974 resultados para Genoma humano Teses
Resumo:
A menudo los cientficos secuencian el ADN de un gran nmero de personas con el objetivo de determinar qu genes se asocian con determinadas enfermedades. Esto permite meon del genoma humano. El precio de un perfil genmico completo se ha posicionado por debajo de los 200 dlares y este servicio lo ofrecen muchas compaas, la mayor parte localizadas en EEUU. Como consecuencia, en unos pocos a~nos la mayora de las personas procedentes de los pases desarrollados tendrn los medios para tener su ADN secuenciado. Alrededor del 0.5% del ADN de cada persona (que corresponde a varios millones de nucletidos) es diferente del genoma de referencia debido a variaciones genticas. As que el genoma contiene informacin altamente sensible y personal y representa la identidad biolgica on sobre el entorno o estilo de vida de uno (a menudo facilmente obtenible de las redes sociales), sera posible inferir el fenotipo del individuo. Multiples GWAS (Genome Wide Association Studies) realizados en los ltimos a~nos muestran que la susceptibilidad de un paciente a tener una enfermedad en particular, como el Alzheimer, cncer o esquizofrenia, puede ser predicha parcialmente a partir de conjuntos de sus SNP (Single Nucleotide Polimorphism). Estos resultados pueden ser usados para medicina genmica personalizada (facilitando los tratamientos preventivos y diagnsticos), tests de paternidad genticos y tests de compatibilidad gentica para averiguar a qu enfermedades pueden ser susceptibles los descendientes. Estos son algunos de los beneficios que podemos obtener usando la informacin gentica, pero si esta informacin no es protegida puede ser usada para investigaciones criminales y por compaas aseguradoras. Este hecho podra llevar a discriminaci n gentica. Por lo que podemos concluir que la privacidad genmica es fundamental por el hecho de que contiene informacin sobre nuestra herencia tnica, nuestra predisposicin a mltiples condiciones fsicas y mentales, al igual que otras caractersticas fenotpicas, ancestros, hermanos y progenitores, pues los genomas de cualquier par de individuos relacionados son idnticos al 99.9%, contrastando con el 99.5% de dos personas aleatorias. La legislacin actual no proporciona suficiente informacin tcnica sobre como almacenar y procesar de forma segura los genomas digitalizados, por lo tanto, es necesaria una legislacin mas restrictiva ---ABSTRACT---Scientists typically sequence DNA from large numbers of people in order to determine genes associated with particular diseases. This allows to improve the modern healthcare and to provide a better understanding of the human genome. The price of a complete genome profile has plummeted below $200 and this service is ofered by a number of companies, most of them located in the USA. Therefore, in a few years, most individuals in developed countries will have the means of having their genomes sequenced. Around 0.5% of each person's DNA (which corresponds to several millions of nucleotides) is diferent from the reference genome, owing to genetic variations. Thus, the genome contains highly personal and sensitive information, and it represents our ultimate biological identity. By combining genomic data with information about one's environment or lifestyle (often easily obtainable from social networks), could make it possible to infer the individual's phenotype. Multiple Genome Wide Association Studies (GWAS) performed in recent years have shown that a patient's susceptibility to particular diseases, such as Alzheimer's, cancer, or schizophrenia, can be partially predicted from sets of his SNPs. This results can be used for personalized genomic medicine (facilitating preventive treatment and diagnosis), genetic paternity tests, ancestry and genealogical testing, and genetic compatibility tests in order to have knowledge about which deseases would the descendant be susceptible to. These are some of the betefts we can obtain using genoma information, but if this information is not protected it can be used for criminal investigations and insurance purposes. Such issues could lead to genetic discrimination. So we can conclude that genomic privacy is fundamental due to the fact that genome contains information about our ethnic heritage, predisposition to numerous physical and mental health conditions, as well as other phenotypic traits, and ancestors, siblings, and progeny, since genomes of any two closely related individuals are 99.9% identical, in contrast with 99.5%, for two random people. The current legislation does not ofer suficient technical information about safe and secure ways of storing and processing digitized genomes, therefore, there is need for more restrictive legislation.
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Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2014
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Dissertao para obteno do grau de Mestre no Instituto Superior de Cincias da Sade Egas Moniz
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DNA repair systems play a critical role in protecting the human genome from damage caused by carcinogens present in the environment. Mutations in DNA repair genes may be responsible for tumor development and resistance of malignant cells to chemotherapeutic agents. The major pathway for oxidative DNA damage repair is the base excision repair pathway. The objective of this study was to investigate the immunoexpression of APE-1 and XRCC-1, which are proteins involved in DNA base excision repair and its association with clinical and histopathological parameters in oral tongue squamous cell carcinoma (OTSCC), in order to investigate a possible prognostic value for those proteins. The expression of APE-1 and XRCC-1 was evaluated semi-quantitatively by immunohistochemistry in 50 OTSCC cases. Clinical data was collected from patients medical charts and histopathological grading was performed for each case. Statistical analysis (Chi-square and Fishers exact tests; significance of 5%) was performed to determine the association between protein expressions and clinico-pathological characteristics. APE-1 was highly expressed in nucleus and cytoplasm in 56% of cases. XRCC-1 showed overexpression only in nucleus in 60% of cases. High expression of XRCC-1 was significantly associated to clinical stages I and II (P=0.02). Both proteins were not associated to other clinical parameters or histopathological grading. Our findings demonstrate that DNA base excision repair proteins APE-1 and XRCC-1 are upregulated in OTSCC, however, they are not related to clinical and histologic parameters, except for XRCC-1 association to better clinical staging. Our results indicate that the immunohistochemical expression of these proteins has no association with prognostic parameters in this tumor.
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DNA repair systems play a critical role in protecting the human genome from damage caused by carcinogens present in the environment. Mutations in DNA repair genes may be responsible for tumor development and resistance of malignant cells to chemotherapeutic agents. The major pathway for oxidative DNA damage repair is the base excision repair pathway. The objective of this study was to investigate the immunoexpression of APE-1 and XRCC-1, which are proteins involved in DNA base excision repair and its association with clinical and histopathological parameters in oral tongue squamous cell carcinoma (OTSCC), in order to investigate a possible prognostic value for those proteins. The expression of APE-1 and XRCC-1 was evaluated semi-quantitatively by immunohistochemistry in 50 OTSCC cases. Clinical data was collected from patients medical charts and histopathological grading was performed for each case. Statistical analysis (Chi-square and Fishers exact tests; significance of 5%) was performed to determine the association between protein expressions and clinico-pathological characteristics. APE-1 was highly expressed in nucleus and cytoplasm in 56% of cases. XRCC-1 showed overexpression only in nucleus in 60% of cases. High expression of XRCC-1 was significantly associated to clinical stages I and II (P=0.02). Both proteins were not associated to other clinical parameters or histopathological grading. Our findings demonstrate that DNA base excision repair proteins APE-1 and XRCC-1 are upregulated in OTSCC, however, they are not related to clinical and histologic parameters, except for XRCC-1 association to better clinical staging. Our results indicate that the immunohistochemical expression of these proteins has no association with prognostic parameters in this tumor.
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O transplante de medula ssea (TMO) um procedimento teraputico importante em casos relacionados pacientes com leucemia ou linfoma. Em decorrncia desse processo, uma reao conhecida como doena enxerto-versus-hospedeiro (GVHD) pode ocorrer em pacientes susceptveis como conseqncia da presena de clulas imunocompetentes do doador. Entretanto, no existe um modelo para descrever completamente as aes relacionadas ao mecanismo imunolgico da GVHD desde a fase que inicializa a doena at a fase efetora. O Objetivo geral deste estudo a investigao da resposta imunolgica considerando-se o sistema HLA (antgenos leucocitrios humano) em pacientes que desenvolveram a GVHD em decorrncia do TMO. O National Cancer Institute (NCI) Pathway interaction Database e Reactome foram usados como bases de dados com o objetivo de se estudar a expresso de genes e vias relacionados s Classes I e II do sistema HLA (antgenos leucocitrios humano). O estudo considerou a mudana de expresso de genes relacionados s 17 vias do sistema imunolgico com potencialidade para se expressar em pacientes que desenvolveram a GVHD associada TMO. Dados referentes aos transcriptomas foram obtidos utilizando-se a plataforma GPL570 Affymetrix Genoma Humano U133 Plus. A atividade relativa foi usada para determinar as alteraes das vias em amostras de GVHD em relao ao controle. As anlises foram realizadas utilizando-se o software Via Complex e Bioconductor. Observou-se aumento significativo da expresso de genes ralacionados s vias do sistema imune adaptativo, antgenos associados s Classe I e II do HLA, fosforilao de CD3 e CD247, sinalizao dos receptores de clulas T em CD4+ nativas e ativao de NF-kapa nas clulas B. Tambm observou-se alteraes significativas na mudana de expresso dos genes associados s vias relacionadas super famlia de molculas B7:CD28\CTLA-4 quando comparadas ao controle. Isso pode indicar a necessidade de gerao de um segundo sinal co-estimulador em GVHD, acionado pelas molculas dessa super famlia. O aumento da expresso do gene CD69 nas amostras experimentais caracteriza a ativao celular e, portanto, a sinalizao de estmulos em GVHD. Os achados obtidos neste estudo contribuem para melhor elucidar o mecanismo imunopatognico associado GVHD. P
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Uma definio universal de embrio uma tarefa difcil para qualquer cincia exata e impossvel em filosofia. Em 1997, afirmava o CNECV: (...) o embrio no pode deixar de dar origem a um representante da espcie humana, e nunca desembocar num indivduo de qualquer outra espcie () a vida humana merece respeito, qualquer que seja o seu estdio ou fase, devido sua dignidade essencial. O embrio , em qualquer fase e desde o incio, o suporte fsico e biolgico indispensvel ao desenvolvimento da pessoa humana e nele antecipamos aquilo que h-de vir a ser: no h, pois, razes que nos levem a estabelecer uma escala de respeito. Sendo o estatuto do embrio um tema ainda to atual e nunca esgotado, nesta era do genoma humano, qualquer tentativa para o definir poder parecer incompleta. Como exemplo, veja-se a definio de Keating (1993): A expresso estatuto do embrio refere-se questo controversa da proteo moral e jurdica a conceder ao embrio humano em diversos contextos (abortamento, Procriao Medicamente Assistida, experimentao embrionria, etc.), consoante a determinao da sua natureza, que oscila, segundo os casos e as filosofias, entre a de material biolgico e a de pessoa (potencial ou no). Assim, infere-se destes textos que a questo do estatuto do embrio deve ser encarada de modo multidisciplinar e pode ser colocada em diferentes planos por exemplo, jurdico, que suscitar perguntas como Quais os direitos do embrio? ou ontolgico, do tipo O embrio pessoa? Nesta conferncia iro ser apresentados os tipos de estatuto que mais tm sido atribudos ao embrio: o biolgico, o ontolgico, o filosfico e o jurdico.
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Tesis (Maestra en Ciencias con Acentuacin en Microbiologa) UANL, 2012.
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Tesis (Maestra en Ciencias con Orientacin Terminal en Biologa Molecular e Ingeniera Gentica) UANL, 2011.
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Numerosos estudios mencionan que la sobreexpresin de la protena p16, un marcador biolgico que permite identificar lesiones preneoplsicas del epitelio exocervical, tendra una alta asociacin con el Papiloma Virus Humano (HPV) de alto riesgo oncognico. Es un estudio descriptivo correlacional cuyo objetivo fue establecer asociacin de las Neoplasias Intraepiteliales Cervicales grado I (NIC I), HPV positivos, con la expresin del p16. Materiales, mtodos y resultados: Es un estudio correlacional que se realiz en el perodo de noviembre de 2009 a noviembre de 2010; se presentaron 256 casos de NIC I de los cuales, 72 fueron HPV positivos; se practic tcnica de p16. La edad promedio de las mujeres fue de 41 aos. Se encontr positividad para el p16 en 40 casos (55.6%) y fueron negativos 32 (44.4%). De los casos positivos para p16, los tipos virales ms frecuentes fueron los de alto riesgo: 33 (82.5%). El p16 fue valorado en cuanta, distribucin e intensidad, establecindose relacin entre la intensidad del p16 con los virus de alto riesgo (p=0.038). Cuando se analiz la edad y el tipo viral, pacientes entre 20 y 40 aos (36 casos, 90%) presentaron genoma de HPV de alto riesgo. Conclusiones: Existi correlacin entre la intensidad del p16 con la presencia de HPV de alto riesgo, ayudando a seleccionar grupos con tendencia a la progresin de la enfermedad.
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152 p. : il., col.
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198 p.
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A transsialidase uma glicoprotena de membrana pertencente a uma famlia de genes de cpia mltipla, envolvida no processo de invaso celular do Trypanosoma cruzi no hospedeiro vertebrado. Esta dissertao foi concebida com um amplo componente analtico que dependia de dados publicamente disponveis, ou seja, as sequncias oriundas do projeto genoma de T. cruzi e cDNAs de trans-sialidase depositadas no Genbank-dbEST. Este componente analtico necessitou ser complementado e ampliado com a obteno experimental de novas sequncias, a partir da metodologia baseada na transcrio reversa acoplada a PCR. Os fragmentos obtidos de cepas de T. cruzi Dm28c (T. cruzi I), Y (T. cruzi II), CL-Brener (T. cruzi II, cepa hbrida), INPA4167 (zimodema III), 3663 (zimodema III) e Colombiana (zimodema III) foram clonados, sequenciados e analisados composicionalmente. Essas sequncias foram editadas e alinhadas usando-se o software CLUSTAL X. Em uma seo especfica do Genbank, denominada dbEST, buscamos os cDNAs homlogos a trans-sialidase. Esta busca por similaridade foi realizada individualmente com os nmeros de acesso referentes s seqncias supracitadas contra o dbEST utilizando o BLAST a fim de obtermos informaes funcionais e evolutivas. Em seguida, desenvolvemos metodologias experimentais que nos permitiu avaliar segmentos da 5 UTR, tais como os stios de trans-splicing adicionais ou mltiplos em TS e seus respectivos sinais (regio rica em polipirimidina), variao composicional e tamanho da regio das sequncias entre diferentes linhagens de T. cruzi. O resultado dessa averiguao tambm nos mostrou a quantidade de cDNAs relacionados com a transsialidase no dbEST bem como a relao desses cDNAs com o mini-exon. As cepas do zimodema III apresentaram tamanho mdio dos fragmentos de 312 bases, enquanto T. cruzi I e T. cruzi II apresentaram, respectivamente 209 e 218. Trans splicing adicional ou duplicaes gnicas com mutaes no stio primrio de trans splicing no parece ser um fenmeno exclusivo de algum grupo populacional, embora seja mais evidente em T. cruzi zimodema III.
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Com a introduo do flor como o principal agente anticariognico e, talvez, um aumento do flor na nossa cadeia alimentar, a fluorose dentria tornou-se um problema mundial. Os mecanismos que conduzem formao do esmalte fluortico so desconhecidos, mas devem envolver modificaes nas reaes fsico-qumicas bsicas de desmineralizao e remineralizao do esmalte dentrio. O aumento daquantidade de flor no cristal apatita resulta no aumento dos parmetros de rede. O objetivo deste trabalho caracterizar o esmalte dentrio humano saudvel e fluortico usando difrao de raios X com luz sncrotron. Todos os perfis de espalhamento foram medidos na linha de difrao de raios X (XRD1) do Laboratrio Nacional de Luz Sncrotron, Campinas SP. Os experimentos foram realizados usando amostras em p e em lminas polidas. As amostras em p foram analisadas a fim de obter a caracterizao do esmalte dentrio saudvel. As lminas foram analisadas em reas do esmalte especficas identificadas como fluorticas. Todos os perfis foram comparados com amostras de esmalte de controle e tambm com a literatura. A evidente similaridade entre os perfis de difrao mostraram a analogia entre as estruturas do esmalte dentrio e a hidroxiapatita padro. Fica evidente que os perfis de difrao do esmalte dentrio das amostras em lmina so diferentes daqueles obtidos para o esmalte em p. As diferenas encontradas incluem variao na cristalinidade e orientao preferencial. Os valores encontrados para as distncias interplanares para o esmalte de controle e fluortico das amostras em lmina no apresentaram diferenas estatisticamente significativas. Isto pode ser explicado pelo fato que a hidroxiapatita e a fluoropatita formam cristais com a mesma estrutura hexagonal, mesmo grupo de simetria e tm parmetros de rede muito prximos, os quais a habilidade do sistema no foi suficiente para resolver. Finalmente, este trabalho mostra que a difrao de raios X usando radiao sncrotron uma tcnica poderosa para o estudo da cristalografia e microestrutura do esmalte dentrio e, ainda, pode ser igualmente aplicada no estudo de outros tecidos biolgicos duros e de biomateriais sintticos.
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O cncer de colo do tero persiste como um importante problema de sade em todo o mundo, em particular nos pases em desenvolvimento. Duas vacinas contra o papilomavirus humano (HPV) encontram-se atualmente disponveis e aprovadas para uso em meninas adolescentes, antes do incio da vida sexual: uma bivalente, contra os sorotipos 16 e 18 e outra quadrivalente, contra os sorotipos 6, 11, 16 e 18. Estes imunobiolgicos tm por objetivo induzir uma imunidade contra o papilomavrus e, desta forma, atuar na preveno primria do cncer do colo de tero. As avaliaes econmicas podem ser um elemento que auxiliem nos processos de tomada de deciso sobre a incorporao da vacina em programas de imunizao nacionais. Estas avaliaes foram o objeto central deste trabalho, que teve como objetivo sintetizar as evidncias procedentes de uma reviso sistemtica da literatura de estudos de avaliao econmica da utilizao da vacina contra o HPV em meninas adolescentes e pr-adolescentes. Foi realizada uma busca na literatura nas bases MEDLINE (via Pubmed), LILACS (via Bireme) e National Health Service Economic Evaluation Database (NHS EED) ate junho de 2010. Dois avaliadores, de forma independente, selecionaram estudos de avaliao econmica completa, que tivessem como foco a imunizao para HPV em mulheres com as vacinas comercialmente disponveis direcionada populao adolescente. Aps a busca, 188 ttulos foram identificados; destes, 39 estudos preencheram os critrios de elegibilidade e foram includos na reviso. Por tratar-se de uma reviso de avaliaes econmicas, no foi realizada uma medida de sntese dos valores de relao incremental entre custos e efetividade. Os 39 artigos includos envolveram 51 avaliaes econmicas em 26 pases. Predominaram estudos de custo-utilidade (51%). Do ponto de vista da perspectiva da anlise, predominou o dos sistemas de sade (76,4%). A maioria dos trabalhos (94,9%) elegeu meninas, com idade entre 9 e 12 anos, como sua populao alvo e desenvolveu simulaes considerando imunidade para toda a vida (84,6%). Os modelos utilizados nos estudos foram do tipo Markov em 25 anlises, de transmisso dinmica em 11 e hbridos em 3. As anlises de sensibilidade revelaram um conjunto de elementos de incerteza, uma parte significativa dos quais relacionados a aspectos vacinais: custos da vacina, durao da imunidade, necessidade de doses de reforo, eficcia vacinal e cobertura do programa. Estes elementos configuram uma rea de especial ateno para futuros modelos que venham a ser desenvolvidos no Brasil para anlises econmicas da vacinao contra o HPV.
