Ultrasensitive detection of pathological prion protein aggregates by dual-color scanning for intensely fluorescent targets

A definite diagnosis of prion diseases such as Creutzfeldt–Jakob disease (CJD) relies on the detection of pathological prion protein (PrPSc). However, no test for PrPSc in cerebrospinal fluid (CSF) has been available thus far. Based on a setup for confocal dual-color fluorescence correlation spectroscopy, a technique suitable for single molecule detection, we developed a highly sensitive detection method for PrPSc. Pathological prion protein aggregates were labeled by specific antibody probes tagged with fluorescent dyes, resulting in intensely fluorescent targets, which were measured by dual-color fluorescence intensity distribution analysis in a confocal scanning setup. In a diagnostic model system, PrPSc aggregates were detected down to a concentration of 2 pM PrPSc, corresponding to an aggregate concentration of approximately 2 fM, which was more than one order of magnitude more sensitive than Western blot analysis. A PrPSc-specific signal could also be detected in a number of CSF samples from patients with CJD but not in control samples, providing the basis for a rapid and specific test for CJD and other prion diseases. Furthermore, this method could be adapted to the sensitive detection of other disease-associated amyloid aggregates such as in Alzheimer's disease.

Cell surface expression of mouse macrosialin and human CD68 and their role as macrophage receptors for oxidized low density lipoprotein

We have previously identified a 94- to 97-kDa oxidized low density lipoprotein (LDL)-binding protein in mouse macrophages as macrosialin (MS), a member of the lamp family. Earlier immunostaining studies have shown that MS and its human homolog, CD68, are predominantly intracellular proteins. However, using sensitive techniques such as flow cytometry (FACS) and cell-surface-specific biotinylation, we now show that there is significant surface expression of these proteins. FACS analysis of intact cells using mAb FA/11 showed small but definite surface expression of MS in resident mouse peritoneal macrophages but this was greatly enhanced with thioglycollate elicitation. Biotinylation of intact cells and detergent-solubilized cell preparations followed by immunoprecipitation revealed 10–15% of the total MS content of elicited macrophages on the plasma membrane. Similar results were obtained with untreated RAW 264.7 cells. FACS analysis of intact THP-1 monocytic cells showed minimal surface expression of CD68 on unactivated cells (4% of total cell content). Stimulation with phorbol 12-myristate 13-acetate increased both surface and total CD68 expression considerably. Furthermore, the specific binding at 4°C and uptake at 37°C of 125I-labeled oxidized LDL by activated THP-1 cells was inhibited by 30–50% by CD68 mAbs KP-1 and EBM-11. Thus, although the surface expression of MS/CD68 at steady-state represents only a small percentage of their total cellular content, these proteins can play a significant role in oxidized LDL uptake by activated macrophages in vitro and could contribute to foam cell formation in atherosclerotic lesions.

Immunization of metastatic breast cancer patients with a fully synthetic globo H conjugate: A phase I trial

The carbohydrate antigen globo H commonly found on breast cancer cells is a potential target for vaccine therapy. The objectives of this trial were to determine the toxicity and immunogenicity of three synthetic globo H-keyhole limpet hemocyanin conjugates plus the immunologic adjuvant QS-21. Twenty-seven metastatic breast cancer patients received five vaccinations each. The vaccine was well tolerated, and no definite differences were observed among the three formulations. Serologic analyses demonstrated the generation of IgM antibody titers in most patients, with minimal IgG antibody stimulation. There was significant binding of IgM antibodies to MCF-7 tumor cells in 16 patients, whereas IgG antibody reactivity was observed in a few patients. There was evidence of complement-dependent cytotoxicity in several patients. Affinity column purification supported the specificity of IgM antibodies for globo H. On the basis of these data, globo H will constitute one component of a polyvalent vaccine for evaluation in high-risk breast cancer patients.

Zeta functions and Eisenstein series on classical groups

We construct an Euler product from the Hecke eigenvalues of an automorphic form on a classical group and prove its analytic continuation to the whole complex plane when the group is a unitary group over a CM field and the eigenform is holomorphic. We also prove analytic continuation of an Eisenstein series on another unitary group, containing the group just mentioned defined with such an eigenform. As an application of our methods, we prove an explicit class number formula for a totally definite hermitian form over a CM field.

Influence of Water Content and Temperature on Molecular Mobility and Intracellular Glasses in Seeds and Pollen1

Although the occurrence of intracellular glasses in seeds and pollen has been established, physical properties such as rotational correlation times and viscosity have not been studied extensively. Using electron paramagnetic resonance spectroscopy, we examined changes in the molecular mobility of the hydrophilic nitroxide spin probe 3-carboxy-proxyl during melting of intracellular glasses in axes of pea (Pisum sativum L.) seeds and cattail (Typha latifolia L.) pollen. The rotational correlation time of the spin probe in intracellular glasses of both organisms was approximately 10−3 s. Using the distance between the outer extrema of the electron paramagnetic resonance spectrum (2Azz) as a measure of molecular mobility, we found a sharp increase in mobility at a definite temperature during heating. This temperature increased with decreasing water content of the samples. Differential scanning calorimetry data on these samples indicated that this sharp increase corresponded to melting of the glassy matrix. Molecular mobility was found to be inversely correlated with storage stability. With decreasing water content, the molecular mobility reached a minimum, and increased again at very low water content. Minimum mobility and maximum storage stability occurred at a similar water content. This correlation suggests that storage stability might be at least partially controlled by molecular mobility. At low temperatures, when storage longevity cannot be determined on a realistic time scale, 2Azz measurements can provide an estimate of the optimum storage conditions.

An idea from Donnellan: deferential and non-deferential uses of proper names

When we use a proper name, by virtue of what do we succeed in saying something about an individual? In other words, how are we supposed to explain the seemingly trivial fact that by uttering “Aristotle was wise” we actually predicate something of the famous philosopher? Questions like these have animated a fervent debate among philosophers of language; however, nowadays the standard answer is that by using “Aristotle” we say something about that famous philosopher because the name we have used in our utterance refers to him. Even though no general consensus has been reached on how to characterize the relation of reference – there are still different and competing accounts of the latter on the philosophical market – almost everybody believes, especially after the publication of Saul Kripke’s "Naming and necessity", that reference is the only semantic relation that connects our uses of proper names to individuals in the world. Contrary to this widespread assumption, in this dissertation I shall claim that our uses of proper names are not always referential.

Linfoma renale del gatto:rilievi anatomopatologici, immunofenotipizzazione delle popolazioni linfocitarie ed espressione tissutale dell'antigene virale FeLV gp70.

Riassunto Il linfoma è una delle neoplasie più diffuse nel gatto. Questa neoplasia è stata classificata in base alla localizzazione anatomica nella forma Mediastinica (che interessa il timo e/o i linfonodi mediastinici), Alimentare, Multicentrica (che interessa diversi linfonodi e/o la milza e/o il fegato, Extranodale (che coinvolge i reni, SNC o la cute). Le cellule neoplastiche sono caratterizzate da diverse sottopopolazioni, che sono definite tramite immunofenotipizzazione ottenuta mediante tecniche immunoistochimiche (IHC), così che possano essere classificate come cellule B o T o non B/non T. I gatti infetti dal virus della leucemia felina (FeLV, Gammaretrovirus) presentano elevata incidenza di linfomi rispetto ai gatti non infetti. I meccanismi proposti di sviluppo neoplastico sono mutagenesi inserzionali o stimolazione persistente delle cellule immunitarie dell’ospite da parte di antigeni virali, i quali possono promuovere la trasformazione in senso maligno dei linfociti. Lo scopo di questo lavoro è stato esaminare i rilievi patologici, l’espressione di FeLV e l’immonofenotipo (B, T, nonB/nonT) nei reni felini affetti da linfoma. Abbiamo effettuato colorazione Ematossilina- Eosina ed Immunoistochimica per FeLV gp70, CD3 e CD79. Nello studio sono stati inclusi i tessuti di 49 gatti presentati all’Unità Operativa di Anatomia Patologica e Patologia Generale del Dipartimento di Scienze Medico Veterinarie dell’Università degli studi di Parma. Il 39% dei casi (19/49) sono caratterizzati dalla presenza di lesioni linfomatose a livello renale. Questa popolazione è costituita dal 52,6% 3 (10/19) maschi e dal 47,4% (9/19) femmine. L’età è compresa tra 8 mesi e 17 anni ed in particolare 26,6% (5/19) sono giovani (0-2 anni), 47,4% (9/19) sono adulti (2-10 anni) e 26,3% (5/19) sono anziani (>10 anni). Per quanto riguarda la classificazione anatomica la forma renale appare primitiva in 5 casi (25%), in 8 casi (42%) appare secondaria a linfomi multicentrici, in 3 casi (15,7%) a linfomi mediastinici e in altri 3 casi (15,7%) a linfomi gastrici e intestinali. Per quanto riguarda l’immunofenotipizzazione sono risultati CD3 positivi il 73,7% (14/19) e CD3 negativi il 27,3% (5/19); CD79 alpha positivi il 26,3% (5/19) e CD79 alpha negativi il 73,7% (14/19); l’espressione della proteina gp70 è stata individuata nel 78,9% (15/19) delle neoplasie renali, mentre il 21,1% (4/19) non presentava espressione della proteina. Nei 4 anni presi in considerazione nello studio si evince un’elevata incidenza della localizzazione anatomica renale sul totale di linfomi osservati. Non si è notata correlazione statistica tra linfomi renali, età e sesso dei soggetti presi in esame ma vi è un’elevata percentuale di animali adulti ed anziani affetti dalla patologia. Nella valutazione fenotipica dell’infiltrato neoplastico si è osservata l’elevata espressione di CD3, caratterizzando i linfociti come appartenenti alla sottopopolazione T. Inoltre si è evidenziato come un elevato numero di cellule neoplastiche esprimano gp70; ciò permette di affermare che i linfociti neoplastici sono infettati dal virus FeLV, il quale inoltre è in attiva replicazione. I marker CD3 e gp70 sono risultati fortemente correlati statisticamente; si può affermare perciò che l’espansione clonale dei linfociti T è correlata alla presenza e replicazione del virus.

Polpa de guavira (Campomanesia cambessedeana Berg) desidratada em spray dryer: efeitos das condições de processo e composição da alimentação nas propriedades físico químicas e atividade antioxidante

O objetivo desse trabalho foi obter polpa de guavira desidratada por atomização, utilizando maltodextrina ou goma arábica como agentes carreadores. Inicialmente, avaliou-se a influência das condições de processo, temperatura do ar de secagem (130, 155 e 180) °C e vazão volumétrica da mistura (20 e 40) mL/min, o tipo e concentração de agente carreador (10 e 20) % nas características físicas, físico-químicas e atividade antioxidante do produto obtido. As propriedades analisadas foram umidade, atividade de água, higroscopicidade, solubilidade, cor, distribuição e tamanho médio de partículas, morfologia, compostos fenólicos totais e atividade antioxidante. A temperatura do ar de secagem e a vazão volumétrica de alimentação influenciaram significativamente todas as propriedades da guavira em pó. A umidade e atividade de água apresentaram os menores valores na temperatura intermediária, independentemente do tipo e concentração do carreador usado. A solubilidade das amostras adicionadas de maltodextrina foram superiores às amostras com goma arábica. O aumento da concentração de agente carreador, em geral, proporcionou um aumento no parâmetro L* e diminuição dos parâmetros a* e b*, tornando as amostras mais claras e reduzindo as tonalidades vermelha e amarela. A guavira em pó apresentou coloração próxima do amarelo e marrom, com grande variação nos parâmetros de cor C* e H* em função das diferentes condições de secagem. A distribuição do tamanho de partículas não teve um padrão definido e o tamanho médio das amostras com maltodextrina foram maiores do que as com goma arábica para a temperatura do ar a 130 °C. No entanto, para as outras temperaturas (155 e 180) °C não houve um comportamento específico do tamanho das partículas em função da vazão de alimentação, tipo e ou concentração de agente carreador. A análise de microscopia eletrônica de varredura permitiu observar que as partículas obtidas tanto com maltodextrina como goma arábica apresentaram formato esférico, superfície rugosa e com adesão de partículas menores nas de maior tamanho, sendo que a superfície das partículas com goma arábica também apresentaram concavidades. A atividade antioxidante foi superior quando utilizada a temperatura de secagem intermediária. A partir das condições selecionadas na primeira etapa (temperatura do ar de 155 °C, vazão volumétrica da mistura de 40 mL/min e 10% de maltodextrina ou goma arábica) a polpa de guavira em pó foi caracterizada quanto a temperatura de transição vítrea, as isotermas de adsorção e a estabilidade à estocagem do ácido ascórbico, compostos fenólicos totais e da atividade antioxidante da polpa de guavira em pó produzida por spray drying ao longo de 120 dias. As temperaturas de transição vítrea foram de (25,2 ± 2,7 °C e 31,4 ± 0,4) °C para os pós produzidos com goma arábica e maltodextrina, respectivamente. O modelo de BET apresentou ajuste muito bom (R2>0,99) para descrever o comportamento de sorção de água das amostras nas temperaturas de (20, 30 e 40) °C. A polpa de guavira em pó produzida com goma arábica apresentou maior adsorção de água do que as amostras obtidas com maltodextrina. No estudo da estabilidade, as amostras foram acondicionadas em embalagem de polietileno laminado e armazenadas a 25 °C e umidade relativa de 75%. A embalagem de polietileno laminado foi eficiente na manutenção do teor de ácido ascórbico e atividade antioxidante da guavira em pó por um período de 120 dias, independente do carreador adicionado. O teor de compostos fenólicos para a guavira em pó com goma arábica apresentou uma redução nos primeiros 22 dias, contudo a amostra com maltodextrina manteve-se estável durante 120 dias de armazenamento.

Efeito da cirurgia bariátrica sobre parâmetros clínicos, laboratoriais e fatores de risco cardiovascular

Introdução - Na prevenção primária das doenças cardiovasculares, a adoção de estilo de vida saudável representa uma das estratégias mais importantes. Entretanto, baixos índices de adesão e o abandono da dieta constituem obstáculo importante ao tratamento. Neste sentido, as intervenções cirúrgicas surgiram como um mecanismo promotor da restrição alimentar e têm ganhado importância não só pelo tratamento da obesidade como também no controle dos fatores de risco cardiovascular e na possível redução da mortalidade. Através de estudos clínicos foi possível observar que estas estratégias cirúrgicas promovem profundas modificações estruturais no trato gastrointestinal gerando aumento da saciedade e da sensibilidade à insulina. Em especial para os pacientes diabéticos, por si só associados a maior risco cardiovascular, as cirurgias bariátricas seriam capazes de promover um efeito muito intenso e agudo sobre os marcadores relacionados ao desenvolvimento da aterosclerose. Um evento muito definido no tempo como uma intervenção cirúrgica pode ser muito útil para o estudo e identificação de mecanismos que ainda não estão completamente estabelecidos no processo aterosclerótico. Objetivos - Analisar o comportamento das variáveis laboratoriais, clínicas e estruturais relacionadas ao desenvolvimento e progressão da aterosclerose em indivíduos diabéticos submetidos à cirurgia bariátrica. Métodos - Foram incluídos vinte voluntários diabéticos refratários ao tratamento clínico e que apresentavam obesidade abdominal. Deste grupo, metade foi aleatoriamente selecionada para realização da cirurgia bariátrica e metade foi mantida em tratamento clínico otimizado. Todos os participantes foram submetidos a exames clínicos e bioquímicos nas mesmas ocasiões, até trinta dias antes da cirurgia, três e vinte e quatro meses após a cirurgia. Nestas ocasiões além do perfil lipídico e da glicemia, determinamos os hormônios incretínicos, adipocinas. A avaliação da quantidade de gordura epicárdica e a presença de esteatose hepática será realizada somente após dois anos de seguimento em conjunto com as demais variáveis,. Foram incluídos também 10 indivíduos saudáveis e com IMC dentro da normalidade, como parte do grupo controle. Estes indivíduos foram submetidos à coleta de sangue em dois momentos para avaliação dos mesmos metabólitos. Resultados - No momento pré-intervenção os indivíduos do grupo cirúrgico e clinico eram diferentes em relação ao IMC, Glicemia e Triglicérides, sendo assim, os resultados obtidos foram ajustados minimizando o impacto destas diferenças. Após o seguimento de 3 meses, o grupo cirúrgico apresentou redução significativa nos valores de peso, IMC (33,4 ± 2,6 vs. 27,4±2,8 kg/m2, p < 0,001), HbA1c (9,26 ± 2,12 vs. 6,18±0,63%, p < 0,001), CT (182,9 ± 45,4 vs. 139,8 ± 13 mg/dl, p < 0,001), HDL (33,1 ± 7,7 vs. 38,4 ± 10,6 mg/dL, p < 0,001), TG (369,5 ± 324,6 vs. 130,8 ± 43,1 mg/dL, p < 0,001), Pro-insulina (12.72±9,11 vs. 1,76±1,14 pM, p < 0,001), RBP-4 (9,85±2,53 vs. 7,3±1,35 ng/ml, p < 0,001) e CCK (84,8±33,2 vs. 79,9 ± 31,1, ng/ml, p < 0,001), houve também aumento significativo nos níveis de HDL-colesterol (33,1 ± 7,7 vs. 38,4 ± 10,6 mg/dL, p < 0,001), Glucagon (7,4 ± 7,9 vs. 10,2±9,7 pg/ml, p < 0,001) e FGF- 19 (74,1 ± 45,8 vs. 237,3 ± 234 pg/ml, p=0,001). Um dado interessante foi que os valores de Pro-insulina, RBP-4, HbA1c e HDL- colesterol no grupo cirúrgico atingiram valores similares àqueles do grupo controle três meses após a intervenção, sendo que o FGF-19 apresentava valor duas vezes maior do que o encontrado no grupo de indivíduos saudáveis (237 ± 234 vs. 98 ± 102,1 pg/ml). O grupo clínico não apresentou variação nas variáveis clinicas, apenas nos valores de glucagon com redução significativa no período pós-intervenção (18,1 ± 20,7 vs. 16,8 ± 18,4 pg/ml, p < 0,001). Conclusão - Concluímos que indivíduos diabéticos descompensados e refratários ao tratamento clínico, quando submetidos à cirurgia bariátrica, apresentam uma alteração profunda do ponto de vista clínico, metabólico e hormonal, em relação ao indivíduos de mesmo perfil mantidos em tratamento clínico otimizado. Esta importante alteração, observada já com três meses após a intervenção, pode representar uma importante redução do risco cardiovascular nestes indivíduos. Individualmente, a notável modificação dos valores de FGF-19 associadas à intervenção devem ser estudadas com maior profundidade para compreensão de seu significado e sua potencial utilidade como marcador ou como um dos protagonistas no mecanismo de prevenção cardiovascular

Estudo experimental do comportamento à fratura frágil em aços estruturais ferríticos e aplicações à determinação da curva mestra.

Este trabalho apresenta uma investigação experimental sobre o comportamento à fratura frágil de aços estruturais ferríticos, ASTM A285 Gr C e ASTM A515 Gr 65. Os resultados deste trabalho ampliam a base de dados de propriedades mecânicas utilizadas nas análises de integridade de estruturas pressurizadas tais como vasos de pressão e tanques de armazenamento construídos com esta classe de material. O trabalho tem por objetivo também avaliar a aplicabilidade de corpos de prova de dimensões reduzidas, PCVN, na determinação da temperatura de referência, T0, por meio da metodologia da Curva Mestra, a qual define a dependência da tenacidade à fratura do material em função da temperatura. Os ensaios de tenacidade à fratura foram conduzidos utilizando-se corpos de prova solicitados em flexão três pontos com geometria SE(B), PCVN e PCVN com entalhe lateral, extraídos de chapas laminadas. Os resultados dos ensaios foram obtidos em termos de integral J no momento da instabilidade, denotados por Jc. Dados adicionais de resistência à tração e de Impacto Charpy convencional também foram obtidos para caracterizar o comportamento mecânico dos aços utilizados. Os resultados mostraram uma forte influência da geometria dos corpos de prova sobre os valores de Jc, evidenciada pela grande variação nos valores de tenacidade à fratura.

PHORA: a system to solve the anaphora in Spanish

In this paper we present a whole Natural Language Processing (NLP) system for Spanish. The core of this system is the parser, which uses the grammatical formalism Lexical-Functional Grammars (LFG). Another important component of this system is the anaphora resolution module. To solve the anaphora, this module contains a method based on linguistic information (lexical, morphological, syntactic and semantic), structural information (anaphoric accessibility space in which the anaphor obtains the antecedent) and statistical information. This method is based on constraints and preferences and solves pronouns and definite descriptions. Moreover, this system fits dialogue and non-dialogue discourse features. The anaphora resolution module uses several resources, such as a lexical database (Spanish WordNet) to provide semantic information and a POS tagger providing the part of speech for each word and its root to make this resolution process easier.

Sequential and parallel synchronous alternating iterative methods

The so-called parallel multisplitting nonstationary iterative Model A was introduced by Bru, Elsner, and Neumann [Linear Algebra and its Applications 103:175-192 (1988)] for solving a nonsingular linear system Ax = b using a weak nonnegative multisplitting of the first type. In this paper new results are introduced when A is a monotone matrix using a weak nonnegative multisplitting of the second type and when A is a symmetric positive definite matrix using a P -regular multisplitting. Also, nonstationary alternating iterative methods are studied. Finally, combining Model A and alternating iterative methods, two new models of parallel multisplitting nonstationary iterations are introduced. When matrix A is monotone and the multisplittings are weak nonnegative of the first or of the second type, both models lead to convergent schemes. Also, when matrix A is symmetric positive definite and the multisplittings are P -regular, the schemes are also convergent.

Perfiles de estudiantes en la comprensión de la aproximación al área de una superficie bajo una curva

El objetivo de este estudio es identificar perfiles de estudiantes en la forma en que aproximan el área de la superficie bajo una curva. Los estudiantes participaron en un experimento de enseñanza dirigido a la construcción del concepto de integral definida partiendo de la idea de aproximación al área de una superficie. Las tareas fueron diseñadas atendiendo a una trayectoria hipotética de aprendizaje considerando las fases de construcción de un concepto apoyadas en la abstracción reflexiva. El análisis de las respuestas, teniendo en cuenta los distintos momentos del proceso de abstracción reflexiva, permitió identificar tres perfiles en la comprensión de la aproximación al área de una superficie bajo una curva.

Factores preditores e protectores da mortalidade por endocardite infecciosa - factores que condicionam a mortalidade intra-hospitalar e até 2 anos de seguimento

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014

Aristotelian predicables, universality and realism: the logic of comparison in topics as denying the view that Aristotle was a realist

Aristotle is reportedly held to have been a Moderate Realist in that he would maintain that a concept derives from an act of grasping a mind-independent universal object that exists somehow inside of the many different things which the concept is predicated of. As far as a universal is independent of mind, it would stand for the proper object of a concept that subsumes a given number of things as its own instantiations. But we claim that Aristotle rejected such a view and instead did perceive and comprehend universality as a feature of thought rather than as a feature of reality in its own right. As showed in the chapters of Topics regarding the so-called logic of comparison (with the support of Albert the Great’s commentary), each predicate can be more or less consistent with the attribute of the subject of which it may be predicated. Both essential and accidental attributes assume a definite degree of being related to the degree of belonging to substance. Unlike particular things, the universality of a concept is to be understood always in comparison with another concept according to a hierarchy of predicates in terms of universality degree arranged by comparative terms such as ‘more’, ‘less’, and ‘likewise’. What is really mind-independent are the truth conditions which make a universal true when exclusively referring to a set of things identically meant by the same predicate whose universality is given by the place occupied in the hierarchy of predicates.