Sequencing and functional analysis of the genome of a nematode egg-parasitic fungus, Pochonia chlamydosporia

Pochonia chlamydosporia is a worldwide-distributed soil fungus with a great capacity to infect and destroy the eggs and kill females of plant-parasitic nematodes. Additionally, it has the ability to colonize endophytically roots of economically-important crop plants, thereby promoting their growth and eliciting plant defenses. This multitrophic behavior makes P. chlamydosporia a potentially useful tool for sustainable agriculture approaches. We sequenced and assembled ∼41 Mb of P. chlamydosporia genomic DNA and predicted 12,122 gene models, of which many were homologous to genes of fungal pathogens of invertebrates and fungal plant pathogens. Predicted genes (65%) were functionally annotated according to Gene Ontology, and 16% of them found to share homology with genes in the Pathogen Host Interactions (PHI) database. The genome of this fungus is highly enriched in genes encoding hydrolytic enzymes, such as proteases, glycoside hydrolases and carbohydrate esterases. We used RNA-Seq technology in order to identify the genes expressed during endophytic behavior of P. chlamydosporia when colonizing barley roots. Functional annotation of these genes showed that hydrolytic enzymes and transporters are expressed during endophytism. This structural and functional analysis of the P. chlamydosporia genome provides a starting point for understanding the molecular mechanisms involved in the multitrophic lifestyle of this fungus. The genomic information provided here should also prove useful for enhancing the capabilities of this fungus as a biocontrol agent of plant-parasitic nematodes and as a plant growth-promoting organism.

Patrones de dispersión de una nueva enfermedad viral en el cultivo de maíz, en Argentina

El maíz es uno de los principales cereales, ubicándose tercero en el ranking de producción mundial. Las enfermedades virales en el cultivo de maíz son factores importantes de pérdidas en la producción, en el mundo. Se ha citado mundialmente la presencia de varios rhabdovirus en maíz, aunque ninguno en Argentina. Maize mosaic virus (MMV) es el más importante debido a las pérdidas que ocasiona. Durante 2006/07 se detectó en trigo Argentina, un Cytorhabdovirus denominado Cereal Rhabdovirus caracterizado serológicamente como Barley yellow striate mosaic virus (BYSMV). Desde 2000/01 hasta la actualidad, se observan plantas de maíz con achaparramiento, esterilidad y estriado amarillo en hojas, en localidades de Córdoba y Santa Fe. Se observaron al microscopio electrónico partículas de rhabdovirus en el citoplasma de las células. Pruebas serológicas para MMV resultaron negativas. Esta virosis fue transmitida a plantas de maíz sanas por el delfácido Peregrinus maidis. Se amplificó un segmento del gen de la polimerasa L de rhabdovirus, mediante RT-PCR con iniciadores degenerados y se obtuvieron las relaciones filogenéticas con otros rhabdovirus, confirmando que se trata de un miembro del género Cytorhabdovirus. Se trataría de un virus nuevo, de la familia Rhabdoviridae presente en diversas localidades del área maicera argentina. El objetivo de este proyecto es estudiar la epidemiología de este virus, mediante la reconstrucción de su historia demográfica y patrones espacio-temporales, utilizando análisis de coalescencia y filogeografía. Se busca: Determinar la secuencia genómica completa del virus en estudio; Obtener iniciadores específicos para el gen de la nucleocápside; Obtener las secuencias nucleotídicas del gen de la nucleocápside viral de aislamientos de diferentes localidades del área maicera argentina; Analizar los patrones filogeográficos de dichos aislamientos. Materiales y métodos. Recolección de material enfermo. Se colectarán plantas de maíz con sintomatología de estriado amarillo, en distintas localidades de Córdoba y Santa Fe. Secuenciación del genoma completo viral. Se purificará el virus en estudio a partir de tejido enfermo (Creamer, 1992). Se extraerá ARN total y se lo enviará al servicio de pirosecuenciación (INDEAR, Argentina). Las secuencias obtenidas serán analizadas utilizando software específico (Lasergene 10, DNASTAR, entre otros). Diseño de iniciadores específicos para el gen de la proteína N viral. Serán diseñados a partir de la secuencia del genoma completo del virus. Determinación de patrones filogeográficos. Se extraerá ARN total de plantas sintomáticas de distintas localidades argentinas. Se amplificará el gen N de cada uno de los aislamientos, se clonarán y secuenciarán estos fragmentos y se alinearán las secuencias obtenidas. Se reconstruirá la filogenia mediante metodología Bayesiana y se realizará un análisis de coalescencia. Finalmente se analizará el patrón filogeográfico del rhabdovirus en estudio. Con el presente trabajo se espera avanzar en el conocimiento de este nuevo virus que afecta cultivos de maíz en Argentina. Se pretende obtener la secuencia genómica completa viral, lo que significará un avance en la caracterización e identificación del mismo. Se busca conocer sus patrones de dispersión espacio-temporales, para comprender los orígenes y posible evolución hacia otras regiones del país. El análisis de secuencias genómicas, brinda una herramienta rápida y de menor esfuerzo de muestreo en el estudio epidemiológico de las poblaciones. El conocimiento de la distribución actual e histórica de este nuevo virus sería crucial para futuros planes de manejo de la enfermedad. El tema de investigación se lleva a cabo en el marco de una tesis doctoral con el apoyo de una beca de formación de CONICET. La transferencia es constante a traves del contacto con productores y asesores agrícolas y mediante la realización de jornadas, charlas, cursos y publicaciones periódicas en medios de difusión.

Montague, Abigale, autographed letter signed to John Winthrop; Hadley, Mass., 1 side (2 pages), 1663 July 19

Correspondence about her seven-year-old daughter, who was suffering from inflammation and discharge from her eye, in which Montague requests Winthrop's advice on whether sarsaparilla root or English barley boiled with herbs would be an effective treatment. Montague adds a postscript about her own health, writing she has a "thick rotten fleame rising out of my stomach" but no cough.

Folk-songs, chanteys and singing games /

For medium voice and piano.

Die Zuchtung der vier Hauptgetreidearten und der Zuckerrübe.

Mode of access: Internet.

The pedler's prophecy.

One copy kept in Munn Collection.

New citharen lessons, with perfect tunings of the same, from foure course of strings to fourteene course, euen to trie the sharpest teeth of enuie, with lessons of all sorts, and methodicall instructions for all professors and practitioners of the citharen.

Mode of access: Internet.

Untersuchungen über die frage der gesundheitsschädlichkeit des eosin und der mit eosin gefärbten gerste ...

Lebenslauf.

Progress report to Board of Directors, April 5, 1946.

"April 5, 1946"

University of Michigan Men's Basketball Team, 1929

Top Row: trainer Cassius Cahill, mngr. Roland Taylor, Tharel Kanitz, Frank Lovell, Albert Barley, asst. coach Bennie Oosterbaan, asst. coach Franklin Cappon

Middle Row: Joseph Truskowski, James Orwig, Ernest McCoy, coach George Veenker, Robert Chapman, Daniel Rose

Front Row: Joseph Balsamo, J. Dallas Whittle

1926 UM Men's Basketball Team

Top Row: asst. coach Frank L. Hayes, Raymond Baer, Edward Line, Albert Barley, Wayne Schroeder, Samuel Gawne, Frank. Kuenzel, Walter Kuenzel, ? Nathan, coach Franklin Cappon

Front Row: Samuel Babcock, Bennie Oosterbaan, Edward Reece, George Haggerty, Richard Doyle, Edward Chambers, Douglas Ginn, Nathan Rasnick, coach Edwin Mather

A report of the trail of the cause of John Taylor vs. Edward C. Delavan : prosecuted for alleged libel ; tried at the Albany circuit, April, 1940 ; and Mr. Delavan's correspondence with the ex. committee of the Albany city temperance society, &c.

"This action ... is brought for two publications in the Evening journal, in the month of February, 1835 ... The declaration sets forth that the defendant meant to charge that impure, dirty and filthy water ... had, for years, been carted to the malt-house of the plaintill; ant that he had been guilty of using that water in preparing barley for malt."--p. 45.

Strange histories, of kings, princes, dukes, earles, lords, ladies, knights and gentlemen ...

Later published with title: The royal garland of delight.

Beiträge zur Braugerstenkultur /

Mode of access: Internet.

Die Gerste : ihre botanischen und brautechnischen Eigenschaften und ihre Anbau /

Includes bibliographical references.