Rapid molecular diagnosis of tuberculosis and other mycobacteriosis in smear-negative clinical specimens

Delay in diagnosis of pulmonary and other forms of tuberculosis (TB) can be fatal, particularly in HIV-infected patients. Hence, techniques based on nucleic acid amplification, which are both rapid and of high specificity and sensitivity, are now widely used and recommended for laboratories that diagnose TB. In the present study, diagnostic methods based on mycobacterial DNA amplification were evaluated in comparative trials alongside tradicional bacterial methods, using negative smear samples from patients with clinically-suspected TB (sputum samples from 25 patients with suspected pulmonary TB, urine samples from two patients with suspected renal TB and cerebrospinal fluid samples from one patient with suspected meningeal TB). A specificity of 100% was achieved with DNA amplification methods and tradicional culture/identification methods, in relation to clinical findings and treatment results. For the smear-negative sputa, conventional PCR for M. tuberculosis was positive in 62% of suspected lung TB case, showing the same sensitivity as bacterial identification. Both techniques failed in the detection of extra-pulmonary samples. Nested PCR showed, after species-specific amplification, a sensitivity of 100% for M. avium and 85% for M. tuberculosis. For extra-pulmonary smear-negative samples, only Nested PCR detected M. tuberculosis and all cases were confirmed clinically. Nested PCR, in which two-step amplification reactions are performed, can identify the two most important mycobacteria in human pathology quickly and directly from clinical spicimens.

Atividade anti-micobacteriana de extratos de folhas de Byrsonima crassa Nied

In this study, the antimycobacterial activity of chloroformic and methanolic extracts obtained from Byrsonima crassa leaves was evaluated. Antimycobacterial activity was assessed through the microtechnique named Microplate Alamar Blue Assay (MABA) and the promising active principles were identified by spectrophotometric analysis. The chloroformic extract presenting 62.5 μg mL-1 minimum inhibitory concentration (MIC) showed to be active against tuberculosis bacillus. The MIC value of the methanolic extract was 1000 μg mL-1. For the chloroformic one , phytochemical analysis indicated that antimycobacterial activity might be related to the presence of triterpenes.

Search for violation of Lorentz invariance in top quark pair production and decay

Using data collected with the D0 detector at the Fermilab Tevatron Collider, corresponding to 5.3fb -1 of integrated luminosity, we search for violation of Lorentz invariance by examining the tt̄ production cross section in lepton+jets final states. We quantify this violation using the standard-model extension framework, which predicts a dependence of the tt̄ production cross section on sidereal time as the orientation of the detector changes with the rotation of the Earth. Within this framework, we measure components of the matrices (c Q) μν33 and (c U) μν33 containing coefficients used to parametrize violation of Lorentz invariance in the top quark sector. Within uncertainties, these coefficients are found to be consistent with zero. © 2012 American Physical Society.

Ethanolic extract of Mimosa caesalpiniifolia leaves: Chemical characterization and cytotoxic effect on human breast cancer MCF-7 cell line

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Multiplex-PCR for differentiation of Mycobacterium bovis from Mycobacterium tuberculosis complex

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

A geometria da Esponja de Menger

Neste trabalho estudaremos algumas propriedades geom´etricas do fractal “Esponja de Menger”, que é um objeto matemático construído através de um processo recursivo infinito que o torna auto-semelhante. Além disso, a dimens˜ao de um fractal n˜ao é necessariamente um número inteiro, diferentemente do que ocorre com os objetos da Geometria Euclidiana. Mais ainda, a Esponja possui área infinita e volume nulo, fatos que demonstraremos ao longo deste texto.

Genes differentially expressed by Mycobacterium tuberculosis after exposure to ruthenium phosphinic compound and isoniazid

Background- The evaluation of the effects of new compounds and nonconventional anti-tuberculous drugs have grown and become increas-ingly more popular in recent years. Studies have shown anti-tuberculous activity for Ruthenium complexes, including organometallic com-pounds containing phosphine ligands such as picolinic acid generating great expectations and hopes. Methods- The Representational Difference Analysis (RDA) was applied in order to gain insight about differences in expression of Mycobacte-rium tuberculosis H37Rv exposed to [Ru(dppb)(pic)(bypy)] PF6 (SCAR1) and isoniazid (INH). Total RNA was extracted from the bacillus not exposed and exposed to SCAR1 and INH separately at concentration of MIC for 12 hours at 35°C. RDA was carried out and differentially expressed products were sequenced. Results- RDA-sequencing identified, for both compounds, orthologs that encode hypothetical and predict proteins. One related cell wall syn-thesis gene, identified by RDA, and genes related to INH target as inhA, katG and ahpC had their expression confirmed and quantified by real-time PCR. The gene encoding the cell wall associated hydrolase was induced 4.627 and 1.189, inhA 0.983 and 1.027, katG 1.111 and 1.345 and ahpC 1.063 and 1.039 fold after exposure to SCAR1 and INH respectively, compared to not exposed growth. Conclusion- The RDA brings, for the first time, directions to study related genes with metabolic pathways of SCAR1. RDA and Real-Time PCR highlight the idea that one of the SCAR1 interaction, in M tuberculosis may be in the cell wall biosynthesis considering the differential expression of a cell wall hydrolase and warrants further investigation.

GeoGebra e o método de Briot & Bouquet para a resolução gráfica de equações cúbicas

In the mid-nineteenth century, french mathematicians Briot and Bouquet have proposed an intriguing graphical method for solving cubic equations "depressed" - the third degree equations that do not have the quadratic term. The proposal is simple geometric construction, though based on an ingenious algebra. We propose here the verification and testing graphical method through an instructional sequence using the software GeoGebra also present the ingenious algebraic development that resulted in this graphic method for determination of real roots of a cubic equation of the type x³ + px + q = 0 where p and q are real numbers. The method states that these solutions are summarized in the abscissas of the points of intersection of the circumference containing the origin and the center C (-q/2, 1-p/2) with the parable y = x².

Ensino de geometria espacial na licenciatura em matemática: uma proposta de trabalho com grupos colaborativos

Apresenta-se neste trabalho experiências obtidas através de 06 (seis) anos consecutivos de trabalho com a disciplina de Geometria Espacial em turmas de formação inicial de professores de matemática. A proposta de trabalho em grupos colaborativos se justifica pela necessidade atual de os professores em atividade utilizarem essa poderosa ferramenta como facilitadora da aprendizagem pessoal e dos estudantes sob sua orientação. Os alunos das várias turmas foram desafiados à tarefa de apresentarem, ao final da disciplina (semestre), um trabalho contendo: material escrito (capa, formatação, desenvolvimento do tema, cálculos, desenhos, resultados e referências), material concreto produzido com canudos e fitilho (sólidos construídos: acabamento, uniformização, montagem e medidas) e apresentação oral do grupo (arquivos de programas de apresentação). A metodologia proposta para a realização dessa tarefa em todas as turmas foi de grupos colaborativos, com em média 05 (cinco) alunos cada. Para a 1ª turma foi proposta a construção de “esqueletos” dos poliedros de Platão, com a maior aresta (canudinho) fixada. Cada grupo deveria observar uma propriedade dentre as seguintes: sólidos com a mesma área total; com o mesmo volume; com uma mesma esfera inscrita e com uma mesma esfera circunscrita. Todo material coletado dos grupos (escrito, construído ou digital/apresentação oral), está sendo devidamente catalogado, para então ser disponibilizado no Laboratório de Ensino de Matemática do referido curso. Os trabalhos propostos posteriormente foram gradativamente sendo mais desafiadores. O último trabalho proposto (2012) teve o seguinte tema: Poliedros Arquimedianos ou semirregulares.

Sobre a compacidade lógica e topológica

Os ambientes da L´ogica e da Topologia tˆem a compacidade como uma propriedade importante. Nos dois diferentes contextos as no¸c˜oes de compacidade s˜ao diversas. Na l´ogica, dizemos que um conjunto de f´ormulas ∆ ´e compacto quando a existˆencia de modelo para todo subconjunto finito de ∆ implica que tamb´em ∆ tem modelo. A l´ogica ´e compacta, se o conjunto de suas f´ormulas v´alidas ´e compacto. Na topologia, um conjunto A ´e compacto, caso qualquer cobertura de A por abertos admita uma subcobertura finita. Neste trabalho, mostramos uma maneira de relacionar tais no¸c˜oes de compacidade.

Jogos no Ensino de Matemática: experiências com o fecha a caixa

Apresentamos neste trabalho experiências obtidas na aplicação de um dos jogos desenvolvidos como parte do projeto de Extensão “Ensinado Matemática através de Jogos, Modelos Geométricos e Informática”, o qual tem como objetivo desenvolver entre os alunos do ensino fundamental e médio o estímulo pelo interesse em Matemática e o aprimoramento de seus conhecimentos nesta área, o que é propiciado através do contato com problemas desafiantes e da interação com outros colegas e docentes, despertando o gosto e interesse pela investigação matemática, através dos jogos, modelos geométricos e softwares. O “Ensinando Matemática através de jogos, modelos geométricos e informática” conta com a colaboração de 3 docentes do departamento de Matemática da UNESP-Bauru e envolve a cidade de Bauru com várias escolas públicas de ensino médio, participando as três séries deste nível. Um dos objetivos dos departamentos de Matemática das universidades brasileiras é estimular o interesse dos graduandos ingressantes pelo raciocínio lógico. Outro ângulo é buscar meios de incentivo para alunos e professores, na tentativa de colaborar para a melhoria do quadro brasileiro que se coloca. Com este projeto estamos estimulando o gosto pela Matemática, propiciando uma maior interação professor / aluno, e promovendo uma aproximação comunidade / universidade, fazendo com que o aluno tenha uma nova visão da Matemática através dos jogos. Assim, de forma lúdica, estamos fazendo com que este aluno pense nos conceitos aprendidos na sala de aula, questione a lógica usada para fazer o pensamento, fazendo com que este estudante crie conexões entre as várias áreas da matemática. Dentre os jogos aplicados, o “fecha a caixa” tem nos proporcionado atingir este objetivo, como apresentamos no decorrer do nosso texto.

Aplicando o jogo Avançando com o resto no Ensino de Matemática

Como é conhecido pela maioria, infelizmente, o ensino de matemática vem enfrentando muitas dificuldades. Cerca o ensino dessa disciplina mitos, preconceitos, que fazem com que o estudante, muitas vezes, já chegue à escola com medo das aulas de matemática. Por outro lado, ainda perdura em muitas escolas um ensino focado na reprodução e não na construção do conhecimento, apesar de alguns professores buscarem alternativas para tornarem as aulas mais atrativas, priorizando atividades interessantes e motivadoras. O famoso livro didático e os caderninhos de apoio enviados pela secretaria do estado da educação ainda continuam sendo os principais recursos disponíveis na sala de aula. Os exercícios e listas, muitas vezes considerados intermináveis, buscam sem sucesso fixar um conhecimento que muitas vezes não foram se quer apropriado pelos alunos. Diante do exposto faz-se necessário pensar em transformações no ensino de matemática que ultrapassem a simples reprodução de exercícios e permitam tanto para o professor, quanto para o aluno um ensino mais atraente e desafiador e principalmente repleto de significados. Dessa forma, este estudo tem como objetivo mostrar ao aluno, a partir dos jogos matemáticos, a diversão e, também, a superação, possibilitando a construção de aprendizagens significativas.

Introdução à teoria de Poincaré-Bendixson para campos de vetores planares

O Teorema de Poincaré-Bendixson é um resultado muito importante no estudo de Sistemas Dinâmicos, pois ele estabelece para quais tipos de conjunto limite as trajetórias de um campo de vetores em IR2 deve convergir. Neste trabalho vamos abordar a Funç˜ao do primeiro Retorno de Poincaré, além de discutir a estabilidade de Ciclos Limites e provar o Teorema de Poincaré-Bendixson.