Pre-analytical and methodological challenges in red blood cell microparticle proteomics.

Microparticles are phospholipid vesicles shed mostly in biological fluids, such as blood or urine, by various types of cells, such as red blood cells (RBCs), platelets, lymphocytes, endothelial cells. These microparticles contain a subset of the proteome of their parent cell, and their ready availability in biological fluid has raised strong interest in their study, as they might be markers of cell damage. However, their small size as well as their particular physico-chemical properties makes them hard to detect, size, count and study by proteome analysis. In this review, we report the pre-analytical and methodological caveats that we have faced in our own research about red blood cell microparticles in the context of transfusion science, as well as examples from the literature on the proteomics of various kinds of microparticles.

Inclusive fitness theory and eusociality.

Arising from M. A. Nowak, C. E. Tarnita & E. O. Wilson 466, 1057-1062 (2010); Nowak et al. reply. Nowak et al. argue that inclusive fitness theory has been of little value in explaining the natural world, and that it has led to negligible progress in explaining the evolution of eusociality. However, we believe that their arguments are based upon a misunderstanding of evolutionary theory and a misrepresentation of the empirical literature. We will focus our comments on three general issues.

[Illustrations de Le livre des prouffitz champestres.] / [Non identifié) ; Pierre de Crescens

Comprend : [Fig. au titre : Pierre de Crescent dictant ou enseignant la matière de son ouvrage.] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [pl. en reg. folio Aii : scène de dédicace. Pierre de Crescent remettant son livre au Roi Charles V.] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [Fig. folio Bi : scène de taille des arbres, de construction d'un édifice. Vue d'une cour de ferme. Scène de taille de la vigne. (Cette gravure est une reprise de l'édition de 1486. Elle est également réemployée dans la présente édition de ; [Fig. folio Cii : scène de taille des arbres, coupe et greffons. (Cette gravure est réemployée dans la présente édition de 1516 aux folios XIVI et CXXXV.)] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [Fig. folio XXii : scène de semailles et de moissons. (Cette gravure est une reprise de l'édition de 1486.)] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [Fig. folio FXVi verso : manières d'utiliser les plantes et les herbes. Séchage, distillation ou infusion, préparation et conditionnement à des fins médicinales.] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [Fig. folio XCiii verso : animaux fabuleux ou exotiques : licorne, chameau, éléphant, cerf, lion, panthère, singe, hérisson et autres.] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [Fig. folio LXViii : scène de chasse. Chasse au faucon avec une arbalète. (Cette gravure est une reprise de l'édition de 1486.)] [cote : microfilm m 11611/R 70185] ; [Fig. folio LXXXiii verso : calendrier des saisons et des mois. Activités agricoles selon les périodes de l'année.] [cote : microfilm m 11611/R 70185]

[Illustrations de Oeuvres] / Chéron, dess. ; Vertue, dess. Van der Gucht, C. du Bosc et P. Fourdrinier, grav. ; Jean Racine, aut. du texte

Comprend : [Tome I. Bandeau à la Dédicace : lion et licorne entourant les armoiries et la devise du Duc de Glocester.] Honi soit qui mal y pense. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome I. Pl. en reg. folio B : la Thébaïde ou les frères ennemis. Tragédie.] Thébaïde. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome I. Pl. en reg. du titre de la tragédie Alexandre le grand :] Alexandre. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome I. Pl. en reg. du titre de la tragédie Andromaque :] Andromaque. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome I. Pl. en reg. du titre de la tragédie Britannicus :] Britannicus. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome I. Pl. en reg. du titre de la tragédie Berenice :] Berenice. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome I. Pl. en reg. du titre de la comédie Les Plaideurs :] Les Plaideurs. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Frontispice :] [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Pl. en reg. du titre de la tragédie Bajazet :] Bajazet. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Pl. en reg. du titre de la tragédie Mithridate :] Mithridate. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Pl. en reg. du titre de la tragédie Iphigénie :] Iphigénie. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Pl. en reg. du titre de la tragédie Phèdre :] Phèdre. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Pl. en reg. du titre de la tragédie Esther :] Esther. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414] ; [Tome II. Pl. en reg. du titre de la tragédie Athalie :] Athalie. [Cote : Yf 404-405/Microfilm R 122414]

Biomarker analysis of stored blood products: emphasis on pre-analytical issues.

Millions of blood products are transfused every year; many lives are thus directly concerned by transfusion. The three main labile blood products used in transfusion are erythrocyte concentrates, platelet concentrates and fresh frozen plasma. Each of these products has to be stored according to its particular components. However, during storage, modifications or degradation of those components may occur, and are known as storage lesions. Thus, biomarker discovery of in vivo blood aging as well as in vitro labile blood products storage lesions is of high interest for the transfusion medicine community. Pre-analytical issues are of major importance in analyzing the various blood products during storage conditions as well as according to various protocols that are currently used in blood banks for their preparations. This paper will review key elements that have to be taken into account in the context of proteomic-based biomarker discovery applied to blood banking.

Proteomic analysis of Intercept-treated platelets.

In the past decades, transfusion medicine has been driven by the quest for increased safety against transfusion-transmitted infections, mainly by better donor selection and by the development of improved serological and nucleic-acid-based screening assays. Recently, pathogen reduction technologies became available and started to be implemented in several countries, with the primary goal to fight against bacterial contamination of blood products, a rare but dramatic event against which there was no definitive measure. Though pathogen reduction technologies represent a quantum leap in transfusion safety, the biomedical efficacy of platelet concentrates (PCs) treated with various pathogen reduction techniques has been recently questioned by clinical studies. Here, a gel-based proteomic analysis of PCs (n=5), Intercept-treated or untreated, from pooled buffy-coat (10 donors per PC) at Days 1, 2 and 8, shows that the Intercept process that is the most widespread pathogen reduction technique to date, has relatively low impact on the proteome of treated platelets: the process induces modifications of DJ-1 protein, glutaredoxin 5, and G(i)alpha 2 protein. As for the impact of storage, chloride intracellular channel protein 4 (CLIC4) and actin increased independently of Intercept treatment during storage. Whereas alteration of the DJ-1 protein and glutaredoxin 5 points out an oxidative stress-associated lesion, modification of G(i)alpha2 directly connects a possible Intercept-associated lesion to haemostatic properties of Intercept-treated platelets. This article is part of a Special Issue entitled: Integrated omics.

Microfabricated dual sprayer for on-line mass tagging of phosphopeptides.

Phosphopeptides tagging reactions by dinuclear zinc(II) complexes (1,3-bis[bis(2-pyridylmethyl)amino]-propan-2-olato dizinc(II)3+, called tag) were performed with a dual-channel microsprayer in electrospray ionization mass spectrometry. The reaction is first studied ex situ and analyzed with a commercial electrospray source. In situ reactions (i.e., inside the Taylor cone) were achieved with a dual-channel microsprayer both with the tag synthesized chemically before the experiments and with the tag electrogenerated by in situ oxidation of a zinc electrode, also used to apply the electrospray current. The device consists of a polyimide microchip with two microchannels (20 microm x 50 microm x 1 cm) etched on each side of the structure and connecting only at the tip of the microchip. We demonstrate here that mixing two solutions with different physicochemical properties inside the Taylor cone can be used to selectively tag target molecules.

Sceaux détachés (originaux en cire), cachets, armoiries, jetons et médailles, dessinés ou gravés. XI 356 numéros (ex-libris armoriés, sceaux dessinés ou gravés, cachets, armoiries, dessins de jetons et médailles, etc.).

Contient : N° 53 Sceau de Catherine d'Alençon, duchesse de Bavière (1416) ; Nos 56 et 57 Sceaux de Jean, duc de Calabre et de Lorraine (31 octobre 1465) et de son fils aîné ; N° 58 Sceau de Marguerite, reine d'Angleterre (1470) ; N° 59 Sceau de Bernardin Bochetel, évêque de Rennes (1564) ; N° 61 « S. Petri, Dei gratia archiepiscopi Tholosani » [Pierre V de Lion ?] ; Nos 62 et 64 Sceau de Robert d'Alençon, comte du Perche (1370 et 1375) ; Nos 72 et 81 Médailles du roi René (dessins) ; N° 73 Sceau de Jeanne, reine de Jérusalem, Sicile et Aragon (1498), avec contre-sceau ; N° 74 Sceau et contre-sceau de Louis de France, duc d'Anjou et roi de Sicile ; N° 75 Sceau d'Isabelle, comtesse du Maine et de Guise (1462), avec contresceau ; N° 76 Sceau et contre-sceau de René d'Anjou, roi de Sicile et de Jérusalem ; N° 77 « [S. Nicolai] ducis Calabrie, Lotharingie, A[ndegavie]..., » avec contre-sceau ; N° 78 Sceau de Pierre, comte d'Alençon, seigneur de Fougères, vicomte de Beaumont (1378), avec contre-sceau ; Nos 79 et 82 Sceau et contre-sceau de Louis II, roi de Jérusalem et de Sicile et comte d'Anjou (1407 et 1408) ; Nos 80 et 88 Sceau et contre-sceau de Robert, comte d'Artois ; N° 84 « S. novum Ludovici, regis Fran. filii, ducis Andegavensis et comitis Cenomannensis, » avec contre-sceau (1374) ; N° 85 Sceau et contre-sceau de Catherine, fille aînée du duc d'Alençon, « comtesse de Montfort, dame de Sonois » ; N° 86 Sceau et contre-sceau de Charles, comte du Maine (1451) ; N° 87 « Scel René d'Anjou, chlr., baron et s. de Mézières et de Thury, » avec contre-sceau ; N° 89 Sceau de Yolande reine de Jérusalem et de Sicile (1428) ; N° 94 Sceau d'Henri de Carinthie, évêque de Troyes ; cf. vol. 3101, n° 8 ; N° 101 Sceau de Charles, comte d'Alençon (1361) ; N° 112 Sceau d'Antoine de Cravant, abbé de la Trinité de Vendôme ; cf. vol. 3113, n° 7 ; N° 113 « Sigillum Johannis, episcopi Silvanectensis » [Jean Neveu † 1499, ou Jean Calveau † 1522] ; N° 115 Sceau de Jean de Tinteniac du Percher, abbé de Saint-Aubin († 1525) ; N° 120 « Scel Pierre, bastart d'Alençon » (1419) ; N° 128 « Constras. Ludovici, regis condam Francor. filii, ducis Andegavie et comit. Cenamanie. » ; N° 154 Sceau de Mathieu, évêque de Troyes (1169-1180) ; N° 257 Sceau de René, duc d'Alençon (1478)

Quadrins historiques de la Bible. Reveus, & augmentés d'un grand nombre de figures

[Bible. 1583]

Des problèmes pré-analytiques à l'oxydation des protéines : voyage protéomique

RAPPORT DE SYNTHESE :Cette thèse a pour but de démontrer que les protéines sanguines sont sensibles à leur micro- environnement redox et que les outils protéomiques permettent pour une part de caractériser les effets de ce micro-environnement au niveau moléculaire. Elle est divisée en trois parties, les deux premières sous forme d'articles de revue publiés et la troisième sous forme d'un travail de recherche mené au Centre de Transfusion Sanguine de Lausanne en collaboration avec la PAF (Protein Analysis Facility) de l'UNIL.L'article « Plasma/serum proteomics : preanalytical issues » publié dans Expert Review of Proteomics en 2007 explique comment la protéine porte l'empreinte de la phase pré¬analytique. La technique d'électrophorèse bi-dimensionnelle « différentielle » permet de simplifier cette phase en soumettant tous les échantillons analysés aux mêmes manipulations, ramenant ainsi les variables pré-analytiques aux plus élémentaires d'entre elles. Dans l'article « Oxidation of proteins : basic principles and perspectives for blood proteomics » publié dans Proteomics Clinical Applications en 2008, il est question de l'oxydation comme réaction chimique à l'origine de lésions, protéiques. Celles-ci peuvent donner lieu à des artefacts d'analyse protéomique et rendre l'identification de peptides confondante. Elles peuvent par ailleurs être chimiquement instables et s'associer à d'autres composés contenus dans l'échantillon.Le travail de recherche décrit l'étude protéomique des modifications oxydatives au niveau du fibrinogène oxydé in vitro. Les résultats de cette étude indiquent que les conditions de conservation de plasma destiné à la transfusion peuvent potentiellement altérer la structure et la fonction des protéines contenues dans ce produit sanguin et que ce phénomène est pour une part oxydatif.

Arrest de la Cour de Parlement qui juge que les procureurs du Roy, procureurs fiscaux et promoteurs des officialitez sont tenus de nommer les dénonciateurs quoy que sur les accusations instruites à leurs requestes on ait mis hors de Cour

[Acte. 1718-08-03. Paris]

Stored red blood cells: a changing universe waiting for its map(s).

The availability of stored red blood cells (RBCs) for transfusion remains an important aspect of the treatment of polytrauma, acute anemia or major bleedings. RBCs are prepared by blood banks from whole blood donations and stored in the cold in additive solutions for typically six weeks. These far from physiological storage conditions result in the so-called red cell storage lesion that is of importance both to blood bankers and to clinical practitioners. Here we review the current state of knowledge about the red cell storage lesion from a proteomic perspective. In particular, we describe the current models accounting for RBC aging and response to lethal stresses, review the published proteomic studies carried out to uncover the molecular basis of the RBC storage lesion, and conclude by suggesting a few possible proteomic studies that would provide further knowledge of the molecular alterations carried by RBCs stored in the cold for six weeks.

Oxidation of proteins: Basic principles and perspectives for blood proteomics.

Protein oxidation mechanisms result in a wide array of modifications, from backbone cleavage or protein crosslinking to more subtle modifications such as side chain oxidations. Protein oxidation occurs as part of normal regulatory processes, as a defence mechanism against oxidative stress, or as a deleterious processes when antioxidant defences are overcome. Because blood is continually exposed to reactive oxygen and nitrogen species, blood proteomics should inherently adopt redox proteomic strategies. In this review, we recall the biochemical basis of protein oxidation, review the proteomic methodologies applied to analyse redox modifications, and highlight some physiological and in vitro responses to oxidative stress of various blood components.

Changes in the foraging strategy of female South American sea lions (Carnivora: Pinnipedia) after parturition.

This study tests the hypothesis that female South American sea lions shift from off-shore, pelagic prey to coastal, benthic prey after parturition in order to reduce the foraging trip duration and hence the time pups remain unattended on the beach during early lactation. The δ13C and δ15N values of the serum and blood cells of 26 South American sea lion suckling pups from northern Patagonia were used to track the dietary changes of their mothers from late pregnancy to early lactation, after correction for differential isotopic fractionation between tissues. Primary producers and potential prey species were also analysed to establish a baseline for interpreting the stable isotope concentration of serum and blood cells. Isotopic ratios revealed a generalized increase in the consumption of coastal-benthic prey after parturition. Such a generalized post-partum shift will allow females to spend more time on land and look after their pups. The effects of this foraging strategy on the nutritional quality of the female"s diet are discussed.