Improvement of in silico strain engineering methods in Saccharomyces cerevisiae

PhD thesis in Bioengineering

A violência entre pares na adolescência: desenvolvimento e implementação de um programa de prevenção

Tese de Doutoramento em Psicologia (área de especialização em Psicologia da Justiça).

O ensino de canto nos ramos genérico e vocacional no 1º ciclo do ensino básico: um estudo de caso múltiplo

Tese de Doutoramento em Estudos da Criança (área de especialização em Educação Musical).

Narrative innovations predict symptom improvement: Studying innovative moments in narrative therapy of depression

Objective:Innovative moments (IMs) are moments in the therapeutic dialog that constitute exceptions toward the client's problems. These narrative markers of meaning transformation are associated with change in different models of therapy and diverse diagnoses. Our goal is to test if IMs precede symptoms change, or, on the contrary, are a mere consequence of symptomatic 15 change. Method: For this purpose, IMs and symptomatology (Outcome Questionnaire-10.2) were assessed at every session in a sample of 10 cases of narrative therapy for depression. Hierarchical linear modeling was conducted to explore whether (i) IMs in a given session predict patients' symptoms in the following session and/or (ii) symptoms in a given session predict IMs in the next session. Results: Results suggested that IMs are better predictors of symptoms than the reverse. Conclusions: These results are discussed considering the contribution of meanings and narrative processes' changes to symptomatic improvement.

Biotechnological approaches for yield improvement of anticancer alkaloids in the plant Catharanthus roseus

Dissertação de mestrado em Biologia Molecular, Biotecnologia e Bioempreendedorismo em Plantas

A estimulação cognitiva através da aprendizagem mediada: uma proposta de promoção das habilidades cognitivas em crianças de meio social desfavorecido

Partindo de dois referenciais teóricos da inteligência, psicométrico e cognitivo, esta tese centra-se no conceito de modificabilidade cognitiva e nos programas de estimulação (treino) cognitiva. Em particular é feita uma descrição detalhada do Programa de Enriquecimento Instrumental-PEI (Feuerstein et al., 1980), nomeadamente alguns conceitos centrais à sua fundamentação e implementação, por exemplo a experiência de aprendizagem mediada, o mapa cognitivo e a modificação cognitiva estrutural, pois que foi o programa considerado no nosso estudo empírico. Em termos empíricos procedemos à aplicação do PEI (tarefa de organização de pontos) junto de um grupo de crianças de 10 a 13 anos, do 4º ano do ensino fundamental, provenientes de um meio sociocultural desfavorecido. Este grupo representava a globalidade de uma turma da escola escolhida (25 crianças), havendo uma outra turma similar da mesma escola que serviu de grupo de comparação (26 crianças). O plano experimental inclui uma avaliação de pré-teste e pósteste com provas cognitivas e de leitura. Igualmente foi considerado o rendimento escolar das crianças, acrescentando-se no grupo experimental uma avaliação mais qualitativa assente nas funções cognitivas, atitudes e comportamentos das crianças ao longo da realização das atividades propostas no programa de estimulação cognitiva. Os resultados obtidos apontam para um efeito benéfico do programa quando comparamos as crianças do grupo experimental e de controlo no pós-teste em termos das habilidades cognitivas e numa das provas de leitura. Igualmente se observam melhorias nas suas funções cognitivas, atitudes e comportamentos de implicação na realização das tarefas ao longo do programa, registando-se uma melhoria do pré-teste para o pós-teste no rendimento académico, contudo esta melhoria ocorre igualmente no grupo de controlo. Estes resultados são discutidos à luz da investigação sobre os programas de treino cognitivo, e em particular do PEI, retirando-se ilações para a prática educativa e para a continuidade da investigação nesta área.

O currículo da formação em engenharia no âmbito do processo de bolonha: desenvolvimento de competências e perfil profissional na perspetiva dos docentes, dos estudantes e dos profissionais

Tese de Doutoramento em Ciências da Educação (área de especilização em Desenvolvimento Curricular).

From software extensions to product lines of dataflow programs

Abstract Dataflow programs are widely used. Each program is a directed graph where nodes are computations and edges indicate the flow of data. In prior work, we reverse-engineered legacy dataflow programs by deriving their optimized implementations from a simple specification graph using graph transformations called refinements and optimizations. In MDE-speak, our derivations were PIM-to-PSM mappings. In this paper, we show how extensions complement refinements, optimizations, and PIM-to-PSM derivations to make the process of reverse engineering complex legacy dataflow programs tractable. We explain how optional functionality in transformations can be encoded, thereby enabling us to encode product lines of transformations as well as product lines of dataflow programs. We describe the implementation of extensions in the ReFlO tool and present two non-trivial case studies as evidence of our work’s generality

Citric acid production by Y. lipolytica W29 from crude glycerol: strain improvement by mutagenesis

[Excerpt] Citric acid, an important and versatile organic acid extensively used in several industries, is originally produced by Aspergillus niger in submerged fermentation from molasses [1]. However, Yarrowia lipolytica have been studied and demonstrate a great potential as citric acid producer from several carbon sources [1–5] including crude glycerol, a low cost byproduct from the biodiesel industry [6]. The simultaneous production of the isomer isocitric acid is the major problem in using this yeast in the citric acid production. (...)

Psychological approach to endometriosis: Women's pain experience and quality of life improvement

Endometriosis is a chronic condition affecting 10 to15% of women in childbearing age. Understanding the impact of this disease on women’s well-being is still a challenge, namely to intervene. Pain is the most current and troublesome symptom. Although medical treatments for pain relief are effective, recurrence rate remains significant, calling for a better understanding and development of new approaches for pain management. A group Cognitive Behavioral Therapy (CBT) for management of associated co-morbidities is suggested, paying special attention to Chronic Pelvic Pain (CPP). CBT design can be grounded on information collected from focus groups and a one-group exploratory trial. Evaluation of therapy effectiveness is possible to be performed by comparing group CBT to Usual Care (UC) and Support Group (SG) in a randomized controlled trial. Research in this area could represent an important step in providing a solution to the management of endometriosis and, to the best of our knowledge, the first national psychological approach for its understanding and treatment.