Quantitative evaluation of altered hepatic spaces and membrane transport in fibrotic rat liver

Four animal models were used to quantitatively evaluate hepatic alterations in this study: (1) a carbon tetrachloride control group (phenobarbital treatment only), (2) a CCl4-treated group (phenobarbital with CCl4 treatment), (3) an alcohol-treated group (liquid diet with alcohol treatment), and (4) a pair-fed alcohol control group (liquid diet only). At the end of induction, single-pass perfused livers were used to conduct multiple indicator dilution (MID) studies. Hepatic spaces (vascular space, extravascular albumin space, extravascular sucrose space, and cellular distribution volume) and water hepatocyte permeability/surface area product were estimated from nonlinear regression of outflow concentration versus time profile data. The hepatic extraction ratio of H-3-taurocholate was determined by the nonparametric moments method. Livers were then dissected for histopathologic analyses (e.g., fibrosis index, number of fenestrae). In these 4 models, CCl4-treated rats were found to have the smallest vascular space, extravascular albumin space, H-3-taurocholate extraction, and water hepatocyte permeability/surface area product but the largest extravascular sucrose space and cellular distribution volume. In addition, a linear relationship was found to exist between histopathologic analyses (fibrosis index or number of fenestrae) and hepatic spaces. The hepatic extraction ratio of H-3-taurocholate and water hepatocyte permeability/surface area product also correlated to the severity of fibrosis as defined by the fibrosis index. In conclusion, the multiple indicator dilution data obtained from the in situ perfused rat liver can be directly related to histopathologic analyses.

Mapping glider habitat in dry eucalypt forests for Montreal Process indicator 1.1: Fragmentation of forest types

Accurate habitat mapping is critical to landscape ecological studies such as required for developing and testing Montreal Process indicator 1.1e, fragmentation of forest types. This task poses a major challenge to remote sensing, especially in mixedspecies, variable-age forests such as dry eucalypt forests of subtropical eastern Australia. In this paper, we apply an innovative approach that uses a small section of one-metre resolution airborne data to calibrate a moderate spatial resolution model (30 m resolution; scale 1:50 000) based on Landsat Thematic Mapper data to estimate canopy structural properties in St Marys State Forest, near Maryborough, south-eastern Queensland. The approach applies an image-processing model that assumes each image pixel is significantly larger than individual tree crowns and gaps to estimate crown-cover percentage, stem density and mean crown diameter. These parameters were classified into three discrete habitat classes to match the ecology of four exudivorous arboreal species (yellowbellied glider Petaurus australis, sugar glider P. breviceps, squirrel glider P. norfolcensis , and feathertail glider Acrobates pygmaeus), and one folivorous arboreal marsupial, the greater glider Petauroides volans. These species were targeted due to the known ecological preference for old trees with hollows, and differences in their home range requirements. The overall mapping accuracy, visually assessed against transects (n = 93) interpreted from a digital orthophoto and validated in the field, was 79% (KHAT statistic = 0.72). The KHAT statistic serves as an indicator of the extent that the percentage correct values of the error matrix are due to ‘true’ agreement verses ‘chance’ agreement. This means that we are able to reliably report on the effect of habitat loss on target species, especially those with a large home range size (e.g. yellow-bellied glider). However, the classified habitat map failed to accurately capture the spatial patterning (e.g. patch size and shape) of stands with a trace or sub-dominance of senescent trees. This outcome makes the reporting of the effects of habitat fragmentation more problematic, especially for species with a small home range size (e.g. feathertail glider). With further model refinement and validation, however, this moderateresolution approach offers an important, cost eff e c t i v e advancement in mapping the age of dry eucalypt forests in the region.

Levene tests of homogeneity of variance for general block and treatment designs

This article develops a weighted least squares version of Levene's test of homogeneity of variance for a general design, available both for univariate and multivariate situations. When the design is balanced, the univariate and two common multivariate test statistics turn out to be proportional to the corresponding ordinary least squares test statistics obtained from an analysis of variance of the absolute values of the standardized mean-based residuals from the original analysis of the data. The constant of proportionality is simply a design-dependent multiplier (which does not necessarily tend to unity). Explicit results are presented for randomized block and Latin square designs and are illustrated for factorial treatment designs and split-plot experiments. The distribution of the univariate test statistic is close to a standard F-distribution, although it can be slightly underdispersed. For a complex design, the test assesses homogeneity of variance across blocks, treatments, or treatment factors and offers an objective interpretation of residual plot.

Exploring complex fitness surfaces: Multiple ornamentation and polymorphism in male guppies

The sexual ornamentation used by male guppies to attract females comprises many components, each of which varies considerably among males. Although natural and sexual selection have been shown to contribute to divergence among populations in male sexual ornaments, the role of sexual selection in maintaining polymorphism within populations is less clear. We used both parametric quadratic regression and nonparametric projection pursuit regression techniques to reveal the major axes of non-linear sexual selection on male ornaments. We visualized the fitness surfaces defined by these axes using thin-plate splines to allow a direct comparison of the two methodologies. Identification of the major axes of selection and their visualization was critical in determining the form and strength of nonlinear selection. Both types of analysis revealed fitness surfaces comprising three peaks, suggesting that there is more than one way to make an attractive guppy. Disruptive selection may be an important process underlying the presence of multiple sexual ornaments and may contribute to the maintenance of the high levels of polymorphism in male sexual ornaments found in guppy populations.

Localization of a novel melanoma susceptibility locus to 1p22

Over the past 20 years, the incidence of cutaneous malignant melanoma (CMM) has increased dramatically worldwide. A positive family history of the disease is among the most established risk factors for CMM; it is estimated that 10% of CMM cases result from an inherited predisposition. Although mutations in two genes, CDKN2A and CDK4, have been shown to confer an increased risk of CMM, they account for only 20%-25% of families with multiple cases of CMM. Therefore, to localize additional loci involved in melanoma susceptibility, we have performed a genomewide scan for linkage in 49 Australian pedigrees containing at least three CMM cases, in which CDKN2A and CDK4 involvement has been excluded. The highest two-point parametric LOD score (1.82; recombination fraction [theta] 0.2) was obtained at D1S2726, which maps to the short arm of chromosome 1 (1p22). A parametric LOD score of 4.65 (theta = 0) and a nonparametric LOD score of 4.19 were found at D1S2779 in nine families selected for early age at onset. Additional typing yielded seven adjacent markers with LOD scores 13 in this subset, with the highest parametric LOD score, 4.95 (theta = 0) ( nonparametric LOD score 5.37), at D1S2776. Analysis of 33 additional multiplex families with CMM from several continents provided further evidence for linkage to the 1p22 region, again strongest in families with the earliest mean age at diagnosis. A nonparametric ordered sequential analysis was used, based on the average age at diagnosis in each family. The highest LOD score, 6.43, was obtained at D1S2779 and occurred when the 15 families with the earliest ages at onset were included. These data provide significant evidence of a novel susceptibility gene for CMM located within chromosome band 1p22.

An??lise da efici??ncia relativa dos programas de p??s-gradua????o acad??micos em administra????o, contabilidade e turismo

O objetivo deste artigo ?? apresentar um modelo alternativo de an??lise da efici??ncia dos programas de p??s-gradua????o acad??micos em Administra????o, Contabilidade e Turismo, vinculados ??s institui????es de ensino superior p??blicas e privadas. O estudo tem como base te??rica a efici??ncia e a otimiza????o de recursos, tomando como refer??ncia a maximiza????o do retorno, sujeito ??s limita????es de recursos. Como modelo anal??tico foi utilizada a An??lise Envolt??ria de Dados (DEA), enquanto t??cnica n??o param??trica de an??lise da efici??ncia relativa. Os resultados apontaram que os programas de p??s-gradua????o foram mais eficientes em 2006, seguido por 2004 e 2005, respectivamente. Notou- se ainda que, em m??dia, os programas vinculados ??s institui????es privadas de ensino foram mais eficientes que os da rede p??blica no tri??nio 2004/2006. Os gestores desses programas podem utilizar a an??lise da efici??ncia relativa como estrat??gia de benchmarking, adotando as melhores pr??ticas observadas nos programas eficientes, visando ?? maximiza????o da efici??ncia em sua gest??o.

Padrões espaço-temporais da mortalidade por câncer de mama em mulheres no Estado do Espírito Santo - um estudo ecológico

O câncer de mama é a principal neoplasia maligna que acomete o sexo feminino no Brasil. O câncer de mama é hoje uma doença de extrema importância para a saúde pública nacional, motivando ampla discussão em torno das medidas que promova o seu diagnóstico precoce, a redução em sua morbidade e mortalidade. A presente pesquisa possui três objetivos, cujos resultados encontram-se organizados em artigos. O primeiro objetivo buscou analisar a completude dos dados do Sistema de Informação de Mortalidade sobre os óbitos por câncer de mama em mulheres no Espírito Santo, Sudeste e Brasil (1998 a 2007). Realizou-se um estudo descritivo analítico baseado em dados secundários, onde foi analisado o número absoluto e percentual de não preenchimento das variáveis nas declarações de óbitos. Adotou-se escore para avaliar os graus de não completude. Os resultados para as variáveis sexo e idade foram excelentes tanto para o Espírito Santo, Sudeste e Brasil. O preenchimento das variáveis raça/cor, grau de escolaridade e estado civil apresentam problemas no Espírito Santo. Enquanto no Sudeste e Brasil as variáveis raça/cor e escolaridade têm tendência decrescente para a não completude, no Espírito Santo a tendência se mantém estável. Para a variável estado civil, a não completude tem tendência crescente no Estado do Espírito Santo. O segundo objetivo foi analisar a evolução das taxas de mortalidade por câncer de mama, em mulheres no Espírito Santo no período de 1980 a 2007. Estudo de série temporal, cujos dados sobre óbitos foram obtidos do Sistema de Informação de Mortalidade e as estimativas populacionais segundo idade e anos-calendário, do Instituto Brasileiro Geografia e Estatística. Os coeficientes específicos 9 de mortalidade, segundo faixa etária, foram calculados anualmente. A análise de tendência foi realizada por meio da padronização das taxas de mortalidade pelo método direto, em que a população do senso IBGE-2000, foi considerada padrão. No período de estudo, ocorreram 2.736 óbitos por câncer de mama. O coeficiente de mortalidade neste período variou de 3,41 a 10,99 por 100.000 mulheres. Os resultados indicam que há tendência de mortalidade por câncer de mama ao longo da série (p=0,001 com crescimento de 75,42%). Todas as faixas etárias a partir de 30 anos apresentaram tendência de crescimento da mortalidade estatisticamente significante (p=0,001). Os percentuais de crescimento foram aumentando, segundo as idades mais avançadas, sendo 48,4% na faixa de 40 a 49 anos, chegando a 92,3%, na faixa de 80 anos e mais. O terceiro objetivo foi realizar a análise espacial dos óbitos em mulheres por câncer de mama no estado do Espírito Santo, nos anos de 2003 a 2007, com análise das correlações espaciais dessa mortalidade e componentes do município. O cenário foi o Estado do Espírito Santo, composto por 78 municípios. Para análise dos dados, utilizou-se a abordagem bayesiana (métodos EBest Global e EBest Local) para correção de taxas epidemiológicas. Calculou-se o índice I de Moran, para dependência espacial em nível global e a estatística Moran Local. As maiores taxas estão concentradas em 19 municípios pertencentes às Microrregiões: Metropolitana (Fundão, Vitória, Vila Velha, Viana, Cariacica e Guarapari), Metrópole Expandida Sul (Anchieta, Alfredo Chaves), Pólo Cachoeiro (Vargem Alta, Rio Novo do Sul, Mimoso do Sul, Cachoeiro de Itapemirim, Castelo, Jerônimo Monteiro, Bom Jesus do Norte, Apiacá e Muqui) e Caparaó (Alegre e São José do Calçado). Os resultados da Estimação Bayesiana (Índice de Moran) dos óbitos por câncer de mama em mulheres ocorridos no estado do Espírito Santo, segundo os dados brutos e 10 ajustados indicam a existência de correlação espacial significativa para o mapa Local (I = 0,573; p = 0,001) e Global (I = 0,118; p = 0,039). Os dados brutos não apresentam correlação espacial (I = 0,075; p = 0,142).

Fatores relacionados à cronologia de erupção da dentição decídua

O objetivo deste estudo foi estimar a cronologia e sequência de erupção da dentição decídua e seus fatores relacionados em amostra de crianças de duas regiões do município de Vitória, ES. Os dados utilizados no estudo são provenientes de um estudo longitudinal realizado entre 2003 e 2006 com 86 recém-nascidos que foram acompanhados até a idade de 36 meses de vida, cuja coleta de dados foi obtida por meio da aplicação de um formulário as mães e da realização de um exame clínico nas crianças. Um total de 67 crianças permaneceram até o final do estudo. Calculou-se a idade média de erupção dos dentes decíduos de cada criança e foram aplicados o teste de kappa, McNemar e kappa ajustado pela prevalência. Em seguida realizou-se a Análise de Sobrevivência. Os resultados mostraram que a média de erupção dos dentes decíduos variou de oito a 29 meses de vida no arco inferior, e de 11 a 30 meses no arco superior e que os maiores níveis de concordância foram para os tempos de erupção dos incisivos e caninos decíduos (71/81, kappa = 0,82; IC95% = 0,72-0,93; 53/63, kappa = 0,76; IC95% = 0,62-0,88) do que para os molares decíduos. Dos fatores relacionados a cronologia de erupção da dentição decídua, foi identificado na Regressão de Cox que os hábitos alimentares infantis podem influenciar, acelerando e retardando esse processo eruptivo. Recomenda-se o conhecimento do perfil de erupção decídua de cada população para que tais evidências sirvam de base para a implementação de medidas de prevenção e controle da saúde dessa população e auxilie na elaboração de estratégias, com ações de proteção e promoção da saúde. As ações tem como finalidade a prevenção de possíveis alterações bucais e gerais durante o crescimento e desenvolvimento infantil e melhoria da qualidade de vida dessa população.

Survival analysis: a tool in the study of post-harvest diseases in peaches

Survival analysis is applied when the time until the occurrence of an event is of interest. Such data are routinely collected in plant diseases, although applications of the method are uncommon. The objective of this study was to use two studies on post-harvest diseases of peaches, considering two harvests together and the existence of random effect shared by fruits of a same tree, in order to describe the main techniques in survival analysis. The nonparametric Kaplan-Meier method, the log-rank test and the semi-parametric Cox's proportional hazards model were used to estimate the effect of cultivars and the number of days after full bloom on the survival to the brown rot symptom and the instantaneous risk of expressing it in two consecutive harvests. The joint analysis with baseline effect, varying between harvests, and the confirmation of the tree effect as a grouping factor with random effect were appropriate to interpret the phenomenon (disease) evaluated and can be important tools to replace or complement the conventional analysis, respecting the nature of the variable and the phenomenon.

Análise de fiabilidade de sistemas e componentes de helicópteros

Este trabalho ocorre face à necessidade da empresa Helisuporte ter uma perspectiva a nível de fiabilidade das suas aeronaves. Para isso, foram traçados como objectivos de estudo a criação de uma base de dados de anomalias; identificação de sistemas e componentes problemáticos; caracterização dos mesmos, avaliar a condição de falha e, com isto, apresentar soluções de controlo de anomalias. Assim, foi desenvolvida uma metodologia que proporciona tratamento de dados com recurso a uma análise não-paramétrica, tendo sido escolhida a estatística de amostra. Esta irá permitir a identificação dos sistemas problemáticos e seus componentes anómalos. Efectuado o tratamento de dados, passamos para a caracterização fiabilística desses componentes, assumindo o tempo de operação e a vida útil específica de cada um. Esta foi possível recorrendo ao cálculo do nível de fiabilidade, MTBF, MTBUR e taxa de avarias. De modo a identificar as diferentes anomalias e caracterizar o “know-how” da equipa de manutenção, implementou-se a análise de condição de falha, mais propriamente a análise dos modos e efeitos de falha. Tendo isso em atenção, foi construído um encadeamento lógico simples, claro e eficaz, face a uma frota complexa. Implementada essa metodologia e analisados os resultados podemos afirmar que os objectivos foram alcançados, concluindo-se que os valores de fiabilidade que caracterizam alguns dos componentes das aeronaves pertencentes à frota em estudo não correspondem ao esperado e idealizado como referência de desempenho dos mesmos. Assim, foram sugeridas alterações no manual de manutenção de forma a melhorar estes índices. Com isto conseguiu-se desenvolver, o que se poderá chamar de, “fiabilidade na óptica do utilizador”.

Estudo das propriedades psicofisiológicas da pintura como actividade criativa remediativa das manifestações de ansiedade

Ao longo das últimas duas décadas, as intervenções de Arte-Terapia baseada nas actividades criativas de Pintura têm sido implementadas em várias instituições e com variados objectivos e fins terapêuticos, diferindo nas suas abordagens (antroposófica, arte-pedagógica e apenas baseada na arte) e nos seus métodos e materiais aplicados. Constatamos que o recurso a actividades criativas, como a Pintura, provocam efeitos positivos nos indivíduos levando-os a resolver problemas e a reduzir ansiedades, melhorando a sua qualidade de vida. Deste modo é objectivo deste estudo pré-experimental efectuar uma análise das propriedades psicofisiológicas da Pintura como actividade criativa remediativa das manifestações de ansiedade em adultos, sem diagnóstico de perturbação ansiosa. De encontro a esse objectivo, perante uma amostra constituída por 7 indivíduos com níveis de ansiedade elevados, desenvolvemos um processo terapêutico, em que foram realizadas dez sessões de pintura, com a periodicidade de duas vezes por semana tendo cada sessão a duração de 45 min. Antes e depois da intervenção pela pintura, foi administrado o inventário para Avaliação do Traço da Ansiedade (STAY-Y), e durante essas sessões foram registadas as manifestações psicofisiológicas da ansiedade, mais especificamente a actividade electrodérmica da pele (EDA) e a frequência cardíaca. (FC), sendo efectuada a sua análise. Na sequência da análise dos dados obtidos nos dois instrumentos aplicados, verificamos que em relação aos marcadores psicofisiológicos EDA e FC não obtivemos diferenças estatísticas significativas para comprovar que de facto existe uma relação entre estes marcadores e a redução da ansiedade. Em relação ao STAY-Y referente à ansiedade traço, aplicado antes e depois das sessões de pintura, verificamos uma diminuição do score, o que evidência a ocorrência de uma diminuição da ansiedade traço nos indivíduos alvo do nosso estudo. Significa isto que apesar de existir uma variância nos resultados obtidos através das duas abordagens, é provavel que a pintura, enquanto actividade terapêutica, reduza o traço de ansiedade em indivíduos normais, com níveis de ansiedade elevados e sem manifestações de ansiedade diagnosticada.

Arrow Plot: a new graphical tool for selecting up and down regulated genes and genes differentially expressed on samples subgroups

Background: A common task in analyzing microarray data is to determine which genes are differentially expressed across two (or more) kind of tissue samples or samples submitted under experimental conditions. Several statistical methods have been proposed to accomplish this goal, generally based on measures of distance between classes. It is well known that biological samples are heterogeneous because of factors such as molecular subtypes or genetic background that are often unknown to the experimenter. For instance, in experiments which involve molecular classification of tumors it is important to identify significant subtypes of cancer. Bimodal or multimodal distributions often reflect the presence of subsamples mixtures. Consequently, there can be genes differentially expressed on sample subgroups which are missed if usual statistical approaches are used. In this paper we propose a new graphical tool which not only identifies genes with up and down regulations, but also genes with differential expression in different subclasses, that are usually missed if current statistical methods are used. This tool is based on two measures of distance between samples, namely the overlapping coefficient (OVL) between two densities and the area under the receiver operating characteristic (ROC) curve. The methodology proposed here was implemented in the open-source R software. Results: This method was applied to a publicly available dataset, as well as to a simulated dataset. We compared our results with the ones obtained using some of the standard methods for detecting differentially expressed genes, namely Welch t-statistic, fold change (FC), rank products (RP), average difference (AD), weighted average difference (WAD), moderated t-statistic (modT), intensity-based moderated t-statistic (ibmT), significance analysis of microarrays (samT) and area under the ROC curve (AUC). On both datasets all differentially expressed genes with bimodal or multimodal distributions were not selected by all standard selection procedures. We also compared our results with (i) area between ROC curve and rising area (ABCR) and (ii) the test for not proper ROC curves (TNRC). We found our methodology more comprehensive, because it detects both bimodal and multimodal distributions and different variances can be considered on both samples. Another advantage of our method is that we can analyze graphically the behavior of different kinds of differentially expressed genes. Conclusion: Our results indicate that the arrow plot represents a new flexible and useful tool for the analysis of gene expression profiles from microarrays.

Caracterização profissional e grau de satisfação dos licenciados em fisioterapia da Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa

Mestrado em Fisioterapia.

Azorean Agriculture Efficiency by PAR

Copyright © 2013 Springer Netherlands.

A new frontier in biodiversity inventory: a proposal for estimators of phylogenetic and functional diversity

Copyright © 2014 The Authors. Methods in Ecology and Evolution © 2014 British Ecological Society.