Local Commons: A visual approach to collective city making through situated community engagement

Due to the numerous possibilities of voicing concerns and the flood of data we are exposed to, local issues are sometimes at risk of being overlooked. This study explores Local Commons, a design intervention in public space that combines situated digital and tangible media in order to engage communities in contributing and debating different perspectives on a given local issue. The intervention invited the community to submit images of their perspectives on the issue, which were displayed on a public screen. Via tangible buttons in front of the screen, community members then agree or disagree on the displayed perspectives, creating a space for deliberation. In a user study, we were specifically interested in testing three aspects of our intervention, which are discussed in this paper: The difference that situatedness, visual content, and tangible interaction can make to urban community engagement.

Common genetic variants influence human subcortical brain structures

The highly complex structure of the human brain is strongly shaped by genetic influences. Subcortical brain regions form circuits with cortical areas to coordinate movement, learning, memory and motivation, and altered circuits can lead to abnormal behaviour and disease. To investigate how common genetic variants affect the structure of these brain regions, here we conduct genome-wide association studies of the volumes of seven subcortical regions and the intracranial volume derived from magnetic resonance images of 30,717 individuals from 50 cohorts. We identify five novel genetic variants influencing the volumes of the putamen and caudate nucleus. We also find stronger evidence for three loci with previously established influences on hippocampal volume and intracranial volume. These variants show specific volumetric effects on brain structures rather than global effects across structures. The strongest effects were found for the putamen, where a novel intergenic locus with replicable influence on volume (rs945270; P = 1.08×10 -33; 0.52% variance explained) showed evidence of altering the expression of the KTN1 gene in both brain and blood tissue. Variants influencing putamen volume clustered near developmental genes that regulate apoptosis, axon guidance and vesicle transport. Identification of these genetic variants provides insight into the causes of variability in human brain development, and may help to determine mechanisms of neuropsychiatric dysfunction.

Identification of common variants associated with human hippocampal and intracranial volumes

Identifying genetic variants influencing human brain structures may reveal new biological mechanisms underlying cognition and neuropsychiatric illness. The volume of the hippocampus is a biomarker of incipient Alzheimer's disease and is reduced in schizophrenia, major depression and mesial temporal lobe epilepsy. Whereas many brain imaging phenotypes are highly heritable, identifying and replicating genetic influences has been difficult, as small effects and the high costs of magnetic resonance imaging (MRI) have led to underpowered studies. Here we report genome-wide association meta-analyses and replication for mean bilateral hippocampal, total brain and intracranial volumes from a large multinational consortium. The intergenic variant rs7294919 was associated with hippocampal volume (12q24.22; N = 21,151; P = 6.70 × 10 -16) and the expression levels of the positional candidate gene TESC in brain tissue. Additionally, rs10784502, located within HMGA2, was associated with intracranial volume (12q14.3; N = 15,782; P = 1.12 × 10 -12). We also identified a suggestive association with total brain volume at rs10494373 within DDR2 (1q23.3; N = 6,500; P = 5.81 × 10 -7).

The ENIGMA Consortium: Large-scale collaborative analyses of neuroimaging and genetic data

The Enhancing NeuroImaging Genetics through Meta-Analysis (ENIGMA) Consortium is a collaborative network of researchers working together on a range of large-scale studies that integrate data from 70 institutions worldwide. Organized into Working Groups that tackle questions in neuroscience, genetics, and medicine, ENIGMA studies have analyzed neuroimaging data from over 12,826 subjects. In addition, data from 12,171 individuals were provided by the CHARGE consortium for replication of findings, in a total of 24,997 subjects. By meta-analyzing results from many sites, ENIGMA has detected factors that affect the brain that no individual site could detect on its own, and that require larger numbers of subjects than any individual neuroimaging study has currently collected. ENIGMA's first project was a genome-wide association study identifying common variants in the genome associated with hippocampal volume or intracranial volume. Continuing work is exploring genetic associations with subcortical volumes (ENIGMA2) and white matter microstructure (ENIGMA-DTI). Working groups also focus on understanding how schizophrenia, bipolar illness, major depression and attention deficit/hyperactivity disorder (ADHD) affect the brain. We review the current progress of the ENIGMA Consortium, along with challenges and unexpected discoveries made on the way.

Automated categorisation of patent claims that reference human genome sequences

Debates on gene patents have necessitated the analysis of patents that disclose and reference human sequences. In this study, we built an automated classifier that assigns sequences to one of nine predefined categories according to their functional roles in patent claims by applying natural language processing and supervised learning techniques. To improve its correctness, we experimented with various feature mappings, resulting in the maximal accuracy of 79%.

Optimal management of the critically Ill: Anaesthesia, monitoring, data capture, and point-of-care technological practices in ovine models of critical care

Animal models of critical illness are vital in biomedical research. They provide possibilities for the investigation of pathophysiological processes that may not otherwise be possible in humans. In order to be clinically applicable, the model should simulate the critical care situation realistically, including anaesthesia, monitoring, sampling, utilising appropriate personnel skill mix, and therapeutic interventions. There are limited data documenting the constitution of ideal technologically advanced large animal critical care practices and all the processes of the animal model. In this paper, we describe the procedure of animal preparation, anaesthesia induction and maintenance, physiologic monitoring, data capture, point-of-care technology, and animal aftercare that has been successfully used to study several novel ovine models of critical illness. The relevant investigations are on respiratory failure due to smoke inhalation, transfusion related acute lung injury, endotoxin-induced proteogenomic alterations, haemorrhagic shock, septic shock, brain death, cerebral microcirculation, and artificial heart studies. We have demonstrated the functionality of monitoring practices during anaesthesia required to provide a platform for undertaking systematic investigations in complex ovine models of critical illness.

Genetic determinants of heel bone properties: Genome-wide association meta-analysis and replication in the GEFOS/GENOMOS consortium

Quantitative ultrasound of the heel captures heel bone properties that independently predict fracture risk and, with bone mineral density (BMD) assessed by X-ray (DXA), may be convenient alternatives for evaluating osteoporosis and fracture risk. We performed a meta-analysis of genome-wide association (GWA) studies to assess the genetic determinants of heel broadband ultrasound attenuation (BUA; n 5 14 260), velocity of sound (VOS; n 5 15 514) and BMD (n 5 4566) in 13 discovery cohorts. Independent replication involved seven cohorts with GWA data (in silico n 5 11 452) and new genotyping in 15 cohorts (de novo n 5 24 902). In combined random effects, meta-analysis of the discovery and replication cohorts, nine single nucleotide polymorphisms (SNPs) had genome-wide significant (P < 5 3 108) associations with heel bone properties. Alongside SNPs within or near previously identified osteoporosis susceptibility genes including ESR1 (6q25.1: rs4869739, rs3020331, rs2982552), SPTBN1 (2p16.2: rs11898505), RSPO3 (6q22.33: rs7741021), WNT16 (7q31.31: rs2908007), DKK1 (10q21.1: rs7902708) and GPATCH1 (19q13.11: rs10416265), we identified a new locus on chromosome 11q14.2 (rs597319 close to TMEM135, a gene recently linked to osteoblastogenesis and longevity) significantly associated with both BUA and VOS (P < 8.23 3 1014). In meta-analyses involving 25 cohorts with up to 14 985 fracture cases, six of 10 SNPs associated with heel bone properties at P < 5 3 106 also had the expected direction of association with any fracture (P < 0.05), including threeSNPswithP < 0.005: 6q22.33 (rs7741021), 7q31.31 (rs2908007) and 10q21.1 (rs7902708). In conclusion, thisGWAstudy reveals the effect of several genescommon to central DXA-derivedBMDand heel ultrasound/DXAmeasures and points to anewgenetic locus with potential implications for better understanding of osteoporosis pathophysiology.

More fertile florets and grains per spike can be achieved at higher temperature in wheat lines with high spike biomass and sugar content at booting

An understanding of processes regulating wheat floret and grain number at higher temperatures is required to better exploit genetic variation. In this study we tested the hypothesis that at higher temperatures, a reduction in floret fertility is associated with a decrease in soluble sugars and this response is exacerbated in genotypes low in water soluble carbohydrates (WSC). Four recombinant inbred lines contrasting for stem WSC were grown at 20/10 degrees C and 11 h photoperiod until terminal spikelet, and then continued in a factorial combination of 20/10 degrees C or 28/14 degrees C with 11 h or 16 h photoperiod until anthesis. Across environments, High WSC lines had more grains per spike associated with more florets per spike. The number of fertile florets was associated with spike biomass at booting and, by extension, with glucose amount, both higher in High WSC lines. At booting, High WSC lines had higher fixed C-13 and higher levels of expression of genes involved in photosynthesis and sucrose transport and lower in sucrose degradation compared with Low WSC lines. At higher temperature, the intrinsic rate of floret development rate before booting was slower in High WSC lines. Grain set declined with the intrinsic rate of floret development before booting, with an advantage for High WSC lines at 28/14 degrees C and 16 h. Genotypic and environmental action on floret fertility and grain set was summarised in a model.

"Elämää yhdellä siivellä lentäen" : Suomessa asuvien Chilen pakolaisten ja heidän jälkeläistensä historiatietoisuus

The starting point of this study was to find out how the historical consciousness manifest in conceptions and experiences of Chilean refugees and their descendants. The previous research of historical consciousness has shown that powerful experiences such as the revolution and being a refugee may have an effect on historical consciousness. The purpose of this study is to solve how those experiences in the past have influenced Chilean refugees and their descendant s interpretations of the present and expectations for the future. The research material was collected by interviewing four Chilean refugees that escaped to Finland in years 1973 1976 and four young adults who represent the second generation. All second generation interviewees were born in Finland and their other parent or both parents were Chilean refugees. The two groups were not in a family relation to each other. The empirical part of the research was made by qualitative methods. The research material was collected by the method of focused interview and it was analysed by the qualitative data analysis software Atlas.ti 6.0. Content analysis was the main research tool. The previous theory of historical consciousness and the study questions was used to create the seven categories that manifest historical consciousness. The seven categories were biographical memory, collective memory, experiences of living between two cultures, idea of man, the essence of history and the reason for living, value conceptions and expectations of the future. Content analysis was based on those categories. Subcategories were based on the research material and were created during the analysis. The results of this study were made up of categories. The study revealed that experiences of revolution and of being a refugee has a significant role in the historical consciousness of the Chilean refugees. It became evident in their biographical memory being separated in three parts, in their values and in the belief of possibility of an individual to govern her own life. The second generation was also exposed to their parent s experiences in the past. The collective trauma in their parent s past has been part of their life indirectly and has affected the way they think of themselves, their concepts and their place in the present world. The active and regular retrospection in Finland by Chilean adults and special Gabriela Mistral club activities has played a big part in the construction of their historical consciousness.

A Mycobacterial Phosphoribosyltransferase Promotes Bacillary Survival by Inhibiting Oxidative Stress and Autophagy Pathways in Macrophages and Zebrafish

Mycobacterium tuberculosis employs various strategies to modulate host immune responses to facilitate its persistence in macrophages. The M. tuberculosis cell wall contains numerous glycoproteins with unknown roles in pathogenesis. Here, by using Concanavalin A and LC-MS analysis, we identified a novel mannosylated glycoprotein phosphoribosyltransferase, encoded by Rv3242c from M. tuberculosis cell walls. Homology modeling, bioinformatic analyses, and an assay of phosphoribosyltransferase activity in Mycobacterium smegmatis expressing recombinant Rv3242c (MsmRv3242c) confirmed the mass spectrometry data. Using Mycobacterium marinum-zebrafish and the surrogate MsmRv3242c infection models, we proved that phosphoribosyltransferase is involved in mycobacterial virulence. Histological and infection assays showed that the M. marinum mimG mutant, an Rv3242c orthologue in a pathogenic M. marinum strain, was strongly attenuated in adult zebrafish and also survived less in macrophages. In contrast, infection with wild type and the complemented Delta mimG: Rv3242c M. marinum strains showed prominent pathological features, such as severe emaciation, skin lesions, hemorrhaging, and more zebrafish death. Similarly, recombinant Msm Rv3242c bacteria showed increased invasion in non-phagocytic epithelial cells and longer intracellular survival in macrophages as compared with wild type and vector control M. smegmatis strains. Further mechanistic studies revealed that the Rv3242c- and mimG-mediated enhancement of intramacrophagic survival was due to inhibition of autophagy, reactive oxygen species, and reduced activities of superoxide dismutase and catalase enzymes. Infection with MsmRv3242c also activated the MAPK pathway, NF-kappa B, and inflammatory cytokines. In summary, we show that a novel mycobacterial mannosylated phosphoribosyltransferase acts as a virulence and immunomodulatory factor, suggesting that it may constitute a novel target for antimycobacterial drugs.

Evaluación del comportamiento de falso roble (Tabebuia rosea (Bertol.) DC.), Genízaro (Pithecellobium saman (Jacq.) Benth.) y Guanacaste negro (Enterolobium cyclocarpum (Jacq.) Griseb.) en ensayo de germinación y sembrados en dos tipos de sustrato orgánico

Las etapas de este trabajo de investigación se llevaron a cabo en las instalaciones del invernadero y vivero de la Universidad Nacional Agraria, ubicada a la altura del kilómetro 12 carretera norte en la ciudad de Managua. Se realizó un ensayo de germinación con semillas falso roble Tabebuia rosea (Bertol.) DC., genízaro Phitecellobium saman (Jacq.) Benth. y guanacaste negro Enterolobium cyclocarpum (Jacq.) Griseb., para cuantificar el porcentaje, energía y valor de la germinación aplicando tratamientos pre germinativos. Posteriormente, en vivero, se establecieron dichas especies en un diseño de bloques completos al azar con tres bloques por especie, tres tratamientos por bloque y noventa repeticiones por tratamiento, realizando un ANDEVA y aplicando una prueba de separación de medias. Las variables evaluadas en el ANDEVA fueron altura total y diámetro basal. Separadamente se evaluó la mortalidad y sobrevivencia de las plantas en el vivero. El tratamiento pre germinativo que dio mejores resultados fue el rompimiento de la testa en el extremo donde se encuentra el micrópilo, con porcentajes de germinación superiores al 90%. No se encontraron diferencias significativas entre tratamientos, por lo cual no hubo efecto de los sustratos sobre los incrementos de las plantas de genízaro Phitecellobium saman (Jacq.) Benth. y se encontraron diferencias significativas entre tratamientos y variables para guanancaste negro Enterolobium cyclocarpum (Jacq.) Griseb. con los mayores incrementos en compostaje con 29,32 cm y los menores en tierra común 18,82 cm. El compostaje fue el sustrato donde ocurrió la mayor sobrevivencia de guanacaste negro Phitecellobium saman (Jacq.) Benth. con 85% y genízaro Phitecellobium saman (Jacq.) Benth. con 66%. Los valores de mortalidad fueron menores al 26% en todos los sustratos.

Evaluación ex-ante del mejoramiento de los sistemas de producción ganadero de doble propósito a través de inversiones propuestas por los mismos ganaderos en la zona de Muy Muy, Matagalpa

El presente trabajo se realizó con el objetivo de evaluar exante la factibilidad técnica y financiera de inversiones propuestas por los mismos ganaderos en la zona de Muy muy, Matagalpa. El estudio se llevó a cabo en dos fases: Una fase preliminar de diagnóstico, en la que se determinó, la disponibilidad y uso actual de los recursos en las fincas, así como las propuestas planteadas por los productores, comprendiéndose en una sub-fase de ésta etapa preliminar un diagnóstico de las características generales de los canales de comercialización y precios de los productos agropecuarios generados por la actividad ganadera de la zona. La segunda fase comprendió el procesamiento y computación de la información. La información relativa a los recursos, se procesó para cada una de las fincas y en base a ello, se estimaron los diferentes parámetros técnicos y elementos fuentes de ingresos y egresos, elaborándose también las diferentes proyecciones de hato por finca, así mismo de disponibilidades de pastos, mano de obra e insumos. Para efectos de analizar tanto el uso eficiente de las pasturas como de los resultados financieros, las fincas se agruparon en cuatro dominios de recomendación en función de sus áreas. En los aspectos técnicos se determinó que la actividad de las fincas es la ganadería ya que en promedio, el 82.33% de las áreas totales por finca se destina a esta actividad, ocupando los pastos mejorados en promedio el 67.44% y un promedio de 32.56% los pastos naturales. Con el proyecto el área ganadera se incrementa en un promedio de 2.46%, pasando a representar los pastos mejorados un promedio de 92.65% y el natural el 7.35%, reduciéndose éste último en un promedio de 25.21%. Las cargas animales encontradas fluctuaron en un rango de 18.6 U.A./mz. a 268.3 U.A./mz. siendo éste en cinco de las nueve fincas superiores a las disponibilidades que resultan por tanto negativas en un rango de -36.3 a -3.8 U.A., con el proyecto las cargas animales se incrementan a valores comprendidos entre 54.2 y 456.5 U.A., resultando sin embargo las disponibilidades positivas en seis de las nueve fincas para el año décimo del proyecto en un rango comprendido entre +2.5 a +16.2 U.A., a excepción de tres fincas en las cuales los déficit reflejan valores entre -2.6 y -43.1 U.A. En lo que se refiere a los niveles de eficiencia en el aprovechamiento de las pasturas, las fincas La Palma y El Castaño resultaron ser las más eficientes, manteniendo sus niveles de aprovechamiento próximo al nivel óptimo de manera en periodo de años más prolongados. El número de cabezas de ganado encontrado por finca, fluctuó entre 20 y 290, como efecto de los proyectos el hato total tendría un incremento promedio anual de 7.5%, es decir 10.58 cabezas por año. La natalidad encontrada en promedio fue mortalidad de terneros 7.04%, descarte de vacas de 50.8%, 10.72% y relación vaca-toro 19:1. Para el año décimo de los los promedios de estos coeficientes alcanzan: 53.1%, mortalidad de terneros 4.46% y descarte de 19.55%. proyectos natalidad vientres. La edad de incorporación de vaquillas resultó entre 2.5 a 3 años. En la composición racial se encontró que predomina un alto encastamiento con razas europeas. La relación producción total por área en el año base resultó en promedio de 42.53 galones de leche/manzana y 52.68 kilogramos de carne manzana y para el ultimo año de los proyectos alcanzan en promedio los 67.56 galones de leche/manzana y 96.14 kilogramos de carne/manzana. La producción promedio de leche por época correspondió a 4 litros/vaca/día en el verano y 6 litros/vaca/día en invierno. Partiendo del promedio de éstos valores, el incremento anual de ésta producción con el proyecto alcanzarla en promedio el 7.3%. En el aspecto de ingresos en promedio la producción de leche aporta en el año base el 43.44%, la producción de carne 34.09%, la venta de otras categorías 12.5% y la agricultura el 9.95% de los ingresos totales. con el proyecto se presenta una recomposición en éstos, de manera que el aporte de la producción de leche alcanza el 46.99%, el de la carne 46.67% y la parte agrícola el 5.25%. En los gastos, en el año base en promedio, la mano de obra representa el mayor porcentaje con 54.63%, medios circulantes y servicios 37.94%, impuestos 7.4%, variando éstos para el año décimo a promedios de: 48.25%, 42.54% y 9.17% respectivamente, reflejándose un incremento en los gastos de medios circulantes y servicios en un promedio de 4.6% y 1.77% los gastos en impuestos. Los costos de producción por litro de leche en el año base, fluctuaron entre C$1.23 y C$1.61 y en el último año varian ligeramente a un rango entre C$0.87 y C$1.53. En el mercado de aspecto la leche de comercialización, el control del en el municipio está en posesión de los manteros, un segundo siendo la agente de Unión de Cooperativas de Boaco (UCASBO) importancia en la comercialización. En el caso de la carne, los mayores volúmenes de ganado comercializado es controlado por los comerciantes intermediarios, que en los años 1990 y 1992 extrajeron de la zona 6000 y 8000 cabezas respectivamente. En el fluctuaron aspecto de los precios, en el caso de la leche con la estacionalidad de la producción C$0.95 en invierno manteros) tipo A y UCASBO). el peso, con pesos y C$1.00 en el verano (al comercializar con y por calidad de la leche entregada C$1.375 leche tipo A y By C$1.12 para el tipo e (al comercializar con las El ganado en cambio, su precio está determinado por obteniéndose C$1,500.00 y C$1,600.00 por novillos de 380 y 420 kilogramos respectivamente. De las inversiones a realizarse, la adquisición de ganado representa el mayor porcentaje con un 49.67%, las instalaciones y equipos con un 29.02% y mejoramiento de pastizales con 21.31% del monto total propuesto equivalente a C$829,400.00, de los cuales el total solicitado representa el 76.68% equivalente a C$636,000.00. Para el análisis financiero, se utilizó el formato y metodología del Banco Mundial. Los resultados de rentabilidad de éste análisis al interés propuesto del 9% ocupan un rango entre 21.78 y 9.10%, relación inversión­ beneficio neto entre 2.2 y 1.07. Con el interés bancario del 12.5%, los resultados pasan a .ocupar valores de TIR entre 16.2% y 7.85% y la relación inversión-beneficio neto alcanza valores entre 1.93 y 0.98. Con la utilización de recursos propios los resultados son inferiores a los obtenidos con el 9% de interés en siete de las nueve fincas y superiores que los resultados logrados con el interés del 12.5%, siendo los valores extremos de las TIR encontradas de 18.42% y 10.19%. En el aspecto de sensibilidad, al incrementarse los gastos operativos en un 10%, el proyecto de la finca La Perla resulta ser el más sensible con el interés del 9%, alcanzando una TIR de 1.04% y un VAN negativo de C$-21,503.08. En la correlación inversión-rentabilidad, las inversiones en ganado ejercieron la mejor influencia, seguida de las inversiones en pastos, fundamentalmente cuando éstas van acompañadas de una alta tasa de parición. Los flujos de efectivos encontrados, resultaron con fuertes déficit a excepción de la finca San Felipe que presentó una situación menos desfavorable. Los déficit encontrado hacen que los proyectos de éstas fincas aún y cuando sean rentables, no sean factibles, al no tener disponibilidades de efectivo para el sostenimiento de las unidades familiares durante los primeros años de proyecto.

Incidencia de fasciola hepática en bovinos sacrificados en la Empresa Nuevo Carnic de Nicaragua

En este trabajo, se analizó la situación existente con respecto a la incidencia de fasciola hepática, en la Empresa Nuevo Carnic, ubicada en el Km 11 carretera Norte, departamento de Managua; esta empresa cubre el 33% de la matanza industrial en Nicaragua. Con los datos recabados se evaluaron: Niveles de infestación de los años 1989, 1990, 1991 y 1992; se determinó el departamento de mayor incidencia; y las pérdidas económicas. Para el análisis estadístico, el método utilizado fue el de Chi-cuadrado, usando el procedimiento CATMOD del paquete Statistical Analisis System. Los resultados obtenidos en el análisis de vari1anza, demuestran que existen diferentes significativas entre años, con un nivel de significancia de P<0.05 obteniéndose 0.55% de infestación global para los cuatro años. León resultó ser el departamento con el mayor número de animales parasitados seguido de Jinotega, Matagalpa y Managua. Las pérdidas económicas revelan cifras aproximadas de C$ 25, 271. 20 (Veinticinco mil doscientos setenta y un Córdobas con veinte centavos) para el matadero, adicionando a esto las pérdidas no visibles, como mala conversión alimenticia abortos, animales que murieron debido a esta enfermedad.