山羊mtDNA 多态性及其起源分化研究

　本文用14 种识别6 碱基的限制性内切酶Apa Ⅰ、BamH Ⅰ、Bgl Ⅰ、Bgl Ⅱ、Dra Ⅰ、 EcoR Ⅰ、EcoR Ⅴ、Kpn Ⅰ、Pvu Ⅱ、Pst Ⅰ、Sac Ⅰ、Sal Ⅰ、Sma Ⅰ和Xho Ⅰ研究了来自我国12 个省 和自治区共计18 个地方山羊品种218 个个体mtDNA 的RFL P ,并运用Nei 氏公式计算了各限制 性类型间的遗传距离P 和群体遗传多态度π值。结果表明,在研究的所有个体中共检测到41 个 酶切位点,18 种限制性态型,其中BamH Ⅰ、Bgl Ⅱ、Dra Ⅰ、EcoR Ⅰ和Sal Ⅰ共5 种酶表现出多态。 18 种限制性态型可归结为6 种基因单倍型,单倍型Ⅰ(BamH Ⅰ2B、Bgl Ⅱ2A、Dra Ⅰ2A、EcoR Ⅰ2A 和Sal Ⅰ2A) 和单倍型Ⅱ(BamH Ⅰ2B、Bgl Ⅱ2A、Dra Ⅰ2A、EcoR Ⅰ2A 和Sal Ⅰ2B) 为两种基本单倍 型,研究结果提示我国地方山羊品种起源于两种不同的母系祖先。各限制性类型间的平均遗传距 离为0100436 ,整个群体的平均遗传多态度π值为010487 % ,表明我国地方山羊品种mtDNA 遗传 多样性比较贫乏,分化程度较低。

中国南方黄牛的mtDNA变异研究──起源及渐渗现象

本研究采用１０种限制性内切酶（ＡｖａⅠ，ＢａｍＨⅠ，ＢｇｌⅡ，ＥｃｏＲⅠ，ＥｃｏＲⅤ，ＨｉｎｄⅢＨｐａＩ，ＰｓｔＩ，ＰｖｕⅡ　ａｎｄ　ＳａｌＩ）对中国南方四省──云南、贵州、广东和海南省的１１个地方黄牛品种和１个培育牛品种共１５４份样品进行了线粒体ＤＮＡ限制性内切酶片段长度多态性分析（ｍｔＤＮＡＲＦＬＰ）。结果发现，除ＥｃｏＲⅠ外其余９种酶均表现出多态性。共检测到２３种限制性态型，可以归结为５种单倍型。利用“ＵＰＧＭＡ”方法构建了单倍型间的聚类树。研究表明，单传型Ⅰ和Ⅱ分别与瘤牛（Ｂｏｓ　ｉｎｄｉｃｕｓ）和普通牛（Ｂｏｓｔａｕｒｕｓ）的单倍型一致，瘤牛和普通牛是中国南方黄牛的２个重要起源，其中瘤牛在中国南方黄牛形成过程中的贡献较普通牛大。单格型Ｉｌｌ与牦牛的互型一致，仅在云南迪庆黄牛中检测到，提示从牦牛（Ｂｏ．ｇｇｆｕ；；。ｉｅ。ｓ）到迪庆黄牛可能存在着ｍｔＤＮＡ渐渗现象。ＩＶ型为首次报道，为云南省德宏黄牛所特有，推测可能是来自除印度瘤牛外的另一支瘤牛的独立驯化事件。单倍型１和ＩＶ的分歧时间大约是在２６８８０—５３５０００年以前，比黄牛的驯化时间１００００年要早许多。中国南方黄牛的mtDNA变异研究──起源及...

云南几个地方鸡种的mtDNA限制性片段多态性研究

云南几个地方鸡种的ｍｔＤＮＡ限制性片段多态性研究邹平张廷饮（云南省畜牧兽医科学研究所昆明６５０２２４）王文陈永久张亚平（中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放实验室线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）具有进化速度快、严格单性母系遗传和易于提取分析而成为研...

猕猴属五个种mtDNA多态性研究

结合日本猴(M. fuscata)的有关资, 料构建了猕猴属6个种的分子系统树, 并给出各个种的分化时间。这6个种可分成4个类群, 熊猴和藏酋猴、恒河猴和日本猴之间的遗传距离较近, 可分别划分为同一类群, 红面猴与其他5种猴的遗传距离最远, 在系统发生上分离最早。图9表5参29

乌珠穆沁羊mtDNA的RFLP研究

用Apa I等7种识别6碱基的限制性内切酶研究了14只乌珠穆沁羊mtDNA的RFLP。结果表明,在所研究的个体中检测到37个酶切位点,17种限制性态型,其中BamH I和Bgl I表现出多态,Xho I无切点。17种限制性态型可归结为3种基因单倍型,mtDNA多态度π值为0.027%,表明乌珠穆沁羊mtDNA多态性比较贫乏。

贵州黄牛品种间mtDNA的限制性片段长度多态性研究

以15种限制性内切酶,用限制性片段长度多态方法分析了贵州黄牛4个地方品种和1个育成品种--贵州黑白花奶牛的mtDNA多态性。发现贵州黄牛有两种类型的mtDNA分子,即普通黄牛类型和瘤牛类型,两者的频率分别是44.07%和55.93%,没有发现重组和中间类型。贵州黑白花奶牛的mtDNA与贵州黄牛类似。贵州黄牛可能起源于普通牛和瘤牛。此外,根据品种间亲缘关系的推断,对“盘江黄牛”和“巫陵黄牛”两个品种的命名进行了讨论。

贵州四个山羊品种mtDNA多态性及起源分化

采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(capra sp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHI、HindIII和SalI3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。单倍型I和II在贵州山羊4个品种中分布频率较高,分别为77.42%和21.50%,单倍型III分布频率较低(1.08%);品种间亲缘关系聚类分析表明白山羊和黑山羊亲缘关系最近,其次为黔北麻羊,而与小香羊的亲缘关系最远。

绵羊、山羊和岩羊mtDNA的RFLP及其遗传分化研究

用15种识别6碱基的限制性内切酶ApaⅠ、BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、ClaⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、HaeⅡ、HindⅢ、KpnⅠ、PvuⅡ、PstⅠ、SacⅠ和SalⅠ对绵羊、山羊和岩羊mtDNA的限制性片断长度多态性进行了比较研究,以探讨其遗传分化关系。

我国北方部分山羊品种mtDNA遗传多样性

我国北方地区有丰富的山羊品种遗传资源。这些遗传资源是人类赖以生存的宝贵基因库之一，是山羊育种不可缺少的重要的遗传材料。因此，对其遗传多样性进行研究具有十分重要的理论和实践意义。然而目前对这些山羊品种的遗传差异，特别是分子遗传的差异却知之甚少。本试验对中国北方地区部分山羊品种和类群的线粒体DNA的限制片段长度多态性进行了研究，以期为我国北方地区山羊品种的起源及遗传分化研究、群体的遗传结构和亲缘关系研究以及品种遗传资源的合理利用和保护研究提供基础资料和科学依据。

中华鲟(Acipenser sinensis)及相关种类的mtDNA控制区串联重复序列及其进化意义

采用PCR技术和DNA测序技术,发现了我国一级珍稀保护动物中华鲟(Acipenser sinensis)线粒体DNA(mtDNA)的控制区(D-loop)存在数目不等的串联重复序列,该重复序列造成了中华鲟广泛的异质性现象。从分子水平进行了不同类型重复序列变化规律的研究,同时还初探了重复序列在我国其它几种鲟鱼类的存在情况,发现在白鲟(Psephurus gladius)、达氏鲟(A. dabryanus)和史氏鲟(A. schrenckii)均存在类似的重复序列结构。

青海湖裸鲤 mtDNA 遗传多样性的初步研究

该文用 BclⅠ、AvaⅠ、BamHⅠ、PstⅠ、KpnⅠ、PvuⅡ 共6种限制性内切核酸酶, 分析了15尾青海湖裸鲤 mtDNA 的限制性片段长度多态性, 共检测出20个酶切位点, 发现 BclⅠ、BamHⅠ和 PvuⅡ 三种酶切类型具有多态性. 根据不同个体 mtDNA 的酶切类型, 青海湖裸鲤存在4种 mtDNA 单倍型, 计算 mtDNA 多态度 π 值为 0.0043, 初步认为青海湖裸鲤在线粒体 DNA 上存在较丰富的群体内变异。

云南文山牛和迪庆牛mtDNA的多态性研究

其它部委、高等院校基金

Pitfalls in the analysis of ancient human mtDNA

The retrieval of DNA from ancient human specimens is not always successful owing to DNA deterioration and contamination although it is vital to provide new insights into the genetic structure of ancient people and to reconstruct the past history. Normally, only short DNA fragments can be retrieved from the ancient specimens. How to identify the authenticity of DNA obtained and to uncover the information it contained are difficult. We employed the ancient mtDNAs reported from Central Asia (including Xinjiang, China) as an example to discern potentially extraneous DNA contamination based on the updated mtDNA phylogeny derived from mtDNA control region, coding region, as well as complete sequence information. Our results demonstrated that many mtDNAs reported are more or less problematic. Starting from a reliable mtDNA phylogeney and combining the available modern data into analysis, one can ascertain the authenticity of the ancient DNA, distinguish the potential errors in a data set, and efficiently decipher the meager information it harbored. The reappraisal of the mtDNAs with the age of more than 2000 years from Central Asia gave support to the suggestion of extensively (pre)historical gene admixture in this region.

中国5种珍稀绢蝶非损伤性取样的mtDNA序列及系统进化

应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。PAUP3.1.1(简约法)数据分析软件构建该5个种绢蝶的分子系统树显示,爱珂绢蝶(Parnassius acco)和巴裔绢蝶(Parnassius baileyi)的亲缘关系比较接近,阿波罗绢蝶(Parnassius apollo)、珍珠绢蝶(Parnassius orlears)和西猴绢蝶(Parnassius simo)3种绢蝶均为相对独立的一支,其中西猴绢蝶分化较早,与形态学研究结果相吻合。