草鱼免疫球蛋白M重链基因的克隆及表达

用RACE-PCR方法扩增出草鱼免疫球蛋白M(immunoglobulin M,IgM)分泌型的重链全长cDNA。其cDNA全长为1 940nt,包含5′非编码区20nt,3′非编码区189nt,开放阅读框1 731nt,编码576个氨基酸。序列比对分析表明草鱼IgM与鲤的相似性高达68%,与斑马鱼、斑点叉尾鱼回、鳜以及大西洋鳕的相似性分别为61%、43%、33%和30%。ClustalX比对结果显示:草鱼IgM中存在半胱氨酸和色氨酸的保守位点。进化分析表明,草鱼IgM与斑马鱼的IgM聚为一枝。荧光定量P

黄鳝cGnRH-Ⅱ的cDNA克隆与序列分析

促性腺激素释放激素(Gonadotropin-releasing hormone,GnRH)是一个保守的十肽神经家族激素,在脊椎动物的性腺发育和繁殖功能的维持方面起着重要的调控作用。本文通过运用RACE和RT-PCR方法,从黄鳝脑组织中克隆得到cGnRH-ⅡcDNA全序列,其核苷酸序列长度为617bp。该cDNA编码的cGnRH-Ⅱ的前体氨基酸序列结构组成与其他物种的cGnRH-Ⅱ前体结构一致,其推导的蛋白前体长度为83个氨基酸,包括一个信号肽、cGnRH-Ⅱ十肽和一个由蛋白水解位点(Gly-Lys-Ar

银鲫pou2基因在胚胎发育过程中的时空表达图式

用RACE-PCR方法从原肠期SMART文库中扩增到银鲫pou2基因的全长cDNA,其全长为2421bp,开放阅读框为1416bp,编码471个氨基酸,与斑马鱼pou2基因的氨基酸序列一致性高达91.0%。我们用RT-PCR和整体原位杂交的方法研究了银鲫pou2基因在胚胎发育过程中的时空表达图式。RT-PCR结果显示,银鲫pou2基因有母源转录本,其合子基因在高囊胚期强烈表达,在50%下包期和90%下包期也有高量的转录本,但在100%下包期表达量急剧降低,至体节期时已经完全检测不到其转录本。胚胎整体原位杂

鲤鱼(Cyprinus carpio L．)GH受体的分子克隆及其两种转录子的发现

应用反转录-PCR及RACE技术,从二龄鲤鱼肝组织中克隆了生长激素受体(GHR)的全长基因,其开放阅读框编码602个氨基酸,其中包括244个氨基酸的胞外激素结合结构域,24个氨基酸的跨膜区域和334个氨基酸的胞内信号传导区域．序列分析表明：无论在基因水平还是蛋白质水平,鲤鱼GHR与鲫鱼GHR均具有较高的同源性．用一对基因特异性引物在研究二龄鲤鱼GHR的组织分布时发现：肝与其他组织的扩增产物大小不一致(肝组织中的约小100 bp),测序结果以及基因组PCR表明这是由于一个97 bp的内含子选择性剪切造成的．

鲢(Hypophthalmichthys molitrix)IL-10基因的克隆及表达分析

白细胞介素10(IL-10)是一种作用广泛的抗炎细胞因子,主要功能是限制和最终终止炎症反应．用RACE(rapid amplification of cDNA ends)-PCR方法扩增出鲢白细胞介素10(IL-10)的 cDNA,其全长为1248nt,包含5’非编码区156 nt,3’非编码区552nt,开放阅读框540nt．鲢IL- 10的开放阅读框编码179个氨基酸,其中包含构成两对二硫键的4个保守半胱氨酸．RT-PCR结果显示鲢IL-10 mRNA主要在脾脏、鳃、头肾和肌肉中表达．将鲢IL-10完

The Silent Period of Evidence Integration in Fast Decision Making

In a typical experiment on decision making, one out of two possible stimuli is displayed and observers decide which one was presented. Recently, Stanford and colleagues (2010) introduced a new variant of this classical one-stimulus presentation paradigm to investigate the speed of decision making. They found evidence for "perceptual decision making in less than 30 ms". Here, we extended this one-stimulus compelled-response paradigm to a two-stimulus compelled-response paradigm in which a vernier was followed immediately by a second vernier with opposite offset direction. The two verniers and their offsets fuse. Only one vernier is perceived. When observers are asked to indicate the offset direction of the fused vernier, the offset of the second vernier dominates perception. Even for long vernier durations, the second vernier dominates decisions indicating that decision making can take substantial time. In accordance with previous studies, we suggest that our results are best explained with a two-stage model of decision making where a leaky evidence integration stage precedes a race-to-threshold process. © 2013 Rüter et al.

银鲫Ran基因的cDNA克隆、表达特征及其在精核解凝中的作用

采用RACE-PCR技术结合SMART cDNA合成技术,从银鲫中克隆到Ran的全长cDNA并对其编码区全长进行了原核表达、相应抗体制备及其时空表达特征分析。RT-PCR结果表明,Ran基因除在脑组织的转录水平较低外,其它组织中的转录水平几乎相同;Ran基因在不同发育阶段的胚胎中都有mRNA转录,但其mRNA的量在原肠期以后呈下降趋势。Western blot结果表明,Ran在卵巢和精巢中均高水平表达,在心、脑、肝、脾、肾中有较低水平表达,在肌肉中则不表达。同时检测到Ran在不同胚胎发育阶段均有较强表达。

鳜IL-1β基因的克隆及原核表达

用RACE PCR获得了鳜白介素-1β(IL-1β)的全长cDNA.鳜IL-1β的cDNA全长为1298 nt(核苷酸),其5′非编码区包含UTR 93 nt;3′非编码区包含452 nt;其开放阅读框内包含753 nt,翻译成251个氨基酸.将鳜IL-1β克隆到原核表达载体pET-32a上,在大肠杆菌Rosetta- gami(DE3)内以包涵体形式得以高效表达.

鲤鱼两个cGnRH-Ⅱ基因的发现及其在成熟个体的表达分析

促性腺激素释放激素(GnRH)是一个保守的神经十肽家族,在调节脊椎动物的性腺发育和控制性成熟中起至关重要的作用.用RACE和RT-PCR方法,从鲤鱼脑组织克隆得到两个差异的cGnRH-Ⅱ cDNAs序列,其长度分别为622,578 bp.两个cDNA编码的cGnRH-Ⅱ前体均为86个氨基酸,包括一个信号肽、cGnRH-Ⅱ十肽和一个由蛋白水解位点(Gly-Lys-Arg)连接的GnRH相关肽.内含子捕获和Southern杂交证实鲤鱼基因组中有两个cGnRH-Ⅱ编码基因,且两个基因都可能以单拷贝形式存在.鲤鱼

草鱼补体C3基因的克隆及在感染大中华鳋草鱼个体的表达分析

利用抑制差减杂交技术 ,构建了草鱼与大中华鳋感染相关的差减文库 ,测序得到一些免疫相关基因 ,其中包含与鲤补体C3高度同源的片段 .根据此片段设计引物 ,采用RACE(rapidamplificationofcDNAends)技术 ,克隆了草鱼补体C3的cDNA ,其全长5 171bp ,编码 16 77个氨基酸 .与已报道的补体C3一样 ,草鱼补体C3同样具有在功能上比较重要的残基以及保守的硫酯区 .草鱼补体C3与高等脊椎动物鸡、小鼠以及人的C3在氨基酸序列上有着相近的相同率 (37.9%～39.1%

鲤鱼sGnRH基因克隆及其在成熟个体的表达分析

采用RACE方法 ,从鲤鱼脑组织克隆了两个差异的sGnRH(salmonGnRH ,[Trp7Leu8]GnRH)cDNAs ,即cDNA1和cDNA2 ,其长度分别为 393和 4 78bp。两个cDNAs都包括一个 2 85bp开放阅读框 ,编码的sGnRH前体为 94个氨基酸残基 ,由一个信号肽、sGnRH十肽和一个由蛋白水解位点 (Gly Lys Arg)连接的促性腺激素释放激素相关肽共 3部分组成。用内含子捕获得到相应的两个差异sGnRH基因 ,即sGnRHgene1和 gene2 ,其基本结构