Inferencia bayesiana sobre los parámetros de dispersión genéticos y ambientales en modelos animales con efectos maternos

Los modelos 'modelos animales con efectos maternos' (MAM)son modelos lineales mixtos que se utilizan para ajustar registros de caracteres bajo la influencia de efectos maternos. Uno de los desafíos más importantes en el marco de los MAM es la estimación de los parámetros de dispersión o 'componentes de (co)varianza' (CVC). En esta tesis se introducen desde una perspectiva bayesiana contribuciones teóricas y metodológicas con relación a la estimación de CVC para MAM sujetos a estructuras de covarianza novedosas. En primer lugar, se describe una implementación del análisis bayesiano jerárquico vía el algoritmo del muestreo de Gibbs. Luego, se considera una especificación conjugada diferente para la distribución a priori de la matriz de covarianza genética, basada en la distribución Wishart invertida generalizada, y se presenta una estrategia para determinar los correspondientes hiperparámetros. Esta estrategia fue comparada contra otras especificaciones a priori mediante un estudio de simulación estocástica, y produjo estimaciones precisas de los parámetros genéticos, con menores errores estándares y mejor tasa de convergencia. En segundo lugar, se presenta una formulación alternativa del MAM que incluye un parámetro de correlación ambiental entre pares de observaciones madre-progenie, y se desarrolla un procedimiento de estimación basado en un algoritmo de muestreo por grilla. El procedimiento fue programado y ejecutado exitosamente, y se obtuvo la primera estimación del parámetro de correlación con datos de campo para peso al destete en bovinos de carne. Por último, se considera el problema de la estimación de CVC en una población multirracial, donde en general es necesario especificar una estructura de covarianza heterogénea para los valores de cría. En particular, se demuestra que el modelo basado en la descomposición de la matriz de covarianza genética es equivalente al que deriva de la teoría genética cuantitativa. Además, se extiende el modelo para incluir efectos maternos y se describe la implementación de un análisis bayesiano jerárquico con el objetivo de estimar los CVC. El procedimiento fue implementado con éxito en datos experimentales de peso al destete y se obtuvieron por primera vez estimaciones para el conjunto completo de CVC.

El diseño del laboratorio de física como herramienta para la resignificación de conceptos matemáticos

La presente ponencia resume el inicio de la construcción de un laboratorio de física y matemáticas en el programa de la Licenciatura en Matemáticas y Tecnologías de la Información, de la Universidad La Gran Colombia. Se presenta la experiencia en el diseño de la primera actividad y de los constructos teóricos y prácticos que se tuvieron en cuenta. Esta experiencia de aula está avalada dentro de la conformación de un semillero de investigación de la facultad, y muestra cómo a partir de un sistema masaresorte se pueden construir algunos conceptos fundamentales como el período de funciones, el comportamiento de las mismas y destacar la importancia del modelado de datos para su respectivo análisis y obtener así una aproximación por medio de la matemática.

Un laboratorio tecnológico como sistema didáctico para el aula de matemáticas

Presentamos una propuesta didáctica para utilizar la calculadora graficadora de una manera inteligente en el aula de matemáticas. Se propone en forma de prácticas de laboratorio a fin de favorecer la idea de un espacio para hacer matemáticas.

De la investigación al aula: unas prácticas de laboratorio utilizando calculadora

Este trabajo presenta el diseño de dos secuencias didácticas en forma de prácticas de laboratorio fundamentadas en resultados de investigaciones en matemática educativa de corte socioepistemológico. Se busca favorecer el uso inteligente de la tecnología (calculadoras graficadoras) en el aula de matemáticas así como un acercamiento entre el profesor y alumno de matemáticas para con la investigación en matemática educativa.

Laboratorio virtual de matemáticas (ALME2005)

Concebimos que la modelación de fenómenos es una práctica que está ligada a la construcción de conocimientos matemáticos y en este sentido se han realizado investigaciones entorno a su incorporación al contexto escolar. Sin embargo, el incorporar la experimentación en el aula de matemáticas conlleva dificultades, una de ellas es la carencia de material de laboratorio. El laboratorio virtual es un proyecto que intenta suplir la ausencia de un laboratorio físicamente, sin embargo, esta sustitución desencadena diferentes relaciones entre los actores. En este trabajo se pretende mostrar como es que un laboratorio simulado, podría contribuir a la incorporación a sistemas escolares concretos de diseños de aprendizaje basados en las prácticas sociales de modelación. Se da evidencia de cómo se desarrollan acciones e interacciones colaborativas alrededor del laboratorio virtual.

Phytogeographic characterization of Gran Canaria Island (Canary Islands-Spain)

Studies on the flora and fauna of the Canary Islands show that this Archipelago is one of the planet’s diversity hot spots. However, an analysis of the differences in the phytogeographic characteristics of each of the islands that make up this Archipelago is lacking. This article focuses on the phytogeographic characterization of the island of Gran Canaria. This island exhibits geological and climatic characteristics resulting in a rich vascular flora, including endemic species and genera that are significantly different from the other islands of the Archipelago. These differences are verified through statistical analysis of the existing similarity between the floras of the members of the Canary Islands. This study also analyses the subdivision of Gran Canaria Island, indicating that there are three well-differentiated areas on the island itself. Finally, this study argues that these areas, themselves, should be considered biogeographic sectors.

Pathophysiology of feline hyperadrenocorticism clinical. Case presentation

Hyperadrenocorticism is a rare endocrine disease in the cat; it is characterized by elevated blood cortisol level that generates numerous clinical signs including hyperglycemia, polyuria, polydipsia, polyphagia and skin diseases. The average age of onset is around 10 years. This disease usually occurs link with other endocrine disorders such as diabetes mellitus.The disease can be produced by functional alteration of the pituitary gland or the adrenal. A case report, with differential diagnosis and review of the literature, is presented.

Early target cells of measles virus after aerosol infection of non-human primates

Measles virus (MV) is highly infectious, and has long been thought to enter the host by infecting epithelial cells of the respiratory tract. However, epithelial cells do not express signaling lymphocyte activation molecule (CD150), which is the high-affinity cellular receptor for wild-type MV strains. We have generated a new recombinant MV strain expressing enhanced green fluorescent protein (EGFP), based on a wild-type genotype B3 virus isolate from Khartoum, Sudan (KS). Cynomolgus macaques were infected with a high dose of rMV(KS)EGFP by aerosol inhalation to ensure that the virus could reach the full range of potential target cells throughout the entire respiratory tract. Animals were euthanized 2, 3, 4 or 5 days post-infection (d.p.i., n?=?3 per time point) and infected (EGFP(+)) cells were identified at all four time points, albeit at low levels 2 and 3 d.p.i. At these earliest time points, MV-infected cells were exclusively detected in the lungs by fluorescence microscopy, histopathology and/or virus isolation from broncho-alveolar lavage cells. On 2 d.p.i., EGFP(+) cells were phenotypically typed as large mononuclear cells present in the alveolar lumen or lining the alveolar epithelium. One to two days later, larger clusters of MV-infected cells were detected in bronchus-associated lymphoid tissue (BALT) and in the tracheo-bronchial lymph nodes. From 4 d.p.i. onward, MV-infected cells were detected in peripheral blood and various lymphoid tissues. In spite of the possibility for the aerosolized virus to infect cells and lymphoid tissues of the upper respiratory tract, MV-infected cells were not detected in either the tonsils or the adenoids until after onset of viremia. These data strongly suggest that in our model MV entered the host at the alveolar level by infecting macrophages or dendritic cells, which traffic the virus to BALT or regional lymph nodes, resulting in local amplification and subsequent systemic dissemination by viremia.

Los Shuar y los animales

La primera edición se agotó muy pronto, tanto más que se habían impreso tan solo 500 ejemplares. El tiraje fue mantenido calculadamente bajo. En efecto, desde el comienzo, el fasciculo fue considerado un simple borrador, es decir un punto de partida para correcciones y añadiduras. Los mismos alumnos de Sevilla D.B. lo vieron a tomar en sus manos y se organizaron en grupos, para corregir y completar. Se les añadieron los del COlegio Agrícola de Bomboiza, del Centro Artesanal de Chiguaza y de la Escuela de Mutintsa

Intron evolution in primates

Dissertation presented to obtain a Ph.D degree in Evolutionary Biology

The evolutionary history of the CD209 (DC-SIGN) family in humans and non-human primates

The CD209 gene family that encodes C-type lectins in primates includes CD209 (DC-SIGN), CD209L (L-SIGN) and CD209L2. Understanding the evolution of these genes can help understand the duplication events generating this family, the process leading to the repeated neck region and identify protein domains under selective pressure. We compiled sequences from 14 primates representing 40 million years of evolution and from three non-primate mammal species. Phylogenetic analyses used Bayesian inference, and nucleotide substitutional patterns were assessed by codon-based maximum likelihood. Analyses suggest that CD209 genes emerged from a first duplication event in the common ancestor of anthropoids, yielding CD209L2 and an ancestral CD209 gene, which, in turn, duplicated in the common Old World primate ancestor, giving rise to CD209L and CD209. K(A)/K(S) values averaged over the entire tree were 0.43 (CD209), 0.52 (CD209L) and 0.35 (CD209L2), consistent with overall signatures of purifying selection. We also assessed the Toll-like receptor (TLR) gene family, which shares with CD209 genes a common profile of evolutionary constraint. The general feature of purifying selection of CD209 genes, despite an apparent redundancy (gene absence and gene loss), may reflect the need to faithfully recognize a multiplicity of pathogen motifs, commensals and a number of self-antigens