Molecular genetic analysis of a cattle population to reconstitute the extinct Algarvia breed

Background: Decisions to initiate conservation programmes need to account for extant variability, diversity loss and cultural and economic aspects. Molecular markers were used to investigate if putative Algarvia animals could be identified for use as progenitors in a breeding programme to recover this nearly extinct breed. Methods: 46 individuals phenotypically representative of Algarvia cattle were genotyped for 27 microsatellite loci and compared with 11 Portuguese autochthonous and three imported breeds. Genetic distances and factorial correspondence analyses (FCA) were performed to investigate the relationship among Algarvia and related breeds. Assignment tests were done to identify representative individuals of the breed. Y chromosome and mtDNA analyses were used to further characterize Algarvia animals. Gene- and allelic-based conservation analyses were used to determine breed contributions to overall genetic diversity. Results: Genetic distance and FCA results confirmed the close relationship between Algarvia and southern Portuguese breeds. Assignment tests without breed information classified 17 Algarvia animals in this cluster with a high probability (q > 0.95). With breed information, 30 cows and three bulls were identified (q > 0.95) that could be used to reconstitute the Algarvia breed. Molecular and morphological results were concordant. These animals showed intermediate levels of genetic diversity (MNA = 6.0 ± 1.6, Rt = 5.7 ± 1.4, Ho = 0.63 ± 0.19 and He = 0.69 ± 0.10) relative to other Portuguese breeds. Evidence of inbreeding was also detected (Fis = 0.083, P < 0.001). The four Algarvia bulls had Y-haplotypes H6Y2 and H11Y2, common in Portuguese cattle. The mtDNA composition showed prevalence of T3 matrilines and presence of the African-derived T1a haplogroup. This analysis confirmed the genetic proximity of Algarvia and Garvonesa breeds (Fst = 0.028, P > 0.05). Algarvia cattle provide an intermediate contribution (CB = 6.18, CW = -0.06 and D1 = 0.50) to the overall gene diversity of Portuguese cattle. Algarvia and seven other autochthonous breeds made no contribution to the overall allelic diversity. Conclusions: Molecular analyses complemented previous morphological findings to identify 33 animals that can be considered remnants of the Algarvia breed. Results of genetic diversity and conservation analyses provide objective information to establish a management program to reconstitute the Algarvia breed.

Potential of fisheries restocking off the Algarve coast using aquaculture produced marine fish

Tese de dout., Ciências do Mar, da Terra e do Ambiente (Ecologia Marinha), Faculdade de Ciências e Tecnologia, Univ. do Algarve, 2012

Development of an operational tool for oil spill forecast: application to oil exposed regions

Tese de doutoramento, Ciências do Mar, da Terra e do Ambiente (Modelação), Faculdade de Ciências e Tecnologia, Universidade do Algarve, 2014

De como o pícaro chegou a Portugal e aí se apresentou:contributo para a história da recepção do romance picaresco espanhol no sistema literário português

Tese de doutoramento, Tradução (História da Tradução), Universidade de Lisboa, Faculdade de Letras, 2012

Contribuição dos métodos geofísicos para o modelo evolutivo da região de Santo André desde o último máximo glaciário

Tese de doutoramento, Geologia (Geologia Económica e do Ambiente), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2014

Império e imagem : D. João de Castro e a retórica do Vice-Rei (1505-1548)

Tese de doutoramento, Ciências Sociais (Sociologia Histórica), Universidade de Lisboa, Instituto de Ciências Sociais, 2014

Motivos de beleza e amor no cancioneiro popular português e sérvio

Tese de doutoramento, Linguística (Linguística Aplicada), Universidade de Lisboa, Faculdade de Letras, 2014

Contribuição para a história social da biotecnologia em Portugal

Tese de doutoramento, Sociologia (Sociologia da Ciência e Tecnologia), Universidade de Lisboa, Instituto de Ciências Sociais, 2014

Percursos da física e da energia nucleares na capital portuguesa : ciência, poder e política, 1947-1973

Tese de doutoramento, História e Filosofia das Ciências, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2014

O espaço português : a consolidação de um reino cristão ibérico : "a reconquista cristã em Portugal" : lendas e mitos, uma proposta didática"

Relatório da Prática de Ensino Supervisionada, Mestrado em Ensino de História e Geografia no 3º ciclo do Ensino Básico e Secundário, Universidade de Lisboa, 2014

Ecology of the common octopus "Octopus vulgaris" (Cuvier, 1797) in the Atlantic Iberian coast : life cycle strategies under different oceanographic regimes

Tese de doutoramento, Biologia (Biologia Marinha e Aquacultura), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2015

Estudantes chineses em Portugal : valores, família e escolaridade

Dissertação de mestrado, Ciências da Educação (Educação Intercultural), Universidade de Lisboa, Instituto de Educação, 2014

Stress e adaptação no processo de luto materno : um estudo exploratório

Tese de mestrado, Psicologia (Secção de Psicologia Clínica e da Saúde, Núcleo de Psicologia Clínica Sistémica), Universidade de Lisboa, Faculdade de Psicologia, 2014

A presença árabe-islâmica em Fernando Pessoa

Tese de doutoramento, Filosofia (Filosofia em Portugal), Universidade de Lisboa, Faculdade de Letras, 2015

Fatores escolares do envolvimento dos alunos na escola : um estudo com alunos adolescentes

Tese de mestrado, Educação (Área de especialização Formação Pessoal e Social), Universidade de Lisboa, Instituto de Educação, 2015