Burrows with Chimneys of the Fiddler Crab Uca thayeri: Construction, Occurrence, and Function

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Spatial choice is biased by chemical cues from conspecifics in the speckeled worm eel Myrophis punctatus

A enguia mirongo-mirim Myrophis punctatus vive em agrupamentos de alta densidade populacional e comumente se enterra ou permanece sob o substrato. Esses comportamentos podem levar a marcas químicas no subtrato e podem, portanto, modular o uso do espaço nessa espécie. Neste estudo, testamos a hipótese de que a preferência espacial da enguia mirongo-mirim é influenciada pela presença de odor do animal coespecífico no subtrato. Mostramos que as enguias evitam a área que contém tal odor, indicando que as decisões de ocupação espacial podem ser influenciadas por pistas químicas de coespecíficos. As enguias claramente detectaram o odor de um animal coespecífico e essa percepção poderia ser um indicativo da presença de um coespecífico enterrado no substrato. Visto que elas evitam uma área contendo tal odor, sugerimos que isso poderia ser uma resposta para evitar invadir o território de um animal residente.

Aberrant expression of E-cadherin and beta-catenin proteins in placenta of bovine embryos derived from somatic cell nuclear transfer

Abnormal placental development is common in the bovine somatic cell nuclear transfer (SCNT)-derived fetus. In the present study, we characterised the expression of E-cadherin and beta-catenin, structural proteins of adherens junctions, in SCNT gestations as a model for impaired placentation. Cotyledonary tissues were separated from pregnant uteri of SCNT (n - 6) and control pregnancies (n - 8) obtained by artificial insemination. Samples were analysed by western blot, quantitative RT-PCR (qRT-PCR) and immunohistochemistry. Bovine trophectoderm cell lines derived from SCNT and control embryos were analysed to compare with the in utero condition. Although no differences in E-cadherin or beta-catenin mRNA abundance were observed in fetal tissues between the two groups, proteins encoded by these genes were markedly under-expressed in SCNT trophoblast cells. Immunohistochemistry revealed a different pattern of E-cadherin and total beta-catenin localisation in SCNT placentas compared with controls. No difference was observed in subcellular localisation of dephosphorylated active-beta-catenin protein in SCNT tissues compared with controls. However, qRT-PCR confirmed that the wingless (WNT)/beta-catenin signalling pathway target genes CCND1, CLDN1 and MSX1 were downregulated in SCNT placentas. No differences were detected between two groups of bovine trophectoderm cell lines. Our results suggest that impaired expression of E-cadherin and beta-catenin proteins, along with defective beta-catenin signalling during embryo attachment, specifically during placentation, is a molecular mechanism explaining insufficient placentation in the bovine SCNT-derived fetus.

Características físico-qímicas da carne de caprinos submetidos a diferentes níveis de substituição do leite por soro de queijo durante o aleitamento

Fifty six crossbred kids Parda Alpina x Gurgueia were separeted into four groups of 14 (seven male and seven female) and submited to four treatments with different levels of milk goat substitution by cheese serum. The treatments were : T1=milk goat (testify); T2=15% serum at 23 days and 33% at 55 days; T3=15% serum starting from 16 days, 33% on 23 days and 51% on 72 days of age; and T4=33% on 16 days and 69% of liquid diet in the final fase. At 92 days of age, all animals were slaughtered for carcass evaluation. Pallete were separeted from 20 male animals (five by treatment) and the physical and chemical analysis of the meat were realized using these materials. The studied characteristics were: total weight (TW), meat weight (MW), bone weigth (BW) of the pallete, and percentage of umidity (U), ashes (A), protein (P), fat (F) and pH of the pallete meat. There was significant effect of the treatment over F. Means of PW, A and BW were, respectively 491, 342 and 149.8 g. The meal represented 69,6% of total pallete weight. Means of U, A, P and F were 73, 1.0, 19 and 1.95%, respectively. The pH was 6.7. Results allow to conclude that only the fat percentage of the meat was modified, due to the administration of serun milk on the liquid diet of the kids, during the milking fase.

Utilização de modelos de regressão aleatória para produção de leite no dia do controle, com diferentes estruturas de variâncias residuais

Foram utilizados quatorze modelos de regressão aleatória, para ajustar 86.598 dados de produção de leite no dia do controle de 2.155 primeiras lactações de vacas Caracu, truncadas aos 305 dias. Os modelos incluíram os efeitos fixos de grupo contemporâneo e a covariável idade da vaca ao parto. Uma regressão ortogonal de ordem cúbica foi usada para modelar a trajetória média da população. Os efeitos genéticos aditivos e de ambiente permanente foram modelados por meio de regressões aleatórias, usando polinômios ortogonais de Legendre, de ordens cúbicas. Diferentes estruturas de variâncias residuais foram testadas e consideradas por meio de classes contendo 1, 10, 15 e 43 variâncias residuais e de funções de variâncias (FV) usando polinômios ordinários e ortogonais, cujas ordens variaram de quadrática até sêxtupla. Os modelos foram comparados usando o teste da razão de verossimilhança, o Critério de Informação de Akaike e o Critério de Informação Bayesiano de Schwar. Os testes indicaram que, quanto maior a ordem da função de variâncias, melhor o ajuste. Dos polinômios ordinários, a função de sexta ordem foi superior. Os modelos com classes de variâncias residuais foram aparentemente superiores àqueles com funções de variância. O modelo com homogeneidade de variâncias foi inadequado. O modelo com 15 classes heterogêneas foi o que melhor ajustou às variâncias residuais, entretanto, os parâmetros genéticos estimados foram muito próximos para os modelos com 10, 15 ou 43 classes de variâncias ou com FV de sexta ordem.

Genetic parameters and relationships between heifers rebreeding and hip height in Nellore cattle

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Produção de amônia na fermentação in vitro de rações com levedura, uréia ou farelo de algodão

O objetivo deste experimento foi avaliar a liberação de nitrogênio amoniacal (N-NH3) in vitro proveniente de rações contendo levedura, uréia e farelo de algodão, usadas na alimentação de ruminantes. Os dados relativos ao N-NH3 encontrado nas amostras obtidas durante a primeira hora de fermentação apresentaram diferenças entre as rações preparadas com farelo de algodão e levedura, quando comparadas à ração com uréia, com valores de 7,52; 8,66; e 29,84 mg de N-NH3/100 mL de fluido ruminal, respectivamente. A mesma tendência foi observada até as 12 horas de fermentação, com valores de 1,05; 1,57; e 8,57 mg N-NH3/100 mL de fluido, para as rações com farelo de algodão, levedura e uréia, respectivamente. A análise dos dados relativos às amostras com 12 horas de fermentação mostrou tendência de diminuição da concentração de N-NH3, atingindo os menores valores neste tempo de incubação.

Equações de predição da composição química corporal a partir do corte da 9-10-11ª costelas de bovinos castrados Nelore

Objetivou-se obter equações de regressão linear simples para estimativa da composição química corporal de novilhos Nelore a partir da composição química do corte da 9-10-11ª costelas. Foram utilizados 27 bovinos em confinamento, com 21 a 31 meses de idade e 338,0 a 503,6 kg de peso corporal. do total, foram abatidos seis animais (referência) ao início do experimento para estimativa da composição química corporal. A composição química em água, proteína, EE e cinzas foi determinada no corte da 9-10-11ª costelas e nos tecidos corporais. As equações de regressão para estimativa do peso de corpo vazio (PCVZ) a partir dos pesos de jejum (PV) e carcaça quente (PCQ) foram PCVZ = 0,8726 PV - 2,7399 e PCVZ = 1,5350 PCQ + 13,598 (R² = 0,98). O ganho de 1 kg de PCVZ correspondeu a aproximadamente 1,15 kg de PV. A porcentagem de água no corpo vazio (CVz) esteve altamente correlacionada às porcentagens de água (R² = 0,98) e EE (R² = 0,91) no corte das costelas. A equação mais indicada foi a desenvolvida a partir da porcentagem de água no corte das costelas (Sx, y = 0,46). Verificou-se alta correlação entre a porcentagem de EE no CVz e a porcentagem de EE (R² = 0,95) no corte das costelas, portanto, a equação %EE CVz = 0,9662%EE costelas + 1,5294 pode ser utilizada para estimativa da composição do CVz em EE. O mesmo ocorreu para a porcentagem de cinzas, sendo recomendada a equação %MM CVz = 0,5915%MM costelas + 0,7619 (R² = 0,88). A composição química percentual em água, EE e minerais no corte das 9-10-11ª costelas permitiu estimar com acuidade a composição do corpo vazio.

Ruthenium (II) phosphine/picolinate complexes as antimycobacterial agents

Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

X-chromosome genetic variation in São Paulo State (Brazil) population

As data on X-chromosomal short tandem repeats (X-STRs) for the Brazilian population are scarse, the aim of this study was to determine the allele frequencies of five X-STRs (DXS6854, DXS7424, DXS101, DXS6808 and DXS7132) in the São Paulo State, Brazil. No deviations from the Hardy-Weinberg equilibrium were observed, with the exception of DXS101. The forensic efficiency parameters demonstrated that DXS101 was the most informative marker. Population comparisons revealed that the X-STR profile sampled in the state of São Paulo was more similar to European and African populations than Asiatic populations reported in this work.

Relief influence on tree species richness in secondary forest fragments of Atlantic Forest, SE, Brazil

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Uso de câmara úmida em enxertia convencional de maracujazeiro-amarelo sobre três porta-enxertos

A propagação do maracujazeiro através da enxertia poderá ser a solução para o controle de doenças do sistema radicular. Assim, com o objetivo de avaliar o desenvolvimento e a sobrevivência de plantas enxertadas de maracujazeiro-amarelo (Passiflora edulis Sims) em três porta-enxertos, utilizando-se de câmara úmida, instalou-se este experimento em um viveiro de mudas no município de Adamantina-SP, no período de dezembro de 2005 a abril de 2006. O delineamento experimental utilizado foi em blocos ao acaso, em esquema fatorial 3 x 2, com quatro repetições e 10 plantas/parcela. Os fatores avaliados foram três porta-enxertos (Passiflora edulis, P. alata e P. gibertii)em dois ambientes (com e sem câmara úmida). Foi utilizada a enxertia convencional pelo método de garfagem tipo fenda cheia. Avaliaram-se a sobrevivência e a altura dos enxertos, o diâmetro do caule do porta-enxerto e do enxerto, o número de folhas e a fitomassa seca da parte aérea e das raízes. Verificaram-se melhores resultados com os porta-enxertos P. edulis e P. gibertii, superiores ao P. alata em todas as variáveis estudadas. Os maiores índices de sobrevivência foram observados em P. edulis e P. gibertii, com 100% e 98,8%, respectivamente. Apesar de o P. alata ter-se mostrado inferior, é viável o uso deste material como porta-enxerto para o maracujazeiro-amarelo. O uso da câmara úmida favoreceu o pegamento dos enxertos em P. alata.

A Novel Diagnostic Target in the Hepatitis C Virus Genome

BackgroundDetection and quantification of hepatitis C virus (HCV) RNA is integral to diagnostic and therapeutic regimens. All molecular assays target the viral 5'-noncoding region (59-NCR), and all show genotype-dependent variation of sensitivities and viral load results. Non-western HCV genotypes have been under-represented in evaluation studies. An alternative diagnostic target region within the HCV genome could facilitate a new generation of assays.Methods and FindingsIn this study we determined by de novo sequencing that the 3'-X-tail element, characterized significantly later than the rest of the genome, is highly conserved across genotypes. To prove its clinical utility as a molecular diagnostic target, a prototype qualitative and quantitative test was developed and evaluated multicentrically on a large and complete panel of 725 clinical plasma samples, covering HCV genotypes 1-6, from four continents (Germany, UK, Brazil, South Africa, Singapore). To our knowledge, this is the most diversified and comprehensive panel of clinical and genotype specimens used in HCV nucleic acid testing (NAT) validation to date. The lower limit of detection (LOD) was 18.4 IU/ml (95% confidence interval, 15.3-24.1 IU/ml), suggesting applicability in donor blood screening. The upper LOD exceeded 10(-9) IU/ml, facilitating viral load monitoring within a wide dynamic range. In 598 genotyped samples, quantified by Bayer VERSANT 3.0 branched DNA (bDNA), X-tail-based viral loads were highly concordant with bDNA for all genotypes. Correlation coefficients between bDNA and X-tail NAT, for genotypes 1-6, were: 0.92, 0.85, 0.95, 0.91, 0.95, and 0.96, respectively; X-tail-based viral loads deviated by more than 0.5 log10 from 5'-NCR-based viral loads in only 12% of samples (maximum deviation, 0.85 log10). The successful introduction of X-tail NAT in a Brazilian laboratory confirmed the practical stability and robustness of the X-tail-based protocol. The assay was implemented at low reaction costs (US$8.70 per sample), short turnover times (2.5 h for up to 96 samples), and without technical difficulties.ConclusionThis study indicates a way to fundamentally improve HCV viral load monitoring and infection screening. Our prototype assay can serve as a template for a new generation of viral load assays. Additionally, to our knowledge this study provides the first open protocol to permit industry-grade HCV detection and quantification in resource-limited settings.

Piranha attacks in dammed streams used for human recreation in the State of São Paulo, Brazil

Ataques por piranhas vêm se tornando um problema comum em trechos represados de rios e córregos no estado de São Paulo, Sudeste do Brasil. em dois surtos ocorridos em dois municípios vizinhos no noroeste do estado, 74 banhistas foram mordidos. Uma mordida por pessoa foi registrada, em curto período do ano. As mordidas estão relacionadas a cuidado parental e/ou defesa do território de desova, o que reforça estudos anteriores e desmistifica os ataques por este peixe lendário, da maneira como são popularmente percebidos. A colocação de redes de malha fina e a remoção de vegetação aquática cessaram os ataques.

Experiências de famílias na imunização de crianças brasileiras menores de dois anos

O objetivo foi descrever as experiências de famílias sobre imunização de crianças menores de dois anos. É estudo de natureza descritiva, com análise qualitativa dos dados, entrevistas não estruturadas com 22 sujeitos. Os resultados foram agrupados em: conhecimentos práticos sobre imunização, responsabilidade e obrigatoriedade na imunização e ampliação da prática de imunização. Foram destacados elementos que fortalecem a imunização: experiência e realização pessoal no papel de ser mãe, temor de adoecimento, reconhecimento como um bom cuidado, acesso, flexibilidade do horário, divulgação, cartão de vacinas, campanhas de vacinação e disponibilidade de vacinas, e elementos da não imunização: inexperiência dos pais, recusa de aplicações simultâneas de vacinas, assistência fragmentada, ausência de diálogo, discriminação, falsas contraindicações e obrigatoriedade. A imunização centrada no cumprimento do calendário vacinal, ou em situações autoritárias, está descolada do cuidado familiar. O vínculo com as famílias precisa ser fortalecido para ampliação da adesão às medidas de proteção e promoção da saúde da criança.