An overview of the higher level classification of Pucciniomycotina based on combined analyses of nuclear large and small subunit rDNA sequences

Mycologia, Vol. 98, nº6

Nouvelles espèces d’ostracodes du miocène du basin du Tage (Portugal)

Twelve new species of miocene ostracoda from the Tagus basin (Portugal) are described. Paleoenvironments concerning each of these species are given.

Etude de populations de Glycymeris (Bivalvia, Glycymerididae) du Miocène d'Aquitaine, Sud-Ouest de la France

Abundant crops of Glycymeris have been made in the neritic bioclastic deposits of the Aquitaine Basin. After an outline about the Chattian taxa, the 5 Lower Miocene lineages are presented; G. cor is plainly predominant. Then, the Middle Miocene faunas are also detaiIed, G. inflatus and G. bimaculatus being the most frequent taxa. A test of biometrical analysis about the G. cor species is presented.

Microeukaryoticdiversity in the extreme environments of the Iberian PyriteBelt: a comparison between universal and fungi-specific primer sets, temperature gradient gel electrophoresis and cloning

FEMS Microbiology Ecology, Vol. 57, nº 1

Nouvelles espèces d'ostracodes du miocène du bassin du Tage (Portugal)

Twelve new species of miocene ostracoda from the Tagus basin (Portugal) are described. Paleoenvironments concerning each of these species are given.

Etude de populations de Glycymeris (Bivalvia, Glycymerididae) du Miocène d'Aquitaine, Sud-Ouest de la France Studyof Glycymeris (Bivalvia, G1ycymerididae) populations from the Aquitaine Miocene, SW France

Abundant crops of Glycymeris have been made in the neritic bioclastic deposits of the Aquitaine Basin. After an outline about the Chattian taxa, the 5 Lower Miocene lineages are presented; G. cor is plainly predominant. Then, the Middle Miocene faunas are also detaiIed, G. inflatus and G. bimaculatus being the most frequent taxa. A test of biometrical analysis about the G. cor species is presented.

Upper Paleocene-Early Eocene mollusks of Silveirinha (Figueira da Foz, West Central Portugal)

A collection of fossil gastropods and bivalves assembled at the Thanetian/Ypresian vertebrate site of Silveirinha (Figueira da Foz, West Central Portugal) is analysed from the point of view of systematics and palaeoecology. The diversity is scarce but the age and exceptional characteristics of the site are factors that substantiate a detailed study. The taxa identified are: Bithynia soaresi sp. nov., Gyraulus antunesi sp. nov., Chlamys sp. and Cardiiacea gen. sp. indet. The prevailing of freshwater gastropods and the occurrence of 2 fragments of marine bivalves suggest a palaeoenvironmental setting that is in conformity with interpretations already established, which are based both in sedimentologic and vertebrate data. These interpretations point out the existence of a freshwater environment opened from time to time to marine influences, resulting from a palaeoatlantic coast placed some kilometres westwards.

Paleontologia e evolução a problemática da espécie em Paleozoologia

The concept of species in Paleontology is of paramount importance since the correct taxonomic determinations are essential to establish the age of the beds where fossils are collected. Particularly since 1940, the concept of species from a biological context, corresponding to the variability of a set of interpopulation compatibility, led us to a new approach, in which a typological conception has been replaced by a populationist one. If the notion of species is not necessarily identical for all living organisms, the greater the difficulties of interpretation in the private world of cephalopod fossils. The latter, lend themselves well to population systematics, and where this concept of species rests primarily on the morphological similarities. Thus, the introduction of general ideas analyse "typological species", "biological species", the problem of the definition of a "population" in Paleontology, and also the importance of the biometric analysis of fossil associations. The classic examples of polymorphism amd polytypism, in existing or extinct organisms, show that the concept of fossil species, observed in a well-defined period of its lifetime, is no different from that of biological species. The study of the evolution of fossil organisms allow us to understand the modelities of evolution and the mechanisms of speciation here synthesized and fully documented, namely the anagenesis or sequential evolution and the cladogenesis or divergent evoltuion; these mechanisms are the basis of the synthetic or gradualist theory of evolution developed by Dobzhansky, Mayr, Huxley, Rensch and impson. This summary ends with a reference to the theory of punctuated (or intermittent) equilibria proposed by Gould and Eldredge, who presented a more objective interpretation of morphological gaps, considered as elements of evolution itself. The interdisciplinary collaboration between zoologists, geneticists and paleontologists, is compulsory in this domain. Paleozoology has a key role since it conveys the dynamism and depth to the dimension of space-time duality.

Estudos moleculares e enológicos da biota de leveduras de uvas da casta Touriga Nacional

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Biotecnologia

Caracterização cariológica do fungo Hemileia vastatrix responsável pela ferrugem alaranjada do cafeeiro

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Biotecnologia

Pesquisa de novos metabolitos secundários bioactivos em bactérias de sedimentos marinhos

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Genética Molecular e Biomedicina

Identificação de micobactérias não tuberculosas através de métodos moleculares não comerciais

Embora Mycobacterium tuberculosis, o agente etiológico da tuberculose humana, seja a principal causa de micobacteriose no Homem, outras micobactérias não tuberculosas (MNT), podem também causar infecção em seres humanos, sendo cada vez mais frequentemente isoladas no laboratório de micobacteriologia. Dada a morosidade da identificação de MNT por métodos convencionais, torna-se essencial o desenvolvimento de métodos rápidos e fiáveis para a sua identificação. Neste estudo foram comparados três métodos moleculares para a identificação de MNT, baseados na análise de restrição enzimática após amplificação de: (i) região rRNA 16S-23S “Internal Transcribed Spacer” (ITS), (ii) gene hsp65, e (iii) zona ITS e regiões adjacentes, 16S e 23S rDNA. Para este fim, avaliamos 50 isolados, correspondendo a 47 isolados clínicos de MNT e três estirpes de referência, representando as 11 espécies de MNT mais frequentemente isoladas no laboratório de Micobactérias do Instituto de Higiene e Medicina Tropical (IHMT, UNL) e uma estirpe referência de M. tuberculosis, e identificadas anteriormente utilizando o sistema comercial GenoType® Mycobacterium CM/AS (Hain Lifescience). O PCR-RFLP do gene hsp65 proporcionou os melhores resultados, identificando correctamente 42 dos 49 isolados de MNT, pertencentes a M. avium, M. gordonae, M. intracellulare, M. kansasii, M. chelonae, M. fortuitum, M. abscessus, M. szulgai, M. peregrinum e M. xenopi. O PCR-RFLP da região ITS identificou correctamente 28 dos 49 isolados testados, não distinguindo M. intracellulare/M. scrofulaceum, M. avium/M. bohemicum e M. kansasii/M. szulgai. Finalmente, o PCR-RFLP da região ITS e regiões adjacentes mostrou o pior desempenho, com apenas oito isolados correctamente identificados e falhando na amplificação de diversos isolados. Dos três métodos testados, o PCR-RFLP do gene hsp65 e da região ITS mostraram maior capacidade de identificação e reprodutibilidade. No entanto, a sua aplicação exige uma optimização cuidadosa das condições de análise e a sua aplicabilidade depende, em grande parte, da diversidade xi de MNT em cada laboratório. Verificaram-se também várias dificuldades a nível da interpretação dos resultados. Assim, apesar das vantagens referidas na literatura para estes três métodos, verificou-se que o grau de variabilidade e dificuldade de interpretação associados aos padrões obtidos, limitam a sua implementação no laboratório de diagnóstico de micobacteriologia.

A responsabilidade da sociedade diretora com os credores da sociedade subordinada

The scope of the present study encompasses the liability of the directing company for the obligations of the subordinated company. Whereas the concept of directing company is comprised in the broader context of groups of companies and, consequently, in the comprehensive framework of the relationships established among such entities, this study starts by defining the notion of groups of companies, distinguishing it from related figures. It, then, moves on to analyse the legal regime applicable to groups of companies in some legal systems deemed significant, notably the American, European and German systems. Finally, this paper scrutinizes the provisions of article 501 of the Portuguese Companies Code (“Códigodas Sociedades Comerciais”), in particular its systematics and peculiarities, so as to ascertain which is the liability scheme 2 applicable to the directing or dominant company for the obligations of the subordinates or dominated company. Pursuant to no. 1 of article 501of the CSC, the directing company’s liability for such obligations exists provided these commitments are born before, during and until such time the subordination contract is terminated. The liability of the directing or dominant company for the debts of the subordinated or dominated company ceases as of the moment when the relationship between those two entities no longer exists, with immediate effect.

Determinação e comparação de genótipo de Candida albicans pelo Método de PCR com base nos polimorfismos da região 255rDNA e das sequências ALT/RPS

As leveduras da espécie Candida albicans são comensais do ser humano, podendo em certos casos, como a toma prolongada de antibióticos de largo espectro, a diminuição da imunidade, ou a quimioterapia, causar infecções severas. Estas infecções classificam-se em superficiais ou sistémicas, consoante a zona anatómica ou os órgãos afectados. As infecções hospitalares por fungos, nomeadamente as causadas por C. albicans, têm vindo a aumentar nos últimos anos, assim como a mortalidade e a morbilidade associadas, e ainda os custos relacionados com os cuidados de saúde. Torna-se por isso importante a implementação de terapêutica de uma forma rápida, eficaz e correcta. Assim, é imperativo que os laboratórios de microbiologia clínica possuam métodos de diagnóstico rápidos, simples e económicos em relação a uma correcta identificação ao nível de espécie e em relação ao estudo da sensibilidade aos antifúngicos. Contudo, esta identificação ao nível de espécie não permite averiguar a origem das infecções, facto importante para a compreensão da evolução das infecções nosocomiais. Para tal, é necessário realizar um estudo ao nível de estirpe através de métodos moleculares que permitam fazer a distinção acurada entre isolados de C. albicans. Os métodos moleculares têm vindo a desenvolver um papel importante no diagnóstico de infecções: são rápidos, sensíveis, precisos e possuem a vantagem de se poder trabalhar pequenas quantidades de amostra. Têm no entanto a desvantagem de ser métodos caros, por vezes demasiado elaborados para serem instituídos num laboratório de microbiologia clínica com grande volume de amostras diárias. O principal objectivo deste trabalho consistiu na diferenciação de estirpes de C. albicans através de uma metodologia molecular inovadora, nunca antes efectuada no ocidente, simples e rápida, por meio de simples amplificações por PCR. Para tal, foram seleccionados 60 isolados clínicos de leveduras obtidas a partir de amostras clínicas de três localidades: Covilhã (Centro Hospitalar Cova de Beira, E.P.E) Lisboa (Instituto Português de Oncologia e Hospital de Santa Maria, E.P.E) e Viseu (Hospital de São Teotónio). O trabalho baseou-se na genotipagem de isolados clínicos de C. albicans por amplificação por PCR com primers dirigidos às sequências 25S rDNA e às regiões ALT das sequências RPS. Foi possível a sua diferenciação e distinção em estirpes, fazendo deste método um bom recurso para estudos epidemiológicos. Realizou-se ainda um estudo de sensibilidade in vitro das estirpes de C. albicans ao antifúngicos Fluconazol e Voriconazol pelo método de difusão em disco, segundo os procedimentos padronizados e publicados pelo CLSI. Através deste estudo foi verificada elevada susceptibilidade aos antifúngicos estudados. Com este trabalho conclui-se que a diferenciação ao nível de estirpe é muito importante para compreender padrões de surtos de infecções e ainda para averiguar a origem, endógena ou exógena, destas infecções nosocomiais. Como tal, este estudo epidemiológico torna-se essencial para definir um controlo mais rigoroso das infecções.