Quorum-sensing regulates biofilm formation in Vibrio scophthalmi

Background: In a previous study, we demonstrated that Vibrio scophthalmi, the most abundant Vibrio species among the marine aerobic or facultatively anaerobic bacteria inhabiting the intestinal tract of healthy cultured turbot (Scophthalmus maximus), contains at least two quorum-sensing circuits involving two types of signal molecules (a 3-hydroxy-dodecanoyl-homoserine lactone and the universal autoinducer 2 encoded by luxS). The purpose of this study was to investigate the functions regulated by these quorum sensing circuits in this vibrio by constructing mutants for the genes involved in these circuits. Results. The presence of a homologue to the Vibrio harveyi luxR gene encoding a main transcriptional regulator, whose expression is modulated by quorumsensing signal molecules in other vibrios, was detected and sequenced. The V. scophthalmi LuxR protein displayed a maximum amino acid identity of 82% with SmcR, the LuxR homologue found in Vibrio vulnificus. luxR and luxS null mutants were constructed and their phenotype analysed. Both mutants displayed reduced biofilm formation in vitro as well as differences in membrane protein expression by mass-spectrometry analysis. Additionally, a recombinant strain of V. scophthalmi carrying the lactonase AiiA from Bacillus cereus, which causes hydrolysis of acyl homoserine lactones, was included in the study. Conclusions: V. scophthalmi shares two quorum sensing circuits, including the main transcriptional regulator luxR, with some pathogenic vibrios such as V. harveyi and V. anguillarum. However, contrary to these pathogenic vibrios no virulence factors (such as protease production) were found to be quorum sensing regulated in this bacterium. Noteworthy, biofilm formation was altered in luxS and luxR mutants. In these mutants a different expression profile of membrane proteins were observed with respect to the wild type strain suggesting that quorum sensing could play a role in the regulation of the adhesion mechanisms of this bacterium.

Comparative analysis of genetic diversity in the mangrove species Avicennia marina (Forsk.) Vierh. (Avicenniaceae) detected by AFLPs and SSRs

Avicennia marina is an important mangrove species with a wide geographical and climatic distribution which suggests that large amounts of genetic diversity are available for conservation and breeding programs. In this study we compare the informativeness of AFLPs and SSRs for assessing genetic diversity within and among individuals, populations and subspecies of A. marina in Australia. Our comparison utilized three SSR loci and three AFLP primer sets that were known to be polymorphic, and could be run in a single analysis on a capillary electrophoresis system, using different-colored fluorescent dyes. A total of 120 individuals representing six populations and three subspecies were samplcd. At the locus level, SSRs were considerably more variable than AFLPs, with a total of 52 alleles and an average heterozygosity of 0.78. Average heterozygosity for AFLPs was 0.193, but all of the 918 bands scored were polymorphic. Thus, AFLPs were considerably more efficient at revealing polymorphic loci than SSRs despite lower average heterozygosities. SSRs detected more genetic differentiation between populations (19 vs 9%) and subspecies (35 vs 11%) than AFLPs. Principal co-ordinate analysis revealed congruent patterns of genetic relationships at the individual, population and subspecific levels for both data sets. Mantel testing confirmed congruence between AFLP and SSR genetic distances among, but not within, population comparisons, indicating that the markers were segregating inde- pendently but that evolutionary groups (populations and subspecies) were similar. Three genetic criteria of importance for defining priorities for ex situ collections or in situ conservation programs (number of alleles, number of locally common alleles and number of private alleles) were correlated between the AFLP and SSR data sets. The congruence between AFLP and SSR data sets suggest that either method, or a combination, is applicable to expanded genetic studies of mangroves. The codominant nature of SSRs makes them ideal for further population-based investigations, such as mating-system analyses, for which the dominant AFLP markers are less well suited. AFLPs may be particularly useful for monitoring propagation programs and identifying duplicates within collections, since a single PCR assay can reveal many loci at once.

Differences in benthic fauna and sediment among mangrove (Avicennia marina var. australasica) stands of different ages in New Zealand

Management of coastal environments requires understanding of ecological relationships among different habitats and their biotas. Changes in abundance and distribution of mangroves, like those of other coastal habitats, have generally been interpreted in terms of changes in biodiversity or fisheries resources within individual stands. In several parts of their range, anthropogenically increased inputs of sediment to estuaries have led to the spread of mangroves. There is, however, little information on the relative ecological properties, or conservational values, of stands of different ages. The faunal, floral and sedimentological properties of mangrove (Avicennia marina var. australasica) stands of two different ages in New Zealand has been compared. Older (>60 years) and younger (3-12 years) stands showed clear separation on the basis of environmental characteristics and benthic macrofauna. Numbers of faunal taxa were generally larger at younger sites, and numbers of individuals of several taxa were also larger at these sites. The total number of individuals was not different between the two age-classes, largely due to the presence of large numbers of the surface-living gastropod Potamopyrgus antipodarum at the older sites. It is hypothesized that as mangrove stands mature, the focus of faunal diversity may shift from the benthos to animals living on the mangrove plants themselves, such as insects and spiders, though these were not included in the present study. Differences in the faunas were coincident with differences in the nature of the sediment. Sediments in older stands were more compacted and contained more organic matter and leaf litter. Measurement of leaf chemistry suggested that mangrove plants in the younger stands were able to take up more N and P than those in the older stands. (C) 2003 Elsevier Science B.V. All rights reserved.

Ichthyotoxicity of Chattonella marina (Raphidophyceae) to damselfish (Acanthochromis polycanthus): the synergistic role of reactive oxygen species and free fatty acids

This investigation aimed to elucidate the relative roles of putative brevetoxins, reactive oxygen species and free fatty acids as the toxic principle of the raphidophyte Chattonella marina, using damselfish as the bioassay. Our investigations on Australian C. marina demonstrated an absence or only very low concentrations of brevetoxin-like compounds by radio-receptor binding assay and liquid chromatography-mass spectroscopy techniques. Chattonella is unique in its ability to produce levels of reactive oxygen species 100 times higher than most other algal species. However, high levels of superoxide on their own were found not to cause fish mortalities. Lipid analysis revealed this raphidophyte to contain high concentrations of the polyunsaturated fatty acid eicosapentaenoic acid (EPA; 18-23% of fatty acids), which has demonstrated toxic properties to marine organisms. Using damselfish as a model organism, we demonstrated that the free fatty acid (FFA) form of EPA produced a mortality and fish behavioural response similar to fish exposed to C. marina cells. This effect was not apparent when fish were exposed to other lipid fractions including a triglyceride containing fish oil, docosahexaenoate-enriched ethyl ester, or pure brevetoxin standards. The presence of superoxide together with low concentrations of EPA accelerated fish mortality rate threefold. We conclude that the enhancement of ichthyotoxicity of EPA in the presence of superoxide can account for the high C. marina fish killing potential. (C) 2003 Elsevier B.V All rights reserved.

Microbiologia dos seios maxilar e etmoidal em pacientes com rinossinusite crônica submetidos à cirurgia funcional endoscópica dos seios paranasais

Estudos da microbiologia da rinossinusite crônica mostram a presença de microorganismos aeróbicos, anaeróbicos, fungos e vírus e sua incidência varia de acordo com cada estudo. Estes estudos nos guiam para a escolha do antimicrobiano mais adequado para eliminar o processo infeccioso, ajudando a restaurar a mucosa nasossinusal. FORMA DE ESTUDO: Clínico prospectivo. OBJETIVO: O objetivo deste trabalho foi estudar a microbiologia dos seios maxilar e/ou etmoidal de pacientes com rinossinusite crônica e com indicação de cirurgia funcional endoscópica dos seios paranasais. MATERIAIS E MÉTODOS: Durante a cirurgia coletamos, em 41 pacientes, secreção e/ou fragmento de mucosa dos seios maxilar e/ou etmoidal para realização de bacterioscopia, pesquisa direta de fungos, cultura para microorganismos aeróbios, anaeróbios e fungos. RESULTADOS: Identificou-se a presença de microorganismos aeróbios em 21 pacientes (51,2%), anaeróbios em 16 (39%) e fungos em 1 (2,4%). Na população estudada, apenas em 12 (29,2%) o microorganismo isolado foi considerado patogênico quando analisado junto à contagem semiquantitativa de leucócitos. O Staphylococcus coagulase-negativo e o Staphylococcus aureus foram os microorganismos mais freqüentes, em 5 (12,1%) e em 4 pacientes (9,75%) respectivamente. CONCLUSÃO: Este estudo revela que o Staphylococcus coagulase-negative e o Staphylococcus aureus foram os microorganismos mais freqüentes isolados nos pacientes com rinossinusite crônica.

Microbiologia dos abscessos peritonsilares

OBJETIVO: O objetivo deste estudo é avaliar a microbiologia dos abscessos periamigdalianos. MATERIAIS E MÉTODOS: Trinta pacientes com diagnóstico de abscesso periamigdaliano, idade média de 24,2 anos, foram submetidos à punção na região periamigdaliana de maior abaulamento com aspiração do material purulento (volume maior que 3mL). O material foi separado para realização das culturas aeróbicas e anaeróbicas. RESULTADOS: Houve um índice de positividade das culturas de 86,7%. Em 23,3% aspirados houve crescimento apenas de bactérias aeróbicas ou facultativas, 3,3% apenas de bactérias anaeróbicas e por fim em 60% aspirados houve crescimento de bactérias aeróbicas e anaeróbicas. Um total de 69 bactérias foi isolado (34 aeróbios e 35 anaeróbios). Os aeróbios predominantes foram Streptococcus sp, sendo o Streptococcus pyogenes em 23% dos casos. Os anaeróbios predominantes foram Prevotella sp e Peptostreptococcus sp. Pacientes receberam antibiótico prévio em 63% dos casos. Neste grupo foram isolados 1,8 bactérias por aspirado, menor número que nos paciente que não utilizaram antibiótico (3,0 bactérias por aspirado). Não houve diferença significativa no tipo de bactéria isolada nestes dois grupos. CONCLUSÃO: Os abscessos periamigdalianos apresentam na maioria dos casos infecções polimicrobianas, sendo os organismos anaeróbicos agentes importantes. O número de agentes isolados é maior nos pacientes que não utilizaram antibioticoterapia prévia, mas o uso de antimicrobiano não interferiu no tipo de bactéria isolada.

Microbiologia do meato médio na rinossinusite crônica

Este foi um estudo prospectivo que visou identificar a microbiologia do meato médio em pacientes com rinossinusite crônica (RSC) e compará-la com a de indivíduos sadios. MATERIAL E MÉTODOS: Foram incluídos 134 pacientes RSC e 50 voluntários sadios, que constituíram o grupo controle. As amostras foram coletadas endoscopicamente e submetidas a exames pelo método de Gram com contagem leucocitária e culturas para aeróbios, anaeróbios e fungos. RESULTADOS: Nos pacientes com RSC foram cultivados 220 microorganismos, dentre os quais os mais freqüentes foram o Staphylococcus aureus, presente em 31% das amostras, e o Staphylococcus coagulase-negativo (SCN) em 23%. Gram-negativos ou facultativos foram isolados em 37% das amostras, anaeróbios em 12%, e fungos em 14%. Ao exame bacterioscópico evidenciou-se alguns ou numerosos leucócitos em 74% das amostras com culturas positivas. Nos indivíduos sadios o SCN foi isolado em 40% das amostras e o Staphylococcus aureus em 18%. Em 12% dos indivíduos a cultura para fungos foi positiva, e o exame direto negativo. Todas as culturas anaeróbias foram estéreis. Quanto à contagem leucocitária todos apresentaram nenhum ou raros leucócitos. CONCLUSÃO: Os grupos apresentaram resultados semelhantes quanto à microbiologia, entretanto, diferiram em relação à contagem leucocitária, o que auxilia na diferenciação um microorganismo infectante de um colonizante.

Campylobacter spp. em Águas: Programas Nacionais de Avaliação Externa da Qualidade - Microbiologia de Alimentos Microbiologia de Águas

Apresentação sobre Campylobacter spp. em Águas no âmbito dos Programas Nacionais de Avaliação Externa da Qualidade - Microbiologia de Alimentos Microbiologia de Águas.

Controlo de qualidade microbiológica na indústria farmacêutica

O presente Relatório de Estágio teve como objectivo analisar e discutir as competências adquiridas e desenvolvidas, durante o estágio, no controlo da qualidade microbiológica na indústria farmacêutica O estágio, foi realizado no Laboratório de Microbiologia dos Laboratórios Atral, Grupo AtralCipan, localizado na Vala do Carregado, Castanheira do Ribatejo. Este teve a duração de aproximadamente dez meses e meio, com data de início a 21 de Setembro de 2011 e final de 10 de Agosto de 2012. Numa fase inicial, foram adquiridas as aptidões necessárias para a aplicação das metodologias realizadas no laboratório de microbiologia com o estudo das normas, procedimento e legislação aplicada, com foco na importância das farmacopeias na indústria farmacêutica e formação para a realização de ensaios em Áreas de Processamento Asséptico, conhecendo e compreendendo os procedimentos a ter nestas. Uma das principais metodologias realizadas, e desenvolvida neste relatório, compreendeu a análise de produtos farmacêuticos estéreis, com a aplicação de Testes de Esterilidade, pelo método de STERITEST e método Directo, com resultados que demonstraram a importância destas técnicas, da avaliação do ambiente em que são realizadas e do operador que as executa. Os Testes de Promoção de Crescimento, foram também explorados neste trabalho, realizados não só para avaliação dos meios de cultura, onde foi possível analisar os requisitos e resultados obtidos, como também para validação de metodologias, nomeadamente, na validação de meios e fluidos de marcas diferentes para utilização no método STERITEST e na validação do método de filtração de membrana para Enumeração Microbiana de um produto não estéril. Estas validações possibilitaram a redução de custos e melhoria das condições da análise e metodologias aplicadas. Com a realização do estágio foi possível adquirir aptidões práticas, que aliadas ao conhecimento teórico obtido no mestrado, proporcionaram um crescimento a nível pessoal, científico e profissional.

Bioactive meroditerpenes from Cystoseira abies-marina, collected from the coast of S. Miguel island

3rd Portuguese Meeting on Medicinal Chemistry and 1st Portuguese-Spanish-Brazilian Meeting on Medicinal Chemistry, Aveiro, 28-30 Novembro 2012.

Purification and structural characterization of compounds isolated from Cystoseira abies-marina

6th Spanish-Portuguese-Japanese Organic Chemistry Symposium, Lisboa, de 18 a 20 de Julho de 2012 (Poster Communication).

Contribuição da microbiologia preditiva na análise de cremes de pasteleiro

Dissertação apresentada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para a obtenção do grau de Mestre em Tecnologia e Segurança Alimentar

Diagnóstico laboratorial em microbiologia clínica: um estudo no centro hospitalar

Dissertação para obtenção do Grau de Mestre em Genética Molecular e Biomedicina