995 resultados para DNA array


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Para analisar cepas de Salmonella ser. Typhimurium isoladas de processos entéricos e extraintestinais humanos ocorridos no período de 1970 a 2008 de diferentes regiões do país foram selecionadas, com base nos registros contidos no banco de dados do Laboratório de Enterobactérias do IOC/FIOCRUZ, RJ, amostras do fagotipo prevalente 193, visando precipuamente o reconhecimento de clones epidêmicos. Foram selecionadas 553 cepas de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 representadas por 91, 65, 70 e 327 amostras referentes as décadas de 70, 80, 90 e ao período de 2000 a 2008, respectivamente. Na análise global da sensibilidade destas cepas, 52% apresentaram um ou mais marcadores de resistência a antibióticos incluídos no perfil ACSSuT. Este perfil de resistência completo foi verificado em 20,9% dos isolados, sendo os 21,9% restantes, sensíveis a todas as drogas testadas, especialmente no período de 2000 a 2008, representadas por 121 amostras (37,0%) em relação as 327 culturas dessa época. O maior percentual de resistência foi observado nas amostras da década de 70 (99%) sendo o perfil ACSSuT detectado em 35,2% dos isolados, ressaltando-se que todas as amostras foram isoladas de processos gastroentéricos ocorridos na cidade de São Paulo. Ao longo das quatro décadas de estudo, descreve-se um ponto de ruptura entre a prevalência de resistência e a suscetibilidade na transição entre as décadas de 80 e 90. Embora o número de isolados de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 tenha aumentado no último período considerado, o percentual de mono e multirresistência aos antimicrobianos se situou em nível elevado (63,0%). A análise do polimorfismo obtido após macrorrestrição com a enzima XbaI revelou que cepas isoladas na década de 90 apresentaram elevado percentual de similaridade (≥85%) com cepas isoladas recentemente (período de 2000-2008), sendo agrupadas nos mesmos subclusters. Por outro lado, as cepas da década de 70 inserem-se em subclusters independentes, embora o percentual de similaridade entre tais subclusters e os demais seja ≥70%; o mesmo sendo observado para as cepas isoladas durante a década de 80. Em conclusão, este estudo mostrou que a prevalência de isolados humanos de Salmonella ser. Typhimurium fagotipo 193 no Brasil vem progredindo desde a década de 1990, enquanto a detecção do modelo R (ACSSuT) está diminuindo e a avaliação através da PFGE indicou a presença de multiplicidade de perfis de macrorrestrição no fagotipo 193, entretanto com elevados percentuais de similaridade entre si, sugerindo alguma clonalidade, tendo em vista o período entre o isolamento e a análise

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The dot matrix hologram (DMH) has been widely used in anti-counterfeiting label. With the same technology and cell array configuration, we can encode to the incidence beam. These codes can be some image matrix grating with different grating gap and different grating orientation. When the multi-level phase diffractive grating is etched, the incidence beam on the cell appears as an encoding image. When the encoded grating and DMH are used in the same label synchronously, the technology of multi-encoded grating array enhances the anti-counterfeit ability.

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A novel Littman-Metcalf external cavity laser diode array with two feedback mirrors is introduced. The line-width broadening effect caused by smile can be reduced by the novel external cavity. At the drive current of 16A, the line-width is narrowed to 0.1nm from free-running width of 1.6nm with output efficiency of 84%.

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A novel off-axis external cavity is designed for laser diode array to improve the beam quality. In this external cavity, a circle aperture with variable size is used as a spatial filter. The diameter of aperture is optimized to 1.2mm and the off-axis angle of external cavity is optimized at 2.6 deg. In the optimal case, the beam parameter product (BPP) of laser diode array is reduced to 121 mm. mrad from 1050 mm. mrad with external cavity optical efficiency of 81%. (C) 2007 Optical Society of America.

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Phase locking of a two-dimensional fiber laser array is experimentally demonstrated by using a self-imaging resonator and a spatial filter. The stable beam profiles of in-phase mode and out-of-phase mode are observed by controlling the position of spatial filter. The phase locking fiber array with in-phase mode has produced 26 W coherent output. An antisymmetric eigenmode is also observed in our experiments. The phase locking is not sensitive to power variations among the pump beams and the configuration has the ability to repair a missing element. (C) 2008 American Institute of Physics.

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An analytical expression of a radial laser array for flat-topped beam is derived based on the generalized Collins formula. The intensity distribution of the resulting beam focused by a lens at the focus plane, for phase-locked and nonphase-locked cases, is studied numerically. The effect of the Fresnel number and normalized radius on intensity distribution for phase-locked and nonphase-locked cases is also presented. It is found that intensity distribution for nonphase-locked case is much less sensible to the Fresnel number and normalized radius than that of phase-locked case. (C) 2008 Elsevier Ltd. All rights reserved.

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Graded-index (GRIN) fiber lens arrays are fabricated from commercial GRIN fibers to collimate a high-power laser diode array. The beam divergence angles are reduced to 4.2 and 14.7 mrad in the fast and slow axes, respectively. The influences of smile and fluctuation in fiber length are discussed. Using an aspherical focal lens system, about 74% power can be launched into a fiber with a numerical aperture (NA) of 0.22 and a core diameter of 400 mu m. (c) 2008 Society of Photo-Optical Instrumentation Engineers.

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Zusammenfassung Zur Identifizierung der folgenden vier Welsarten bzw. zwei Hybriden (Clarias gariepinus, Pangasius hypophthalmus, Pseudoplatystoma spp., Silurus glanis, Claresse® und Melander®) wurden die isolektrische Fokussierung (IEF) der wasserlöslichen Muskelproteine und die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) zur Vervielfältigung und Sequenzierung eines Abschnittes aus dem Cytochrom b – Gen eingesetzt. Die IEF ergab artspezifische Proteinmuster mit hitzestabilen Proteinbanden im anodalen Gelbereich. Der afrikanische Wels (C. gariepinus) und das Hybriderzeugnis Melander® wiesen das gleiche Proteinmuster auf. Mittels DNA-Analyse ließen sich die Welsarten anhand ihrer Cytochrom b Gensequenzen eindeutig identifizieren. Auch hier zeigte der Welshybrid Melander® ein identisches Ergebnis wie der afrikanische Wels. Die Schwierigkeiten der Identifizierung von Tigerwelsen südamerikanischer Herkunft aus der Gattung Pseudoplatystoma werden diskutiert. Abstract Isoelectric focusing (IEF) of water soluble proteins and PCR-based DNA- analysis were used to differentiate between four catfish species (Clarias gariepinus, Pangasius hypophthalmus, Pseudoplatystoma spp., Silurus glanis) and two hybrids Claresse® and Melander®. Specific protein patterns have been obtained for all species and Claresse®, but in case of Melander® the identical pattern was observed as for the African catfish Clarias gariepinus. By sequencing the PCR products and application of BLAST, authenticity of the different catfish samples was confirmed. The cytochrome b gene sequences of Melander® and African catfish were identical. The difficulties of identifying catfishes of the genus Pseudoplatystoma are discussed.

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Os INDELs são polimorfismos de comprimento, gerados a partir de inserções e/ou deleções de um ou mais nucleotídeos. Os marcadores INDELs, que estão amplamente distribuídos pelo genoma e se caracterizam pela alta estabilidade devido à baixa taxa mutacional (10-9), podem ser analisados a partir da amplificação por PCR (Reação em Cadeia da Polimerase). A facilidade de análise e a possibilidade de construção de sistemas multiplex capazes de gerar amplicons curtos (menores que 100 pb) tornam os INDELs uma importante ferramenta para identificação humana por DNA. Para avaliar a eficiência e validar a metodologia que emprega os polimorfismos de inserção/deleção na identificação humana, utilizamos o sistema Indel-plex ID, capaz de amplificar simultaneamente 38 loci INDELs bialélicos de cromossomos autossomos. Diferentes amostras biológicas (cabelo, saliva, sangue, sêmen e urina) foram genotipadas apresentando reprodutibilidade entre todas as tipagens. A concentração mínima de DNA necessária para amplificação dos 38 loci INDELs foi de 0,5 ng. Artefatos do tipo split peaks foram observados em algumas amostras. Os produtos da PCR foram purificados em resina Sephadex proporcionando melhores condições de análise, redução de artefatos e aumento na intensidade média de fluorescência dos alelos amplificados. A eficiência do sistema Indel-plex ID na amplificação de DNA degradado foi verificada durante as análises das amostras de DNA extraídas de restos mortais (ossos e dentes). Comparativamente ao sistema Identifiler, o Indel-plex ID, se mostrou mais eficiente em termos de número de loci genotipados e qualidade de amplificação. Nas investigações de vínculos genéticos realizadas com o sistema Indel-plex ID foi possível corroborar resultados anteriores obtidos pela análise de marcadores STR. Nas análises com amostras in vivo foram obtidos valores máximos de Probabilidades de Paternidade de 99,99998%. Para casos envolvendo supostos pais falecidos, o sistema Indel-plex ID reforçou resultados obtidos com o sistema Identifiler e Minifiler. A Probabilidade de Paternidade de 99,953%, obtida com o sistema Indel-plex ID, conjugada com a Probabilidade de Paternidade de 99,957%, obtida como o sistema Minifiler, possibilitou um índice final de 99,99998%. Os resultados evidenciaram que os loci INDELs do sistema Indel-plex ID são altamente informativos, constituindo uma ferramenta importante em estudos de identificação humana e de relações de parentesco

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As porções uniparentais do genoma humano, representadas pelo cromossomo Y e pelo DNA mitocondrial (DNAmt), contêm informação genética relacionada às heranças patrilinear e matrilinear, respectivamente. Além da aplicabilidade em genética médica e forense, o DNAmt tem sido utilizado como um importante marcador molecular em estudos sobre evolução para traçar inferências filogenéticas e filogeográficas sobre as populações humanas. A análise de linhagens de DNAmt presentes em diferentes populações mundiais levou à identificação de haplogrupos reunindo diversos haplótipos específicos dos grandes grupos étnicos: africanos, europeus, asiáticos e nativos americanos. A população brasileira é conhecida como uma das mais heterogêneas do mundo, resultado do processo de colonização do país, abrangendo mais de cinco séculos de miscigenação entre povos de diferentes continentes. Este trabalho teve como objetivo estimar a partir da análise do DNA mitocondrial as proporções ancestrais africanas, européias e ameríndias na população do Rio de Janeiro. Para isso foram sequencidas as regiões hipervariáveis HVI e HVII do DNAmt de 109 indivíduos não relacionados geneticamente residentes no Rio de Janeiro. Os haplogrupos foram classificados de acordo com o conjunto de polimorfismos dos haplótipos individuais. Programas estatísticas foram utilizados para a determinação de parâmetros de diversidade genética e comparações populacionais. A diversidade haplotípica foi estimada em 0,9988. Nossos resultados demonstraram na população do Rio de Janeiro percentuais de cerca de 60%, 25% e 15% de ancestralidades maternas africana, ameríndia e européia, respectivamente. Através da análise de distâncias genéticas, evidenciou-se que a população do Rio de Janeiro está mais próxima das populações brasilerias dos estados de São Paulo e Alagoas. Como descrito nos registros históricos, algumas regiões do país tiveram processos de colonização muito específicos que se refletem nas proporções ancestrais maternas e paternas observadas. Em relação ao DNAmt, não se verificou diferença genética significativa entre as populações do Rio de Janeiro e a de Angola, uma população africana. Os resultados obtidos estão em estreita concordância com os registros históricos e outros estudos genéticos acerca da formação da população brasileira

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Microvoid arrays were self-organized when femtosecond laser beam was tightly focused at a fixed point inside CaF2 crystal sample. Except void array grown below the focal point which had been reported before, we found another void array grown vertical to the laser propagation direction. This result has potential application in the fabrication of integrated micro-optic elements and photonic crystals. The possible mechanism of the phenomenon was proposed and verified experimentally.

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[ES]El objetivo final del trabajo fin de grado, que se expone en este documento, trata sobre el diseño de un array de antena de microstrip, con la intención de que se utilice para aplicaciones de comunicación entre vehículos que trabajen en la banda de los 5 GHz, bajo el estándar ITS-G5/IEEE 802.11p, además de su fabricación y medición posterior para poder compararlos con las simulaciones. Se buscará que la ganancia de la antena sea la máxima posible pero tratando de conseguir a su vez el mayor ancho de banda dentro del rango de frecuencias requerido. Para el diseño se partirá de un único parche y se le irán añadiendo los demás componentes progresivamente (reflectores, desfasadores, mayor número de parches, transformadores λ/4, etc.) y se irán estudiando sus simulaciones. Todas estas simulaciones se realizarán con el programa HFSS.

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Electrochemically active Polypyrrole (PPy) nano-fiber array device was fabricated via electrochemical deposition method using aluminum anodic oxide (AAO) membrane as template. After alkaline treatment electrochemically active PPy nano-fiber lost electrochemical activity, and became electrochemically inactive PPy. The electronic properties of PPy nano-fiber array devices were measured by means of a simple method. It was found that for an indium-tin oxide/electrochemically inactive PPy nano-fiber device, the conductivity of nano-fiber increased with the increase of voltage applied on the two terminals of nano-fiber. The electrochemical inactive PPy nano-fiber might be used as a nano-fiber switching diode. Both Au/electrochemically active PPy and Au/electrochemically inactive PPy nano-fiber devices demonstrate rectifying behavior, and might have been used for further application as nano-rectifiers. (c) 2005 Elsevier B.V. All tights reserved.

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We report on an optical interference method to fabricate array microstructures on the surface of silicon wafers by means of five-beam interference of femtosecond laser pulses. Optical microscope and scanning electron microscope observations revealed microstructures with micrometer-order were fabricated. The diffraction characteristics of the fabricated structures were evaluated. The present technique allows one-step realization of functional optoelectronic devices on silicon surface. (C) 2004 Elsevier B.V. All rights reserved.