Supplemental Information to the August 2008 Flood Plain Management & Hazard Mitigation Task Force Report, August 2008

The Flood Plain Management and Hazard Mitigation Task Force emphasizes the long-term benefits of mitigation and management to the entire state in preventing or reducing damages from floods and other hazards faced in Iowa. Investments in efforts to manage watershed areas and to mitigate any damages from floods or other disaster events benefit individuals, families, communities, agriculture, business and industry, and certainly public entities and infrastructure. The Task Force encourages the Rebuild Iowa Advisory Commission to balance the immediate needs for rebuilding to include the beginning of the investments required to effectively mitigate future damage and maintain effective policy in Iowa’s watersheds. The significance of the damage seen in Iowa from the tornadoes, storms, and floods of 2008 include the loss of eighteen Iowans in disaster-related events. This alone should inspire investment in mitigation efforts for all hazards. Much of the damage resulting from the disasters can be tied to floodplain management and hazard mitigation, pointing the way toward enhanced efforts and new initiatives to safeguard lives, property, and communities’ economic health. Even so, it must be recognized that the weather events throughout last winter and spring added impetus to the rains and storms that ultimately resulted in record flooding. Some perspective must be maintained as planning progresses and significant investments in mitigation are considered to meet a specific level of safety and protection from future threats. The Task Force identified a number of issues, and four were agreed-upon as those with the highest priority to be addressed by the Task Force through a set of recommendations. Supplemental Information to the August 2008

Molecular genetics of ocular diseases

The eye is a complex organ, which provides one of our most important senses, sight. The retina is the neuronal component of the eye and represents the connection with the central nervous system for the transmission of the information that leads to image processing. Retinitis pigmentosa (RP) is one of the most common forms of inherited retinal degeneration, in which the primary death of rods, resulting in night blindness, is always followed by the loss of cones, which leads to legal blindness. Clinical and genetic heterogeneity in retinitis pigmentosa is not only due to different mutations in different genes, but also to different effects of the same mutation in different individuals, sometimes even within the same family. My thesis work has been mainly focused on an autosomal dominant form of RP linked to mutations in the PRPF31 gene, which often shows reduced penetrance. Our study has led to the identification of the major regulator of the penetrance of PRPF31 mutations, the CNOT3 protein, and to the characterization of its mechanism of action. Following the same rationale of investigating molecular mechanisms that are responsible for clinical and genetic heterogeneity of retinitis pigmentosa, we studied a recessive form of the disease associated with mutations in the recently-identified gene FAMI61 A, where mutations in the same gene give rise to variable clinical manifestations. Our data have increased the knowledge of the relationship between genotype and phenotype in this form of the disease. Whole genome sequencing technique was also tested as a strategy for disease gene identification in unrelated patients with recessive retinitis pigmentosa and proved to be effective in identifying disease-causing variants that might have otherwise failed to be detected with other screening methods. Finally, for the first time we reported a choroidal tumor among the clinical manifestations of PTEN hamartoma tumor syndrome, a genetic disorder caused by germline mutations of the tumor suppressor gene PTEN. Our study has highlighted the heterogeneity of this choroidal tumor, showing that genetic and/or epigenetic alterations in different genes may contribute to the tumor development and growth. - L'oeil est un organe complexe, à l'origine d'un de nos sens les plus importants, la vue. La rétine est la composante neuronale de l'oeil qui constitue la connexion avec le système nerveux central pour la transmission de l'information et qui conduit à la formation des images. La rétinite pigmentaire (RP) est une des formes les plus courantes de dégénérescence rétinienne héréditaire, dans laquelle la mort primaire de bâtonnets, entraînant la cécité nocturne, est toujours suivie par la perte de cônes qui conduit à la cécité complète. L'hétérogénéité clinique et génétique dans la rétinite pigmentaire n'est pas seulement due aux différentes mutations dans des gènes différents, mais aussi à des effets différents de la même mutation chez des individus différents, parfois même dans la même famille. Mon travail de thèse s'est principalement axé sur une forme autosomique dominante de RP liée à des mutations dans le gène PRPF31, associées souvent à une pénétrance réduite, me conduisant à l'identification et à la caractérisation du mécanisme d'action du régulateur principal de la pénétrance des mutations: la protéine CNOT3. Dans la même logique d'étude des mécanismes moléculaires responsables de l'hétérogénéité clinique et génétique de la RP, nous avons étudié une forme récessive de la maladie associée à des mutations dans le gène récemment identifié FAMI61 A, dont les mutations dans le même gène donnent lieu à des manifestations cliniques différentes. Nos données ont ainsi accru la connaissance de la relation entre le génotype et le phénotype dans cette forme de maladie. La technique de séquençage du génome entier a été ensuite testée en tant que stratégie pour l'identification du gène de la maladie chez les patients atteints de RP récessive. Cette approche a montré son efficacité dans l'identification de variantes pathologiques qui n'auraient pu être détectées avec d'autres méthodes de dépistage. Enfin, pour la première fois, nous avons identifié une tumeur choroïdienne parmi les manifestations cliniques du PTEN hamartoma tumor syndrome, une maladie génétique causée par des mutations germinales du gène suppresseur de tumeur PTEN. Notre étude a mis en évidence l'hétérogénéité de cette tumeur choroïdienne, montrant que les altérations génétiques et/ou épigénétiques dans les différents gènes peuvent contribuer au développement et à la croissance tumorale.

Effect of Wildlife Highway Warning Reflectors on Deer-Vehicle Accident, December 1984

he number of deer-vehicle accidents in Iowa and around the country has steadily increased during the past 30 years. This i s basically due to: ( 1 ) increased volume of traffic; 12) an expanding network of hard surface roads, especially 4 lane interstates; and (3) a general increase in deer populations. Initidtion of a 55 MPH speed limit in 1974 and gasoline shortages in 1975 reduced deer-vehicle accident rates briefly, but since 1975, rates have continued to climb. Various methods of reducinq these accidents have been attempted in other states. These include: instal lation of rc?flective devlres, deer crossing signs, fencing, underpasses, clearing right--of--waysa,n d controlled hunting to reduce deer population s i z e . These methods have met with varying degrees of success, depending on animal behavior, deet- population fluctuations, method used, topoyr-aphy, road-side vegetation, traffic patterns, and highway configuration. This project was designed to evaluate a new ntethod of reducing deer-vehicle accidents. There are qenerally 4 important aspects of deer-vehicle accidents: danger to human l i f e , vehicle damage, loss of a valuable wildlife resource, and cost of processing accident reports. In !owe, during 1983, there were over 15,OOC) reported deer--vehicle accidents and probably many more that were not reported (Gladfelter 1984). The extent of human injury or death in Iowa i s not known, but studies in southern Michigan show that human injur ies occurred in about 4% of the deer-vehicle accidents (A1 lcn and MrCullough 1976). T h i s would indicate that in Iowa there could have been 200 human injury cases from deer-vehicle accidents i n 1983. These injuries usual 1 occur from secondary collisions when motorists try to avoid a deer on the highway, and hit some other object Vehicle darnaye from these accidents can into thousands of dollars because of the high speed involved and the size of the animal. The total amount of vehicle damage occurring in Iowa is unknown, but if the average vehicle damage was between $500-$800 per accident, estimated property damage would be between $2 1/2--$4 million annually. The value of deer lost in these accidents cannot be estimated, but recreational potential of this natural resource is surely diminished for hunters and wildlife enthusiasts. Also, there ir a great deal of money spent by governmental agencies for manpower to process accident reports and remove dead animals from highways.

Towards a consensus view on understanding nanomaterials hazards and managing exposure

The aim of this article is to present an overview of salient issues of exposure, characterisation and hazard assessment of nanomaterials as they emerged from the consensus-building of experts undertaken within the four year European Commission coordination project NanoImpactNet. The approach adopted is to consolidate and condense the findings and problem-identification in such a way as to identify knowledge-gaps and generate a set of interim recommendations of use to industry, regulators, research bodies and funders. The categories of recommendation arising from the consensual view address: significant gaps in vital factual knowledge of exposure, characterisation and hazards; the development, dissemination and standardisation of appropriate laboratory protocols; address a wide range of technical issues in establishing an adequate risk assessment platform; the more efficient and coordinated gathering of basic data; greater inter-organisational cooperation; regulatory harmonization; the wider use of the life-cycle approaches; and the wider involvement of all stakeholders in the discussion and solution-finding efforts for nanosafety.

La corrupción y sus raíces : El caso de Filipinas

La corrupción tiene raíces de tipo cultural, económico y político y su identificación en cada país es indispensable para luchar contra ella. Se han estudiado las principales causas descritas en la bibliografía y para cada una de ellas se han obtenido indicadores y se han clasificado los diferentes países del mundo. Se han identificado los factores en que destaca Filipinas, una excolonia española y estadounidense, y se han establecido sus raíces coloniales.

Oxidation proteomics: the role of thiol modifications

Identification of thiol modifications has gained significant importance. It is increasingly recognized that cysteines play an important role in protein function under both physiological and patho-physiological conditions. Here we reviewed different approaches that are used to identify oxidized proteins and discuss different fluorescent labeling techniques, differential two-dimensional gel electrophoresis and matrix-assisted laser desorption ionization - time of flight identification, in short MALDI-TOF. We illuminate processes that depend on protein oxidation of cysteines and we look into consequences of thiol oxidation during aging and in a variety of diseases, with a special reference to Alzheimer's disease. There is an urgent need for methods that detect specifically oxidized proteins and are able to distinguish different oxidation types.

Nosturivaihteiden kunnonvalvontajärjestelmän kehittäminen värähtelymittauksia käyttäen

Työssä selvitettiin värähtelymittauksien käyttömahdollisuuksia nosturivaihteiden ennakoivassa kunnonvalvonnassa. Työ on painottunut lähinnä värähtelymittausten mittaus- ja analyysiteknisten näkökohtien tarkasteluun ja toimii niiltä osin al-kuselvityksenä värähtelymittauspohjaisen kunnonvalvontajärjestelmän luomiselle. Kirjallisuuden mukaan yleisimpiä ja käyttökelpoisimpia värähtelyanalyysejä vaihteistojen kunnonvalvonnassa ovat spektri-, kepstri-, ja demodulointitekniik-kaan perustuvat analyysit, joita kokeiltiin vauriokokeilla. Työssä käsitellään myös iskusysäysmenetelmää ja aikatason tunnuslukuja. Vauriokokeilla saatiin tietoa hammasvaurioiden havaitsemisesta värähtelymittauksilla, mutta laakerivaurioista kaivataan sen sijaan vielä lisää tietoa. Hammasvaurioiden tarkastelussa spektri-analyysin ohella PeakVue -analyysi osoittautui tehokkaaksi, kun siinä käytettiin sopivaa suodatusaluetta. Lisäksi työhön on koottu kokemuksia nosturivaihteiden käytännön värähtelymittauksista ja annettu ohjeita niiden suorittamisesta. Työn tulokset osoittavat, että värähtelymittauspohjaisella kunnonvalvontajärjes-telmällä voidaan parantaa nostovaihteiden ennakoivaa kunnonvalvontaa. Nosto-vaihteiden värähtelymittauksia kannattaa siis ehdottomasti jatkaa ja kunnonval-vontajärjestelmää edelleen kehittää. Siirtovaihteiden valvonta värähtelymittauksilla on sen sijaan hankalaa niiden epävakaan kuormitustilan vuoksi.

Wireless Applications Evaluation and Development Process: Case -Paper Industry Logistics

Sähköisen liiketoiminnan ja mobiliteetin konvergenssi yhdessä teknologisen innovaation kiihtyvän vauhdin kanssa ovat saaneet aikaan kiinnostusta langattomia liiketoimintaratkaisuja kohtaan. Tämän diplomityön tavoitteena oli tutkia sähköisen liiketoiminnan langattomien sovellusten arviointi- ja kehitysprosessia. Työ keskittyy tarkastelemaan paperiteollisuuden toimitusketjun langatonta seurantaa. Tutkimuksessa esitetään langattoman sähköisen liiketoiminnan määritelmä, kuvaillaan langattomuuden eri sovellusalueita ja sovellusten arviointi- ja kehitysprosessin strategisia sekä teknologisia ulottuvuuksia. Työ luo viitekehyksen, jonka avulla tarkastella langattomien teknologioiden merkitystä logistiikassa. Tutkimuksen merkittävin tulos on prosessimalli sovellusten arvioimiseksi ja kehittämiseksi. Mallilla kehitetty langaton sovellus osoittautui tarkastelussa hyödylliseksi toimitusketjun hallinnassa.

Broken colinearity of the amphioxus Hox cluster.

Background In most eumetazoans studied so far, Hox genes determine the identity of structures along the main body axis. They are usually linked in genomic clusters and, in the case of the vertebrate embryo, are expressed with spatial and temporal colinearity. Outside vertebrates, temporal colinearity has been reported in the cephalochordate amphioxus (the least derived living relative of the chordate ancestor) but only for anterior and central genes, namely Hox1 to Hox4 and Hox6. However, most of the Hox gene expression patterns in amphioxus have not been reported. To gain global insights into the evolution of Hox clusters in chordates, we investigated a more extended expression profile of amphioxus Hox genes. Results Here we report an extended expression profile of the European amphioxus Branchiostoma lanceolatum Hox genes and describe that all Hox genes, except Hox13, are expressed during development. Interestingly, we report the breaking of both spatial and temporal colinearity for at least Hox6 and Hox14, which thus have escaped from the classical Hox code concept. We show a previously unidentified Hox6 expression pattern and a faint expression for posterior Hox genes in structures such as the posterior mesoderm, notochord, and hindgut. Unexpectedly, we found that amphioxus Hox14 had the most divergent expression pattern. This gene is expressed in the anterior cerebral vesicle and pharyngeal endoderm. Amphioxus Hox14 expression represents the first report of Hox gene expression in the most anterior part of the central nervous system. Nevertheless, despite these divergent expression patterns, amphioxus Hox6 and Hox14 seem to be still regulated by retinoic acid. Conclusions Escape from colinearity by Hox genes is not unusual in either vertebrates or amphioxus and we suggest that those genes escaping from it are probably associated with the patterning of lineage-specific morphological traits, requiring the loss of those developmental constraints that kept them colinear.

Potential Microbiological Effects of Higher Dosing of Echinocandins.

The antifungal "paradoxical effect" has been described as the reversal of growth inhibition at high doses of echinocandins, most usually caspofungin. This microbiological effect appears to be a cellular compensatory response to cell wall damage, resulting in alteration of cell wall content and structure as well as fungal morphology and growth. In vitro studies demonstrate this reproducible effect in a certain percentage of fungal isolates, but animal model and clinical studies are less consistent. The calcineurin and Hsp90 cell signaling pathways appear to play a major role in regulating these cellular and structural changes. Regardless of the clinical relevance of this paradoxical growth effect, understanding the specific actions of echinocandins is paramount to optimizing their use at either standard or higher dosing schemes, as well as developing future improvements in our antifungal arsenal.

Nitric oxide-induced p53 accumulation and regulation of inducible nitric oxide synthase expression by wild-type p53.

The tumor suppressor gene product p53 plays an important role in the cellular response to DNA damage from exogenous chemical and physical mutagens. Therefore, we hypothesized that p53 performs a similar role in response to putative endogenous mutagens, such as nitric oxide (NO). We report here that exposure of human cells to NO generated from an NO donor or from overexpression of inducible nitric oxide synthase (NOS2) results in p53 protein accumulation. In addition, expression of wild-type (WT) p53 in a variety of human tumor cell lines, as well as murine fibroblasts, results in down-regulation of NOS2 expression through inhibition of the NOS2 promoter. These data are consistent with the hypothesis of a negative feedback loop in which endogenous NO-induced DNA damage results in WT p53 accumulation and provides a novel mechanism by which p53 safeguards against DNA damage through p53-mediated transrepression of NOS2 gene expression, thus reducing the potential for NO-induced DNA damage.

Análise térmica aplicada a fármacos e formulações farmacêuticas na indústria farmacêutica

Several matters of the pharmaceutical demonstrate the great importance of thermal analysis application, especially TG and DSC for the pharmaceutical industry future, namely: characterization of the drugs with the thermal events definition, in studies of drug purity, in the polymorphs identification, in compatibility studies of solid dosage pharmaceutical formulations, in drugs and pharmaceutical formulations thermal stability, and in determination of shelf life for isothermal degradation kinetics by extrapolation using the Arrhenius equation. Thus, the test results obtained from thermal analysis are directly related to the quality of a pharmaceutical product, whether the stability or bioavailability of the pharmaceutical product.

Cromatografia gasosa quiral na resolução de enantiômeros envolvidos em flavours de frutas

This work addresses the use of chiral gas chromatography in resolving optically active stereoisomers and racemates found in fruit flavours. It presents the types of chiral selectors applied to terpene-derived metal coordination compounds, polysiloxane-linked α-amino acid and mixed chiral stationary phases, and focuses on derivatized cyclodextrins, the most popular chiral stationary phases presently used in chromatographic analysis. Knowledge about the techniques involved in chiral recognition and enantiomer identification in the fruit flavour field is given along with examples from the latest studies.

Pohjakuonan käsittelyn ja hyötykäytön toimintamallin muodostaminen Kotkan Energia Oy:n jätteenpolttolaitokselle

Tavoitteena tässä diplomityössä oli selvittää Kotkan Energia Oy:n jätteenpolttolaitoksen toiminnassa syntyvän pohjakuonan hyötykäyttömahdollisuuksia ja kustannuksiltaan järkevin tapa käsitellä pohjakuona. Tarkasteltavia vaihtoehtoja hyötykäytön osalta olivat erilaiset maarakennustyöt sekä kaatopaikkojen peittäminen. Hyötykäyttövaihtoehdoille vaihtoehtoisena ratkaisuna tutkittiin kaatopaikkasijoituksen kannattavuutta. Pohjakuonan käyttöä maarakentamisessa, jätetäyttöjen peitemaina sekä pohjakuonan loppusijoitusta kaatopaikoille säätelee lainsäädäntö. Valtioneuvoston asetuksessa kaatopaikoista on määritelty loppusijoitettaville jakeille liukoisuus raja-arvot, joiden mukaisesti jätteet sijoitetaan joko pysyvän jätteen, tavanomaisen jätteen tai ongelmajätteen kaatopaikoille. Jätetäyttöjen peitemateriaalina käytettävän jakeen on myös täytettävä kyseisen kaatopaikkaluokan liukoisuusraja-arvot. Maarakennusasetus antaa puolestaan liukoisuus- ja pitoisuusraja-arvot maarakennuksessa hyödynnettäville jakeille. Pohjakuonan hyötykäyttö vaatii kuitenkin aina ympäristöluvan. Hyötyvoimalan pohjakuonasta tehtyjen analyysien perusteella voidaan todeta, että käsiteltyä pohjakuonaa olisi mahdollista käyttää esimerkiksi kenttien ja kaatopaikkojen pohjarakenteissa sekä kaatopaikoilla jätetäyttöjen peitemaina. Pohjakuonan hyödyntäminen kaukolämpötöiden maarakennuksessa vaatii vielä lisätutkimuksia putkien korroosioriskin osalta. Diplomityön tuloksena kehitettiin toimintamalli, jonka avulla Kotkan Energia Oy:n on mahdollista säästää kuonan käsittelyn ja hyötykäytön kustannuksissa. Kustannuksiltaan parhaaksi vaihtoehdoksi osoittautui kuonan käsittely omalla biopolttoaineiden välivarastolla sekä käsitellyn pohjakuonan hyödyntäminen välivaraston pohjarakenteissa. 

Packaging concept development for an assortment of medical device products

Diplomityön tavoitteena oli kehittää Wipak Oy:n valmistamille sterilointipakkauksille tulevaisuuden pakkauskonsepti. Sterilointipakkaukset luokitellaan lääkelaitedirektiivin mukaan lisätarvikkeiksi luokan 1 lääkelaitteille, ja tämä näkökulma oli vahvasti mukana konseptin kehityksessä. Lähtökohtana pakkauskonseptin suunnittelulle oli tuotteiden arvoketjussa, eli pakata tuotteet siten että pakkausten avulla voidaan tuottaa lisäarvoa arvoketjun toimijoille. Tavoitteena oli parantaa pakkausten viestintää, toimivuutta/tehokkuutta toimitusketjussa sekä vahvistaa brändin imagoa myynti- ja kuljetuspakkauksen avulla. Lääkinnälliset laitteet ja tarvikkeet ovat lainsäädännön ja normien avulla tarkasti säädeltyjä. Näiden normien vaatimukset asettavat perusteet myynti- ja kuljetuspakkausten kehittämiselle. Tämän lisäksi suunnittelussa on huomioitu asiakkaiden toiveet ja kehitystarpeet. Kirjallisuusosuudessa on keskitytty lääkinnällisten laitteiden pakkausyksiköiden toimintoihin sekä niiden kehitysnäkymiin. Pääpaino on ollut pakkausmerkintöjen ja jäljitettävyyden kehittämisellä, koska tietojen automaattisen tunnistuksen hyödyntäminen lääkintälaitteiden pakkausten arvoketjussa on kasvava trendi. Manuaalisesti tehtävät tuotevirtojen kirjaukset ketjun eri toimijoiden osalta lisäävät riskejä jäljitettävyyden kannalta ja aiheuttavat lisätyötä ja – kustannuksia ketjun kaikille osapuolille. Ehdotus uudesta pakkauskonseptista on kehitetty näiden tietojen pohjalta. Ehdotuksessa on huomioitu lainsäädännöstä ja ketjun toimijoilta tulevat tarpeet, sekä alan tulevaisuuden kehitysnäkymät. Ehdotetun pakkauskonseptin avulla saadaan lisättyä myynti- ja kuljetuspakkausten tehokkuutta, parannettua jäljitettävyyttä ja helpotettu arvoketjun alavirran toimijoiden työtä lisäämällä erillinen sisäpakkaus myyntiyksikön sisälle. Työssä on lisäksi selvitetty pakkauskonseptin kustannusvaikutukset tuotteiden hintaan. Lopussa on ehdotettu jatkotoimenpiteet suunnitelman implementoimisesta käytäntöön.