Development of expressed sequence tags from the bay scallop, Argopecten irradians irradians

The bay scallop, Argopecten irradians irradians, introduced from North America, has become one of the most important aquaculture species in China. Inan effort to identify scallop genes involved in host defense, a high-quality cDNA library was constructed from whole body tissues of the bay scallop. A total of 5828 successful sequencing reactions yielded 4995 expressed sequence tags (ESTs) longer than 100 bp. Cluster and assembly analyses of the ESTs identified 637 contigs (consisting of 2853 sequences) and 2142 singletons, totaling 2779 unique sequences. Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) analysis showed that the majority (73%) of the unique sequences had no significant homology (E-value >= 0.005) to sequences in GenBank. Among the 748 sequences with significant GenBank matches, 160 (21.4%) were for genes related to metabolism, 131 (17.5%) for cell/organism defense, 124 (16.6%) for gene/protein expression, 83 (11.1%) for cell structure/motility, 70 (9.4%) for cell signaling/communication, 17 (2.3%) for cell division, and 163 (21.8%) matched to genes of unknown functions. The list of host-defense genes included many genes with known and important roles in innate defense such as lectins, defensins, proteases, protease inhibitors, heat shock proteins, antioxidants, and Toll-like receptors. The study provides a significant number of ESTs for gene discovery and candidate genes for studying host defense in scallops and other molluscs.

牙鲆和大黄鱼经济性状候选基因的DNA分子标记研究

本文利用不同的分子标记方法，分别对牙鲆及大黄鱼不同养殖群体的生长、抗病等经济性状的候选基因进行了序列多态性研究，检测到了几个SNP位点和微卫星的多态性位点，并分析了它们与经济性状之间的相关性；同时，利用微卫星的多态性位点对牙鲆2个养殖群体的遗传变异进行了分析，这些均为海水鱼类遗传育种及标记辅助选育工作提供了基础数据。 在牙鲆胶南养殖群体中，以100个个体为实验材料，根据其生长激素（GH）基因的6个外显子序列设计引物，通过SSCP分析技术显示该群体GH基因的第4外显子存在多态性，检测到2种基因型，AA型和AB型。DNA测序结果表明，AB型在第1763位发生碱基突变，c→t，与AA型同源性达到99%。连锁分析结果表明：这2种基因型的个体在体重和头长上表现出显著的差异，AB型个体的体重和头长都明显大于AA型个体(P<0.05)，由此推测等位基因B是一个对牙鲆体重和头长都有利的等位基因；这2种基因型个体之间在其体型性状上也存在显著差异（P<0.05）；同时，该多态位点的Hardy-Weinberg平衡性检验结果表明，该群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。在牙鲆GH基因第1外显子区域还发现了一个微卫星位点，对该位点进行多态性分析，检测到5种基因型、3种等位基因，one-way ANOVA统计结果显示，基因型AC个体的体重、头长和体高明显大于其它基因型个体（P<0.05），C是一个对体重、头长和体高有利的等位基因。 对2个大黄鱼养殖群体的GH基因进行SSCP分析后发现，浙江群体大黄鱼GH基因在第196位存在1个SNP（g→a）位点，检测到2种基因型，AA和AB。t检验结果表明，AA型个体的体高比AB型个体的高(P≤0.05)，但AB型个体在体长/体高上占优势(P≤0.05)，提示该突变位点可以作为大黄鱼体型性状的候选标记。福建群体大黄鱼GH基因在第692位有1个SNP位点(t→c)，共检测到2种基因型，CC型和CD型，其中，CD基因型个体的体重和全长显著大于CC基因型个体(P≤0.01)，提示该位点可以作为大黄鱼体重和头长性状的候选标记。 在牙鲆胶南和日照2个养殖群体中，采用牙鲆GHR基因5’端Promoter区的一个微卫星标记，进行了群体遗传变异的研究，并探索了该基因多态性位点与牙鲆生长性状之间的相关性。结果表明，2个群体在该位点检测到的等位基因数为12和9个，有效等位基因数为6.26和5.04个。两个群体该位点的Hardy-Weinberg遗传偏离指数均为正值，并没有显示出杂合子缺失，但各基因型分布频率都在一定程度上偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。连锁分析发现，在胶南群体中，IM基因型对应的个体在全重、全长、体长、头长、体高和眼径形态学数据中均是最大的，但仅在体重上极其显著的大于全部其它基因型个体；在日照群体中，BC基因型对应的个体在全重、全长、体高、尾柄高、尾柄长和眼径数据中均是最大的；而CJ基因型对应的个体在体长和头长这两组数据中是最大的。由此认为，该位点IM基因型可以作为牙鲆体重性状的潜在标记。 在进行牙鲆抗病性状标记的筛选时，利用迟缓爱德华氏菌（Edwardsiella tarda）LSE40对牙鲆鱼进行攻毒感染实验，得到死亡群体和未死亡群体。选择Toll样受体基因中的TLR2、TLR3和TLR9基因作为候选基因，分别对这3个基因中的部分序列共设计7对引物进行扩增，同时对扩增产物进行RFLP多态性分析，目前只在TLR3基因内检测到一个EcoRI的酶切多态性位点，测序后发现，这是由于在TLR3基因第3806位的EcoRI酶切位点在某些个体中缺失所致。酶切产物共呈现出3种基因型，分别定义为AA，AB和BB。χ2检验证明该多态性位点与牙鲆抗迟缓爱德华氏菌LSE40的能力有一定关系。利用多因素非条件Logistic回归分析对死亡组和存活组牙鲆的各种形态学数据以及不同基因型之间进行了分析，发现体长、头长和体高均具有显著的相关性（P<0.05），而这几个因素与体重的相关性不显著（P>0.05）。多因素非条件Logistic分析后发现：AA基因型对死亡率具有显著的影响（P<0.05），是主要的危险因素，而AB基因型的作用不显著（P>0.05）；头长是主要的保护因素（P<0.05），体重对死亡率的影响很小。χ2检验证明，等位基因A是对死亡的主要危险等位基因，B是对存活有利的主要等位基因。推测该位点可以作为牙鲆抗迟缓爱德华氏菌的潜在标记。

高可靠性红外车辆分离器设计与应用

本文给出了一种针对公路自动收费系统的车辆分离检测而设计的,利用红外线发射和接收所形成的光幕,完全消除跟车现象,并能将半挂车、全挂车、单车可靠分离的红外车辆分离器。高可靠性红外车辆分离器的设计很好克服了传统红外车辆分离器环境适应性差、故障率高等缺点。本文还介绍了光幕形成的基本原理,并阐述了硬件关键点及实现方法,给出了系统硬件原理图、软件基本设计思想。

自动车辆识别系统的设计与实现

在电子不停车收费系统中,自动车辆识别技术是收费系统的核心部分。文中讲述了自动车辆识别的实现过程,并利用VxD技术实现Win98下的硬件中断,以满足不停车收费系统对实时性的要求。

排队理论在车道收费系统中的应用研究

以排队理论为基础,研究了车道收费系统的排队模型及系统性能指标的评价方法,给出长青收费站在正常收费及繁忙时的性能参数;结合项目实例,给出了收费车道数的设计方法,并给出了车道数与设计小时交通辆(DHV)的变化曲线;最后对以社会总费用为目标的车道数进行了优化设计。

高速公路收费系统联网技术

结合目前我国高速公路通信传输网络的建设现状和收费系统数据通信的需求，从 结构、性能等方面分析了适应高速公路通信的3种网络技术SDH、ATM和宽带IP技术，以及这 3 种技术的综合集成模型ATM Over SDH、IP Over ATM、IP Over SDH、IP Over WDM。提出 比 较适合于高速公路收费系统联网的技术方案，并设计了网络通信管理和维护的具体内容 。

基于模糊模式识别的车型分类研究

根据目前中国路桥车辆收费标准,提出了一种基于模糊模式识别的车型分类系统。车辆经过环形线圈传感器时,形成感应曲线,提取感应曲线的特征并进行特征分离,利用模糊模式识别方法对车型进行匹配分类。研究结果已在路桥收费系统以及交通流量统计中得到应用。

公路电子收费系统中DSRC协议规范的应用设计

根据领域中专用短程通信()协议的基础规范,设计出应用于电子收费系统的物理层、数据链路层和应用层相关参数ITSDSRCDSRC选定和设置。力求在电子收费领域相关的装置与设备能遵循指定的规格标准,并增进各系统相互之间的相容性和互连性。

基于DSRC的多功能不停车收费系统

DSRC标准是ISO/TC204制定的智能交通系统(ITS)中车—路信息通讯的协议。采用双片式ETC电子标签结合双界面IC卡的储值卡方案形成的多功能不停车收费系统,充分兼容了当前国内普遍应用的IC卡半自动收费方式,集中了IC卡收费系统和ETC收费系统的优点,方便、快捷、通行能力强,并解决了收费口的交通拥挤现象。

基于CAN总线的路桥收费系统

介绍了基于CAN总线的路桥收费系统的设计与应用 ,给出了收费系统的整体结构 ,并对系统的硬件配置、软件功能作了详细说明。现场应用表明 ,该系统结构简单 ,可靠性高 ,应用灵活

自动车辆识别系统的设计与实现

在电子不停车收费系统中,自动车辆识别技术是收费系统的核心部分。本文讲述了自动车辆识别的实现过程,并利用VxD技术实现Win98下的硬件中断,以满足不停车收费系统对实时性的要求。