Senescence rates are determined by ranking on the fast-slow life-history continuum.

Comparative analyses of survival senescence by using life tables have identified generalizations including the observation that mammals senesce faster than similar-sized birds. These generalizations have been challenged because of limitations of life-table approaches and the growing appreciation that senescence is more than an increasing probability of death. Without using life tables, we examine senescence rates in annual individual fitness using 20 individual-based data sets of terrestrial vertebrates with contrasting life histories and body size. We find that senescence is widespread in the wild and equally likely to occur in survival and reproduction. Additionally, mammals senesce faster than birds because they have a faster life history for a given body size. By allowing us to disentangle the effects of two major fitness components our methods allow an assessment of the robustness of the prevalent life-table approach. Focusing on one aspect of life history - survival or recruitment - can provide reliable information on overall senescence.

A fast automated screening method for the detection of blood transfusion in sports.

Currently, there is no simple direct screening method for the misuse of blood transfusions in sports. In this study, we investigated whether the measurement of iron in EDTA-plasma can serve as biomarker for such purpose. Our results revealed an increase of the plasma iron level up to 25-fold 6 h after blood re-infusion. The variable remained elevated 10-fold one day after the procedure. A specificity of 100% and a sensitivity of 93% were obtained with a proposed threshold at 45 µg/dL of plasma iron. Therefore, our test could be used as a simple, cost effective biomarker for the screening for blood transfusion misuse in sports. Copyright © 2014 John Wiley & Sons, Ltd.

Impact of restrictive intravenous fluid replacement and combined epidural analgesia on perioperative volume balance and renal function within a Fast Track program.

BACKGROUND AND OBJECTIVE: Key factors of Fast Track (FT) programs are fluid restriction and epidural analgesia (EDA). We aimed to challenge the preconception that the combination of fluid restriction and EDA might induce hypotension and renal dysfunction. METHODS: A recent randomized trial (NCT00556790) showed reduced complications after colectomy in FT patients compared with standard care (SC). Patients with an effective EDA were compared with regard to hemodynamics and renal function. RESULTS: 61/76 FT patients and 59/75 patients in the SC group had an effective EDA. Both groups were comparable regarding demographics and surgery-related characteristics. FT patients received significantly less i.v. fluids intraoperatively (1900 mL [range 1100-4100] versus 2900 mL [1600-5900], P < 0.0001) and postoperatively (700 mL [400-1500] versus 2300 mL [1800-3800], P < 0.0001). Intraoperatively, 30 FT compared with 19 SC patients needed colloids or vasopressors, but this was statistically not significant (P = 0.066). Postoperative requirements were low in both groups (3 versus 5 patients; P = 0.487). Pre- and postoperative values for creatinine, hematocrit, sodium, and potassium were similar, and no patient developed renal dysfunction in either group. Only one of 82 patients having an EDA without a bladder catheter had urinary retention. Overall, FT patients had fewer postoperative complications (6 versus 20 patients; P = 0.002) and a shorter median hospital stay (5 [2-30] versus 9 d [6-30]; P< 0.0001) compared with the SC group. CONCLUSIONS: Fluid restriction and EDA in FT programs are not associated with clinically relevant hemodynamic instability or renal dysfunction.

Fast Track and Fast Track II - Cedar Rapids, Iowa, HR-544, Construction Report, 1989

Two lanes of a major four lane arterial street needed to be reconstructed in Cedar Rapids, Iowa. The traffic volumes and difficulty of detouring the traffic necessitated closure for construction be held to an absolute minimum. Closure of the intersections, even for one day, was not politically feasible. Therefore, Fast Track and Fast Track II was specified for the project. Fast Track concrete paving has been used successfully in Iowa since 1986. The mainline portion of the project was specified to be Fast Track and achieved the opening strength of 400 psi in less than twelve hours. The intersections were allowed to be closed between 6 PM and 6 AM. This could occur twice - once to remove the old pavement and place the base and temporary surface and the second time to pave and cure the new concrete. The contractor was able to meet these restrictions. The Fast Track II used in the intersections achieved the opening strength of 350 psi in six to seven hours. Two test sections were selected in the mainline Fast Track and two intersections were chosen to test the Fast Tract II. Both flexural and compression specimens were tested. Pulse velocity tests were conducted on the pavement and test specimens. Maturity curves were developed through monitoring of the temperatures. Correlations were performed between the maturity and pulse velocity and the flexural strengths. The project was successful in establishing the feasibility of construction at night, with no disruption of traffic in the daytime, using fast Track II. Both the Fast Track II pavements were performing well four years after construction.

Optimization strategies for fast detection of positive selection on phylogenetic trees.

MOTIVATION: The detection of positive selection is widely used to study gene and genome evolution, but its application remains limited by the high computational cost of existing implementations. We present a series of computational optimizations for more efficient estimation of the likelihood function on large-scale phylogenetic problems. We illustrate our approach using the branch-site model of codon evolution. RESULTS: We introduce novel optimization techniques that substantially outperform both CodeML from the PAML package and our previously optimized sequential version SlimCodeML. These techniques can also be applied to other likelihood-based phylogeny software. Our implementation scales well for large numbers of codons and/or species. It can therefore analyse substantially larger datasets than CodeML. We evaluated FastCodeML on different platforms and measured average sequential speedups of FastCodeML (single-threaded) versus CodeML of up to 5.8, average speedups of FastCodeML (multi-threaded) versus CodeML on a single node (shared memory) of up to 36.9 for 12 CPU cores, and average speedups of the distributed FastCodeML versus CodeML of up to 170.9 on eight nodes (96 CPU cores in total).Availability and implementation: ftp://ftp.vital-it.ch/tools/FastCodeML/. CONTACT: selectome@unil.ch or nicolas.salamin@unil.ch.

Interrogating eleven fast-evolving genes for signatures of recent positive selection in worldwide human populations

Different signatures of natural selection persist over varying time scales in our genome, revealing possible episodes of adaptative evolution during human history. Here, we identify genes showing signatures of ancestral positive selection in the human lineage and investigate whether some of those genes have been evolving adaptatively in extant human populations. Specifically, we compared more than 11,000 human genes with their orthologs inchimpanzee, mouse, rat and dog and applied a branch-site likelihood method to test for positive selection on the human lineage. Among the significant cases, a robust set of 11 genes were then further explored for signatures of recent positive selection using SNP data. We genotyped 223 SNPs in 39 worldwide populations from the HGDP Diversity panel and supplemented this information with available genotypes for up to 4,814 SNPs distributed along 2 Mb centered on each gene. After exploring the allele frequency spectrum, population differentiation and the maintainance of long unbroken haplotypes, we found signals of recent adaptative phenomena in only one of the 11 candidate gene regions. However, the signal ofrecent selection in this region may come from a different, neighbouring gene (CD5) ratherthan from the candidate gene itself (VPS37C). For this set of positively-selected genes in thehuman lineage, we find no indication that these genes maintained their rapid evolutionarypace among human populations. Based on these data, it therefore appears that adaptation forhuman-specific and for population-specific traits may have involved different genes.

Fast Bias Field Correction for 9.4 Tesla Magnetic Resonance Imaging

In this paper the problem of intensity inhomogeneity athigh magnetic field on magnetic resonance images isaddressed. Specifically, rat brain images at 9.4Tacquired with a surface coil are bias corrected. Wepropose a low- pass frequency model that takes intoaccount not only background-object contours but alsoother important contours inside the image. Twopre-processing filters are proposed: first, to create avolume of interest without contours, and second, toextrapolate the image values of such masked area to thewhole image. Results are assessed quantitatively andvisually in comparison to standard low pass filterapproach, and they show as expected better accuracy inenhancing image intensity.

Release Process Effectiveness - Case of Operating Room Management Software

Työn päätavoitteena oli tuoda esiin tärkeimmät julkistamisprosessin tehokkuuteen vaikuttavat tekijät. Tutkimuksessa tarkasteltiin aihetta julkistamisprojektien vetäjän näkökulmasta. Kirjallinen selvitys kattaa keskeisimmät ohjelmistoprosessin, palvelun laadun sekä projektihallinnan teoriat. Kokeellisena aineistona käytettiin asiakkailta ja myynnin sekä käyttöönoton organisaatioilta tullutta palautetta ja asiantuntijahaastatteluita. Case-tuotteena tarkasteltiin suuren kansainvälisen yrityksen jälleenmyymää leikkaussalihallinnan ohjelmistoa. Tärkeimpiä julkistamisprosessin tehokkuuteen vaikuttavia tekijöitä ovat tiekartan ja julkistamispakettien sisällön hallinta, projektin aikataulujen pitäminen, rehellinen ja nopea kommunikaatio myyntikanavaan ja asiakkaille, sekä hyvin toteutettu testaus. Työssä käydään läpi esimerkkistrategioita kehittymiseen näillä alueilla.

ERP- järjestelmän tukiprosessin nykytilan analyysi ja prosessin kehittäminen

Diplomityön tavoitteena oli tunnistaa kohdeyrityksessä kehitysmahdollisuuksia. Kehitysmahdollisuuksien etsiminen käyttäjätukiprosessin aloitettiin prosessin nykytilan analysoinnilla, jolla pyrittiin tunnistamaan prosessin ominaisuuksia sekä ongelma-alueita, joita korjaamalla prosessia voitiin tehostaa. Tutkimus on jaettu teoria ja empiria osaan.Teorian alussa käsitellään tietotekniikkapalveluiden organisointia, jotta ymmärretään toiminnanohjausjärjestelmien ja niihin liittyvien tukiprosessien merkitys yrityksissä. Tämän jälkeen perehdytään prosessijohtamiseen ja sen keinoihin liiketoimintaprosessien kehittämiseen. Tuloksena voidaan sanoa, että prosessien virtaviivaistaminen on nopea ja edullinen tapa tehostaa prosessin toimintaa ja päivittää vanha prosessi vastaamaan yrityksen nykyisiä tarpeita. Prosessien virtaviivaistamisella ei saada suuria kustannussäästöjä, vaan hyödyt liittyvät prosessin tehostumiseen. Virtaviivaistetusta prosessista on poistettu turhat toiminnot ja se on suunniteltu vastaamaan tarkoitustaan parhaalla mahdollisella tavalla. Näin prosessin virtaviivaistaminen lisää myös asiakkaan kokemaa arvoa.

Scenario method in anticipating future opportunities of e-business in the forest industry

Tutkimuksen tavoitteena on ennakoida liiketoimintaprosessien sähköistymisen kehittymistä käyttämällä skenaariomenetelmää, yhtä laajimmin käytetyistä tulevaisuuden tutkimisen menetelmistä. Tarkastelun kohteena ovat erityisesti tulevaisuuden e-business -ratkaisut metsäteollisuudessa. Tutkimuksessa selvitetään skenaariomenetelmän ominaisuuksia, skenaariosuunnittelun periaatteita sekä menetelmän sopivuutta teknologian ja toimialan muutosten tarkasteluun. Tutkimuksen teoriaosassa selvitetään teknologian muutoksen vaikutusta toimialojen kehitykseen. Todettiin, että teknologisella muutoksella on vahva vaikutus toimialojen muutoksiin, ja että jokainen toimiala seuraa tietynlaista kehitystrajektoria. Yritysten tulee olla tietoisia teknologisen muutoksen nopeudesta ja suunnasta, ja seurata toimialansa kehityksen sääntöjä. Metsäteollisuudessa muutosten radikaali luonne sekä ICT-teknologian nopea kehitys asettavat haasteita liiketoimintaprosessien sähköistämisen kentässä. Empiriaosuudessa luotiin kolme erilaista skenaariota e-busineksen tulevaisuudesta metsäteollisuudessa. Skenaariot perustuvat pääosin aiheen asiantuntijoiden tämän hetkisiin näkemyksiin, joita koottiin skenaariotyöpajassa. Skenaarioiden muodostamisessa yhdistettiin kvalitatiivisia ja kvantitatiivisia elementtejä. Muodostetut kolme skenaariota osoittavat, että e-busineksen vaikutukset tulevaisuudessa nähdään pääosin positiivisina, ja että yritysten tulee kehittyä aktiivisesti ja joustavasti pystyäkseen hyödyntämään sähköisiä ratkaisuja tehokkaasti liiketoiminnassaan.

Service Management for Service Desk

Palvelunhallinnan kehittäminen Service Desk ympäristöön johtaa parempaan työnkulun hallintaan. Service Deskin päätehtävänä on toimia ainoana yhteyspisteenä asiakkaalta tietohallinto-osastolle. Jokainen yhteydenottopitää kirjata ja se pitäisi olla jäljitettävissä. Tapahtumien eli insidenttien kirjaaminen tapahtuu pääasiassa Service Desk -funktiossa, joka omistaa niistä jokaisen. Tapahtumien hallintaprosessin tehtävänä on etsiä loppukäyttäjän tai IT-infrastruktuurin monitorointityökalun ilmoittamalle insidentille mahdollisimman nopea ratkaisu. Insidentit saattavat johtaa ongelmiin, jotka käsitellään erillisessä prosessissa. Ongelmien hallintaprosessi yrittää etsiä vikatilanteen pohjimmaisen syyn. Kun pohjimmaisin syy on löytynyt, prosessi lähettää muutospyynnön muutosten hallintaprosessille. Jotta päästään mahdollisimman hyvään tehokkuuteen, pitää määrittää asiakasrajapinta sekä mittarit. ITIL-malli tarjoaa prosessit IT-palvelunhallinnan kehittämiselle. Kansainvälisesti tunnettuna 'de factO' standardina sitä voidaan soveltaa globaaleissa yrityksissä. Tässä työssä keskitytään erään lääkkeiden jakelussa toimivan yrityksen tietohallinto-osaston Help Deskin nykytilan määrittämiseen. Työssä myös kuvataan tietohallinto-osaston tavoitetila, jossa keskitytään Service Deskin IT palvelunhallinnan kehittämiseen. Muut prosessit ja mittarit on kuvattu niiltä osin, jotka tulee huomioida Service Deskin seuraamisen ja ohjaamisen kannalta.

Fast gas chromatography and negative-ion chemical ionization tandem mass spectrometry for forensic analysis of cannabinoids in whole blood.

The present work describes a fast gas chromatography/negative-ion chemical ionization tandem mass spectrometric assay (Fast GC/NICI-MS/MS) for analysis of tetrahydrocannabinol (THC), 11-hydroxy-tetrahydrocannabinol (THC-OH) and 11-nor-9-carboxy-tetrahydrocannabinol (THC-COOH) in whole blood. The cannabinoids were extracted from 500 microL of whole blood by a simple liquid-liquid extraction (LLE) and then derivatized by using trifluoroacetic anhydride (TFAA) and hexafluoro-2-propanol (HFIP) as fluorinated agents. Mass spectrometric detection of the analytes was performed in the selected reaction-monitoring mode on a triple quadrupole instrument after negative-ion chemical ionization. The assay was found to be linear in the concentration range of 0.5-20 ng/mL for THC and THC-OH, and of 2.5-100 ng/mL for THC-COOH. Repeatability and intermediate precision were found less than 12% for all concentrations tested. Under standard chromatographic conditions, the run cycle time would have been 15 min. By using fast conditions of separation, the assay analysis time has been reduced to 5 min, without compromising the chromatographic resolution. Finally, a simple approach for estimating the uncertainty measurement is presented.