A key to selected rockfishes (Sebastes spp.) based on mitochondrial DNA restriction fragment analysis

Larval and juvenile rockfishes (Sebastes spp.) are difficult to identify using morphological characters. We developed a key based on sizes of restriction endonuclease fragments of the NADH dehydrogenase-3 and -4 (ND3/ND4) and 12S and 16S ribosomal RNA (12S/16S) mitochondrial regions. The key makes use of variation in the ND3/ND4 region. Restriction endonuclease Dde I variation can corroborate identifications, as can 12S/16S variation. The key, based on 71 species, includes most North American taxa, several Asian species, and Sebastolobus alascanus and Helicolenus hilgendorfi that are closely related to rockfishes. Fifty-eight of 71 rockfish species in our database can be distinguished unequivocally, using one to five restriction enzymes; identities of the remaining species are narrowed to small groups: 1) S. polyspinis, S. crameri, and S. ciliatus or variabilis (the two species could not be distinguished and were considered as a single species) ; 2) S. chlorostictus, S. eos, and S. rosenblatti; 3) S. entomelas and S. mystinus; 4)S. emphaeus, S. variegatus, and S. wilsoni; and 5) S. carnatus and S. chrysomelas.

Comportamento territorial de Lipaugus lanioides (Aves: Cotingidae) em área de Floresta Atlântica na Ilha Grande, RJ

O comportamento territorial é uma estratégia de monopolização de recursos quando esses são essenciais para o sucesso reprodutivo de um organismo. Um território é uma área de uso exclusivo, defendido contra invasores coespecíficos de mesmo sexo, resultante da interação social entre vizinhos. A territorialidade exerce importante papel no sistema reprodutivo de uma espécie, pois influencia a participação do macho na reprodução. Nesses casos, as fêmeas podem obter vantagens diretas, como sítios de nidificação e cuidado parental. O comportamento territorial também exerce influência na regulação do tamanho populacional através de uma relação entre custos e benefícios individuais: em ambientes ótimos e com alta densidade populacional, os territórios são pequenos com pouca substituição, e jovens machos têm dificuldade para conseguirem estabelecer-se. O presente estudo teve como objetivo investigar aspectos comportamentais do tropeiro-da-serra, espécie rara e endêmica de Floresta Atlântica, com distribuição bastante restrita. Ao longo de 18 meses na Ilha Grande (RJ), analisamos seu comportamento territorial, mensuramos os tamanhos de territórios individuais de machos e realizamos estimativas de densidade populacional. O playback foi utilizado para atestar a presença de territorialidade na espécie, para simular a aproximação de coespecíficos (interações intraespecíficas) e para induzir o deslocamento dos indivíduos até os limites de seus territórios. Para investigar as respostas comportamentais à aproximação de invasores, analisamos quantitativamente as reações dos indivíduos a estímulos sonoros (vocalização espontânea e induzida pelo playback). Os territórios individuais foram definidos em duas estações reprodutivas através do método do Mínimo Polígono Convexo (MPC) em uma área equivalente a 20ha. A densidade populacional foi definida através do número de territórios encontrados e pelo número de indivíduos vistos/ouvidos por unidade de área através de transecções lineares. As vocalizações espontâneas e induzidas ocorreram somente entre os meses de agosto a janeiro, caracterizando uma estação reprodutiva bem definida. Durante este período, os machos tornaram-se solitários e agressivos com coespecíficos; na fase não-reprodutiva, entretanto, os indivíduos mostram-se sociáveis, forrageando em pequenos grupos de até quatro indivíduos. Os resultados indicam que o território é estabelecido para a monopolização de alimento e acesso às fêmeas. Essas observações sugerem que a espécie estudada é territorialista. Foram estimados sete territórios com valores entre 0,21ha e 0,73ha (0,43 + 0,16ha). Os indivíduos apresentaram fidelidade territorial, ocupando os mesmos territórios em duas estações reprodutivas. A densidade populacional de L. lanioides apresentou flutuações ao longo do ano, com os maiores valores encontrados durante a estação reprodutiva (variando entre 0,37 e 1,84 indivíduos/ha). Flutuações na densidade populacional podem apontar migrações altitudinais motivadas por variações na disponibilidade de recursos alimentares. Concluímos que o comportamento reprodutivo de L. lanioides não se enquadra no conceito de sistema reprodutivo em leks, conhecido em outros cotingídeos (ex. Lipaugus vociferans), no qual a corte é um comportamento social, com disputa por status de dominância, e o papel do macho resume-se à cópula sem benefícios diretos para as fêmeas. Dessa forma, os resultados do presente estudo trazem informações originais sobre a biologia de L. lanioides

Range-wide Yangtze freshwater dolphin expedition: The last chance to see Baiji?

Background, Aim and Scope. There are two species of fresh water cetaceans surviving in the Yangtze River system in China: Baiji (Lipotes vexillifer) and Yangtze finless porpoise (Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis). As a result of the expansion of human activities on the river, their distribution ranges appear to be decreasing and in the case of the Baiji, are even being restricted to several sections. The Baiji is the world's most critically endangered cetacean species with a population estimated at only a few tens of individuals. The Yangtze finless porpoise is the world's only freshwater-adapted population of the species, and it has been estimated that only around 1,000 individuals remain in the river system. In order to prevent the extinction of Baiji and a sharp decline in the abundance of the porpoise, in situ conservation (i.e. in the river) and two ex situ conservation (i.e. in semi-natural reserves and in captivity) strategies were proposed and have been implemented since the early 1990s. In view of both the severely endangered status of the animals and the severely degraded conditions of their habitats, the feasibility and actual status of these two strategies are raised for discussion. Main Features. The threats faced by the cetaceans are mainly from the unfettered exploitation of the river's resources. In the past 20 years, five nature reserves have been established along the river. Imposing maximum prohibition of harmful and illegal fishing methods in the reserves might prolong the process of extinction of these cetaceans in the wild, but so far, the administrative measures taken in the reserves have not yet kept the abundance from sharply declining. As human use of the river and its resources is expected to intensify for many decades into the future, the ability of the river to continue to support these species is certainly undecided. Therefore, rescuing animals from the river and establishing viable breeding populations in semi-natural reserves, in which the environment is similar to the main stream of the river, and in captivity, has to be considered urgently as the short-term goal of ex situ strategies. Since the abundance of porpoises is higher than that of the Baiji, we have first established breeding populations of them in the semi-natural reserves and in captivity. But, considering the extremely low density of Baiji in the river, an immediate range-wide Yangtze Baiji survey is an urgent need for locating and capturing sufficient Baiji for successfully establishing a breeding population of them in semi-natural reserves. Results. Two semi-natural reserves (in Shishou, Hubei Province, and Tongling, Anhui Province) have been set up along the river in order to establish breeding populations of the Baiji and the porpoises. So far, several small groups of porpoises that were caught in the main stream of the river have successively been introduced into the semi-natural reserves. Under careful management, these animals in both of the semi-natural reserves not only survive, but can also reproduce naturally and successfully. At least one or three calves were born in each reserve each year. Additionally, a breeding group of porpoises is being established at the Baiji Dolphinarium at the Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan. There are presently four adults and one calf living in the Dolphinarium. The calf, born in July, 2005, is the first captive bred Yangtze Finless Porpoise in the world. In preparation for the range-wide Yangtze cetacean survey, a 9-day pilot expedition on the river near Wuhan was conducted in March, 2006, in order to develop methods for locating the Baiji. No Baiji were expected to be seen in such a short period but about 40 porpoise sightings were observed. Results of the pilot survey indicated that traditional visual and acoustical survey methods for cetaceans should be adapted to find the elusive Baiji in the river. Currently, the range-wide Yangtze cetacean survey is in preparation. The survey will cover over 1,700 km of the Yangtze River from Yichang to Shanghai, and is expected to provide detailed information on Baiji and porpoise numbers and distribution patterns in the river. Discussion. Although the short-term goal of ex situ conservation is to rescue cetaceans from the river and to establish viable breeding populations in semi-natural reserves and in captivity, the long-term goal of releasing the animals back into the river when the threats have decreased and the natural environment has been improved, should not be neglected. Moreover, the in situ conservation efforts in the natural reserves, and even in the entire Yangtze River system, including the lakes, should not be ignored or abandoned at any time. The activities contributing to the conservation of the Baiji and the porpoise in the wild have the incidental effect of benefiting the entire Yangtze ecosystem and other rare threatened species. The dynamics of the groups of porpoises in semi-natural reserves should be monitored continually, in order to guide the establishment of breeding groups of Baiji in these semi-natural reserves in the near future. Conclusions. Under the existing severely degraded conditions of the Yangtze system, the sharply fall populations of Baiji and porpoises will not be suspended in the foreseeable future. Therefore, ex situ conservation should be emphasized, and the severely threatened Baiji in the river should be removed and translocated to semi-natural reserves for establishing viable breeding populations. The successful program of capturing, translocating and maintaining finless porpoises in the Shishou semi-natural reserve has demonstrated its adequacy as an ex situ environment for cetaceans. Following the successful pilot survey in the river, the immediate range-wide Yangtze cetacean survey is proposed and is in preparation. The range-wide survey is expected to ensure that any remaining Baiji can be found reliably and captured successfully after the survey. Recommendations and Perspectives. During the range-wide survey, not only the Baiji but also the porpoise as well as their habitats should be investigated based on visual and acoustical methods that adapted to the river and the animals. Meanwhile, the current risk levels to the Baiji and porpoises should be evaluated at each area where Baiji or porpoises can be reliably sighted. Any capture efforts should be targeted on the most threatened areas, or where there is maximum risk of injury or death. The immediate track of the Baiji should be carried out once a Baiji is sighted during the range-wide survey in order to obtain the movement route of the animals, which is crucial information for the successful capture operation. Additionally, the need to establish new semi-natural reserves for the porpoises should be placed on the agenda of local and central governments in the near future.

Shark personalities? Repeatability of social network traits in a widely distributed predatory fish. Behavioral Ecology and Sociobiology, 68, 1995-2003.

Interest in animal personalities has generated a burgeoning literature on repeatability in individual traits such as boldness or exploration through time or across different contexts. Yet, repeatability can be influenced by the interactive social strategies of individuals, for example, consistent inter-individual variation in aggression is well documented. Previous work has largely focused on the social aspects of repeatability in animal behaviour by testing individuals in dyadic pairings. Under natural conditions, individuals interact in a heterogeneous polyadic network. However, the extent to which there is repeatability of social traits at this higher order network level remains unknown. Here, we provide the first empirical evidence of consistent and repeatable animal social networks. Using a model species of shark, a taxonomic group in which repeatability in behaviour has yet to be described, we repeatedly quantified the social networks of ten independent shark groups across different habitats, testing repeatability in individual network position under changing environments. To understand better the mechanisms behind repeatable social behaviour, we also explored the coupling between individual preferences for specific group sizes and social network position. We quantify repeatability in sharks by demonstrating that despite changes in aggregation measured at the group level, the social network position of individuals is consistent across treatments. Group size preferences were found to influence the social network position of individuals in small groups but less so for larger groups suggesting network structure, and thus, repeatability was driven by social preference over aggregation tendency.

Threshold effects in the Teaching Space Allocation Problem with Splitting

Universities aim for good “Space Management” so as to use the teaching space efficiently. Part of this task is to assign rooms and time-slots to teaching activities with limited numbers and capacities of lecture theaters, seminar rooms, etc. It is also common that some teaching activities require splitting into multiple events. For example, lectures can be too large to fit in one room or good teaching practice requires that seminars/tutorials are taught in small groups. Then, space management involves decisions on splitting as well as the assignments to rooms and time-slots. These decisions must be made whilst satisfying the pedagogic requirements of the institution and constraints on space resources. The efficiency of such management can be measured by the “utilisation”: the percentage of available seat-hours actually used. In many institutions, the observed utilisation is unacceptably low, and this provides our underlying motivation: to study the factors that affect teaching space utilisation, with the goal of improving it. We give a brief introduction to our work in this area, and then introduce a specific model for splitting. We present experimental results that show threshold phenomena and associated easy-hard-easy patterns of computational difficulty. We discuss why such behaviour is of importance for space management.

Do hens have friends?

Recent interest in positive welfare has encouraged consideration of the formation of socio-positive relationships in farmed species which may provide a means by which to manage positive states. We investigated in detail the existence of dyadic preferential associations in small groups of domestic laying hens. Spatial and temporal associations were examined in two contexts (day activity and evening roosting), within 8 identical pens of 15 laying hens over 8 weeks. Little aggression was observed. Social network analysis was performed to investigate correlations in who associated with whom using weighted degree (number) and binary (presence or absence) data for shared resource areas and proximity to other individuals. No consistent evidence was found for hens actively preferring others in their choice of resource area, or in companion proximity. Perch-roosting positions chosen by the hens were compared with data generated from a random-choice model. Hens showed no position preferences. Most dyads were never observed roosting together and, although some apparently perched together frequently, the low number of nights perching and proportion of nights spent together indicates these findings should be interpreted with caution. Overall, we found no convincing evidence of dyadic preferential relationships expressed by close active and resting proximities. Further work is required to confirm whether these findings hold true in other experimental contexts, are affected by social experience and if they hold in common with the progenitor sub-species. © 2012 Elsevier B.V.

Size Matters: The Effect of the Scramble for Africa on Informal Institutions and Development

We argue that the partition of ethnic groups following the Scramble for Africa does not itself matter for development in Africa. It matters only when the partitioned groups are relatively small because small groups lack political representation which may promote ethnic mobilization and foster support for informal (rather than formal) institutions which then may a ect development. Furthermore, the analysis of data from the Afrobarometer shows that the persistence of informal/tribal institutions related to property rights and the rule of law is one of the possible channels through which the size of the partitioned group a ects development.

Uma abordagem curricular em matemática no 3º ciclo do ensino básico: um estudo de caso em geometria

Este trabalho debruça-se sobre as práticas de Ensino de Geometria no 3º ciclo do Ensino Básico tendo como principal foco de investigação as práticas de ensino da professora investigadora. O estudo empírico foi realizado em três turmas de 9º ano, da professora investigadora, de Abril a Junho de 2005, numa Escola da região de Trás-os-Montes (designada por Escola A). O trabalho realizado pela professora investigadora com alunos dessas turmas (no 7º em 2002/03, no 8º ano em 2003/04 e no 9º ano até Abril de 2005) constituiu o contexto precursor do estudo. O planeamento, desenvolvimento e reflexão sobre as práticas desenvolvidas foram realizados de forma colaborativa entre a professora investigadora e a critical friend, professora de Matemática a leccionar Matemática a turmas de 9º ano, numa outra Escola, da mesma região de Trás-os-Montes (designada por Escola B). A gestão curricular orientada por pressupostos legais em vigor e por resultados da investigação em Educação e Didáctica da Matemática foi realizada considerando o conhecimento informal e tácito de cada aluno; visou maximizar a aprendizagem matemática de todos os alunos em cada turma mas tendo a preocupação subjacente de proporcionar experiências de aprendizagem diversificadas de forma a favorecer todo o tipo de estilos de aprendizagem. O problema de investigação foi formulado a partir da seguinte questão: Como articular os esforços realizados e desenvolvidos pelo professor na sala de aula, de forma coerente e exequível, para promover aprendizagens significativas nos alunos, nomeadamente no domínio da Geometria? Face ao problema de investigação foram abordadas e estudadas as questões de investigação seguintes: 1. Quais são as características da experiência matemática proporcionada e qual é a sua relação com o que os alunos aprenderam? 2. Quais as características da avaliação implementada enquanto processo regulador das aprendizagens? 3. Qual a relação entre as tarefas de aprendizagem planificadas e as experiências de aprendizagem matemática proporcionadas? 4. Qual o papel das conferências com a critical friend (no desenvolvimento das experiências matemáticas proporcionadas) na gestão curricular? Este trabalho seguiu uma metodologia de investigação de natureza qualitativa baseado num estudo de caso, com uma vertente de investigação-acção, a partir de uma abordagem curricular em Geometria no 3º ciclo do Ensino Básico: a da professora investigadora. A observação participante e uma grande diversidade de documentos recolhidos (tarefas iniciais e reformuladas, cópias de relatórios, diários de bordo, transcrições das gravações áudio das conferências, etc.) constituíram as principais fontes de dados. Também foram considerados dados provenientes de instrumentos mais quantitativos, como de testes e de questionários. A análise de dados tomou como base a unidade de tempo de meio bloco de aulas (45 minutos) e as fases didácticas de realização de tarefas numa escala de investigação meso de forma a respeitar o trabalho na sala de aula e a sua complexidade. A triangulação de diversas fontes de dados permitiu apresentar: i) a experiência matemática proporcionada a partir das tarefas implementadas e os diferentes papéis assumidos pelo professor, pelos pequenos grupos de alunos ou pelo grupo turma; ii) as práticas avaliativas onde foram evidenciadas as diferentes formas de avaliação formativa e o feedback distribuído; iii) o envolvimento induzido e promovido nos alunos relativamente à sua aprendizagem matemática; iv) o papel crucial da critical friend na abordagem curricular em foco. A partir dos testes de competências e do questionário acerca do ensino, da avaliação e do modo de estudar dos alunos (QEAME) foi possível identificar os ganhos e o impacte desta abordagem curricular no desenvolvimento dos três tipos de constelações de competências e as percepções dos alunos relativamente à mediação realizada pela professora investigadora relativamente ao ensino, aprendizagem e métodos de estudo, respectivamente; a Listagem Dinâmica de Perguntas permitiu aumentar a consciência acerca dos itens trabalhados em sala de aula. A principal conclusão deste estudo é de que é possível implementar um currículo que desenvolva e favoreça a aquisição e desenvolvimento de competências na Geometria (desde as mais elementares até às de nível superior – nas diferentes constelações de reprodução, de conexão e de reflexão) onde o trabalho colaborativo entre os professores é fundamental na gestão e desenvolvimento curriculares. Como implicações para a investigação educacional em matemática surge a necessidade de se fomentar estudos investigacionais descritivos e holísticos em salas de aulas normais sobre as opções e razões das práticas de ensino, das actividades de aprendizagem e das diferentes formas de avaliação.

The function of drosophila integrin adhesion complexes in pupal hemocyte migration in vivo

Tese de doutoramento, Ciências Biomédicas (Biologia Celular e Molecular), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2014

Avaliação para as aprendizagens de alunos com necessidades educativas especiais no 1º ciclo de ensino básico : da diversidade da avaliação à avaliação da diversidade

Tese de doutoramento, Educação (Avaliação em Educação), Universidade de Lisboa, Instituto de Educação, 2014

Taking environmental engineering out of the laboratory

Environmental engineering is a core component of most construction and surveying undergraduate courses. It is generally accepted that students on these courses should have an understanding of thermal comfort, heat transfer, condensation, lighting, noise transmission and acoustics. Experiments are essential in developing students’ awareness and understanding of the underlying physical concepts which drive environmental engineering solutions. Traditionally these experiments have been conducted by students working in small groups in laboratories. However, increasing student numbers and, in particular, the growth in part time study, have placed significant additional demands on limited laboratory resources. The availability of reasonably priced, simple, hand-held equipment has made it possible for students to conduct experiments outside the confines of the laboratory. Furthermore, various professional software packages (some of which are freely available online) enable the resultant data to be further developed and analysed in conjunction with the conventional textbook approach. This paper examines these alternative approaches to the traditional laboratory experiment. An assessment is provided of the types of experiment which are both possible and appropriate, and the efficacy of these approaches is considered.

Teaching by leading and managing learning environments

The aim of this chapter is to promote an understanding of how different environments or settings within which students are asked or required to learn - such as large groups, small groups and laboratory and practice settings – have an impact on how they approach their learning and hence on the design and delivery of teaching. It provides an overview of underpinning principles and concepts before exploring their application in practice. The focus is on face-to-face teaching and learning.

A aprendizagem da Matemática no 1º ciclo através de atividades de investigação numa comunidade de aprendizagem

Dissertação apresentada para obtenção do grau de Mestre em Educação Matemática na Educação Pré-Escolar e nos 1º e 2º Ciclos do Ensino Básico na especialidade de Didática da Matemática

A aprendizagem cooperativa em alunos com dificuldades de aprendizagem

Projeto de Intervenção apresentado à Escola Superior de Educação de Lisboa para obtenção de grau de mestre em Educação Especial

Relatório de estágio

I - As minhas expectativas eram elevadas pois este regresso à Escola Superior de Música de Lisboa permitia-me voltar a trabalhar com os professores que me formaram como músico e professor e com eles poder actualizar-me sobre vários temas ligados à pedagogia. Este aspecto é muito importante pois chego à conclusão que o tempo por vezes provoca-nos excesso de confiança que parece “cegar-nos” não nos deixando ver erros pedagógicos muitas vezes evitáveis. Quando ingressei neste estágio sentia-me confiante e seguro quanto às minhas capacidades como professor. O momento de viragem na minha perspectiva do estágio dá-se quando surgem as observações/gravações e respectivas análises e reflexões das aulas. Procurei trabalhar nessas aulas da forma mais natural possível pois o meu objectivo era observar o meu trabalho diário. A primeira observação das aulas permitiu-me anotar algumas coisas menos boas. Contudo, quando essa observação foi feita com o professor de didática os aspectos menos positivos ganharam uma enorme proporção: (1) falhas ao nível da instrução: demasiado longo, (2) feedback de pouca qualidade ou eficácia , (3) pouca percentagem de alunos que atingiam os objectivos., (4) ritmo de aula por vezes baixo devido a períodos longos de instrução ou devido a uma má gestão do espaço. Todos estes problemas eram mais visíveis quando as turmas eram maiores. Ao longo do estágio, e após a detecção destas falhas, fui procurando evitar estas práticas em todas as turmas onde leccionava. Senti que o ritmo de aula aumentou substancialmente não apenas à custa da energia do professor e de boas estratégias mas porque sobretudo se “falava menos e trabalhava-se mais”. Os erros dos alunos passaram a ser corrigos enquanto trabalhavam (feedback corretivo próximo do momento positivo ou negativo), o feedback positivo passou a ser mais destacado, a disposição da sala alterou-se de forma aos alunos estarem mais perto do professor, e este procurou ser menos “criativo” no momento de alterar o plano de aula devido a ideias momentâneas o que provocou mais tempo para cada estratégia e para que mais alunos fossem atingindo os objectivos. Apesar da evolução no sentido de proporcionar aos alunos aulas mais rentáveis e de ainda melhor qualidade, existe a consciência que alguns dos erros cometidos eram hábitos e como tal poderão levar algum tempo a ser corrigidos. Contudo, existe a consciência e a vontade em debelá-los da minha prática docente.