Environmental context of all samples from the Tara Oceans Expedition (2009-2013), about depth specific features

The Tara Oceans Expedition (2009-2013) sampled the world oceans on board a 36 m long schooner, collecting environmental data and organisms from viruses to planktonic metazoans for later analyses using modern sequencing and state-of-the-art imaging technologies. Tara Oceans Data are particularly suited to study the genetic, morphological and functional diversity of plankton. The present data set provides environmental context to all samples from the Tara Oceans Expedition (2009-2013), including calculated averages of mesaurements made concurrently at the sampling location and depth, and calculated averages from climatologies (AMODIS, VGPM) and satellite products.

Registry of samples and environmental context from the Ocean Sampling Day 2014

The Ocean Sampling Day (OSD) is a simultaneous sampling campaign of the world's oceans which took place (for the first time) on the summer solstice (June 21st) in the year 2014. These cumulative samples, related in time, space and environmental parameters, provide insights into fundamental rules describing microbial diversity and function and contribute to the blue economy through the identification of novel, ocean-derived biotechnologies. We see OSD data as a reference data set for generations of experiments to follow in the coming decade. The present data set includes a description of each sample collected during the Ocean Sampling Day 2014 and provides contextual environmental data measured concurrently with the collection of water samples for genomic analyses.

Environmental context of all samples from the Tara Oceans Expedition (2009-2013), about mesoscale features

The Tara Oceans Expedition (2009-2013) sampled the world oceans on board a 36 m long schooner, collecting environmental data and organisms from viruses to planktonic metazoans for later analyses using modern sequencing and state-of-the-art imaging technologies. Tara Oceans Data are particularly suited to study the genetic, morphological and functional diversity of plankton. The present data set provides environmental context to all samples from the Tara Oceans Expedition (2009-2013), about mesoscale features related to the sampling date, time and location. Includes calculated averages of mesaurements made concurrently at the sampling location and depth, and calculated averages from climatologies (AMODIS, VGPM) and satellite products.

Documentation of IPY Seamount

During Leg ANT-XXIII/9 on 2007-04-04 the German research vessel POLARSTERN mapped a significant bathymetric feature with its swath sonar system in the area of the Indian Ridge in the Southern Indian Ocean. The feature is a vulcano located 800 km northwest of Crozet Island. The vulcano with a crater has an absolute height of 1370 m, extending from 3100 m mean depth of the surrounding sea floor to a depth of 1730 m at the top of the crater rim. The crater has a depth of about 135 m. Due to the fact, that the feature was discovered just a month after the fourth International Polar Year (IPY) 2007/2009 has started, it was named "IPY Seamount". The undersea feature name proposal was submitted to the International Hydrographic Organisation (IHO) and the Intergovernmental Oceanographic Commission (IOC of UNESCO) on 2007-05-11. The name was officially accepted by the GEBCO Sub-Committee on Undersea Feature Names (SCUFN) at its 20th meeting in July and was added to the GEBCO Gazetteer of UFN.

AWI Bathymetric Chart of the Weddell Sea, Antarctica (BCWS)

From data collected by RV Polarstern, and additional echosoundings provided by national hydrographic offices, research institutions and the International Hydrographic Organization (IHO) Digital Bathymetric Data Center, the 1:1,000,000 Bathymetric Chart of the Weddell Sea (AWl BCWS) series has been developed. The heterogeneity of bathymetric data and the lack of observations within ice-covered areas required the incorporation of supplementary geophysical and geographical information. A semi-automatic procedure was developed for terrain modeling and contouring. In coastal regions, adjacent sub-glacial information was included in order to model the bathymetry of the transition zone along the Antarctic ice edge. Six sheets of the AWl BCWS series in the scale of 1:1,000,000 covering the southern Weddell Sea from 66°S to 78°S and from 68°W to 0°E were recently completed and included in the 1997 GEneral Bathymetric Chart of the Oceans (GEBCO) Digital Atlas CD-ROM (http://www.gebco.net). On the basis of these six 1:1,000,000 AWl BCWS sheets, a generalized 1:3,000,000-scale bathymetric chart was compiled for the entire southern Weddell Sea.

Registry of selected samples from the Tara Oceans Expedition (2009-2013)

The present data set is a registry of samples from the Tara Oceans Expedition (2009-2013) that were selected for publication in a special issue of the SCIENCE journal (see related references below). The registry provides details about the sampling location and methodology of each sample. Uniform resource locators (URLs) offer direct links to additional contextual environmental data and to the corresponding sequence runs used for analysis in the related literature publications in the SCIENCE journal.

Registry of all stations from the Tara Oceans Expedition (2009-2013)

The Tara Oceans Expedition (2009-2013) sampled the world oceans on board a 36 m long schooner, collecting environmental data and organisms from viruses to planktonic metazoans for later analyses using modern sequencing and state-of-the-art imaging technologies. Tara Oceans Data are particularly suited to study the genetic, morphological and functional diversity of plankton. The present data set is a registry of all stations conducted during the Tara Oceans Expedition (2009-2013). The registry provides details about the scientific interest of each station, including (1) the geographic context, (2) legal context, (3) the environmental features that were targeted, and (4) a detailed account of devices deployed during the station. Uniform resource locators (URLs) offer direct links to the corresponding (1) physical oceanographic context reports, (2) list of samples collected during the station, (3) environmental data published at PANGAEA, and (4) nucleotides data published at the European Nucleotides Archive (EBI-ENA).

Caracterização do índice de biofilme oral em doentes internados no serviço de cuidados intensivos 1 do Centro Hospitalar do Porto

Introdução: A cavidade oral de um doente que esteja internado num serviço hospitalar apresenta uma flora diferente das pessoas saudáveis. Ao fim de 48 horas de internamento, a flora apresenta um maior número de microrganismos que rapidamente podem ser responsáveis por aparecimento de infeções secundárias, tais como pneumonias, resultante à proliferação bactérias que lhe está associada. Este risco é ainda superior em doentes críticos. Nesta população torna-se fundamental a implementação de um efetivo protocolo de higiene oral, procurando controlar ao máximo o desenvolvimento do biofilme oral. Objetivo: Avaliar o índice de biofilme oral dos doentes na admissão a um serviço de Cuidados Intensivos, procedendo á sua reavaliação após 7 dias de internamento e, procurando deste modo avaliar a eficácia de higienização oral efetuada no Serviço. Materiais e Métodos: Estudo prospetivo, institucional, descritivo, analítico e observacional realizado no Serviço de Cuidados Intensivos do CHP. Foram envolvidos no estudo doentes com mais de 18 anos, e com um tempo de internamento igual ou superior a 7 dias. Procedeu-se à colheita de dados demográficos, motivo de admissão, tempo de internamento, medicação prescrita, tipo de alimentação efetuada no serviço, necessidade ou não de suporte respiratório e qual o tipo de higiene realizada no serviço. Foi avaliado o índice de higiene oral simplificado de Greene & Vermillion (IHO-S) nas primeiras 24h e 7 dias após a 1ª avaliação. O IHO-S é um indicador composto que avalia 2 componentes, a componente de resíduos e a componente de cálculo, sendo cada componente avaliada numa escala de 0 a 3. São avaliadas 6 faces dentárias que são divididas em 3 porções clínicas (porção gengival, terço médio e porção oclusal). No final de cada avaliação é calculado o somatório do valor encontrado para cada face, sendo este total dividido pelo nº de faces analisadas. O cálculo do IHO-S por indivíduo corresponde à soma das componentes. Resultados: Foram avaliados 74 doentes, tendo-se excluído 42 por não terem a dentição mínima exigida. Os 32 doentes que completaram o estudo apresentaram uma idade média de 60,53 ± 14,44 anos, 53,1% eram do género masculino, e na sua maioria pertenciam a pacientes do foro médico e cirúrgico (37,5,5%). Os doentes envolvidos no estudo tiveram uma demora média de 15,69±6,69 dias de internamento, tendo-se verificado que 17 dos pacientes (53,1%) estiveram internados mais de 14 dias no Serviço de Cuidados Intensivos 1. Relativamente às características particulares da amostra verificou-se que durante o período de avaliação a maioria dos doentes estiveram sedados (75%), sob suporte ventilatório (81,3%) e a fazer suporte nutricional por via entérica por sonda nasogástrica (62,6%). O IHO-S inicial foi de 0,67±0,45tendo-se verificado um agravamento significativo ao fim de sete dias de internamento 1,04±0.51 (p<0,05).Este agravamento parece estar fundamentalmente dependente dos maus cuidados orais prestados aos doentes, não se tendo observado qualquer diferença significativa resultante dos aspetos particulares avaliados, com exceção para a nutrição entérica versus a soroterapia. Discussão e Conclusão: Apesar de vários estudos evidenciarem a necessidade de um boa higiene oral para evitar a proliferação bacteriana e o risco de infeção nosocomial, muitas das instituições de saúde continuam a não valorizar esta prática. Neste estudo observa-se que os doentes na admissão apresentam um bom índice de higiene oral tendo-se contudo observado um agravamento significativo ao fim de uma semana de internamento. Embora este agravamento possa não ser importante para o doente com uma semana de internamento ele poderá ser indicativo de um risco acrescido para infeções nosocomiais em doentes com internamentos mais prolongados, necessitando estes doentes de uma higiene oral mais eficaz.

Prevalencia de caries en niños de 6 a 12 años atendidos en la Clínica Odontológica de la Universidad Católica Santo Toribio de Mogrovejo de Chiclayo durante el 2013

Tesis de segunda especialidad

Avaliação da eficácia de remoção do biofilme oral após a instrução da escovagem dentária em pacientes com necessidades educativas especiais

No âmbito da Medicina Dentária define como Paciente com Necessidades Especiais (PNE) todos o indivíduo que apresenta determinados desvios dos padrões de normalidade, identificáveis ou não e que por isso necessitam de atenção e abordagens especiais por um período da sua vida ou indefinidamente. De acordo com a Organização Mundial de Saúde (OMS), cerca de 10% da população mundial é constituída por pacientes especiais, sendo 50% portadores de deficiência mental, 20% de deficiência física, 15% de deficiência auditiva, 5% de deficiência visual e, 10% de alterações múltiplas. Indivíduos com necessidades especiais têm um risco elevado de ter doenças orais. Se, por um lado, um dos grandes objetivos deste trabalho é realçar a importância da higiene oral, não será menos importante, por outro lado, refletir sobre a eficácia da remoção do biofilme dentário através da técnica mais adequada para pacientes com necessidades educativas especiais. Assim, os principais objetivos deste estudo são: i. Perceber previamente ao estudo, quais as noções de higiene oral dos encarregados de educação dos alunos com necessidades educativas especiais e os hábitos de saúde oral que lhes estão associados; ii. Promover e melhorar a saúde oral desta população através de técnicas de motivação como jogos, apresentações de slides através do programa Microsoft powerpoint, filmes; iii. Levar os alunos com NEE a aprender a técnica mais adaptada às suas necessidades através do treino em macromodelos; iv. Comparar os valores do índice de placa no início e no final do estudo para perceber se houve ou não melhoria. Foi utilizada a base de dados do Pubmed, tendo sido pesquisados artigos com as palavras-chave “dental care in special children”, “especial needs”, “oral hygiene”, “oral health”; “deaf children and oral health”, “dental plaque” e “mechanic plaque control”. Foram incluídos os artigos escritos em Português e Inglês, aos quais houvesse acesso integral do artigo, dos últimos 10 anos. Foi realizada também uma consulta de livros relacionados com o tema. A população alvo foram os utentes da instituição CERCIPENICHE, portadores de dificuldade intelectual e desenvolvimental (DID) que compreendiam idades entre os 20 e os 57 anos. A amostra é constituída por 53 indivíduos. O estudo inclui todos aqueles alunos da instituição que conseguiam realizar a escovagem dentária sozinhos, sem qualquer ajuda. A investigação dividiu-se em 3 fases: na primeira fase foi avaliada a eficácia da escovagem dentária dos utentes sem qualquer instrução por parte do investigador, recorrendo a um revelador de placa bacteriana sem qualquer contraindicação para a saúde do indivíduo; numa segunda etapa foram dadas instruções de técnicas de escovagem com base nos resultados da fase anterior, auxiliando com atividades de motivação para a higiene da cavidade oral; por fim foi realizada uma nova avaliação do índice de placa bacteriana para verificar se houve ou não eficácia na remoção do biofilme dentário. Apesar das limitações físicas e mentais destes pacientes atuarem como um travão para uma boa higiene oral, os resultados são positivos, indicam que se verificou a existência de melhorias significativas no IHO-s após a intervenção. Do primeiro para o segundo momento houve uma diminuição dos valores médios deste índice, ou seja, houve uma melhoria na higiene oral desta população, após a instrução. Conclui-se que é importante para estes pacientes reforçar-se continuamente os hábitos de higiene oral, uma vez que reforça a interiorização do conhecimento, havendo não só melhorias na saúde oral destes indivíduos como melhoria na sua qualidade de vida e na saúde em geral.