CpG islands or CpG clusters: how to identify functional GC-rich regions in a genome?

Background: CpG islands (CGIs), clusters of CpG dinucleotides in GC-rich regions, are often located in the 5' end of genes and considered gene markers. Hackenberg et al. ( 2006) recently developed a new algorithm, CpGcluster, which uses a completely diffe

人类基因同义密码子偏好的特征以及与基因GC含量的关系

对人类的728个基因，按其编码区中GC的含量分成四组（从GC < 0.43到GC > 0.58），分别考察了这四组样本对同义密码子偏好的特征，发现在全部样本中都呈现NTG（N代表四种碱其中的任一种）特爱偏爱和NCG尽量避免的特征。基因环境中GC含量与C3／G3含量（密码子第三位C和G的含量）的相关分析，以及四组本对密码子的偏好都支持以C线的密码子在编码中有特殊的优势，这种优势有利于保证翻译的准确性。还考察了各种氨基酸含量随编码区GC含量不同而变化的趋势。

The features of synonymous codon bias and GC-content relationship in human genes

728 human genes were divided to four groups according to the GC contents of their coding sequences (from GC<0.43 to GC>0.58). Examination of synonymous-codon bias in the 4 groups show that NTG (N represents any base of T, A, C, G) is most favored and NCG

利用HS-SPME-GC技术分析环境水样中超痕量的六氯苯,DDT及其代谢产物

利用顶空固相微萃取(HSSPME)和气相色谱检测技术,通过对三种不同的SPME萃取头(PDMS,PMPVS,PA)实验条件的优化,并参照液液萃取的方法,对水相中六氯苯,DDT及其代谢产物的萃取效果进行了比较.结果表明,SPME方法比液液萃取方法在检测限和回收率上有很大的提高,其中PDMS对检测六氯苯,DDT及其代谢产物的效果较其它两种萃取头好.

湖北栀子花挥发油的GC/MS分析

利用水蒸气蒸馏法从湖北栀子花鲜花中提取栀子花挥发油。通过 DB 5弹性石英毛细管柱 GC MS分析所得栀子花挥发油 ,共鉴定了 4 0个化合物并测定了其相对含量。湖北栀子花挥发油的主要成分为芳樟醇 ( 1 7 92 %)、茉莉内酯 ( 9 1 1 %)和惕各酸顺 3 己烯酯( 6 5 4 %)

除臭大蒜口服液的GC/MS分析

应用GC/MS联用技术,对除臭大蒜口服液进行了检测,定性鉴定了25种含硫有机化合物。二烯丙基硫醚、甲基烯丙基三硫醚、3-乙烯基-1,2-二硫杂-5-环己烯、2-乙烯基-1,3-二硫杂-5-环己烯和二烯丙基三硫醚是主要组分;二烯丙基四硫醚、烯丙基四硫化氢、2-和3-(2’,3’-二硫杂-5’-己烯基)-3,4-二氢-2H-噻喃、2-(2’-[3’,4’-二氢-2H噻喃基])-1,3-二硫杂-5-环己烯和3-(2’-[3’,4’-二氢-2H-噻喃基])-1,2-二硫杂-5-环己烯是次要组分。最后4种次要组分在

湖泊沉积物中邻苯二甲酸酯类的GC／MS分析

东湖沉积物阴干后用二氯甲烷溶剂萃取，用ＤＢ－５弹性石英毛细管柱ＧＣ／ＭＳ分离鉴定，并结合ｍ／ｚ１４９质量色谱图，确证东湖沉积物中含有９种邻苯二甲酸酯类化合物，它们是邻苯二甲酸二乙酯、二异丁酯、二正丁酯、二己酯、己基辛基酯、二－（２－乙基己基）酯、二辛酯、己基癸基酯和辛基癸基酯，其特征离子及峰度见表１。

自来水中非挥发性氯化产物的GC／MS分析

本文采用ＸＡＤ－２和ＸＡＤ－８（１：１）混合树脂现场富集采样，循环提取器提取，毛细管ＧＣ／ＭＳ定性的方法，通过对冬夏两季的采样分析，初步分析了某地自来（饮用）水中非挥发性有机氯化产物。从夏天自来水中检测出了２８种有机氯化合物。从冬天自来水中只检出了１种有机氯化合物。

湖北大蒜油的GC/MS研究

<正> 1 简介与实验大蒜(Allium sativun L.)系石蒜科葱属植物,世界各地均有栽培,大蒜作为民间药物广泛应用于世界各地。我国用大蒜作为药物有悠久的历史,大蒜在临床上的重要作用引起了广大化学家的重视,对大蒜的分析国内外均有报道。Stoll 等人认为大蒜的主要成分是大蒜辣素(Allicm),其结构式为 CH_2=

珍稀水生动物白暨豚油中脂肪酸的GC/MS分析

白暨豚是一种珍稀水生动物.本文报道了运用 Dexsil-300GC 毛细管柱色质联用仪,对白(?)豚油中脂肪酸进行了分析鉴定,并检测到了22种脂肪酸,其中主要脂肪酸是十四碳烯酸、十六碳烯酸和十八碳烯酸.