Transposable elements in a marginal plant population

Background
How new forms arise in nature has engaged evolutionary biologists since Darwin's seminal treatise on the origin of species. Transposable elements (TEs) may be among the most important internal sources for intraspecific variability. Thus, we aimed to explore the temporal dynamics of several TEs in individual genotypes from a small, marginal population of Aegilops speltoides. A diploid cross-pollinated grass species, it is a wild relative of the various wheat species known for their large genome sizes contributed by an extraordinary number of TEs, particularly long terminal repeat (LTR) retrotransposons. The population is characterized by high heteromorphy and possesses a wide spectrum of chromosomal abnormalities including supernumerary chromosomes, heterozygosity for translocations, and variability in the chromosomal position or number of 45S and 5S ribosomal DNA (rDNA) sites. We propose that variability on the morphological and chromosomal levels may be linked to variability at the molecular level and particularly in TE proliferation.

Results
Significant temporal fluctuation in the copy number of TEs was detected when processes that take place in small, marginal populations were simulated. It is known that under critical external conditions, outcrossing plants very often transit to self-pollination. Thus, three morphologically different genotypes with chromosomal aberrations were taken from a wild population of Ae. speltoides, and the dynamics of the TE complex traced through three rounds of selfing. It was discovered that: (i) various families of TEs vary tremendously in copy number between individuals from the same population and the selfed progenies; (ii) the fluctuations in copy number are TE-family specific; (iii) there is a great difference in TE copy number expansion or contraction between gametophytes and sporophytes; and (iv) a small percentage of TEs that increase in copy number can actually insert at novel locations and could serve as a bona fide mutagen.

Conclusions
We hypothesize that TE dynamics could promote or intensify morphological and karyotypical changes, some of which may be potentially important for the process of microevolution, and allow species with plastic genomes to survive as new forms or even species in times of rapid climatic change.

Localized data gathering paradigms for small and marginal farm lands in Semi-Arid region – Issues and Concerns

In this work we explore the application of wireless sensor technologies for the benefit of small and marginal farmers in semi-arid regions. The focus in this paper is to discuss the merits and demerits of data gathering & relay paradigms that collect localized data over a wide area. The data gathered includes soil moisture, temperature, pressure, rain data and humidity. The challenge to technology intervention comes mainly due to two reasons: (a) Farmers in general are interested in crop yield specific to their piece of land. This is because soil texture can vary rapidly over small regions. (b) Due to a high run-off, the soil moisture retention can vary from region to region depending on the topology of the farm. Both these reasons alter the needs drastically. Additionally, small and marginal farms can be sandwiched between rich farm lands. The village has very little access to grid power. Power cuts can extend up to 12 hours in a day and upto 3 or 4 days during some months in the year. In this paper, we discuss 3 technology paradigms for data relaying. These include Wi-Fi (Wireless Fidelity), GPRS (General Packet Radio Service) and DTN (Delay and Disruption Tolerant Network) technologies. We detail the merits and demerits of each of these solutions and provide our final recommendations. The project site is a village called Chennakesavapura in the state of Karnataka, India.

Ultrahigh-temperature metamorphism from an unusual corundum plus orthopyroxene intergrowth bearing Al-Mg granulite from the Southern Marginal Zone, Limpopo Complex, South Africa

The Southern Marginal Zone of the Limpopo Complex is composed of granite-greenstone cratonic rocks reworked by a Neoarchean high-grade tectono-metamorphic event. Petrographic and mineral chemical characterization of an Al-Mg granulite from this zone is presented here. The granulite has a gneissic fabric with distinct Al-rich and Si-rich layers, with the former preserving the unusual lamellar (random and regular subparallel) intergrowths of corundum and symplectic intergrowth of spinel with orthopyroxene. The Al-rich layer preserves mineral assemblages such as rutile with orthopyroxene + sillimanite +/- A quartz, Al-rich orthopyroxene (similar to 11 wt%), spinel + quartz, and corundum in possible equilibrium with quartz, while the Si-rich layer preserves antiperthites and orthopyroxene + sillimanite +/- A quartz, all considered diagnostic of ultrahigh-temperature metamorphism. Application of Al-in-opx thermometry, ternary feldspar thermometry and construction of suitable pressure-temperature phase diagrams, compositional and model proportion isopleth results indicate P-T conditions as high as similar to 1,050-1,100 A degrees C, and similar to 10-12 kbars for the Al-Mg granulite. Our report of ultrahigh-temperature conditions is significant considering that the very high temperature was reached during decompression of an otherwise high-pressure granulite complex (clockwise P-T path), whereas most other ultrahigh-temperature granulites are linked to magma underplating at the base of the crust (counterclockwise P-T path).

Proceedings of the 1998 Science Board Symposium on The Impacts of the 1997/98 El Niño Event on the North Pacific Ocean and Its Marginal Seas

Preface [pdf, 0.01 Mb] James J. O'Brien The big picture - The ENSO of 1997-98 [pdf, 0.01 Mb] James E. Overland, Nicholas A. Bond & Jennifer Miletta Adams Atmospheric anomalies in 1997: Links to ENSO? [pdf, 0.54 Mb] Vladimir I. Ponomarev, Olga Trusenkova, Serge Trousenkov, Dmitry Kaplunenko, Elena Ustinova & Antonina Polyakova The ENSO signal in the northwest Pacific [pdf, 0.47 Mb] Robert L. Smith, A. Huyer, P.M. Kosro & J.A. Barth Observations of El Niño off Oregon: July 1997 to present (October 1998) [pdf, 1.31 Mb] Patrica A. Wheeler & Jon Hill Biological effects of the 1997-1998 El Niño event off Oregon: Nutrient and chlorophyll distributions [pdf, 1.13 Mb] William T. Peterson Hydrography and zooplankton off the central Oregon coast during the 1997-1998 El Niño event [pdf, 0.26 Mb] William Crawford, Josef Cherniawsky, Michael Foreman & Peter Chandler El Niño sea level signal along the west coast of Canada [pdf, 1.25 Mb] Howard J. Freeland & Rick Thomson The El Niño signal along the west coast of Canada - temperature, salinity and velocity [pdf, 0.49 Mb] Frank A. Whitney, David L. Mackas, David W. Welch & Marie Robert Impact of the 1990s El Niños on nutrient supply and productivity of Gulf of Alaska waters [pdf, 0.06 Mb] Craig McNeil, David Farmer & Mark Trevorrow Dissolved gas measurements at Stn. P4 during the 97-98 El Niño [pdf, 0.13 Mb] Kristen L.D. Milligan, Colin D. Levings & Robert E. DeWreede Data compilation and preliminary time series analysis of abundance of a dominant intertidal kelp species in relation to the 1997/1998 El Niño event [pdf, 0.05 Mb] S.M. McKinnell, C.C. Wood, M. Lapointe, J.C. Woodey, K.E. Kostow, J. Nelson & K.D. Hyatt Reviewing the evidence that adult sockeye salmon strayed from the Fraser River and spawned in other rivers in 1997 [pdf,0.03 Mb] G.A. McFarlane & R.J. Beamish Sardines return to British Columbia waters [pdf, 0.34 Mb] Ken H. Morgan Impact of the 1997/98 El Niño on seabirds of the northeast Pacific [pdf, 0.06 Mb] Thomas C. Royer & Thomas Weingartner Coastal hydrographic responses in the northern Gulf of Alaska to the 1997-98 ENSO event [pdf, 0.76 Mb] John F. Piatt, Gary Drew, Thomas Van Pelt, Alisa Abookire, April Nielsen, Mike Shultz & Alexander Kitaysky Biological effects of the 1997/98 ENSO in Cook Inlet, Alaska [pdf, 0.22 Mb] H.J. Niebauer The 1997-98 El Niño in the Bering Sea as compared with previous ENSO events and the "regime shift" of the late 1970s [pdf, 0.10 Mb] A.S. Krovnin, G.P. Nanyushin, M.Yu. Kruzhalov, G.V. Khen, M.A. Bogdanov, E.I. Ustinova, V.V. Maslennikov, A.M. Orlov, B.N. Kotenev, V.V. Bulanov & G.P. Muriy The state of the Far East seas during the 1997/98 El Niño event [pdf, 0.15 Mb] Stacy Smith & Susan Henrichs Phytoplankton collected by a time-series sediment trap deployed in the southeast Bering Sea during 1997 [pdf, 0.21 Mb] Cynthia T. Tynan Redistributions of cetaceans in the southeast Bering Sea relative to anomalous oceanographic conditions during the 1997 El Niño [pdf, 0.02 Mb] Akihiko Yatsu, Junta Mori, Hiroyuki Tanaka, Tomowo Watanabe, Kazuya Nagasawa, Yikimasa Ishida, Toshimi Meguro, Yoshihiko Kamei & Yasunori Sakurai Stock abundance and size compositions of the neon flying squid in the central North Pacific Ocean during 1979-1998 [pdf, 0.11 Mb] O.B. Feschenko A new point of view concerning the El Niño mechanism [pdf, 0.01 Mb] Nathan Mantua 97/98 Ocean climate variability in the northeast Pacific: How much blame does El Niño deserve? [pdf, 0.01 Mb] Vadim P. Pavlychev Sharp changes of hydrometeorological conditions in the northwestern Pacific during the 1997/1998 El Niño event [pdf, 0.01 Mb] Jingyi Wang Predictability and forecast verification of El Niño events [pdf, 0.01 Mb] (Document contains 110 pages)

Avaliação dos métodos para análise da microinfiltração marginal em restaurações de resina composta classe V in vitro

O objetivo deste estudo foi comparar os resultados da microinfiltração marginal obtidos por diferentes meios de aquisição de imagens e métodos de mensuração da penetração de prata em restaurações de resina composta classe V, in vitro. Dezoito pré-molares humanos hígidos, recém extraídos, foram divididos em três grupos, de acordo com o tipo de instrumento para preparação cavitária utilizado. Grupo 1: ponta diamantada número 3100, em alta rotação. Grupo 2: broca carbide número 330, em alta rotação. Grupo 3: ponta CVDentus código 82137, em aparelho de ultrassom. Foram realizados preparos cavitários padronizados (3x4x2mm) classe V nas faces vestibular e lingual de todos os dentes, com margens oclusais em esmalte e cervicais em dentina/cemento. As cavidades foram restauradas com o sistema adesivo Solobond M (VOCO) e resina composta Grandio (VOCO), a qual foi inserida e fotoativada em três incrementos. Os corpos de prova ficaram imersos em água destilada por 24h a 37oC; receberam acabamento e polimento com discos SofLex (3M) e foram novamente armazenados em água destilada, por sete dias. Posteriormente, as superfícies dentárias foram coberta com duas camadas de esmalte para unhas vermelho, exceto as áreas adjacentes às restaurações. Os espécimes ficaram imersos em solução aquosa de nitrato de prata a 50% por 24h e em solução fotorreveladora por 2h e foram seccionados no sentido vestíbulo-lingual, passando pelo centro das restaurações, com disco diamantado em baixa rotação. As amostras foram polidas em politriz horizontal e analisadas por diferentes métodos. À extensão da microinfiltração foi atribuído escores de 0 a 3 através de análises por meio de estereomicroscópio tradicional e com leds e microscópio ótico. As imagens obtidas na lupa com leds e no microscópio ótico tiveram as áreas infiltradas medidas através do software AxioVision. O teste χ2 de McNemar-Bowker revelou concordância estatística entre estereomicroscópio tradicional e o com leds (p=0,809) durante análises semiquantitativas. Porém, houve diferenças significantes entre microscópio ótico e estereomicroscópios (p<0,001). Houve boa correlação entre análises semiquantitativas e quantitativas de acordo com o teste de Spearmann (p<0,001). O teste de Kruskall-Wallis não revelou diferenças estatisticamente significantes (p=0,174) entre os grupos experimentais na análise quantitativa por microscópio ótico, em esmalte. Ao contrário do que se observa com a mesma em lupa (p<0,001). Conclui-se que o método de atribuição de escores comumente aplicado com a lupa nos estudos da microinfiltração marginal é uma opção confiável para análise da microinfiltração.

Avaliação da microinfiltração marginal em cavidades classe II de molares decíduos restauradas com diferentes cimentos de ionômero de vidro

O objetivo desta pesquisa foi avaliar a microinfiltração em restaurações classe II realizadas com diferentes cimentos de ionômero de vidros em molares decíduos. Para tal, foram selecionados quarenta molares decíduos humanos a partir de um Banco de Dentes. Nas faces mesial e distal de cada dente foram preparadas cavidades classe II com dimensões padronizadas. Em seguida, os dentes foram divididos em oito grupos experimentais correspondentes ao material restaurador utilizado: grupo MXR (Maxxion R); grupo VDR (Vidrion R); grupo VTR (Vitremer); grupo VTF (Vitro Fill LC); grupo FUJ (Fuji IX); grupo KTM (Ketac Molar); grupo VMO (Vitro Molar); grupo MGS (Magic Glass ART). Ao término de vinte e quatro horas de imersão em água destilada, os dentes foram mantidos em solução de nitrato de prata a 50% pelo mesmo período e, então, em solução reveladora de radiografias (hidroquinona, Kodak) por quinze minutos. Os dentes foram então seccionados através do centro das restaurações, e observados em lupa estereoscópica sob o aumento de quarenta vezes. A microinfiltração foi graduada co base em escores relacionados à penetração do nitrato de prata na interface adesiva. Os resultados, após submetidos à análise estatística, demonstraram que nenhum dos materiais testados impediu completamente a microinfiltração. No entanto, o Vitremer apresentou os escores mais baixos, seguido do Ketac Molar e do Fuji IX. Os materiais Magic Glass ART, Vitro Molar, Vitro Fill LC e Vidrion R apresentaram comportamento intermediário em relação aos demais, enquanto o Maxxion R apresentou os piores resultados. Com base na metodologia empregada e nos resultados obtidos, pode-se concluir que nenhum dos materiais testados foi capaz de impedir completamente a microinfiltração, apesar de apresentarem graus varáveis de suscetibilidade a esse fenômeno, destacando-se, entre eles o Vitremer, o Ketac Molar e o Fuji IX por apresentarem baixos níveis de microinfiltração, seguidos do Magic Glass ART, Vitro Molar, Vitro Fill LC e Vidrion R. Em contrapartida, o Maxxion R apresentou os piores resultados, fato constatado pelos altos escores de microinfiltração registrados.

Etos na poesia combatente de menestréis do rap: por uma análise das imagens discursivas no grito marginal do hip hop brasileiro

Este estudo tem como objetivo averiguar os efeitos de sentido produzidos por músicas de hip hop (movimento cultural cultivado nos guetos fluminenses), com base na análise de sua expressão verbal (rap) e em uma consideração experimental de capas de disco. Objetiva-se também investigar, no material artístico de Marcelo D2 e MV Bill, relações sociais engendradas por sujeitos da periferia, em espaços sociais antagônicos (centro e periferia). Para isso, exploramos uma Análise do Discurso de base enunciativa, enfatizando o conceito de etos discursivo, além de noções vinculadas à problemática da alteridade discursiva, a fim de que se analise o posicionamento de entes subjugados perante o descaso a que estão submetidos, e suas impressões sobre as imagens discursivas de marginalizadores. Buscamos apreender etos produzidos por sujeitos do rap, considerando a presença do Outro que fala nele/por ele (alteridade). Nossos procedimentos metodológicos apontam o que levou a considerar o hip hop, além da trajetória seguida na delimitação do corpus. Além disso, expõem-se os motivos que nos fizeram priorizar etos e alteridade discursiva. As análises buscam avaliações sobre a materialidade discursiva, que almejam extrair sentidos produzidos nos guetos. Como resultados, refletimos sobre aspectos inerentes ao contexto social fluminense, ao relacionamento entre sujeitos, lugares e práticas, para que se alarguem considerações sobre essas afinidades, inclusive na escola. Desse modo, ambicionamos que se aprimorem os debates sobre práticas de afirmação social de classes e, através de novas discussões, se intensifiquem as iniciativas sociopolíticas

O clarim dos marginalizados. A literatura marginal/periférica na Literatura Brasileira Contemporânea

A presente dissertação tem como objetivo principal problematizar a questão da Literatura Marginal / Periférica e apresentá-la no âmbito da Literatura e das Culturas. Para a construção do trabalho, foram utilizados teóricos que trabalham e reveem conceitos de cultura, não cristalizados, tais como, Cultura Popular, Cultura de Elite e Cultura de Massa, tendo em vista uma concepção de mercado e de socialização da arte. Ao mesmo tempo, a fim de inserir este novo movimento literário no âmbito das artes e das instituições, foram feitas entrevistas e utilizadas obras literárias de três autores (Ferréz, Alessandro Buzo e Allan da Rosa) e de uma autora (Elizandra Souza) que atuam na cena literária marginal / periférica. Para sua concretização, o estudo toma como referência as indagações e as recepções diante das culturas e da indústria cultural, ao traçar um panorama de como este movimento vem atuando na Literatura Brasileira Contemporânea

Desajuste interno e desadaptação marginal de sistemas restauradores estéticos usados em restaurações inlays indiretas

O objetivo é comparar o ajuste interno e marginal cervical de dois sistemas de compósito e um de cerâmica prensada. O Material e Métodos foi elaborado a partir de um modelo mestre metálico com preparo para inlay MOD, 15 troquéis de gesso tipo IV foram obtidos e distribuídos randomicamente em três grupos (n=5), a saber: Grupo Empress, Grupo Sinfony e Grupo Z350. Após a confecção das restaurações, cada peça foi posicionada no modelo mestre e fotografada nas faces mesial e distal para através de um programa de computador fazer a análise da desadaptação marginal cervical. Depois, a peça foi cimentada no modelo mestre usando silicone de adição de ultrabaixa viscosidade para preencher o espaço entre as restaurações e o preparo. Após a remoção das inlays, cada réplica foi pesada em balança de precisão para posterior obtenção de seu volume. Nos Resultados temos a interface paredes do preparo/paredes da restauração: houve diferença estatística entre o grupo Empress, que apresentou volume até 137% maior que os demais grupos, que foram considerados iguais entre si. Área de desadaptação marginal cervical: Houve diferença entre todos os grupos com o grupo Empress apresentando os maiores valores, seguido pelo grupo Sinfony e pelo grupo Z350. Os grupos Empress e o Sinfony apresentaram respectivamente áreas de desadaptação 450% e 200% maiores que o grupo Z350. Maior distância entre as bordas da restauração e as margens do preparo os grupos Empress e Sinfony foram iguais estatisticamente e diferentes do grupo Z350 que apresentou os menores valores. Entretanto, o grupo Empress apresentou uma desadaptação linear 43% maior que o grupo Sinfony. Concluímos que quanto ao desajuste interno, o grupo Empress apresentou os maiores valores no volume da interface dente/restauração, com diferença estatística significativa (P<0,05) em relação aos demais grupos. Para o cálculo da área, a desadaptação marginal foi menor no grupo Z350, seguido dos grupos Sinfony e Empress, todos mostrando diferença estatística significativa entre si (P<0,05). Considerando a medida linear, a desadaptação marginal foi menor no grupo Z350, indicando diferença estatística significativa (P<0,05) deste para os demais grupos.

Influência de propriedades físico químicas dos materiais resinosos e da técnica de inserção na adaptação marginal de restaurações classe II

A contração de polimerização das resinas compostas é uma característica indesejável que compromete a integridade da interface dente/restauração. O objetivo deste estudo foi avaliar in vitro a influência de diferentes materiais usados em restaurações classe II de resina composta, quanto ao grau de conversão, tensão de contração, resistência a flexão, módulo de elasticidade e formação de fenda marginal. Foram realizados preparos classe II com dimensões de 4x4x2mm em terceiros molares recém-extraídos para a avaliação da formação de fenda marginal. As cavidades foram niveladas com cimento de ionômero de vidro Riva Light Cure (SDI) (CIV), resina de baixa contração SureFilSDR (Dentsply) (SDR), resina flow FiltekZ350Flow (3M/ESPE) (Z350F) e resina composta FiltekP90 (3M/ESPE) (P90). As restaurações (n=3) foram avaliadas com lupa estereoscópica. A resistência a flexão foi avaliada por meio de ensaio de flexão em três pontos. Para este ensaio foram confeccionados dez corpos de prova (n=10) de cada material com dimensões de 10x2x1mm. Para o teste de tensão de contração foram utilizados cilindros de polimetacrilato com 5 mm de diâmetro e 13 ou 28mm de comprimento. Os bastões foram fixados na EMIC com um espaço de 2mm entre eles, onde os materiais foram inseridos. Foram realizadas cinco repetições para cada grupo (n=5) e a tensão proveniente da contração foi medida por até 10 minutos após o início da fotopolimerização. O Grau de Conversão (GC) foi determinado por espectroscopia no infravermelho com transformada de Fourier (FTIR). Os resultados foram tratados estatisticamente por análise de variância (ANOVA) e Teste de Tukey (p<0,05). Fenda marginal: Z350F = CIV > SDR = P90. Tensão de contração: Z350F > SDR > CIV = P90. Resistência a flexão: P90 > SDR = Z350F > CIV. Módulo de Elasticidade: P90 > CIV = SDR = Z350F. GC: Z350F = SDR > P90 > CIV. Conclusões: existe correlação entre a formação de fenda marginal e as propriedades físico químicas dos materiais testados, sendo as resinas de baixa contração que proporcionaram melhor adaptação marginal; existe correlação entre resistência a flexão, módulo de elasticidade, tensão de contração e a composição dos materiais, já que os compósitos com melhores resultados foram os que apresentaram os maiores percentuais de carga, no entanto, maior grau de conversão não representou melhores propriedades mecânicas.