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Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal.

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Le virus de lâimmunodéficience humaine de type 1 (VIH-1) est responsable du syndrome de lâimmunodéficience acquise (SIDA). Il faut identifier de nouvelles cibles pour le développement dâagents anti-VIH-1, car ce virus développe une résistance aux agents présentement utilisés. Notre but est dâapprofondir la caractérisation de lâétape du changement de cadre de lecture ribosomique en -1 (déphasage -1) nécessaire à la production du précurseur des enzymes du VIH-1. Ce déphasage est programmé et effectué par une minorité de ribosomes lorsquâils traduisent la séquence dite glissante à un endroit spécifique de lâARN messager (ARNm) pleine-longueur du VIH-1. Lâefficacité de déphasage est contrôlée par le signal stimulateur de déphasage (SSF), une tige-boucle irrégulière située en aval de la séquence glissante. La structure du SSF est déroulée lors du passage dâun ribosome, mais elle peut se reformer ensuite. Nous avons montré que des variations de lâinitiation de la traduction affectent lâefficacité de déphasage. Nous avons utilisé, dans des cellules Jurkat-T et HEK 293T, un rapporteur bicistronique où les gènes codant pour les luciférases de la Renilla (Rluc) et de la luciole (Fluc) sont séparés par la région de déphasage du VIH-1. La Rluc est produite par tous les ribosomes traduisant lâARNm rapporteur alors que la Fluc est produite uniquement par les ribosomes effectuant un déphasage. Lâinitiation de ce rapporteur est coiffe-dépendante, comme pour la majorité des ARNm cellulaires. Nous avons examiné lâeffet de trois inhibiteurs de lâinitiation et montré que leur présence augmente lâefficacité de déphasage. Nous avons ensuite étudié lâeffet de la tige-boucle TAR, qui est présente à lâextrémité 5â de tous les ARNm du VIH-1. TAR empêche la liaison de la petite sous-unité du ribosome (40S) à lâARNm et module aussi lâactivité de la protéine kinase dépendante de lâARN double-brin (PKR). Lâactivation de PKR inhibe lâinitiation en phosphorylant le facteur dâinitiation eucaryote 2 (eIF2) alors que lâinhibition de PKR a lâeffet inverse. Nous avons étudié lâeffet de TAR sur la traduction et le déphasage via son effet sur PKR en utilisant TAR en trans ou en cis, mais à une certaine distance de lâextrémité 5â afin dâéviter lâinterférence avec la liaison de la 40S. Nous avons observé quâune faible concentration de TAR, qui active PKR, augmente lâefficacité de déphasage alors quâune concentration élevée de TAR, qui inhibe PKR, diminue cette efficacité. Nous avons proposé un modèle où des variations de lâinitiation affectent lâefficacité de déphasage en modifiant la distance entre les ribosomes parcourant lâARNm et, donc, la probabilité quâils rencontrent un SSF structuré. Par la suite, nous avons déterminé lâeffet de la région 5â non traduite (UTR) de lâARNm pleine-longueur du VIH-1 sur lâefficacité de déphasage. Cette 5âUTR contient plusieurs régions structurées, dont TAR à lâextrémité 5â, qui peut interférer avec lâinitiation. Cet ARNm a une coiffe permettant une initiation coiffe-dépendante ainsi quâun site dâentrée interne des ribosomes (IRES), permettant une initiation IRES-dépendante. Nous avons introduit cette 5âUTR, complète ou en partie, comme 5âUTR de notre ARNm rapporteur bicistronique. Nos résultats démontrent que cette 5âUTR complète inhibe lâinitiation coiffe dépendante et augmente lâefficacité de déphasage et que ces effets sont dus à la présence de TAR suivie de la tige-boucle Poly(A). Nous avons aussi construit un rapporteur tricistronique où les ribosomes exprimant les luciférases utilisent obligatoirement lâIRES. Nous avons observé que cette initiation par lâIRES est faible et que lâefficacité de déphasage correspondante est également faible. Nous avons formulé une hypothèse pour expliquer cette situation. Nous avons également observé que lorsque les deux modes dâinitiation sont disponibles, lâinitiation coiffe dépendante est prédominante. Finalement, nous avons étudié lâeffet de la protéine virale Tat sur lâinitiation de la traduction et sur lâefficacité de déphasage. Nous avons montré quâelle augmente lâinitiation de la traduction et que son effet est plus prononcé lorsque TAR est située à lâextrémité 5â des ARNm. Nous proposons un modèle expliquant les effets de Tat sur lâinitiation de la traduction par lâinhibition de PKR ainsi que par des changements de lâexpression de protéines cellulaires déroulant TAR. Ces résultats permettent de mieux comprendre les mécanismes régissant le déphasage du VIH-1, ce qui est essentiel pour le développement dâagents anti-déphasage.

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Pour la plupart des gens, la lecture est une activité automatique, inhérente à leur vie quotidienne et ne demandant que peu dâeffort. Chez les individus souffrant dâépilepsie réflexe à la lecture, le simple fait de lire déclenche des crises épileptiques et les personnes doivent alors renoncer à la lecture. Les facteurs responsables du déclenchement de lâactivité épileptique dans lâépilepsie réflexe à la lecture demeurent encore mal définis. Certains auteurs suggèrent que le nombre ainsi que la localisation des pointes épileptiques seraient en lien avec la voie de lecture impliquée. Des études en imagerie cérébrale, menées auprès de populations sans trouble neurologique, ont dévoilé que la lecture active un réseau étendu incluant les cortex frontaux, temporo-pariétaux et occipito-temporaux bilatéralement avec des différences dans les patrons dâactivation pour les voies de lecture lexicale et phonologique. La majorité des études ont eu recours à des tâches de lecture silencieuse qui ne permettent pas d'évaluer la performance des participants. Dans la première étude de cette thèse, qui porte sur une étude de cas d'un patient avec épilepsie réflexe à la lecture, nous avons déterminé les tâches langagières et les caractéristiques des stimuli qui influencent l'activité épileptique. Les résultats ont confirmé que la lecture était la principale tâche responsable du déclenchement de lâactivité épileptique chez ce patient. En particulier, la fréquence des pointes épileptiques était significativement plus élevée lorsque le patient avait recours au processus de conversion grapho-phonémique. Les enregistrements électroencéphalographiques (EEG) ont révélé que les pointes épileptiques étaient localisées dans le gyrus précentral gauche, indépendamment de la voie de lecture. La seconde étude avait comme objectif de valider un protocole de lecture à voix haute ayant recours à la spectroscopie près du spectre de lâinfrarouge (SPIR) pour investiguer les circuits neuronaux qui sous-tendent la lecture chez les normo-lecteurs. Douze participants neurologiquement sains ont lu à voix haute des mots irréguliers et des non-mots lors dâenregistrements en SPIR. Les résultats ont montré que la lecture des deux types de stimuli impliquait des régions cérébrales bilatérales communes incluant le gyrus frontal inférieur, le gyrus prémoteur et moteur, le cortex somatosensoriel associatif, le gyrus temporal moyen et supérieur, le gyrus supramarginal, le gyrus angulaire et le cortex visuel. Les concentrations totales dâhémoglobine (HbT) dans les gyri frontaux inférieurs bilatéraux étaient plus élevées dans la lecture des non-mots que dans celle des mots irréguliers. Ce résultat suggère que le gyrus frontal inférieur joue un rôle dans la conversion grapho-phonémique, qui caractérise la voie de lecture phonologique. Cette étude a confirmé le potentiel de la SPIR pour lâinvestigation des corrélats neuronaux des deux voies de lecture. Une des retombées importantes de cette thèse consiste en lâutilisation du protocole de lecture en SPIR pour investiguer les troubles de la lecture. Ces investigations pourraient aider à mieux établir les liens entre le fonctionnement cérébral et la lecture dans les dyslexies développementales et acquises.

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Le présent mémoire expose les effets de lâenseignement réciproque sur la compréhension en lecture en français langue seconde dâélèves allophones immigrants nouvellement arrivés en situation de grand retard scolaire, scolarisés dans des classes dâaccueil au secondaire. Deux groupes expérimentaux et un groupe contrôle ont pris part à la recherche. Deux modèles dâintervention en enseignement réciproque ont été proposés aux groupes expérimentaux, soit une intervention traditionnelle ou une intervention qui favorise lâouverture aux langues maternelles. Un questionnaire administré en grand groupe ainsi que des entretiens individuels menés auprès de 11 élèves sous forme dâétudes de cas ont permis de mesurer les effets des interventions et de présenter des portraits de lecteurs. Les résultats au questionnaire valident que les interventions ont eu des effets significatifs sur la compréhension en lecture des élèves des groupes expérimentaux comparativement aux élèves du groupe contrôle. De plus, les 11 études de cas vont dans le même sens et révèlent que les élèves des groupes expérimentaux, au post-test, se sont améliorés dans la mise en place des stratégies cognitives et métacognitives. Finalement, lorsque les deux groupes expérimentaux sont comparés entre eux, les deux présentent des gains significatifs sur le plan de la compréhension en lecture. Cependant, le groupe ayant participé à des interventions avec une ouverture aux langues maternelles présente des changements de perceptions plus positifs et explicites à lâégard de la relation, en lecture, entre les langues.

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Réalisé en cotutelle internationale avec l'Université de Toulouse II-Le Mirail

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La complexité de la tâche quâest la lecture du français en interaction avec les caractéristiques de la personne qui a un retard de deux ans en lecture, la population cible de cette recherche, place cette dernière en situation dâéchec. Tous les processus impliqués dans lâacte de lire en interaction avec ces caractéristiques induisent des échecs et des retards dâapprentissage de la lecture. Lâenseignant, qui souhaite utiliser un manuel scolaire tout en intégrant un élève de 3e année ne sachant toujours pas lire, a deux choix : lui offrir un manuel de 1re année, un manuel de 3e année ou adapter lui-même son matériel. Si lâenseignant lui remet un manuel de 1re année, lâélève vit des réussites, mais les thèmes sont infantilisants. Si lâenseignant remet un manuel de 3e année à ce même élève, les thèmes ne sont pas infantilisants, mais le niveau en lecture place ce dernier systématiquement en situation dâéchec. Si lâenseignant adapte lui-même le matériel, lâentreprise est grande en charge de travail pour ce dernier. En réponse à ce dilemme, le Groupe DÃFI Accessibilité (GDA) a conçu des manuels scolaires adaptés. Ils sont, à première vue, identiques à la version originale Signet (3e année), mêmes thèmes, mêmes titres, mêmes numéros de pages, mêmes illustrations et mêmes réponses aux deux premières questions de chaque page, mais les textes sont simplifiés afin de permettre la lecture à lâélève de 3e année qui a deux ans de retard dans cette matière. En accord avec une stratégie de design inclusif, la simplification des manuels par le GDA a été réalisée en fonction des caractéristiques dâun groupe de référence reconnu pour avoir de grandes difficultés dâapprentissage de la lecture, soit des élèves qui ont des incapacités intellectuelles (Langevin, Rocque, Ngongang et Chaghoumi, 2012). Lâobjet de cette thèse est le calcul de la productivité et de lâefficience de ces manuels scolaires adaptés auprès dâélèves qui ont deux années de retard en lecture, la population cible. La méthodologie utilisée pour cette recherche est lâanalyse de la valeur pédagogique, une méthode systématique de développement et dâévaluation de produits, procédés ou services, adaptée de lâingénierie. Cette recherche a pour objet la troisième et dernière phase de lâanalyse de la valeur pédagogique, soit lâévaluation des manuels scolaires adaptés. En analyse de la valeur pédagogique, comme pour cette recherche, la mise à lâessai a deux objectifs : comparer le prototype créé au cahier des charges fonctionnel regroupant toutes les fonctions que devrait remplir le produit pour répondre aux besoins de ses utilisateurs potentiels et calculer la productivité/efficience. Puisquâil sâagit dâune première mise à lâessai, un troisième objectif est ajouté, soit la proposition de pistes dâamélioration au prototype de manuels scolaires adaptés. La mise à lâessai sâest échelonnée sur six mois. Lâéchantillon regroupe quatre enseignantes de 3e année, deux en classes spéciales et deux en classes régulières. Ces dernières enseignent à 32 élèves utilisateurs des manuels scolaires adaptés : six sont dyslexiques, quatre ont une connaissance insuffisante de la langue française, un a un trouble envahissant du développement avec incapacités intellectuelles et 21 ont des incapacités intellectuelles légères. Les résultats sont présentés sous la forme de trois articles. Les quatre enseignantes ont confirmé la réponse des manuels scolaires adaptés au cahier des charges fonctionnel. De plus, la phase de conception a été jugée efficiente et la phase dâutilisation productive. Il nây a pas de modification à faire aux manuels scolaires adaptés. Par contre, le guide dâutilisateur doit être modifié, puisque lâoutil nâa pas été utilisé tel quâil était prévu par lâéquipe de conception.

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De nos jours, il ne suffit pas de décoder pour être considéré comme alphabétisé, il faut aussi être capable de comprendre différents types de textes et d'utiliser avec efficience les informations qu'ils présentent (MELS, 2006). Le redoublement et le retard scolaire au primaire étant le plus souvent attribuables aux difficultés en lecture et en écriture et ces faiblesses se répercutant sur la réussite des élèves dans toutes les matières (Stetson et Williams, 1992), l'importance de présenter aux élèves des situations d'apprentissage complexes qui les soutiendront dans leur apprentissage par la lecture est sans équivoque. Surtout que Horton et Lovitt (1994) mentionnent que les échecs scolaires seraient étroitement liés aux difficultés que ces élèves éprouvent lorsqu'ils apprennent en lisant. Cette étude a été réalisée à partir des données collectées dans la recherche menée en 2003-2004 par Chouinard, Bowen, Cartier, Desbiens, Laurier, Plante (2005) intitulée: «L'effet de différentes approches évaluatives sur l'engagement et la persévérance scolaire dans le contexte du passage du primaire au secondaire» (Chouinard et coll., 2005). Lâobjectif de la présente étude était dâexplorer la relation entre lâévaluation à lâaide dâexamens d'enseignants de la fin du primaire et lâapprentissage par la lecture d'élèves en difficulté d'apprentissage. Pour ce faire, deux sous-objectifs ont été retenus : (1) Comparer la relation entre les deux types dâélèves (élèves ordinaires et élèves en difficulté dâapprentissage) et le processus dâapprentissage par la lecture et (2) Comparer la relation entre les niveaux dâidentification dâévaluation à lâaide dâexamens des enseignants et le processus dâapprentissage par la lecture. Les trois principaux concepts de la question de recherche sont la difficulté d'apprentissage, l'apprentissage par la lecture et les pratiques évaluatives, dont lâévaluation à lâaide dâexamens. Une analyse des caractéristiques des 22 recherches répertoriées a permis constater que très peu de recherche traitent de la relation entre les pratiques évaluatives et le processus d'apprentissage des élèves du primaire et encore moins impliquent des élèves en difficulté d'apprentissage. ii Afin de répondre à l'objectif de la présente étude, une recherche de type exploratoire dans une approche quantitative a été retenue. Des analyses descriptives (moyennes et écart-type), suivie par une analyse multivariée de la variance (MANOVA) à deux niveaux (2x2) ont été effectuées. Ensuite, des analyses univariées ont été conduites sur les variables qui présentaient des relations significatives afin de mieux cibler ces relations. Cent six enseignants et leurs 1864 élèves ont accepté de répondre à deux questionnaires auto-déclarés : Le questionnaire sur les pratiques évaluatives (Chouinard et coll., 2005) a été utilisé auprès des enseignants. Le questionnaire sur l'apprentissage par la lecture: Lire pour apprendre de Cartier et Butler (version 2004) a été utilisé auprès des élèves. Les résultats en lien avec les objectifs de cette étude indiquent un effet d'interaction significatif entre lâidentification des enseignants à lâévaluation à lâaide dâexamens (forte ou faible) et les types d'élèves (élèves en difficulté dâapprentissage et élèves ordinaires). Les élèves en difficulté dâapprentissage interprètent davantage les exigences de lâactivité que les élèves ordinaires lorsquâils sont dans ce contexte. On remarque aussi que les élèves en difficulté dâapprentissage rapportent recourir davantage aux stratégies dâencodage et de rappel que les élèves ordinaires et ce, peu importe lâidentification des enseignants à lâévaluation à lâaide dâexamens. Les résultats en lien avec le premier sous-objectif ont montré une relation significative entre les types dâélèves (élèves en difficulté dâapprentissage et élèves ordinaires) et le processus dâapprentissage par la lecture. Cette relation significative se situe sur lâengagement périphérique et les stratégies cognitives. Aussi, les résultats en lien avec le deuxième sous-objectif ont révélé une relation significative entre lâévaluation à lâaide dâexamens et le processus dâapprentissage par la lecture.