Distributed Extremum-Seeking Control with Applications to High-Altitude Balloons

The real-time optimization of large-scale systems is a difficult problem due to the need for complex models involving uncertain parameters and the high computational cost of solving such problems by a decentralized approach. Extremum-seeking control (ESC) is a model-free real-time optimization technique which can estimate unknown parameters and can optimize nonlinear time-varying systems using only a measurement of the cost function to be minimized. In this thesis, we develop a distributed version of extremum-seeking control which allows large-scale systems to be optimized without models and with minimal computing power. First, we develop a continuous-time distributed extremum-seeking controller. It has three main components: consensus, parameter estimation, and optimization. The consensus provides each local controller with an estimate of the cost to be minimized, allowing them to coordinate their actions. Using this cost estimate, parameters for a local input-output model are estimated, and the cost is minimized by following a gradient descent based on the estimate of the gradient. Next, a similar distributed extremum-seeking controller is developed in discrete-time. Finally, we consider an interesting application of distributed ESC: formation control of high-altitude balloons for high-speed wireless internet. These balloons must be steered into a favourable formation where they are spread out over the Earth and provide coverage to the entire planet. Distributed ESC is applied to this problem, and is shown to be effective for a system of 1200 ballons subjected to realistic wind currents. The approach does not require a wind model and uses a cost function based on a Voronoi partition of the sphere. Distributed ESC is able to steer balloons from a few initial launch sites into a formation which provides coverage to the entire Earth and can maintain a similar formation as the balloons move with the wind around the Earth.

Fast 2D/3D object representation with growing neural gas

This work presents the design of a real-time system to model visual objects with the use of self-organising networks. The architecture of the system addresses multiple computer vision tasks such as image segmentation, optimal parameter estimation and object representation. We first develop a framework for building non-rigid shapes using the growth mechanism of the self-organising maps, and then we define an optimal number of nodes without overfitting or underfitting the network based on the knowledge obtained from information-theoretic considerations. We present experimental results for hands and faces, and we quantitatively evaluate the matching capabilities of the proposed method with the topographic product. The proposed method is easily extensible to 3D objects, as it offers similar features for efficient mesh reconstruction.

Techniques en appui des formats de modulation avancés pour les futurs réseaux optiques

Les systèmes de communication optique avec des formats de modulation avancés sont actuellement l’un des sujets de recherche les plus importants dans le domaine de communication optique. Cette recherche est stimulée par les exigences pour des débits de transmission de donnée plus élevés. Dans cette thèse, on examinera les techniques efficaces pour la modulation avancée avec une détection cohérente, et multiplexage par répartition en fréquence orthogonale (OFDM) et multiples tonalités discrètes (DMT) pour la détection directe et la détection cohérente afin d’améliorer la performance de réseaux optiques. Dans la première partie, nous examinons la rétropropagation avec filtre numérique (DFBP) comme une simple technique d’atténuation de nonlinéarité d’amplificateur optique semiconducteur (SOA) dans le système de détection cohérente. Pour la première fois, nous démontrons expérimentalement l’efficacité de DFBP pour compenser les nonlinéarités générées par SOA dans un système de détection cohérente porteur unique 16-QAM. Nous comparons la performance de DFBP avec la méthode de Runge-Kutta quatrième ordre. Nous examinons la sensibilité de performance de DFBP par rapport à ses paramètres. Par la suite, nous proposons une nouvelle méthode d’estimation de paramètre pour DFBP. Finalement, nous démontrons la transmission de signaux de 16-QAM aux taux de 22 Gbaud sur 80km de fibre optique avec la technique d’estimation de paramètre proposée pour DFBP. Dans la deuxième partie, nous nous concentrons sur les techniques afin d’améliorer la performance des systèmes OFDM optiques en examinent OFDM optiques cohérente (CO-OFDM) ainsi que OFDM optiques détection directe (DDO-OFDM). Premièrement, nous proposons une combinaison de coupure et prédistorsion pour compenser les distorsions nonlinéaires d’émetteur de CO-OFDM. Nous utilisons une interpolation linéaire par morceaux (PLI) pour charactériser la nonlinéarité d’émetteur. Dans l’émetteur nous utilisons l’inverse de l’estimation de PLI pour compenser les nonlinéarités induites à l’émetteur de CO-OFDM. Deuxièmement, nous concevons des constellations irrégulières optimisées pour les systèmes DDO-OFDM courte distance en considérant deux modèles de bruit de canal. Nous démontrons expérimentalement 100Gb/s+ OFDM/DMT avec la détection directe en utilisant les constellations QAM optimisées. Dans la troisième partie, nous proposons une architecture réseaux optiques passifs (PON) avec DDO-OFDM pour la liaison descendante et CO-OFDM pour la liaison montante. Nous examinons deux scénarios pour l’allocations de fréquence et le format de modulation des signaux. Nous identifions la détérioration limitante principale du PON bidirectionnelle et offrons des solutions pour minimiser ses effets.

A Periodic State Space Model to Monthly Long-term Temperature Data

This work presents a periodic state space model to model monthly temperature data. Additionally, some issues are discussed, as the parameter estimation or the Kalman filter recursions adapted to a periodic model. This framework is applied to monthly long-term temperature time series of Lisbon.

Some parameters that affect CDMA capacity analysis. Results using GIS based simulation

In previous papers we describe a model for capacity analysis in CDMA systems using DC-Cell, a GIS based planning tool developed at Universidad Politecnica de Valencia, and MATLAB. We show some initial results of that model, and now, we are exploring different parameters like cell size, proximity between cells, number of cells in the system and “clustering” CDMA in order to improve the planning process for third generation systems. In this paper we show the results for variations of some of these parameters, specifically the cell size and number of cells. In CDMA systems is quite common to suppose only one carrier frequency for capacity estimation, and it is intuitive to think that for more base stations, mean more users. However the multiple access interference problem in CDMA systems could establish a limit for that supposition in a similar way that occurs in FDMA and TDMA systems.

Hydrometallurgical process modeling using advanced mathematical tools

Hydrometallurgical process modeling is the main objective of this Master’s thesis work. Three different leaching processes namely, high pressure pyrite oxidation, direct oxidation zinc concentrate (sphalerite) leaching and gold chloride leaching using rotating disc electrode (RDE) are modeled and simulated using gPROMS process simulation program in order to evaluate its model building capabilities. The leaching mechanism in each case is described in terms of a shrinking core model. The mathematical modeling carried out included process model development based on available literature, estimation of reaction kinetic parameters and assessment of the model reliability by checking the goodness fit and checking the cross correlation between the estimated parameters through the use of correlation matrices. The estimated parameter values in each case were compared with those obtained using the Modest simulation program. Further, based on the estimated reaction kinetic parameters, reactor simulation and modeling for direct oxidation zinc concentrate (sphalerite) leaching is carried out in Aspen Plus V8.6. The zinc leaching autoclave is based on Cominco reactor configuration and is modeled as a series of continuous stirred reactors (CSTRs). The sphalerite conversion is calculated and a sensitivity analysis is carried out so to determine the optimum reactor operation temperature and optimum oxygen mass flow rate. In this way, the implementation of reaction kinetic models into the process flowsheet simulation environment has been demonstrated.

Knowledge about dietary fibres (KADF): development and validation of an evaluation instrument through structural equation modelling (SEM)

Objectives: Because there is scientific evidence that an appropriate intake of dietary fibre should be part of a healthy diet, given its importance in promoting health, the present study aimed to develop and validate an instrument to evaluate the knowledge of the general population about dietary fibres. Study design: The present study was a cross sectional study. Methods: The methodological study of psychometric validation was conducted with 6010 participants, residing in ten countries from 3 continents. The instrument is a questionnaire of self-response, aimed at collecting information on knowledge about food fibres. For exploratory factor analysis (EFA) was chosen the analysis of the main components using varimax orthogonal rotation and eigenvalues greater than 1. In confirmatory factor analysis by structural equation modelling (SEM) was considered the covariance matrix and adopted the Maximum Likelihood Estimation algorithm for parameter estimation. Results: Exploratory factor analysis retained two factors. The first was called Dietary Fibre and Promotion of Health (DFPH) and included 7 questions that explained 33.94 % of total variance ( = 0.852). The second was named Sources of Dietary Fibre (SDF) and included 4 questions that explained 22.46% of total variance ( = 0.786). The model was tested by SEM giving a final solution with four questions in each factor. This model showed a very good fit in practically all the indexes considered, except for the ratio 2/df. The values of average variance extracted (0.458 and 0.483) demonstrate the existence of convergent validity; the results also prove the existence of discriminant validity of the factors (r2 = 0.028) and finally good internal consistency was confirmed by the values of composite reliability (0.854 and 0.787). Conclusions: This study allowed validating the KADF scale, increasing the degree of confidence in the information obtained through this instrument in this and in future studies.

Improving the use of G-CSF during chemotherapy using physiological mathematical modelling : a quantitative systems pharmacology approach

La diminution des doses administrées ou même la cessation complète d'un traitement chimiothérapeutique est souvent la conséquence de la réduction du nombre de neutrophiles, qui sont les globules blancs les plus fréquents dans le sang. Cette réduction dans le nombre absolu des neutrophiles, aussi connue sous le nom de myélosuppression, est précipitée par les effets létaux non spécifiques des médicaments anti-cancéreux, qui, parallèlement à leur effet thérapeutique, produisent aussi des effets toxiques sur les cellules saines. Dans le but d'atténuer cet impact myélosuppresseur, on administre aux patients un facteur de stimulation des colonies de granulocytes recombinant humain (rhG-CSF), une forme exogène du G-CSF, l'hormone responsable de la stimulation de la production des neutrophiles et de leurs libération dans la circulation sanguine. Bien que les bienfaits d'un traitement prophylactique avec le G-CSF pendant la chimiothérapie soient bien établis, les protocoles d'administration demeurent mal définis et sont fréquemment déterminés ad libitum par les cliniciens. Avec l'optique d'améliorer le dosage thérapeutique et rationaliser l'utilisation du rhG-CSF pendant le traitement chimiothérapeutique, nous avons développé un modèle physiologique du processus de granulopoïèse, qui incorpore les connaissances actuelles de pointe relatives à la production des neutrophiles des cellules souches hématopoïétiques dans la moelle osseuse. À ce modèle physiologique, nous avons intégré des modèles pharmacocinétiques/pharmacodynamiques (PK/PD) de deux médicaments: le PM00104 (Zalypsis®), un médicament anti-cancéreux, et le rhG-CSF (filgrastim). En se servant des principes fondamentaux sous-jacents à la physiologie, nous avons estimé les paramètres de manière exhaustive sans devoir recourir à l'ajustement des données, ce qui nous a permis de prédire des données cliniques provenant de 172 patients soumis au protocol CHOP14 (6 cycles de chimiothérapie avec une période de 14 jours où l'administration du rhG-CSF se fait du jour 4 au jour 13 post-chimiothérapie). En utilisant ce modèle physio-PK/PD, nous avons démontré que le nombre d'administrations du rhG-CSF pourrait être réduit de dix (pratique actuelle) à quatre ou même trois administrations, à condition de retarder le début du traitement prophylactique par le rhG-CSF. Dans un souci d'applicabilité clinique de notre approche de modélisation, nous avons investigué l'impact de la variabilité PK présente dans une population de patients, sur les prédictions du modèle, en intégrant des modèles PK de population (Pop-PK) des deux médicaments. En considérant des cohortes de 500 patients in silico pour chacun des cinq scénarios de variabilité plausibles et en utilisant trois marqueurs cliniques, soient le temps au nadir des neutrophiles, la valeur du nadir, ainsi que l'aire sous la courbe concentration-effet, nous avons établi qu'il n'y avait aucune différence significative dans les prédictions du modèle entre le patient-type et la population. Ceci démontre la robustesse de l'approche que nous avons développée et qui s'apparente à une approche de pharmacologie quantitative des systèmes (QSP). Motivés par l'utilisation du rhG-CSF dans le traitement d'autres maladies, comme des pathologies périodiques telles que la neutropénie cyclique, nous avons ensuite soumis l'étude du modèle au contexte des maladies dynamiques. En mettant en évidence la non validité du paradigme de la rétroaction des cytokines pour l'administration exogène des mimétiques du G-CSF, nous avons développé un modèle physiologique PK/PD novateur comprenant les concentrations libres et liées du G-CSF. Ce nouveau modèle PK a aussi nécessité des changements dans le modèle PD puisqu’il nous a permis de retracer les concentrations du G-CSF lié aux neutrophiles. Nous avons démontré que l'hypothèse sous-jacente de l'équilibre entre la concentration libre et liée, selon la loi d'action de masse, n'est plus valide pour le G-CSF aux concentrations endogènes et mènerait en fait à la surestimation de la clairance rénale du médicament. En procédant ainsi, nous avons réussi à reproduire des données cliniques obtenues dans diverses conditions (l'administration exogène du G-CSF, l'administration du PM00104, CHOP14). Nous avons aussi fourni une explication logique des mécanismes responsables de la réponse physiologique aux deux médicaments. Finalement, afin de mettre en exergue l’approche intégrative en pharmacologie adoptée dans cette thèse, nous avons démontré sa valeur inestimable pour la mise en lumière et la reconstruction des systèmes vivants complexes, en faisant le parallèle avec d’autres disciplines scientifiques telles que la paléontologie et la forensique, où une approche semblable a largement fait ses preuves. Nous avons aussi discuté du potentiel de la pharmacologie quantitative des systèmes appliquées au développement du médicament et à la médecine translationnelle, en se servant du modèle physio-PK/PD que nous avons mis au point.

Self-exciting threshold binomial autoregressive processes

We introduce a new class of integer-valued self-exciting threshold models, which is based on the binomial autoregressive model of order one as introduced by McKenzie (Water Resour Bull 21:645–650, 1985. doi:10.1111/j.1752-1688.1985. tb05379.x). Basic probabilistic and statistical properties of this class of models are discussed. Moreover, parameter estimation and forecasting are addressed. Finally, the performance of these models is illustrated through a simulation study and an empirical application to a set of measle cases in Germany.

Geological realism in hydrogeological and geophysical inverse modeling: A review

Scientific curiosity, exploration of georesources and environmental concerns are pushing the geoscientific research community toward subsurface investigations of ever-increasing complexity. This review explores various approaches to formulate and solve inverse problems in ways that effectively integrate geological concepts with geophysical and hydrogeological data. Modern geostatistical simulation algorithms can produce multiple subsurface realizations that are in agreement with conceptual geological models and statistical rock physics can be used to map these realizations into physical properties that are sensed by the geophysical or hydrogeological data. The inverse problem consists of finding one or an ensemble of such subsurface realizations that are in agreement with the data. The most general inversion frameworks are presently often computationally intractable when applied to large-scale problems and it is necessary to better understand the implications of simplifying (1) the conceptual geological model (e.g., using model compression); (2) the physical forward problem (e.g., using proxy models); and (3) the algorithm used to solve the inverse problem (e.g., Markov chain Monte Carlo or local optimization methods) to reach practical and robust solutions given today's computer resources and knowledge. We also highlight the need to not only use geophysical and hydrogeological data for parameter estimation purposes, but also to use them to falsify or corroborate alternative geological scenarios.

Estimação e compensação de não linearidades inerentes aos atuadores dos processos industriais

The oscillations presents in control loops can cause damages in petrochemical industry. Canceling, or even preventing such oscillations, would save up to large amount of dollars. Studies have identified that one of the causes of these oscillations are the nonlinearities present on industrial process actuators. This study has the objective to develop a methodology for removal of the harmful effects of nonlinearities. Will be proposed an parameter estimation method to Hammerstein model, whose nonlinearity is represented by dead-zone or backlash. The estimated parameters will be used to construct inverse models of compensation. A simulated level system was used as a test platform. The valve that controls inflow has a nonlinearity. Results and describing function analysis show an improvement on system response

Kinetic modelling of in vitro data of PI3K, mTOR1, PTEN enzymes and on-target inhibitors Rapamycin, BEZ235, and LY294002

The phosphatidylinositide 3-kinases (PI3K) and mammalian target of rapamycin-1 (mTOR1) are two key targets for anti-cancer therapy. Predicting the response of the PI3K/AKT/mTOR1 signalling pathway to targeted therapy is made difficult because of network complexities. Systems biology models can help explore those complexities but the value of such models is dependent on accurate parameterisation. Motivated by a need to increase accuracy in kinetic parameter estimation, and therefore the predictive power of the model, we present a framework to integrate kinetic data from enzyme assays into a unified enzyme kinetic model. We present exemplar kinetic models of PI3K and mTOR1, calibrated on in vitro enzyme data and founded on Michaelis-Menten (MM) approximation. We describe the effects of an allosteric mTOR1 inhibitor (Rapamycin) and ATP-competitive inhibitors (BEZ2235 and LY294002) that show dual inhibition of mTOR1 and PI3K. We also model the kinetics of phosphatase and tensin homolog (PTEN), which modulates sensitivity of the PI3K/AKT/mTOR1 pathway to these drugs. Model validation with independent data sets allows investigation of enzyme function and drug dose dependencies in a wide range of experimental conditions. Modelling of the mTOR1 kinetics showed that Rapamycin has an IC50 independent of ATP concentration and that it is a selective inhibitor of mTOR1 substrates S6K1 and 4EBP1: it retains 40% of mTOR1 activity relative to 4EBP1 phosphorylation and inhibits completely S6K1 activity. For the dual ATP-competitive inhibitors of mTOR1 and PI3K, LY294002 and BEZ235, we derived the dependence of the IC50 on ATP concentration that allows prediction of the IC50 at different ATP concentrations in enzyme and cellular assays. Comparison of the drug effectiveness in enzyme and cellular assays showed that some features of these drugs arise from signalling modulation beyond the on-target action and MM approximation and require a systems-level consideration of the whole PI3K/PTEN/AKT/mTOR1 network in order to understand mechanisms of drug sensitivity and resistance in different cancer cell lines. We suggest that using these models in systems biology investigation of the PI3K/AKT/mTOR1 signalling in cancer cells can bridge the gap between direct drug target action and the therapeutic response to these drugs and their combinations.

Niveles de actividad física y su relación con los desórdenes musculo esqueléticos en profesores de educación física en Bogotá - Colombia.

La actividad física regular desempeña un papel fundamental en la prevención y control de los desórdenes musculo esqueléticos, dentro de la actividad laboral del profesor de educación física. Objetivo: El propósito del estudio fue determinar la relación entre los niveles de actividad física y la prevalencia de los desórdenes musculo esqueléticos, en profesores de educación física de 42 instituciones educativas oficiales de Bogotá-Colombia. Métodos. Se trata de un estudio de corte transversal en 262 profesores de educación física, de 42 instituciones educativas oficiales de Bogotá - Colombia. Se aplicó de manera auto-diligenciada el Cuestionario Nórdico de desórdenes músculos esqueléticos y el Cuestionario IPAQ versión corta para identificar los niveles de actividad física. Se obtuvieron medidas de tendencia central y de dispersión para variables cuantitativas y frecuencias relativas para variables cualitativas. Se calculó la prevalencia de vida y el porcentaje de reubicación laboral en los docentes que habían padecido diferentes tipo de dolor. Para estimar la relación entre el dolor y las variables sociodemográficas de los docentes, se utilizó un modelo de regresión logística binaria simple. Los análisis fueron realizados en SPSS versión 20 y se consideró como significativo un valor p < 0.05 para el contraste de hipótesis y un nivel de confianza para la estimación de parámetros. Resultados: El porcentaje de respuesta fue del 83.9%, se consideraron válidos 262 registros, 22.5% eran de género femenino, la mayor cantidad de docentes de educación física se encuentraon entre 25 y 35 años (43,9%), frente a los desórdenes musculo esqueléticos, el 16.9% de los profesores reporto haberlos sufrido alguna vez molestias en el cuello, el 17,2% en el hombro, 27,9% espalda, 7.93% brazo y en mano el 8.4%. Los profesores con mayores niveles de actividad física, reportaron una prevalencia menor de alteraciones musculo esqueléticas de 16,9 % para cuello; 27.7% para dorsal/lumbar frente a los sujetos con niveles bajos de actividad física. La presencia de los desórdenes se asoció a los años de experiencia (OR 3.39 IC95% 1.41-7.65), a pertenecer al género femenino (OR 4.94 IC95% 1.94-12.59), a la edad (OR 5.06 IC95% 1.25-20.59), y al atender más de 400 estudiantes a cargo dentro de la jornada laboral (OR 4.50 IC95% 1.74-11.62). Conclusiones: En los profesores de Educación Física no sé encontró una relación estadísticamente significativa entre los niveles de actividad física y los desórdenes musculo esqueléticos medidos por auto reporte.

Dynamical modeling of biogas production supported by an experimental anaerobic digestion process

This paper presents the development of a combined experimental and numerical approach to study the anaerobic digestion of both the wastes produced in a biorefinery using yeast for biodiesel production and the wastes generated in the preceding microbial biomass production. The experimental results show that it is possible to valorise through anaerobic digestion all the tested residues. In the implementation of the numerical model for anaerobic digestion, a procedure for the identification of its parameters needs to be developed. A hybrid search Genetic Algorithm was used, followed by a direct search method. In order to test the procedure for estimation of parameters, first noise-free data was considered and a critical analysis of the results obtain so far was undertaken. As a demonstration of its application, the procedure was applied to experimental data.