369 resultados para glycosyl azide


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A series of polyesters based on 2-propargyl-1,3-propanediol or 2,2-dipropargyl-1,3-propanediol or 2-allyl-2-propargyl-1,3-propanediol and 1,20-eicosanedioic acid were prepared by solution polycondensation using the corresponding diacid chloride; these polyesters were quantitatively ``clicked'' with a fluoroalkyl, azide, namely CF3(CF2)(7)CH2CH2N3, to yield polyesters carrying long-chain alkylene segments in the backbone and either one or two perfluoroalkyl segments located at periodic intervals along the polymer chain. The immiscibility of the alkylene and fluoroalkyl segments causes the polymer chains to fold in a zigzag fashion to facilitate the segregation of these segments; the folded chains further organize in the solid state to form a lamellar structure with alternating domains of alkyl (HC) and fluoroalkyl (FC) segments. Evidence for the self-segregation is provided by DSC, SAXS, WAXS, and TEM studies; in two of the samples, the DSC thermograms showed two distinct endotherms associated with the melting of the individual domains, while the WAXS patterns confirm the existence of two separate peaks corresponding to the interchain distances within the crystalline lattices of the HC and FC domains. SAXS data, on the other hand, reveal the formation of an extended lamellar morphology with an interlamellar spacing that matches reasonably well with those estimated from TEM studies. Interestingly, a smectic-type liquid crystalline phase is observed at temperatures between the two melting transitions. These systems present a unique opportunity to develop interesting nanostructured polymeric materials with precise control over both the domain size and morphology; importantly, the domain sizes are far smaller than those typically observed in traditional block copolymers.

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A mild and convenient oxidative transformation of secondary alcohols to 1,5-disubstituted tetrazoles is uncovered by employing trimethylsilyl azide (TMSN3) as a nitrogen source in the presence of a catalytic amount of copper(II) perchlorate hexahydrate Cu(ClO4)(2)(.)6H(2)O] (5mol%) and 2,3-dichloro-5,6-dicyano-para-benzoquinone (DDQ) (1.2equiv.) as an oxidant. This reaction is performed under ambient conditions and proceeds through CC bond cleavage.

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Four neutral polynuclear magnetic clusters, (Mn6Mn2Na2I)-Mn-III-Na-II(N-3)(8)(mu(1)-O)(2)(L-1)(6)(CH3OH)(2)] (1), (Mn6Na2I)-Na-III(N-3)(4)(mu(4)-O)(2)(L-2)(4)(CH3COO)(4)] (2), Ni-5(II)(N-3)(4)(HL1)(4)(HCOO)(2)(CH3OH)(2)(H2O)(2)]center dot 2CH(3)OH (3) and (Ni4Na2I)-Na-II(N-3)(4)(HL2)(6)]center dot 2CH(3)OH (4) have been synthesized using tetradentate ligands H2L1-2 along with azide as a co-ligand. H2L1-2 are the products formed in situ upon condensation of 2-hydroxy-3-methoxybenzaldehyde with 1-aminopropan-2-ol and 1-aminopropan-3-ol, respectively. Single crystal X-ray diffraction and bond valence sum calculation showed that complex 1 is composed of both Mn-III and Mn-II. Complex 3 contains coordinated formate, which was formed upon in situ oxidation of methanol. The magnetic study over a wide range of temperatures of all the complexes (1-4) showed that 1 and 2 are antiferromagnetic whereas other two (3-4) are predominantly ferromagnetic. The estimated ground states of the complexes are S approximate to 3(1), S = 4(2), S = 5(3) and S approximate to 4(4), respectively. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.

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The mechanism of the diazo transfer reaction which converts amines to azides has been studied with labeled amino acids and labeled imidazole-l-sulfonyl azides. Retention of amine nitrogen in the amine, and transfer of the two terminal nitrogen atoms of the imidazole-l-sulfonyl azide to the product, were unambiguously established. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

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A simple, mild, and cost effective methodology has been developed for the synthesis of aryl thio-and selenoglycosides from glycosyl halides and diaryl dichalcogenides. Diaryl dichalcogenides undergo reductive cleavage in the presence of rongalite (HOCH2SO2Na) to generate a chalcogenide anion in situ followed by reaction with glycosyl halides to furnish the corresponding aryl thio- and selenoglycosides in excellent yields. Using this protocol, synthesis of 4-methyl-7-thioumbelliferyl-beta-D-cellobioside (MUS-CB), a fluorescent non-hydrolyzable substrate analogue for cellulases has been achieved. (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

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Two series of periodically clickable polyesters were prepared; one of them carries alkylene segments along its backbone, whereas the other carries poly(ethylene glycol) (PEG) segments. These polyesters were clicked with either MPEG-350 azide or docosyl (C22) azide to yield periodically grafted amphiphilic copolymers (PGACs) carrying either flexible hydrophilic or crystallizable hydrophobic backbone segments. The immiscibility between hydrocarbon and PEG segments causes both of these systems to fold in either a zigzag or hairpin-like conformation; the hairpin-like conformation appears to be preferred when flexible PEG segments are present in the backbone. The folded chains further reorganize in the solid state to develop a lamellar morphology that permits the collocation of the PEG and hydrocarbon (HC) segments within alternate domains; evidence for the self-segregation was gained from DSC, SAXS, and AFM studies. SAXS studies revealed the formation of an extended lamellar structure, whereas AFM images showed uniform layered morphology with layer heights that matched reasonably well with the interlamellar spacing obtained from the SAXS study. Labeling One representative PGAC, carrying crystallizable long alkylene segments in the backbone and pendant PEG-350 side chains, with a small mole fraction of pyrene fluorophore permitted the examination of the conformational transition that occurs upon going from a good to a poor solvent; this single-chain folded conformation, we postulate, is the intermediate that organizes into the lamellar morphology.

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Efforts have been made in growing bulk single crystals of GaN front supercritical fluids using the ammonothermal method, which utilizes ammonia as fluid rather than water as in the hydrothermal process. Different mineralizers such as amide or azide and temperatures in the range of 200-600degreesC have been used to increase the solubility. The pressure is from 1 to 4 kbar. Modeling of the ammonothermal growth process has been used to identify factors which may affect the temperature distribution, fluid flow and nutrient transport. The GaN charge is considered as a porous media bed and the flow in the charge is simulated using the Darcy-Brinkman-Forchheimer model. The resulting governing equations are solved using the finite volume method. The effects of baffle design and opening on flow pattern and temperature distribution in an autoclave are analyzed. Two cases are considered with baffle openings of 15% and 20% in cross-sectional area, respectively.

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GaN can be used to fabricate blue/green/UV LEDs and high temperature, high power electronic devices. Ideal substrates are needed for high quality III-nitride epitaxy, which is an essential step for the manufacture of LEDs. GaN substrates are ideal to be lattice matched and isomorphic to nitride-based films. Bulk single crystals of GaN can be grown from supercritical fluids using the ammonothermal method, which utilizes ammonia as fluid rather than water as in the hydrothermal process. In this process, a mineralizer such as amide, imide or azide is used to attack a bulk nitride feedstock at temperatures from 200 - 500癈 and pressures from 1 - 4 kbar. Baffle design is essential for successful growth of GaN crystals. Baffle is used to separate the dissolving zone from the growth zone, and to maintain a temperature difference between the two zones. For solubility curve with a positive coefficient with respect to temperature, the growth zone is maintained at a lower temperature than that in the dissolving zone, thus the nutrient becomes supersaturated in the growth zone. The baffle opening is used to control the mixing of nutrients in the two zones, thus the transfer of nutrient from the lower part to the upper part. Ammonothermal systems have been modeled here using fluid dynamics, thermodynamics and heat transfer models. The nutrient is considered as a porous media bed and the flow is simulated using the Darcy-Brinkman-Forchheimer model. The resulting governing equations are solved using the finite volume method. We investigated the effects of baffle opening and position on the transport phenomena of nutrient from dissolving zone to the growth zone. Simulation data have been compared qualitatively with experimental data.

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O óleo lubrificante mineral é amplamente utilizado no cenário mundial no funcionamento de máquinas e motores. No entanto, o ciclo de vida deste petro-derivado resulta na geração de um resíduo (óleo lubrificante usado), o qual é nocivo ao meio ambiente quando não descartado adequadamente ou reciclado. No Brasil, apesar das normas que tratam especificamente do armazenamento, recolhimento e destino de óleo lubrificante usado, grande parte do mesmo ainda é despejado diretamente no meio ambiente, sem qualquer tratamento, sendo de grande importância estudos que visem o entendimento dos processos e o desenvolvimento de tecnologias de remediação de áreas contaminadas por esse resíduo. O objetivo geral do presente trabalho foi conduzir estudos de tratabilidade de solo arenoso contaminado experimentalmente com 5% (m m-1 seco) de óleo lubrificante usado, através de duas diferentes estratégias de biorremediação: bioestímulo e bioaumento. Foram conduzidos dois experimentos. No primeiro, foi avaliada a atividade microbiana aeróbia na biodegradação do OLU através do método respirométrico de Bartha. No segundo, foram montados três biorreatores de fase sólida simulando biopilhas estáticas com aeração forçada, cada um contendo 125 kg de solo e 5% (m m-1 seco) de óleo lubrificante automotivo usado, os quais receberam como tratamento: bioestímulo por ajuste de pH e umidade (BIOSca); bioestímulo por ajuste de pH e umidade associado ao bioaumento com a adição de composto maduro (BIOA1ca) ; e bioestímulo por ajuste de pH e umidade associado ao bioaumento com a adição de composto jovem (BIOA2ca). Foram também montados três biorreatores de bancada simulando biopilhas estáticas sem aeração forçada, cada um contendo 3 kg de solo e 5% (m m-1) do mesmo contaminante, sendo que o primeiro continha solo sem contaminação - CONTsa, o segundo, solo contaminado com ajuste de pH BIOSsa e o terceiro, solo contaminado com adição de 0,3% de azida sódica - ABIOsa. Os tratamentos foram avaliados pela remoção de hidrocarbonetos totais de petróleo (HTPs) e após 120 dias de experimento obteve-se remoções de HTPs de 84,75%, 99,99% e 99,99%, com BIOS, BIOA1 e BIOA2, respectivamente, demonstrando que a estratégia de bioestímulo associada ao bioaumento foram promissoras na remediação do solo contaminado pelo óleo lubrificante usado. Os tratamentos que receberam composto (BIOA1 e BIOA2) não apresentaram diferenças quanto à remoção de HTPs, evidenciando que a fase de maturação dos compostos não apresentou influência na eficiência do processo. No entanto, verificou-se uma eficiência nos tratamentos que receberam composto quando comparado ao tratamento sem adição de composto

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Detection of biologically relevant targets, including small molecules, proteins, DNA, and RNA, is vital for fundamental research as well as clinical diagnostics. Sensors with biological elements provide a natural foundation for such devices because of the inherent recognition capabilities of biomolecules. Electrochemical DNA platforms are simple, sensitive, and do not require complex target labeling or expensive instrumentation. Sensitivity and specificity are added to DNA electrochemical platforms when the physical properties of DNA are harnessed. The inherent structure of DNA, with its stacked core of aromatic bases, enables DNA to act as a wire via DNA-mediated charge transport (DNA CT). DNA CT is not only robust over long molecular distances of at least 34 nm, but is also especially sensitive to anything that perturbs proper base stacking, including DNA mismatches, lesions, or DNA-binding proteins that distort the π-stack. Electrochemical sensors based on DNA CT have previously been used for single-nucleotide polymorphism detection, hybridization assays, and DNA-binding protein detection. Here, improvements to (i) the structure of DNA monolayers and (ii) the signal amplification with DNA CT platforms for improved sensitivity and detection are described.

First, improvements to the control over DNA monolayer formation are reported through the incorporation of copper-free click chemistry into DNA monolayer assembly. As opposed to conventional film formation involving the self-assembly of thiolated DNA, copper-free click chemistry enables DNA to be tethered to a pre-formed mixed alkylthiol monolayer. The total amount of DNA in the final film is directly related to the amount of azide in the underlying alkylthiol monolayer. DNA monolayers formed with this technique are significantly more homogeneous and lower density, with a larger amount of individual helices exposed to the analyte solution. With these improved monolayers, significantly more sensitive detection of the transcription factor TATA binding protein (TBP) is achieved.

Using low-density DNA monolayers, two-electrode DNA arrays were designed and fabricated to enable the placement of multiple DNA sequences onto a single underlying electrode. To pattern DNA onto the primary electrode surface of these arrays, a copper precatalyst for click chemistry was electrochemically activated at the secondary electrode. The location of the secondary electrode relative to the primary electrode enabled the patterning of up to four sequences of DNA onto a single electrode surface. As opposed to conventional electrochemical readout from the primary, DNA-modified electrode, a secondary microelectrode, coupled with electrocatalytic signal amplification, enables more sensitive detection with spatial resolution on the DNA array electrode surface. Using this two-electrode platform, arrays have been formed that facilitate differentiation between well-matched and mismatched sequences, detection of transcription factors, and sequence-selective DNA hybridization, all with the incorporation of internal controls.

For effective clinical detection, the two working electrode platform was multiplexed to contain two complementary arrays, each with fifteen electrodes. This platform, coupled with low density DNA monolayers and electrocatalysis with readout from a secondary electrode, enabled even more sensitive detection from especially small volumes (4 μL per well). This multiplexed platform has enabled the simultaneous detection of two transcription factors, TBP and CopG, with surface dissociation constants comparable to their solution dissociation constants.

With the sensitivity and selectivity obtained from the multiplexed, two working electrode array, an electrochemical signal-on assay for activity of the human methyltransferase DNMT1 was incorporated. DNMT1 is the most abundant human methyltransferase, and its aberrant methylation has been linked to the development of cancer. However, current methods to monitor methyltransferase activity are either ineffective with crude samples or are impractical to develop for clinical applications due to a reliance on radioactivity. Electrochemical detection of methyltransferase activity, in contrast, circumvents these issues. The signal-on detection assay translates methylation events into electrochemical signals via a methylation-specific restriction enzyme. Using the two working electrode platform combined with this assay, DNMT1 activity from tumor and healthy adjacent tissue lysate were evaluated. Our electrochemical measurements revealed significant differences in methyltransferase activity between tumor tissue and healthy adjacent tissue.

As differential activity was observed between colorectal tumor tissue and healthy adjacent tissue, ten tumor sets were subsequently analyzed for DNMT1 activity both electrochemically and by tritium incorporation. These results were compared to expression levels of DNMT1, measured by qPCR, and total DNMT1 protein content, measured by Western blot. The only trend detected was that hyperactivity was observed in the tumor samples as compared to the healthy adjacent tissue when measured electrochemically. These advances in DNA CT-based platforms have propelled this class of sensors from the purely academic realm into the realm of clinically relevant detection.

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I. THE CRYSTAL STRUCTURE OF A NEW DIMER OF TRIPHENYLFLUOROCYCLOBUTADIENE

The crystal structure of thermal isomer of the “head-to-head” dimer of triphenylfluorocyclobutadiene was determined by the direct method. The Σ2 relationship involving the low angle reflections with the largest E’s were found and solved for the signs by the symbolic method of Zachariasen. The structure was seen in the electron density map and the E-map, and was refined antisotropically by the method of least squares. The residual R was 0.065.

The structure is a gem-difluorohexaphenyldihydropentalene. All of the phenyl groups are planar as it is the cyclopentadiene ring of the dihydropentalene skeleton. Overcrowding at the position of the flourines causes some deviations from the normal bond angles in the cyclopentene ring.

The list of observed and calculated structure factors on pages 32-34 will not be legible on the microfilm. Photographic copies may be obtained from the California Institute of Technology.

II. A LOW TEMPERATURE REFINEMENT OF THE CYANURIC TRIAZIDE STRUCTURE

The structure of cyanuric triazide was refined anisotropically by the method of least squares. Three-dimensional intensity data, which has been collected photographically with MoKα radiation at -110˚C, were used in the refinement. The residual R was reduced to 0.081.

The structure is completely planar, and there is no significant bond alternation in the cyanuric ring. The packing of the molecules causes the azide groups to deviate from linearity by 8 degrees.

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No Brasil, a contaminação do solo por derramamentos de combustíveis representa um dos mais graves problemas ambientais e o impacto da introdução de novas misturas como diesel/biodiesel na matriz energética requer investigação quanto a tecnologias apropriadas de remediação. O presente estudo teve por objetivo avaliar diferentes estratégias de biorremediação no tratamento de solo contaminado experimentalmente com óleo diesel B5. Foram conduzidos três experimentos. No primeiro, quatro microcosmos em duplicata, contendo 500 g de solo e 5% (p/p) de óleo diesel B5, todos suplementados com oxigênio através de revolvimento manual e com ajuste de umidade, tiveram como tratamentos: bioestímulo com ajuste de pH (BE1); bioestímulo com ajuste de pH e nutrientes (BE2); bioaumento com ajuste de pH, nutrientes e adição de consórcio microbiano comercial KMA (BAM) e; controle abiótico, com ajuste de pH e solo esterilizado em autoclave (PA). Paralelamente, foi conduzido tratamento por bioaumento com ajuste de pH e nutrientes, suplementação de oxigênio e consórcio KMA, em solo contaminado apenas por diesel a 5% (BAD). A população microbiana foi monitorada através da contagem de UFC e os tratamentos, avaliados pela remoção de carbono orgânico e de hidrocarbonetos de petróleo (n-alcanos C10-C36). No segundo experimento, o metabolismo microbiano aeróbio foi avaliado através da produção de CO2 em respirômetros de Bartha (triplicatas), em solo contaminado com 5% (p/p) de óleo diesel B5, ajustado para pH e umidade, nas seguintes condições: solo com adição do consórcio KMA; solo com adição de cultura microbiana obtida a partir de outro solo proveniente de um posto de combustível com histórico de vazamento de tanques (RES) e; solo esterilizado por adição de azida de sódio a 0,3% (p/p). Como controle, solo sem contaminação, com sua população microbiana autóctone. No terceiro experimento, a capacidade da microbiota autóctone (EX), assim como do consórcio KMA e da cultura RES, em biodegradar óleo diesel B5, diesel e biodiesel de soja foi testada através do uso de indicadores de oxirredução DCPIP e TTC. Os experimentos em microcosmos indicam que houve uma complementaridade metabólica entre a população nativa e o consórcio comercial de microorganismos KMA, cuja presença promoveu um decaimento mais rápido de n-alcanos nas primeiras semanas do experimento. No entanto, após 63 dias de experimento, os tratamentos BAM, BAD e BE2 apresentaram, respectivamente, em média, 92,7%, 89,4% e 81,7% de remoção dos hidrocarbonetos n-alcanos C10-C36, sendo tais diferenças, sem significância estatística. Nos respirômetros, o bioaumento com cultura microbiana RES apresentou a maior produção de CO2 e a maior remoção de hidrocarbonetos (46,2%) após 29 dias. Tanto nos ensaios em microcosmos quanto nos respirométricos, não foi possível estimar a contribuição dos processos abióticos, tendo em vista evidências da existência de atividade microbiana no solo esterilizado térmica ou quimicamente. Os ensaios com os dois indicadores redox mostraram que apenas a microbiota nativa do solo em estudo e a cultura microbiana RES apresentaram potencial para degradar óleo diesel B5, biodiesel de soja ou diesel, quando colocadas em meio mineral contendo tais combustíveis como única fonte de carbono.

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Nesse trabalho foram realizadas reações de substituição nucleofílica (SN2), utilizando aquecimento térmico convencional e por irradiação de micro-ondas (MO), de alguns átomos cloro em amostras comerciais de poli(cloreto de vinila) (PVC), por grupos nitrila e também por grupos azida. Os grupos nitrila e azida foram substituidos na matriz em diferentes teores (10% e 20%). As reações do PVC com azida foram eficazes, apresentado percentuais de derivatização muito próximos dos valores desejados. Já no estudo com a nitrila não foi obtido o resultado esperado. Os copolímeros PVC azido substituídos foram modificados com propargilato de etila, sob catálise de iodeto de cuproso (CuI), para a obtenção de heterocíclicos do tipo triazólicos. Todos os copolímeros obtidos foram caracterizados por espectroscopia na região do infravermelho (FTIR) e os teores de nitrogênio incorporado foram determinados por análise elementar (AE). Através da análise dos dados obtidos, foi comprovado que a utilização da irradiação micro-ondas, quando comparada ao aquecimento convencional, é um processo mais seletivo e diminui, significativamente, os tempos de reação

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Didaticamente, podemos dividir o espectro da radiação ultravioleta (UV) em três faixas: UVA (400 a 320 nm), UVB (320 a 290 nm) e UVC (290 a 100 nm). Apesar do UVC ou UV-curto ser eficientemente filtrado pela camada de ozônio da Terra e sua atmosfera, este é uma das faixas do espectro de UV mais usadas para explorar as consequências de danos causados ao DNA, já que a letalidade induzida por este agente está relacionada aos danos diretos no genoma celular, como as lesões dímero de pirimidina, que são letais se não reparadas. Contudo, demonstrou-se que a radiação UVC pode gerar espécies reativas de oxigênio (ERO), como o oxigênio singleto (1O2). Embora, o radical hidroxil (OH) cause modificações oxidativas nas bases de DNA, alguns trabalhos indicam que o 1O2 também está envolvido nos danos oxidativos no DNA. Esta ERO é produzida por vários sistemas biológicos e reações fotossensibilização, quando cromóforos são expostos à luz visível ou são excitados pela luz UV, permitindo que essa energia possa ser transferida para o oxigênio sendo convertido em 1O2, que é conhecido por modificar resíduos de guanina, gerando 8-oxoG, que caso não seja reparada pode gerar uma transversão GC-TA. O objetivo deste trabalho foi o de elucidar a participação de ERO nos efeitos genotóxicos e mutagênicos gerados pela radiação UVC, assim como as enzimas envolvidas no processo de reparação destas lesões em células de Escherichia coli. Nos ensaios as culturas foram irradiadas com o UVC (254 nm; 15W General Electric G15T8 germicidal lamp, USA). Nossos resultados mostram que o uso de quelantes de ferro não alterou a letalidade induzida pelo UVC. A azida sódica, um captador de 1O2, protegeu as cepas contra os danos genotóxicos gerados pelo UVC e também diminuiu a frequência de mutações induzidas no teste com rifampicina. A reversão específica GC-TA foi induzida mais de 2,5 vezes no ensaio de mutagênese. A cepa deficiente na proteína de reparo Fpg, enzima que corrige a lesão 8-oxoG, apresentou menos quebras no DNA do que a cepa selvagem no ensaio de eletroforese alcalina. A letalidade induzida pelo UVC foi aumentada nos mutantes transformados com o plasmídeo pFPG, ao mesmo tempo que representou uma redução na indução mutagênica. Houve dimuição na eficiência de transformação com plasmídeo pUC 9.1 na cepa fpg quando comparado a cepa selvagem. Assim como, um aumento da sensibilidade ao UVC na associação entre mutantes fpg e uvrA. Estes resultados mostram que o 1O2 participa dos danos induzidos pelo UVC, através da geração da lesão 8-oxoG, uma lesão mutagênica, que é reparada pela proteína Fpg

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Neste trabalho foi realizada a modificação química do poli(cloreto de vinila) (PVC) pela sua reação com azida de sódio, onde alguns dos seus átomos de cloro foram substituídos por azidas. Em seguida o grupo incorporado foi transformado em triazóis por uma reação de cicloadição 1,3 entre o polímero modificado e propiolato de etila, sendo a reação catalisada por iodeto de cobre. Essas reações foram conduzidas sob aquecimento convencional e empregando irradiação de micro-ondas. Inicialmente, a reação incorporou 20% de triazol no PVC, sendo avaliadas as condições reacionais ideais. Essas condições foram usadas para a formação de novos copolímeros com diferentes teores de triazóis incorporados. Os produtos obtidos foram usados para o suporte de paládio que é utilizado como catalisador na reação de Suzuki-Miyaura. Todos os copolímeros foram caracterizados por espectroscopia na região do infravermelho com transformada de Fourier (FTIR)