The single principle of compositional data analysis, continuing fallacies, confusions and misunderstandings and some suggested remedies

In any discipline, where uncertainty and variability are present, it is important to have principles which are accepted as inviolate and which should therefore drive statistical modelling, statistical analysis of data and any inferences from such an analysis. Despite the fact that two such principles have existed over the last two decades and from these a sensible, meaningful methodology has been developed for the statistical analysis of compositional data, the application of inappropriate and/or meaningless methods persists in many areas of application. This paper identifies at least ten common fallacies and confusions in compositional data analysis with illustrative examples and provides readers with necessary, and hopefully sufficient, arguments to persuade the culprits why and how they should amend their ways

A compositional approach to stable isotope data analysis

Isotopic data are currently becoming an important source of information regarding sources, evolution and mixing processes of water in hydrogeologic systems. However, it is not clear how to treat with statistics the geochemical data and the isotopic data together. We propose to introduce the isotopic information as new parts, and apply compositional data analysis with the resulting increased composition. Results are equivalent to downscale the classical isotopic delta variables, because they are already relative (as needed in the compositional framework) and isotopic variations are almost always very small. This methodology is illustrated and tested with the study of the Llobregat River Basin (Barcelona, NE Spain), where it is shown that, though very small, isotopic variations comp lement geochemical principal components, and help in the better identification of pollution sources

Dynamic graphics of parametrically linked multivariate methods used in compositional data analysis

Many multivariate methods that are apparently distinct can be linked by introducing one or more parameters in their definition. Methods that can be linked in this way are correspondence analysis, unweighted or weighted logratio analysis (the latter also known as "spectral mapping"), nonsymmetric correspondence analysis, principal component analysis (with and without logarithmic transformation of the data) and multidimensional scaling. In this presentation I will show how several of these methods, which are frequently used in compositional data analysis, may be linked through parametrizations such as power transformations, linear transformations and convex linear combinations. Since the methods of interest here all lead to visual maps of data, a "movie" can be made where where the linking parameter is allowed to vary in small steps: the results are recalculated "frame by frame" and one can see the smooth change from one method to another. Several of these "movies" will be shown, giving a deeper insight into the similarities and differences between these methods

Es el reimplante valvular mejor que el bentall biológico modificado para tratar aneurismas de la raíz asociados a insuficiencia?

Es el reimplante valvular mejor que el Bentall Biológico Modificado para tratar aneurismas de la raíz asociados a insuficiencia? Obando CE; Gutiérrez HF; Santamaría G, Bresciani R; Camacho J; Sandoval N; Umaña J. Departamento de Cirugía Cardiovascular, Fundación Cardio Infantil, Bogotá, Colombia. Objetivo: comparar resultados funcionales, morbilidad y sobrevida a corto y mediano plazo, tras la realización de Bentall modificado con prótesis Freestyle vs reimplante valvular de Tirone David, en insuficiencia aortica secundaria a aneurisma de la raíz. Diseño: revisión de registros institucionales de 88 pacientes tratados entre enero de 2003 y agosto de 2009 con insuficiencia aortica secundaria a aneurisma de la raíz sin daño valvular, distribuidos en dos cohortes: Grupo 1 (Bentall modificado) y Grupo 2 (reimplante valvular). Se evaluaron complicaciones perioperatorias, transfusiones, estancias hospitalarias y en el seguimiento a mediano plazo insuficiencia valvular, clase funcional, función ventricular y sobrevida. Solidez de los resultados verificada mediante análisis de propensidad con balanceo de grupos. Resultados: Grupo (1) 51(57.9%) pacientes y grupo (2) 37(42.1%). Aunque el grupo 2 es mas joven, patrones similares de coomorbilidad, anatomía de la raíz, función y diámetros ventriculares hacen comparables los dos grupos. Seguimiento de 3.3 años (IQR 2.0-4.4). Mortalidad temprana 2(3.8%) vs 0 p =0.2 y tardía de 2(4.1%) vs 0 p=0.33. El análisis estratificado de covariables en bloques de distribución tampoco identifica diferencias en mortalidad. El análisis de sobrevida de mortalidad y sobrevida libre de eventos identifica desenlaces similares entre los grupos (Log-Rank chi2=0.9, p=0.3); incluyendo Insuficiencia aortica = II temprana (3.8% vs 0, p=0.2) y tardía (3.8%vs 0, p=0.1), transfusiones perioperatorias, reintervenciones por sangrado (2.3% vs 3.4%, p=0.4), arritmias (25.5% vs 13.5%, p=0.2) y disfunción neurológica (5.7% vs 2.9%, p=0.9). Finalmente la hospitalización total (6.5 {1-35} vs 4{3-16} p=0.001) y estancia en Cuidado intensivo (2.5 {1-21} vs 1{1-16} p=0.001) es superior en el grupo1. Conclusiones: el tratamiento de los aneurismas de la raíz aortica asociados a insuficiencia valvular sin daño estructural, mediante reimplante valvular o Bentall biológico modificado ofrece resultados similares a corto y mediano plazo. La preservación valvular se asocia a estancias mas cortas, pero no hay diferencia en complicaciones postoperatorias, estatus funcional, insuficiencia valvular, función ventricular, mortalidad y sobrevida libre de eventos adversos.

Internacionalización de las empresas colombianas caso: Pizza Gourmet 1969

A través de un análisis interno y estructural realizado a dos compañías pertenecientes al sector de alimentos, más específicamente al sector de las pizzas. Para reconocer sus principales características, cualidades y situación actual. Ambas con evidentes diferencias entre ellas, es decir, donde una es reconocida mundialmente y la otra aún no ha salido de su lugar de origen, asimismo donde una es estadounidense: Pizza Hut, y la otra Colombiana: Pizza Gourmet 1969. Y su respectivo análisis con respecto a su relación con las diversas teorías de la internacionalización de las empresas, se logró identificar la estrategia utilizada por Pizza Hut para lograr conquistar otros mercados y ser identificada como una de las mejores en el mundo. Y por otro lado, revelar y descubrir el mejor camino que podría seguir Pizza Gourmet 1969 para realizar su proceso de internacionalización. Por medio de lo dicho anteriormente, se evidencio que Pizza Gourmet 1969 podría llevar a cabo un comportamiento parecido al utilizado por P izza Hut para lograr salir de sus fronteras. Utilizando un mecanismo de franquicias y de la calidad e innovación de productos. Resaltando de esta forma los factores diferenciadores, y así obtener el aprovechamiento de los recursos, conocimientos y talentos de la compañía. Logrando conquistar el paladar del consumidor y satisfacer sus necesidades. De esta forma, la experiencia día a día será mayor y la participación de mercado a su vez se incrementara. El indiscutible éxito de Pizza Hut en el mundo, es el motivo por el cual se tomó como patrón y base para dicho análisis comparativo. Esta compañía es un ejemplo, y su historia y estrategias pueden ser utilizadas e imitadas por compañías que deseen ampliar sus mercados y realizar procesos de internacionalización.

Sostenibilidad fiscal: una aproximación con datos panel para 8 países Latinoaméricanos

Este documento examina la hipótesis de sostenibilidad fiscal para 8 países de Latinoamérica. A partir de un modelo de datos panel, se determina si los ingresos y gasto primario de los Gobiernos entre 1960 - 2009 están cointegrados, es decir, si son sostenibles a largo plazo. Para esto, se utilizaron pruebas de raíz unitaria y cointegración de segunda generación con datos panel macroeconómicos, lo que permite tener en cuenta la dependencia cruzada entre los países, así como los posibles quiebres estructurales en la relación que estén determinados de manera endógena; en particular, se usan la prueba de estacionariedad de Hadri y Rao (2008) y la prueba de cointegración de Westerlund (2006). Como resultado del análisis se encontró evidencia empírica de que en el período bajo estudio el déficit primario en los 8 países latinoamericanos es sostenible pero en sentido débil.

Efectividad en las redes empresariales

Este estudio tiene como objetivo identificar cuáles son las variables que repercuten en la efectividad de las redes empresariales. Esto, con base en la búsqueda de literatura existente de la efectividad en equipos, en organizaciones y en las redes interorganizacionales, así como el análisis de modelos y estudios empíricos que permitieron el análisis. De acuerdo con la búsqueda, se encontró que variables como la estructura de la red, la estabilidad del sistema, el compromiso de los empleados en cada una de las organizaciones que hacen parte de la red, la confianza dentro de la red, la transferencia de conocimiento y la apertura del sistema son las variables que en conclusión, mostraron ser buenas predictoras de efectividad dentro de las redes empresariales.

Tratamiento de Artritis reumatoide con antagonistas del factor de necrosis tumoral alfa y su asociación con el desarrollo de melanoma cutáneo: revisión sistemática de la literatura y meta-análisis.

Introducción: El tratamiento con antagonistas del factor de necrosis tumoral alfa (anti TNF) ha impactado el pronóstico y la calidad de vida de los pacientes con artritis reumatoide (AR) positivamente, sin embargo, se interroga un incremento en el riesgo de desarrollar melanoma. Objetivo: Conocer la asociación entre el uso de anti TNF y el desarrollo de melanoma maligno en pacientes con AR. Metodología: Se realizó una búsqueda sistemática en MEDLINE, EMBASE, COCHRANE LIBRARY y LILACS para ensayos clínicos, estudios observacionales, revisiones y meta-análisis en pacientes adultos con diagnóstico de AR y manejo con anti TNF (Certolizumab pegol, Adalimumab, Etanercept, Infliximab y Golimumab). Resultados: 37 estudios clínicos cumplieron los criterios de inclusión para el meta-análisis, con una población de 16567 pacientes. El análisis de heterogeneidad no fue significativo (p=1), no se encontró diferencia en el riesgo entre los grupos comparados DR -0.00 (IC 95% -0.001; -0.001). Un análisis adicional de los estudios en los que se reportó al menos 1 caso de melanoma (4222 pacientes) tampoco mostró diferencia en el riesgo DR -0.00 (IC 95% -0.004 ; -0.003). Conclusión: En la evidencia disponible a la fecha no encontramos asociación significativa entre el tratamiento con anti TNF en pacientes con diagnóstico de AR y el desarrollo de melanoma cutáneo.

Asymmetrically fair rules for an indivisible good problem with a budget constraint

We study a particular restitution problem where there is an indivisible good (land or property) over which two agents have rights: the dispossessed agent and the owner. A third party, possibly the government, seeks to resolve the situation by assigning rights to one and compensate the other. There is also a maximum amount of money available for the compensation. We characterize a family of asymmetrically fair rules that are immune to strategic behavior, guarantee minimal welfare levels for the agents, and satisfy the budget constraint.

Análisis de supervivencia en pacientes con prótesis valvular biológica, Fundación Cardioinfantil-Instituto de Cardiología, Colombia, 2005-2013

Introducción: A partir de la década de los cincuenta el manejo de la enfermedad valvular presenta cambios significativos cuando se incorporan los reemplazos valvulares tanto mecánicos como biológicos dentro de las opciones de tratamiento quirúrgico (1). Las válvulas biológicas se desarrollaron como una alternativa que buscaba evitar los problemas relacionados con la anticoagulación y con la idea de utilizar un tejido que se comportara hemodinámicamente como el nativo. Este estudio está enfocado en establecer la sobrevida global y la libertad de reoperación de la válvula de los pacientes sometidos a reemplazo valvular aórtico y mitral biológicos en la Fundación Cardioinfantil - IC a 1, 3, 5 y 10 años. Materiales y métodos: Estudio de cohorte retrospectiva de supervivencia de pacientes sometidos a reemplazo valvular aórtico y/o mitral biológico intervenidos en la Fundación Cardioinfantil entre 2005 y 2013. Resultados: Se obtuvieron 919 pacientes incluidos en el análisis general y 876 (95,3%) pacientes con seguimiento efectivo para el análisis de sobrevida. La edad promedio fue 64años. La sobrevida a 1, 3, 5 y 10 años fue 95%,90%,85% y 69% respectivamente. El seguimiento efectivo para el desenlace reoperación fue del 55% y se encontró una libertad de reoperación del 99%, 96%, 93% y 81% a los 1, 3, 5 y 10 años. No hubo diferencias significativas entre la localización de la válvula ni en el tipo de válvula aortica empleada. Conclusiones: La sobrevida de los pacientes que son llevados a reemplazo valvular biológico en este estudio es comparable a grandes cohortes internacionales. La sobrevida de los pacientes llevados a reemplazo valvular con prótesis biológicas en posición mitral y aortica fue similar a 1, 3, 5 y 10 años.

Secuenciación de siguiente generación en mujeres afectadas por falla ovárica prematura no sindrómica para la identificación de nuevos genes etiológicos de la enfermedad y estudio funcional de la mutación p.thr943ile en adamts19

La infertilidad afecta en la actualidad a aproximadamente 1 de cada 7 parejas a nivel mundial. La falla ovárica prematura (FOP) es una condición común en la población femenina, afectando al 1% de mujeres menores de 40 años. La etiología de la FOP es idiopática entre el 50% y el 80% de los casos, lo que sugiere causas genéticas, epigenéticas y ambientales aún desconocidas. A pesar de los avances en las técnicas de cartografía genética y de sistematización de la técnica de Sanger, pocos genes etiológicos de FOP fueron identificados en los últimos 20 años. Este fracaso relativo se asoció principalmente a que cientos de genes, que abarcan grandes regiones del genoma, son candidatos pero la técnica de secuenciación directa sólo permite el análisis de unas 700bp en cada reacción. En el presente trabajo se empleó la secuenciación de siguiente generación (NGS) para la búsqueda de mutaciones en 70 genes candidatos que potencialmente contribuyen con el desarrollo de la patología. Se identificaron mutaciones en 3 de 12 pacientes. La paciente POF-7 presentaba una mutación no sinónima en el gen ADAMTS19 (c.2828C>T, p.Thr943Ile). La proteína ADAMTS19 se clasifica dentro de la familia ADAMTS como huérfana ya que no se ha identificado su sustrato. Mediante el sistema de doble hibrido en levaduras se buscó identificar las potenciales proteínas que interactúan con ADAMTS19. Permitió identificar, a partir de las versiones murinas, la interacción de Adamts19 y Col6a2. Para comprobar la interacción entre las proteínas ADAMTS19 y COL6A2 humanas se empleó el sistema de doble hibrido en células eucariotas. Los hallazgos no permitieron replicar los resultados obtenidos previamente. En síntesis de identificó una mutación potencialmente causal de FOP en un gen nuevo y una muy probable interacción entre ADAMTS19 y COL6A2.

Detection of pressed hazelnut oil in virgin olive oil by analysis of polar components: improvement and validation of the method

An improved method for the detection of pressed hazelnut oil in admixtures with virgin olive oil by analysis of polar components is described. The method. which is based on the SPE-based isolation of the polar fraction followed by RP-HPLC analysis with UV detection. is able to detect virgin olive oil adulterated with pressed hazelnut oil at levels as low as 5% with accuracy (90.0 +/- 4.2% recovery of internal standard), good reproducibility (4.7% RSD) and linearity (R-2: 0.9982 over the 5-40% adulteration range). An international ring-test of the developed method highlighted its capability as 80% of the samples were, on average, correctly identified despite the fact that no training samples were provided to the participating laboratories. However, the large variability in marker components among the pressed hazelnut oils examined prevents the use of the method for quantification of the level of adulteration. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Evaluating the potential for statistical decadal predictions of sea surface temperatures with a perfect model approach

We explore the potential for making statistical decadal predictions of sea surface temperatures (SSTs) in a perfect model analysis, with a focus on the Atlantic basin. Various statistical methods (Lagged correlations, Linear Inverse Modelling and Constructed Analogue) are found to have significant skill in predicting the internal variability of Atlantic SSTs for up to a decade ahead in control integrations of two different global climate models (GCMs), namely HadCM3 and HadGEM1. Statistical methods which consider non-local information tend to perform best, but which is the most successful statistical method depends on the region considered, GCM data used and prediction lead time. However, the Constructed Analogue method tends to have the highest skill at longer lead times. Importantly, the regions of greatest prediction skill can be very different to regions identified as potentially predictable from variance explained arguments. This finding suggests that significant local decadal variability is not necessarily a prerequisite for skillful decadal predictions, and that the statistical methods are capturing some of the dynamics of low-frequency SST evolution. In particular, using data from HadGEM1, significant skill at lead times of 6–10 years is found in the tropical North Atlantic, a region with relatively little decadal variability compared to interannual variability. This skill appears to come from reconstructing the SSTs in the far north Atlantic, suggesting that the more northern latitudes are optimal for SST observations to improve predictions. We additionally explore whether adding sub-surface temperature data improves these decadal statistical predictions, and find that, again, it depends on the region, prediction lead time and GCM data used. Overall, we argue that the estimated prediction skill motivates the further development of statistical decadal predictions of SSTs as a benchmark for current and future GCM-based decadal climate predictions.

The kinetics of the gas-phase reactions of selected monoterpenes and cyclo-alkenes with ozone and the NO3 radical

The relative rate method has been used to measure the room-temperature rate constants for the gasphase reactions of ozone and NO3 with selected monoterpenes and cyclo-alkenes with structural similarities to monoterpenes. Measurements were carried out at 298 ! 2 K and 760 ! 10 Torr. The following rate constants (in units of 10"18 cm3 molecule"1 s"1) were obtained for the reaction with ozone: methyl cyclohexene (132 ! 17), terpinolene (1290 ! 360), ethylidene cyclohexane (223 ! 57), norbornene (860 ! 240), t-butyl isopropylidene cyclohexane (1500 ! 460), cyclopentene (543 ! 94), cyclohexene (81 ! 18), cyclooctene (451 ! 66), dicyclopentadiene (1460 ! 170) and a-pinene (107 ! 13). For the reaction with NO3 the rate constants obtained (in units of 10"12 cm3 molecule"1 s"1) were: methyl cyclohexene (7.92 ! 0.95), terpinolene (47.9 ! 4.0), ethylidene cyclohexane (4.30 ! 0.24), norbornene (0.266 ! 0.029), cyclohexene (0.540 ! 0.017), cyclooctene (0.513 ! 0.029), dicyclopentadiene (1.20 ! 0.10) and a-pinene (5.17 ! 0.62). Errors are quoted as the root mean square of the statistical error (95% con!dence) and the quoted error in the rate constant for the reference compound. Combining these results with previous studies, new recommendations for the rate constants are presented. Molecular orbital energies were calculated for each alkene and the kinetic data are discussed in terms of the deviation from the structureeactivity relationship obtained from the rate constants for a series of simple alkenes. Lifetimes with respect to key initiators of atmospheric oxidation have been calculated suggesting that the studied reactions play dominant roles in the night-time removal of these compounds from the atmosphere.

Environmental and ecological economics in the 21st century: an age adjusted citation analysis of the influential articles, journals, authors and institutions

We investigate the influence of articles, authors, journals and institutions in the field of environmental and ecological economics. We depart from studies that investigated the literature until 2001 and include a time period that has witnessed an enormous increase of importance in the field. We adjust for the age effect given the huge impact of the year of an article's publication on its influence and we show that this adjustment does make a substantial difference — especially for disaggregated units of analysis with diverse age characteristics such as articles or authors. We analyse 6597 studies on environmental and ecological economics published between 2000 and 2009. We provide rankings of the influential articles, authors, journals and institutions and find that Ecological Economics, Energy Economics and the Journal of Environmental Economics and Management have the most influential articles, they publish very influential authors and their articles are cited most. The University of Maryland, Resources for the Future, the University of East Anglia and the World Bank appear to be the most influential institutions in the field of environmental and ecological economics.