Exploration du nord-ouest du Spitsberg entreprise sous les auspices de S.A.S. le prince de Monaco par la Mission Isachsen.

fasc.44 [Exploration pt.5] (1913-1914)

Mapping of the healthy immunoglobulin repertoire over the course of B cell maturation by deep pyrosequencing

Healthy immunoglobulin repertoire has not been extensively evaluated reflecting in part the challenge of generating sufficiently robust data sets by conventional clonal sequencing. Deep sequencing has revolutionized the capacity to evaluate the depth and breadth of the Ig repertoire along the B cell developmental pathway, and can be used to pin point defect(s) of primary or acquired B-cell associated diseases. In this study healthy IgM and IgG repertoires were studied by 454-pyrosequencing to establish the healthy controls for diseased repertoires. (...)

Limb-girdle Muscular Dystrophy Type 2A Can Result from Accelerated Autoproteolytic Inactivation of Calpain 3.

Loss-of-function mutations in calpain 3 have been shown to cause limb-girdle muscular dystrophy type 2A (LGMD2A), an autosomal recessive disorder that results in gradual wasting of the muscles of the hip and shoulder areas. Due to the inherent instability of calpain 3, recombinant expression of the full-length enzyme has not been possible, making in vitro analysis of specific LGMD2A-causing mutations difficult. However, because calpain 3 is highly similar in amino acid sequence to calpain 2, the recently solved crystal structure of full-length, Ca2+-bound, calpastatin-inhibited rat calpain 2 has allowed us to model calpain 3 as a Ca2+-bound homodimer. The model revealed three distinct areas of the enzyme that undergo a large conformational change upon Ca2+-binding. Located in these areas are several residues that undergo mutation to cause LGMD2A. We investigated the in vitro effects of six of these mutations by making the corresponding mutations in rat calpain 2. All six mutations examined in this study resulted in a decrease in enzyme activity. All but one of the mutations caused an increased rate of autoproteolytic degradation of the enzyme as witnessed by SDS-PAGE, indicating the decrease in enzyme activity is caused, at least in part, by an increase in the rate of autoproteolytic degradation. The putative in vivo effects of these mutations on calpain 3 activity are discussed with respect to their ability to cause LGMD2A.

IS6110 restriction fragment length polymorphism of Mycobacterium tuberculosis isolated from patients with pulmonary tuberculosis in Campinas, Brazil: evidence of intercontinental distribution of strains

Tuberculosis (TB) is a major concern in developing countries. In Brazil, few genotyping studies have been conducted to verify the number of IS6110 copies present in local prevalent strains of Mycobacterium tuberculosis, the distribution and clustering of strains. IS6110 DNA fingerprinting was performed on a sample of M. tuberculosis isolates from patients with AFB smear-positive pulmonary TB, at a hospital in Brazil. The IS6110 profiles were analyzed and compared to a M. tuberculosis database of the Houston Tuberculosis Initiative, Houston, US. Seventy-six fingerprints were obtained from 98 patients. All M. tuberculosis strains had an IS6110 copy number between 5-21 allowing for differentiation of the isolates. Human immunodeficiency virus infection was confirmed in nearly half the patients of whom data was available. Fifty-eight strains had unique patterns, while 17 strains were grouped in 7 clusters (2 to 6 strains). When compared to the HTI database, 6 strains matched isolates from El Paso, Ciudad de Juarez, Houston, and New York. Recently acquired infections were documented in 19% of cases. The community transmission of infection is intense, since some clustered strains were recovered during the four-year study period. The intercontinental dissemination of M. tuberculosis strains is suspected by demonstration of identical fingerprints in a distant country.

Marked hemiatrophy in carriers of Duchenne muscular dystrophy.

OBJECTIVE: To describe the clinical and molecular genetic findings in 2 carriers of Duchenne muscular dystrophy (DMD) who exhibited marked hemiatrophy. Duchenne muscular dystrophy is an X-linked disorder in which affected male patients harbor mutations in the dystrophin gene. Female patients with heterozygous mutations may be manifesting carriers. DESIGN: Case study. SETTING: Neurology clinic. PATIENTS: Two manifesting carriers of DMD. INTERVENTIONS: Clinical and radiologic examinations along with histologic and molecular investigations. RESULTS: Both patients had marked right-sided hemiatrophy on examination with radiologic evidence of muscle atrophy and fatty replacement on the affected side. In each case, histologic analysis revealed a reduction in dystrophin staining on the right side. Genetic analysis of the dystrophin gene revealed a tandem exonic duplication in patient 1 and a multiexonic deletion in patient 2 with no further point mutations identified on the other chromosome. CONCLUSIONS: Marked hemiatrophy can occur in DMD manifesting carriers. This is likely to result from a combination of skewed X-inactivation and somatic mosaicism.

Outbreak of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae: two-year epidemiologic follow-up in a tertiary hospital

This study describes a carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae (CRKP) outbreak that occurred from October 2008-December 2010. Polymerase chain reaction assays were performed to detect the blaKPC gene and molecular typing was performed using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). There were 33 CRKP infections; PFGE revealed five genotypes: genotype A in five (15%), B in 18 (55%), C in eight (24%) and two unique profiles. Genotype B was disseminated in all hospital units and belonged to the same clone identified in 11 different hospitals in the state of São Paulo. Sixteen (48%) patients died. Seven isolates (21%) were resistant to polymyxin B and 45% were resistant to tigecycline and amikacin.

Complete genome of the multidrug-resistant Acinetobacter baumannii strain KBN10P02143 isolated from Korea

Acinetobacter baumannii, a strictly aerobic, non-fermentative, Gram-negative coccobacillary rod-shaped bacterium, is an opportunistic pathogen in humans. We recently isolated a multidrug-resistant A. baumannii strain KBN10P02143 from the pus sample drawn from a surgical patient in South Korea. We report the complete genome of this strain, which consists of 4,139,396 bp (G + C content, 39.08%) with 3,868 protein-coding genes, 73 tRNAs and six rRNA operons. Identification of the genes related to multidrug resistance from this genome and the discovery of a novel conjugative plasmid will increase our understanding of the pathogenicity associated with this species.

A Nested Case-Control Study of Metabolically Defined Body Size Phenotypes and Risk of Colorectal Cancer in the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC).

BACKGROUND Obesity is positively associated with colorectal cancer. Recently, body size subtypes categorised by the prevalence of hyperinsulinaemia have been defined, and metabolically healthy overweight/obese individuals (without hyperinsulinaemia) have been suggested to be at lower risk of cardiovascular disease than their metabolically unhealthy (hyperinsulinaemic) overweight/obese counterparts. Whether similarly variable relationships exist for metabolically defined body size phenotypes and colorectal cancer risk is unknown. METHODS AND FINDINGS The association of metabolically defined body size phenotypes with colorectal cancer was investigated in a case-control study nested within the European Prospective Investigation into Cancer and Nutrition (EPIC) study. Metabolic health/body size phenotypes were defined according to hyperinsulinaemia status using serum concentrations of C-peptide, a marker of insulin secretion. A total of 737 incident colorectal cancer cases and 737 matched controls were divided into tertiles based on the distribution of C-peptide concentration amongst the control population, and participants were classified as metabolically healthy if below the first tertile of C-peptide and metabolically unhealthy if above the first tertile. These metabolic health definitions were then combined with body mass index (BMI) measurements to create four metabolic health/body size phenotype categories: (1) metabolically healthy/normal weight (BMI < 25 kg/m2), (2) metabolically healthy/overweight (BMI ≥ 25 kg/m2), (3) metabolically unhealthy/normal weight (BMI < 25 kg/m2), and (4) metabolically unhealthy/overweight (BMI ≥ 25 kg/m2). Additionally, in separate models, waist circumference measurements (using the International Diabetes Federation cut-points [≥80 cm for women and ≥94 cm for men]) were used (instead of BMI) to create the four metabolic health/body size phenotype categories. Statistical tests used in the analysis were all two-sided, and a p-value of <0.05 was considered statistically significant. In multivariable-adjusted conditional logistic regression models with BMI used to define adiposity, compared with metabolically healthy/normal weight individuals, we observed a higher colorectal cancer risk among metabolically unhealthy/normal weight (odds ratio [OR] = 1.59, 95% CI 1.10-2.28) and metabolically unhealthy/overweight (OR = 1.40, 95% CI 1.01-1.94) participants, but not among metabolically healthy/overweight individuals (OR = 0.96, 95% CI 0.65-1.42). Among the overweight individuals, lower colorectal cancer risk was observed for metabolically healthy/overweight individuals compared with metabolically unhealthy/overweight individuals (OR = 0.69, 95% CI 0.49-0.96). These associations were generally consistent when waist circumference was used as the measure of adiposity. To our knowledge, there is no universally accepted clinical definition for using C-peptide level as an indication of hyperinsulinaemia. Therefore, a possible limitation of our analysis was that the classification of individuals as being hyperinsulinaemic-based on their C-peptide level-was arbitrary. However, when we used quartiles or the median of C-peptide, instead of tertiles, as the cut-point of hyperinsulinaemia, a similar pattern of associations was observed. CONCLUSIONS These results support the idea that individuals with the metabolically healthy/overweight phenotype (with normal insulin levels) are at lower colorectal cancer risk than those with hyperinsulinaemia. The combination of anthropometric measures with metabolic parameters, such as C-peptide, may be useful for defining strata of the population at greater risk of colorectal cancer.

Radiolabeling of monoclonal antibody against carcinoembryonic antigen with 88Y and biodistribution studies.

The biodistribution of the 202 monoclonal antibody against CEA labeled with 88Y by the bicyclic DTPA anhydride method was studied in normal Balb/c mice. The in vitro binding to 1 X 10(7) CO112, LS174T and WiDR colon cancer cells was 21.0, 27.3 and 18.8%, respectively. The binding to an equal number of KM-3 leukemia cells and normal human lymphocytes was 8.9 and 3.2%, respectively. Liver, spleen, kidney and blood were the tissues that showed the highest uptake of radiolabeled antibody in vivo.

Systematic molecular and cytogenetic screening of 100 patients with marfanoid syndromes and intellectual disability.

The association of marfanoid habitus (MH) and intellectual disability (ID) has been reported in the literature, with overlapping presentations and genetic heterogeneity. A hundred patients (71 males and 29 females) with a MH and ID were recruited. Custom-designed 244K array-CGH (Agilent®; Agilent Technologies Inc., Santa Clara, CA) and MED12, ZDHHC9, UPF3B, FBN1, TGFBR1 and TGFBR2 sequencing analyses were performed. Eighty patients could be classified as isolated MH and ID: 12 chromosomal imbalances, 1 FBN1 mutation and 1 possibly pathogenic MED12 mutation were found (17%). Twenty patients could be classified as ID with other extra-skeletal features of the Marfan syndrome (MFS) spectrum: 4 pathogenic FBN1 mutations and 4 chromosomal imbalances were found (2 patients with both FBN1 mutation and chromosomal rearrangement) (29%). These results suggest either that there are more loci with genes yet to be discovered or that MH can also be a relatively non-specific feature of patients with ID. The search for aortic complications is mandatory even if MH is associated with ID since FBN1 mutations or rearrangements were found in some patients. The excess of males is in favour of the involvement of other X-linked genes. Although it was impossible to make a diagnosis in 80% of patients, these results will improve genetic counselling in families.

Uhkaava ennenaikainen synnytys: hoitotyön prosessi Naistenklinikan osastolla 42 kätilöiden kokemana

Opinnäytetyön tarkoituksena oli selvittää ja kuvata miten hoitotyön prosessi etenee uhkaavassa ennenaikaisessa synnytyksessä Naistenklinikan osastolla 42 kätilöiden näkökulmasta. Lisäksi selvitettiin, minkälaisia haasteita uhkaavan ennenaikaisen synnytyksen hoitotyön prosessissa ilmenee. Opinnäytetyön tutkimusaineisto koottiin haastattelemalla viittä Naistenklinikan osastolla 42 työskentelevää kätilönä. Haastattelut toteutettiin teemahaastatteluina. Teemahaastatteluiden avulla pyrittiin saamaan vastauksia tutkimusongelmiin, jotka oli laadittu perehtymällä aihetta käsitteleviin tutkimuksiin ja kirjallisuuteen. Saatu tutkimusaineisto analysoitiin induktiivisen sisällönanalyysin avulla. Tulosten mukaan uhkaavan ennenaikaisen synnytyksen hoidossa kätilön rooli korostuu potilaan kokonaistilanteen kartoittamisessa sekä äidin fyysisen, psyykkisen ja sosiaalisen hyvinvoinnin tukemisessa. Osastolla toteutettavaa hoitoa ohjaavat lääkärin antamat yksilölliset hoito-ohjeet ja määräykset, mutta kätilöillä on myös oma hoitotyön näkökulma työskentelyssään äitien kanssa. Kätilötyön näkökulmasta uhkaavan ennenaikaisen synnytyksen hoito koostuu äidin ja sikiön fyysisen hyvinvoinnin sekä äidin psyykkisen ja sosiaalisen hyvinvoinnin tukemisesta. Fyysisen hyvinvoinnin tukemiseen kuuluvat lepohoidosta ja lääkehoidosta huolehtiminen, supistusten, vuotojen ja infektio-oireiden seuranta sekä sikiön voinnin tarkkailu. Psyykkisestä ja sosiaalisesta hyvinvoinnista huolehditaan pyrkimällä antamaan äideille riittävästi tukea, tietoa ja ohjausta sekä huomioimalla myös potilaan muun perheen jaksaminen. Uhkaavan ennenaikaisen synnytyksen hoito on moniammatillista yhteistyötä, jossa kätilö toimii hoitotiimin koordinaattorina. Haasteellisimmaksi asiaksi hoitotyössä haastatteluihin osallistuneet kätilöt nimesivät äitien psyykkisen hyvinvoinnin tukemisen. Tämän opinnäytetyön tutkimustuloksia voidaan hyödyntää uhkaavan ennenaikaisen synnytyksen hoitotyön prosessin arvioinnissa ja kehittämisessä Naistenklinikan osastolla 42. Lisäksi tätä opinnäytetyötä tullaan käyttämään lähteenä, kun osastolla 42 tehdään prosessikuvaus uhkaavan ennenaikaisen synnytyksen hoidosta ja hoitopolusta.

Asiakaspalvelun merkitys kahvila-ravintolan tulokseen

Opinnäytetyömme tarkoitus oli tutkia asiakaspalvelun merkitystä tulokseen kahvila-ravintolassa. Pääongelmana tutkimuksessa oli, että miten asiakaspalvelulla saadaan aikaan parempi tulos. Tutkimuksen alaongelmana oli, että miten asiakaspalvelija voi palvelullaan vaikuttaa tulokseen.

"Pippalot leikkihuoneen lattialla" : musiikki ja leikki lasten pelon- ja kivunlievitysmenetelminä sairaalassa

Tässä opinnäytetyössä selvitetään, miten sairaanhoitajat käyttävät musiikkia ja leikkiä leikki-ikäisen lapsen (1-6 v.) pelon ja kivunlievitysmenetelminä. Työssä kartoitetaan, mitä musiikkiin ja leikkiin liittyviä keinoja sairaanhoitajat käyttävät, miten ja missä tilanteissa he käyttävät näitä menetelmiä, mikä merkitys menetelmillä on sekä mitä estäviä ja edistäviä tekijöitä kyseisten menetelmien käyttöön liittyy. Opinnäytetyö on osa 5-vuotista hoitotyön tutkimus- ja kehittämishanketta, joka tehdään yhteistyössä HUS Lasten ja nuorten sairaalan, Turun yliopiston ja Helsingin ammattikorkeakoulu Stadian kanssa. Opinnäytetyön aineistona oli kuuden lastensairaanhoitajan teemahaastattelu. Haastattelu tehtiin ryhmässä ja nauhoitettiin nauhurille. Tutkimustulokset analysoitiin laadullisen tutkimusaineiston sisällönanalyysimenetelmällä. Sairaanhoitajat käyttävät pelon ja kivun lievityksessä musiikkia ja leikkiä monipuolisesti monessa eri tilanteessa. Musiikin ja leikin valintaa ohjaavat lapsesta, hoitajasta, resursseista ja ympäristöstä johtuvat tekijät. Musiikin ja leikin käytöllä on ainoastaan positiivisia vaikutuksia ja ne ulottuvat lapsen lisäksi hoitajaan, vanhempiin ja hoitoympäristöön. Musiikin ja leikin käyttöä estävät pääasiassa hoitajan kokemattomuus ja taidottomuus, sairaalaympäristöstä johtuvat rajoitukset sekä resurssien vähyys. Edistävistä tekijöistä korostuvat hoitajan taidot, kokemus ja ominaisuudet, materiaalin saatavuus sekä salliva työyhteisö. Musiikkia ja leikkiä käytetään pelon ja kivun lievityksessä nykyään enemmän kuin ennen, mutta käyttöä on vielä lisättävä. Tulosten avulla sairaanhoitajat voivat tarkastella työskentelyään ja laajentaa osaamistaan ja näkökulmaansa lastensairaanhoidossa. Musiikin ja leikin käyttöä estäviin tekijöihin voidaan tulosten avulla puuttua ja tehdä tarvittavia toimenpiteitä niiden vähentämiseksi. Jatkossa voitaisiin tutkia vanhempien näkemyksiä musiikin ja leikin käytöstä pelon ja kivun lievityksessä.

Hereillä konsertissa : konserttikäynti osana musiikin perusteiden opetusta

Esittelen opinnäytetyössäni konserttikäyntiprojektia, jonka toteutin Helsingin Konservatorion musiikin perusteiden (säveltapailu ja musiikinteoria) ryhmieni kanssa lukuvuonna 2004-2005. Keskeistä projektissa oli konsertissa kuultavaan teokseen, Antonín Dvořákin yhdeksänteen sinfoniaan tutustuminen tunneilla ennen varsinaista konserttikäyntiä. Ennen konserttia tunneilla tehdyn pohjatyön avulla tahdoin tarjota oppilailleni mahdollisuuden erilaiseen konserttikokemukseen sekä testata omaa oletustani, jonka mukaan kuunteleminen ja keskittyminen konsertissa saattaa olla helpompaa, jos esitettäviä teoksia tuntee etukäteen. Projektin onnistumista sekä opetuksen ja konserttikäynnin tällaisen yhdistämisen mielekkyyttä tarkastelen oppilailta keräämäni palautteen avulla. Konserttikäyntien käytännön järjestelyihin ei ole olemassa erityisiä ohjeita, mutta suuria oppilasryhmiä liikutellessaan opettajan täytyy osata huomioida monenlaisia asioita. Minulle, työurani alussa olevalle nuorelle opettajalle, projekti toimi siis myös käytännön harjoitustehtävänä konserttikäynnin järjestämisestä. Selvitellessäni opettajan vastuuseen liittyviä kysymyksiä kävi ilmi, että musiikkiopistopuolella vastuuasioihin liittyvä ohjeistus on pitkälti oppilaitoskohtaista ja vielä varsin jäsentymätöntä. Yhteiset pelisäännöt valtakunnallisella tasolla tulisivat varmasti tarpeeseen. Oppilailta keräämäni palaute vahvisti käsitystäni konserttikäyntien tärkeydestä musiikin perusteiden opetuksessa. Erityisesti vakuutuin siitä, että valmistautuminen auttaa monia lapsia keskittymään kuuntelemiseen konsertissa. Työn konkreettisia tuloksia ovat pohjatyötä varten valmistamani nuottimateriaalisivut, joita voi käyttää opetusmateriaalina Dvořákin yhdeksännestä sinfoniasta. Toivoisin tämän opinnäytetyön rohkaisevan opettajia näkemään vaivaa konserttikäyntien järjestämiseksi sekä auttavan aloittelijoita tiedostamaan huomionarvoisia asioita käytännön työvaiheissa. Asiasta kiinnostuneille kuten oppilaille, heidän vanhemmilleen ja muiden aineiden opettajille opinnäytetyöni tarjoaa lisäksi esimerkin musiikin perusteiden opiskelusta.