD19, LCD93 e LCD67A sobre a divisão dos tomontes. Às 24 e 48 horas de exposição a 0,1mM NAD19 e 1mM LCD93, os tomontes observados não tinham entrado em divisão. Na segunda parte realizou-se um ensaio in vivo no qual os fármacos foram administrados a juvenis de dourada (Sparus aurata) a uma concentração de 10μmol/kg através de tratamento oral. No ensaio in vivo avaliou-se o possível efeito profiláctico dos fármacos na infecção através da análise da abundância e prevalência do parasita, da eficácia dos fármacos e dos efeitos do parasita e do tratamento na fisiologia e no eixo do stress dos animais infectados através de análises enzimáticas e de parâmetros bioquímicos do sangue. As medições realizadas ao plasma sanguíneo e às brânquias de douradas com diferentes níveis de infecção de A. ocellatum revelaram que não existe diferença significativa entre os controlos e os endoperóxidos para a dose testada. Será necessário realizar mais ensaios para obter conclusões sobre o efeito dos endoperóxidos no controlo do parasita de peixes A. ocellatum.

Testes em batch para selecionar fontes de carbono de baixo custo adequadas ao crescimento e atividade de bactérias sulfato-redutoras

Dissertação de mestrado, Engenharia Biológica, Faculdade de Ciências e Tecnologias, Universidade do Algarve, 2015

Atividades de resolução de problemas no desenvolvimento de competências : um estudo com alunos do 8.º ano na temática dos ecossistemas

Relatório da Prática de Ensino Supervisionada, Ensino da Biologia e Geologia no 3.º Ciclo do Ensino Básico e no Secundário, Universidade de Lisboa, 2013

Colonoscopia virtual e DNA fecal : estudo de viabilidade como testes de rastreio do cancro colorretal

Tese de doutoramento, Cirurgia Geral (Medicina), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2014

Ensino de bases de dados : testes, deteção de erros e correções

Relatório da prática de ensino supervisionada, Mestrado em Ensino de Informática, Universidade de Lisboa, 2014