The EMBL nucleotide sequence database

The EMBL Nucleotide Sequence Database (http://www.ebi.ac.uk/embl/) is maintained at the European Bioinformatics Institute (EBI) in an international collaboration with the DNA Data Bank of Japan (DDBJ) and GenBank at the NCBI (USA). Data is exchanged amongst the collaborating databases on a daily basis. The major contributors to the EMBL database are individual authors and genome project groups. Webin is the preferred web-based submission system for individual submitters, whilst automatic procedures allow incorporation of sequence data from large-scale genome sequencing centres and from the European Patent Office (EPO). Database releases are produced quarterly. Network services allow free access to the most up-to-date data collection via ftp, email and World Wide Web interfaces. EBI’s Sequence Retrieval System (SRS), a network browser for databanks in molecular biology, integrates and links the main nucleotide and protein databases plus many specialized databases. For sequence similarity searching a variety of tools (e.g. Blitz, Fasta, BLAST) are available which allow external users to compare their own sequences against the latest data in the EMBL Nucleotide Sequence Database and SWISS-PROT.

High-Molecular-Weight FK506-Binding Proteins Are Components of Heat-Shock Protein 90 Heterocomplexes in Wheat Germ Lysate1

In animal cell lysates the multiprotein heat-shock protein 90 (hsp90)-based chaperone complexes consist of hsp70, hsp40, and p60. These complexes act to convert steroid hormone receptors to their steroid-binding state by assembling them into heterocomplexes with hsp90, p23, and one of several immunophilins. Wheat germ lysate also contains a hsp90-based chaperone system that can assemble the glucocorticoid receptor into a functional heterocomplex with hsp90. However, only two components of the heterocomplex-assembly system, hsp90 and hsp70, have thus far been identified. Recently, purified mammalian p23 preadsorbed with JJ3 antibody-protein A-Sepharose pellets was used to isolate a mammalian p23-wheat hsp90 heterocomplex from wheat germ lysate (J.K. Owens-Grillo, L.F. Stancato, K. Hoffmann, W.B. Pratt, and P. Krishna [1996] Biochemistry 35: 15249–15255). This heterocomplex was found to contain an immunophilin(s) of the FK506-binding class, as judged by binding of the radiolabeled immunosuppressant drug [3H]FK506 to the immune pellets in a specific manner. In the present study we identified the immunophilin components of this heterocomplex as FKBP73 and FKBP77, the two recently described high-molecular-weight FKBPs of wheat. In addition, we present evidence that the two FKBPs bind hsp90 via tetratricopeptide repeat domains. Our results demonstrate that binding of immunophilins to hsp90 via tetratricopeptide repeat domains is a conserved protein interaction in plants. Conservation of this protein-to-protein interaction in both plant and animal cells suggests that it is important for the biological action of the high-molecular-weight immunophilins.

Production of infectious recombinant Moloney murine leukemia virus particles in BHK cells using Semliki Forest virus-derived RNA expression vectors.

We describe a heterologous, Semliki Forest virus (SFV)-driven packaging system for the production of infectious recombinant Moloney murine leukemia virus particles. The gag-pol and env genes, as well as a recombinant retrovirus genome (LTR-psi (+)-neoR-LTR), were inserted into individual SFV1 expression plasmids. Replication-competent RNAs were transcribed in vitro and introduced into the cytoplasm of BHK-21 cells using electroporation. The expressed Moloney murine leukemia virus structural proteins produced extracellular virus-like particles. In these particles the gag precursor was processed into mature products, indicating that the particles contained an active protease. The protease of the gag-pol fusion protein was also shown to be active in a trans-complementation assay using a large excess of Pr65gag. Moreover, the particles possessed reverse transcriptase (RT) activity as measured in an in vitro assay. Cotransfection of BHK-21 cells by all three SFV1 constructs resulted in the production of transduction-competent particles at 4 x 10(6) colony-forming units (cfu)/ml during a 5-hr incubation period. Altogether, 2.9 x 10(7) transduction-competent particles were obtained from about 4 x 10(6) transfected cells. Thus, this system represents the first RNA-based packaging system for the production of infectious retroviral particles. The facts that no helper virus could be detected in the virus stocks and that particles carrying the amphotropic envelope could be produced with similar efficiency as those that carry the ecotropic envelope make the system very interesting for gene therapy.

A general genetic approach in Escherichia coli for determining the mechanism(s) of action of tumoricidal agents: application to DMP 840, a tumoricidal agent.

We describe here a simple and easily manipulatable Escherichia coli-based genetic system that permits us to identify bacterial gene products that modulate the sensitivity of bacteria to tumoricidal agents, such as DMP 840, a bisnaphthalimide drug. To the extent that the action of these agents is conserved, these studies may expand our understanding agents is conserved, these studies may expand our understanding of how the agents work in mammalian cells. The approach briefly is to use a library of E. coli genes that are overexpressed in a high copy number vector to select bacterial clones that are resistant to the cytotoxic effects of drugs. AtolC bacterial mutant is used to maximize permeability of cells to hydrophobic organic molecules. By using DMP 840 to model the system, we have identified two genes, designated mdaA and mdaB, that impart resistance to DMP 840 when they are expressed at elevated levels. mdaB maps to E. coli map coordinate 66, is located between the parE and parC genes, and encodes a protein of 22 kDa. mdaA maps to E. coli map coordinate 18, is located adjacent to the glutaredoxin (grx) gene, and encodes a protein of 24 kDa. Specific and regulatable overproduction of both of these proteins correlates with DMP 840 resistance. Overproduction of the MdaB protein also imparts resistance to two mammalian topoisomerase inhibitors, Adriamycin and etoposide. In contrast, overproduction of the MdaA protein produces resistance only to Adriamycin. Based on its drug-resistance properties and its location between genes that encode the two subunits of the bacterial topoisomerase IV, we suggest that mdaB acts by modulating topoisomerase IV activity. The location of the mdaA gene adjacent to grx suggests it acts by a drug detoxification mechanism.

Chloroplast gene sequence data suggest a single origin of the predisposition for symbiotic nitrogen fixation in angiosperms.

Of the approximately 380 families of angiosperms, representatives of only 10 are known to form symbiotic associations with nitrogen-fixing bacteria in root nodules. The morphologically based classification schemes proposed by taxonomists suggest that many of these 10 families of plants are only distantly related, engendering the hypothesis that the capacity to fix nitrogen evolved independently several, if not many, times. This has in turn influenced attitudes toward the likelihood of transferring genes responsible for symbiotic nitrogen fixation to crop species lacking this ability. Phylogenetic analysis of DNA sequences for the chloroplast gene rbcL indicates, however, that representatives of all 10 families with nitrogen-fixing symbioses occur together, with several families lacking this association, in a single clade. This study therefore indicates that only one lineage of closely related taxa achieved the underlying genetic architecture necessary for symbiotic nitrogen fixation in root nodules.

Obtenção de gel mucoadesivo de nistatina para o tratamento da candidíase oral. Desenvolvimento e caracterização de dispersões sólidas de nistatina

A nistatina (NYS) é o fármaco de primeira escolha no tratamento da candidíase oral, que frequentemente acomete mais os indivíduos imunocomprometidos e pacientes com outras desordens (diabetes não tratada, neoplasias, imunodeficiências). No mercado brasileiro, a NYS é encontrada na forma de suspensão oral aquosa, onde o procedimento para sua administração consiste em bochechar o medicamento. Apesar de haver a indicação de que se mantenha o contato direto entre fármaco e a mucosa oral, na qual se encontra a Candida spp., o que aumentaria expressivamente o sucesso terapêutico, a suspensão não apresenta tal propriedade. Assim, a NYS que é fármaco com ação efetiva contra a candidíase oral, é considerada pertencente à Classe IV do Sistema de Classificação Biofarmacêutica, ou seja, apresenta baixa solubilidade e baixa permeabilidade. A baixa solubilidade pode comprometer sua disponibilidade na cavidade oral, e consequentemente, sua ação farmacológica. Diante desse quadro, o objetivo do presente trabalho foi o desenvolvimento de dispersões sólidas de NYS para o tratamento da candidíase oral, e sua posterior incorporação em gel mucoadesivo oral, favorecendo a formulação no local de ação. As dispersões sólidas são sistemas farmacêuticos, onde um fármaco pouco solúvel em água encontra-se dispersado em um carreador, no estado sólido. Os carreadores normalmente são hidrofílicos, o que permite que esses sistemas sejam empregados para aumentar a solubilidade aquosa do fármaco. Assim, foram desenvolvidas as dispersões sólidas de NYS, pelo método de eliminação do solvente, empregando como carreadores, lactose, HPMC, poloxamer 407 e poloxamer 188. Essas foram submetidas à caracterização por análise térmica, usando os ensaios de calorimetria exploratória diferencial (DSC) e termogravimetria/termogravimetria derivada (TG/DTG). Dentre essas dispersões sólidas, aquelas que se mostraram com comportamento térmico sugerindo a formação de um novo \"sistema\", foram analisadas por meio de ensaio de solubilidade. Dessa forma, a formulação NYS DS G2 (49) se destacou, pois apresentou maior solubilidade em água (4,484 mg/mL); em pH 5,5 (4,249 mg/mL) e em pH 7,0 (4,293 mg/mL), ou seja, houve um aumento de 1,426 vezes em água; 4,227 vezes em pH 5,5; e 2,743 vezes em pH 7,0. Essa formulação foi, por fim avaliada por difração de raio-X e espectroscopia de infravermelho com transformada de Fourier, técnicas que corroboraram com a análise térmica quanto à indicação de formação da dispersão sólida. Por sua vez, essa dispersão sólida foi incorporada em 4 bases de géis mucoadesivos de carbopol ® 934 PNF, alterando apenas a concentração do polímero (0,5; 1,0; 1,5; 2,0 %p/p). Foi observado que a liberação de NYS DS G2 (49) foi superior, quando comparada à liberação de NYS MP a partir do gel, e através do ensaio de mucoadesão, percebeu-se que os géis desenvolvidos apresentaram propriedades mucoadesivas compatíveis com relatos na literatura, independentemente da quantidade de carbopol ® empregada. As características reológicas foram distintas, e foi observado que as formulações Gel A e Gel B, que possuem menor quantidade de polímero, tiverem um indicativo de comportamento de fluido newtoniano, diferente dos demais, o que pode não ser desejado para esse tipo de forma farmacêutica tópica e semi-sólida. Ao final desse trabalho, pode-se concluir que foi possível desenvolver um sistema farmacêutico na forma de dispersão sólida com maior solubilidade que a NYS pura, e sua incorporação em uma forma farmacêutica mucoadesiva, e que a liberação da NYS na forma DS foi muito superior que o fármaco na forma \"convencional\", o que permite que a NYS esteja mais disponível na cavidade oral, e também junto à mucosa bucal, o que levaria a efeito farmacológico mais efetivo do antifúngico.

Avaliação da capacidade funcional de pacientes vítimas de trauma um ano após alta hospitalar

Objetivos: Avaliar a capacidade funcional de pacientes vítimas de trauma um ano após alta hospitalar e verificar associação da capacidade funcional com fatores relacionados ao trauma e à internação hospitalar. Metodologia: Estudo de coorte prospectivo, com pacientes vítimas de trauma grave (Injury Severity Score - ISS >=16), internados entre Junho e Setembro de 2010 em unidade de terapia intensiva (UTI) cirúrgica especializada em paciente politraumatizado de um hospital público de grande porte na cidade de São Paulo, Brasil. Variáveis de interesse como idade, sexo, escore de Glasgow, Acute Physiology and Chronic Health Disease Classification System II (APACHE II), mecanismos de trauma, número de lesões, região corpórea afetada, número de cirurgias, duração da ventilação mecânica (VM) e tempo de internação hospitalar foram coletadas dos prontuários médicos. A capacidade funcional foi avaliada um ano após alta hospitalar utilizando as escalas Glasgow Outcome Scale (GOS) e Escala de Atividades Instrumentais de Vida Diária de Lawton (AIVDL). Os pacientes também foram questionados se haviam retornado ao trabalho ou estudo. Resultados: O seguimento um ano após trauma foi completo em 49 indivíduos, a maioria composta por jovens (36±11 anos), do sexo masculino (81,6%) e vítimas de acidentes de trânsito (71,5%). Cada indivíduo sofreu aproximadamente 4 lesões corporais, acarretando uma média no ISS de 31 ± 14,4. O traumatismo cranioencefálico foi o tipo de lesão mais comum (65,3%). De acordo com a GOS, a maioria dos pacientes apresentou disfunção moderada (43%) ou disfunção leve ou ausente (37%) um ano após o trauma. A escala AIVDL apresentou pontuação média de 12±4 com aproximadamente 60- 70% dos indivíduos capazes de realizar de forma independente a maioria das atividades avaliadas. Escore de Glasgow, APACHE II, duração da VM e tempo de internação hospitalar foram associadas com a capacidade funcional um ano após lesão. A regressão linear múltipla considerando todas as variáveis significativas revelou associação entre a pontuação da escala AIVDL e o tempo de internação hospitalar. Apenas 32,6% dos indivíduos retornaram ao trabalho ou estudo. Conclusões: A maioria dos pacientes vítimas de trauma grave foi capaz de realizar as atividades avaliadas com independência; apenas um terço deles retornou ao trabalho e/ou estudo um ano após alta hospitalar. O tempo de internação hospitalar foi revelado como preditor significativo para a recuperação da capacidade funcional um ano após lesão grave

Assistência de fisioterapia na UTI está relacionada a redução de custos de internação?

Introdução: A unidade de terapia intensiva (UTI) é conhecida por ser um setor de alta complexidade dos pacientes e por seu alto custo ao sistema hospitalar. A gravidade da doença, o tempo de internação na UTI e a necessidade de ventilação mecânica invasiva (VMI) são fatores conhecidos como influenciadores no custo destas unidades, sendo que aproximadamente 30% dos pacientes internados em UTI necessitam de VMI. Os objetivos deste estudo foram avaliar os custos de internação em UTI comparando unidades com assistência de fisioterapia 24 horas e unidades com assistência de fisioterapia 12 horas e analisar o impacto da fisioterapia nos referidos custos. Método: Este é um estudo observacional, prospectivo, realizado em um hospital geral, público e de grande porte, localizado na cidade de São Paulo. Foram incluídos pacientes clínicos e cirúrgicos com 18 anos de idade ou mais, que estiveram em VMI por um período >= 24 horas e que receberam alta da UTI para a enfermaria. A coleta de dados incluiu diagnóstico de internação hospitalar, diagnóstico de admissão na UTI, gravidade do paciente no momento da admissão na UTI através do Acute Physiology and Chronic Health Disease Classification (APACHE II), tempo de VMI e tempo de internação na UTI; para a análise de custos utilizamos a ferramenta Omega French Score. Um modelo de regressão linear múltipla foi construído para verificar a associação entre o custo de internação em UTI com o turno diário de assistência fisioterapêutica. Resultados: Foram incluídos na amostra 815 pacientes, distribuídos em dois grupos conforme o turno de fisioterapia existente na UTI: 332 pacientes em UTI\'s com 24 horas de assistência fisioterapêutica (PT-24) e 483 pacientes em UTI\'s com 12 horas de assistência fisioterapêutica (PT-12). Os grupos não apresentaram diferença quanto ao APACHE II (p=0,65); comparado ao grupo PT-12 o grupo PT-24 era mais velho (p < 0,001), apresentou menor tempo de VMI (p < 0,001) e de internação na UTI (p=0,013). Quanto a análise de custos o grupo PT-24 apresentou custos menores indicados pela menor pontuação no Omega 3 (p=0,005) e Omega Total (p=0,010), menor custo direto, custo com equipe médica e enfermagem (p=0,010). A análise de regressão linear múltipla indicou associação do custo da internação em UTI com as variáveis APACHE II (p < 0,001), tempo de internação da UTI (p < 0,001) e assistência fisioterapêutica em turnos de 24 horas (p=0,05). Conclusão: O grupo com assistência de fisioterapia em turnos de 24 horas apresentou custos menores sendo que a severidade da doença, o tempo de internação na UTI e a assistência de fisioterapia foram variáveis preditoras para redução de custo de internação na UTI

Antichagásicos potenciais: síntese e modelagem molecular de híbridos de hidrazonas e liberadores de óxido nítrico

A doença de Chagas é uma parasitose extremamente negligenciada, cujo agente etiológico é o protozoário Trypanosoma cruzi. Atualmente, 21 países da América Latina são considerados regiões endêmicas, onde 75-90 milhões de pessoas estão expostas à infecção, 6-7 milhões estão infectadas e mais de 41 mil novos casos surgem por ano. Entretanto, apenas os fármacos nifurtimox e benznidazol estão disponíveis no mercado. Estes, além da baixa eficácia na fase crônica da parasitose, apresentam diversos efeitos adversos, sendo que no Brasil apenas o benznidazol é utilizado. Este fato mostra a importância de se ampliar o número de fármacos disponíveis e propor quimioterapia mais eficaz para o tratamento da doença de Chagas. Como forma de contribuir para essa busca, este trabalho objetiva a síntese de compostos híbridos bioisostéricos N-acilidrazônicos e sulfonilidrazônicos, contendo grupo liberador de óxido nítrico, com potencial de interação com cisteíno-proteases parasitárias, tais como a cruzaína. Nestes derivados, os grupos liberadores de óxido nítrico utilizados foram os grupos furoxano (contendo substituinte metílico e fenílico) e éster nitrato. Propôs-se a variação de anéis aromáticos substituídos e não-substituídos, com o intuito de avaliar a possível relação estrutura-atividade (REA) desses análogos. Até o momento, somente os compostos da série N-acilidrazônica tiveram avaliação biológica realizada. Os valores de IC50 dos compostos na forma amastigota do parasita variaram entre >100 a 2,88 µM, sendo este último valor comparável ao fármaco de referência. A atividade inibitória frente à cruzaína foi de 25,2 µM a 2,2 µM. Já a liberação de óxido nítrico foi avaliada pelo método indireto de detecção de nitrato e os valores variaram entre 52,0 µM e 4.232,0 µM. Estes são bem inferiores ao composto padrão, além de não se identificar correlação direta entre a atividade biológica e a liberação de NO. Na sequência, os dois compostos mais ativos (6 e 14) foram submetidos a estudos de permeabilidade e de citotoxicidade. O composto 6 foi considerado o de maior permeabilidade segundo o Sistema de Classificação Biofarmacêutica (SCB) e todos os compostos apresentaram a taxa de fluxo menor que 2, indicando a ausência de mecanismo de efluxo. Na avaliação do potencial citotóxico desses compostos em células humanas, o derivado 6 apresentou índice de seletividade superior ao do benznidazol. Em estudos de modelagem molecular usando análise exploratória de dados (HCA e PCA), propriedades estéricas/geométricas e eletrônicas foram consideradas as mais relevantes para a atividade biológica. Além disso, estudos de docking mostraram que a posição do grupo nitro no anel aromático é importante para a interação com a cruzaína. Ademais o composto 6 não provocou mudanças significativas no ciclo celular e na fragmentação de DNA em células humanas, mostrando-se como líder promissor para futuros estudos in vivo. Atividade tripanomicida, citotoxicidade, potencial de liberação de NO e estudos de permeabilidade dos 23 derivados sulfonilidrazônicos e ésteres nitrato estão sendo avaliados.

Desfechos tardios de sobreviventes de ensaio clínico randomizado controlado (protocolo ARDSnet vs. Open Lung Approach para o manejo ventilatório da síndrome do desconforto respiratório agudo moderado-grave)

Apesar da utilização da ventilação mecânica protetora como estratégia para o tratamento da síndrome do desconforto respiratório agudo, ao menos um quarto dos pacientes com essa síndrome ainda apresentam redução na função pulmonar após 6 meses de seguimento. Não se sabe se esta redução está relacionada com a gravidade da síndrome ou associada com a forma de ventilar o paciente. Nosso objetivo neste trabalho foi avaliar a associação entre alterações funcionais e estruturais do pulmão com parâmetros de gravidade clínica e de ventilação mecânica. Foi realizada uma análise secundária dos dados obtidos em estudo randomizado e controlado que incluiu pacientes com síndrome do desconforto respiratório agudo moderada/grave, internados em seis unidades de terapia intensiva em um hospital terciário da cidade de São Paulo. Foram analisados dados de pacientes que tinham ao menos um teste de função pulmonar no seguimento. O teste funcional incluiu a medida da capacidade vital forçada, volumes pulmonares e a capacidade de difusão do monóxido de carbono após 1, 2 e 6 meses de seguimento. Foram considerados variáveis independentes o volume corrente, a pressão de distensão e a pressão positiva ao final da expiração (todos medidos após 24 horas da randomização) e um sistema de classificação de prognóstico (APACHE II), a relação PaO2/FIO2 e a complacência respiratória estática (todos medidos antes da randomização). Também foi realizada tomografia de alta resolução do tórax juntamente com os testes de função pulmonar, e posterior análise quantitativa das imagens. Na avaliação de 6 meses também foi realizado teste de caminhada de 6 minutos e um questionário de qualidade de vida (SF-36). Um total de 21 pacientes realizaram o teste de função pulmonar após 1 mês e 15 pacientes realizaram após 2 e 6 meses de seguimento. A capacidade vital forçada foi relacionada inversamente com a pressão de distensão na avaliação de 1, 2 e 6 meses (p < 0,01). A capacidade de difusão do monóxido de carbono relacionou-se inversamente com a pressão de distensão e com o APACHE II (ambos p < 0,01) na avaliação de 1 e 2 meses. Após 6 meses de seguimento, houve correlação inversa entre a pressão de distensão e a capacidade vital forçada independente do volume corrente, da pressão de platô e da complacência estática respiratória após ajustes (R2 = 0,51, p = 0,02). A pressão de distensão também se relacionou com o volume pulmonar total, a densidade pulmonar media e a porcentagem de volume pulmonar não aerado ou pobremente aerado medidos através da análise quantitativa da tomografia computadorizada de tórax realizada na avaliação de 6 meses. Também foi observada relação entre a qualidade de vida após 6 meses de seguimento e a pressão de distensão considerando o domínio estado geral de saúde. Nós concluímos que mesmo em pacientes ventilados com reduzido volume corrente e pressão de platô limitada, maiores valores de pressão de distensão relacionaram-se com menores valores de função pulmonar no seguimento de longo prazo

Traditional knowledge of medicinal plants in the Serra de Mariola Natural Park, South-eastern Spain

The present study aims to inventory and analyse the ethnobotanical knowledge about medicinal plants in the Serra de Mariola Natural Park. In respect to traditional uses, 93 species reported by local informants were therapeutic, 27 food, 4 natural dyes and 13 handcrafts. We developed a methodology that allowed the location of individuals or vegetation communities with a specific popular use. We prepared a geographic information system (GIS) that included gender, family, scientific nomenclature and common names in Spanish and Catalan for each species. We also made a classification of 39 medicinal uses from ATC (Anatomical, Therapeutic, Chemical classification system). Labiatae (n=19), Compositae (n=9) and Leguminosae (n=6) were the families most represented among the plants used to different purposes in humans. Species with the most elevated cultural importance index (CI) values were Thymus vulgaris (CI=1.431), Rosmarinus officinalis (CI=1.415), Eryngium campestre (CI=1.325), Verbascum sinuatum (CI=1.106) and Sideritis angustifolia (CI=1.041). Thus, the collected plants with more therapeutic uses were: Lippia triphylla (12), Thymus vulgaris and Allium roseum (9) and Erygium campestre (8). The most repeated ATC uses were: G04 (urological use), D03 (treatment of wounds and ulcers) and R02 (throat diseases). These results were in a geographic map where each point represented an individual of any species. A database was created with the corresponding therapeutic uses. This application is useful for the identification of individuals and the selection of species for specific medicinal properties. In the end, knowledge of these useful plants may be interesting to revive the local economy and in some cases promote their cultivation.

Ocular residual astigmatism and topographic disparity vector indexes in normal healthy eyes

Purpose: To define a range of normality for the vectorial parameters Ocular Residual Astigmatism (ORA) and topography disparity (TD) and to evaluate their relationship with visual, refractive, anterior and posterior corneal curvature, pachymetric and corneal volume data in normal healthy eyes. Methods: This study comprised a total of 101 consecutive normal healthy eyes of 101 patients ranging in age from 15 to 64 years old. In all cases, a complete corneal analysis was performed using a Scheimpflug photography-based topography system (Pentacam system Oculus Optikgeräte GmbH). Anterior corneal topographic data were imported from the Pentacam system to the iASSORT software (ASSORT Pty. Ltd.), which allowed the calculation of the ocular residual astigmatism (ORA) and topography disparity (TD). Linear regression analysis was used for obtaining a linear expression relating ORA and posterior corneal astigmatism (PCA). Results: Mean magnitude of ORA was 0.79 D (SD: 0.43), with a normality range from 0 to 1.63 D. 90 eyes (89.1%) showed against-the-rule ORA. A weak although statistically significant correlation was found between the magnitudes of posterior corneal astigmatism and ORA (r = 0.34, p < 0.01). Regression analysis showed the presence of a linear relationship between these two variables, although with a very limited predictability (R2: 0.08). Mean magnitude of TD was 0.89 D (SD: 0.50), with a normality range from 0 to 1.87 D. Conclusion: The magnitude of the vector parameters ORA and TD is lower than 1.9 D in the healthy human eye.

Clinical utility of ocular residual astigmatism and topographic disparity vector indexes in subclinical and clinical keratoconus

Purpose. We aimed to characterize the distribution of the vector parameters ocular residual astigmatism (ORA) and topography disparity (TD) in a sample of clinical and subclinical keratoconus eyes, and to evaluate their diagnostic value to discriminate between these conditions and healthy corneas. Methods. This study comprised a total of 43 keratoconic eyes (27 patients, 17–73 years) (keratoconus group), 11 subclinical keratoconus eyes (eight patients, 11–54 years) (subclinical keratoconus group) and 101 healthy eyes (101 patients, 15–64 years) (control group). In all cases, a complete corneal analysis was performed using a Scheimpflug photography-based topography system. Anterior corneal topographic data was imported from it to the iASSORT software (ASSORT Pty. Ltd), which allowed the calculation of ORA and TD. Results. Mean magnitude of the ORA was 3.23 ± 2.38, 1.16 ± 0.50 and 0.79 ± 0.43 D in the keratoconus, subclinical keratoconus and control groups, respectively (p < 0.001). Mean magnitude of the TD was 9.04 ± 8.08, 2.69 ± 2.42 and 0.89 ± 0.50 D in the keratoconus, subclinical keratoconus and control groups, respectively (p < 0.001). Good diagnostic performance of ORA (cutoff point: 1.21 D, sensitivity 83.7 %, specificity 87.1 %) and TD (cutoff point: 1.64 D, sensitivity 93.3 %, specificity 92.1 %) was found for the detection of keratoconus. The diagnostic ability of these parameters for the detection of subclinical keratoconus was more limited (ORA: cutoff 1.17 D, sensitivity 60.0 %, specificity 84.2 %; TD: cutoff 1.29 D, sensitivity 80.0 %, specificity 80.2 %). Conclusion. The vector parameters ORA and TD are able to discriminate with good levels of precision between keratoconus and healthy corneas. For the detection of subclinical keratoconus, only TD seems to be valid.

Abordagem cirúrgica da luxação gleno-umeral em contexto desportivo

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014

(Tables 1, 3) Component composition of organic particles in samples from ODP Site 131-808

Analysis of the palynofacies and miospore thermal alteration indices (TAI) of sediments from ODP Site 808 in the Nankai Trough was undertaken to determine (1) the source, depositional environment, and diagenesis of organic matter in the accreted sediments, and (2) the thermal structure and history of the prism and its relationship to fluid flow. Using the Hartax classification system, two palynofacies were recognized in the sedimentary sequence. Facies 1 occurs within the upper 600 m of trench-wedge turbidites (sedimentation rate > 1 km/m.y.) and contains >50% inertite particles. The rest of the assemblage is dominated by well-preserved phytoclasts and contains small amounts of poorly preserved phytoclasts and well-preserved scleratoclasts. Facies 2 occurs within the Shikoku Basin hemipelagites (600-1300 m below seafloor; sedimentation rate <150 m/m.y.) and contains over two-thirds inertite particles. The rest of the assemblage is dominated by poorly preserved phytoclasts. Miospores and marine phytoplankton compose only a small percentage of both palynofacies. Degraded organic matter is most noticeable in Facies 2, whereas its presence in Facies 1 is overshadowed by the high influx of well-preserved primary organic matter. Most of the degraded organic matter and inertite is interpreted to be reworked. Some of the degraded organic matter may be primary, and may have experienced more biodegradation and thermal alteration in Facies 2 than in Facies 1. TAI values indicate an immature stage of organic maturation (< 2) down to about 900 mbsf. Below this, samples show an increase with depth to a mature stage, reaching peak levels of about 3 just above basement. Samples from within the thrust fault and decollement zones do not show levels of maturity significantly greater than those of surrounding samples, leaving uncertain whether hot fluids have migrated along these fault boundaries in the past.