QSAR e dinâmica molecular no estudo de sistemas biomoleculares: predição da atividade biológica de antagonistas do receptor sigma-1 e simulações de bicamadas lipídicas

Diferentes abordagens teóricas têm sido utilizadas em estudos de sistemas biomoleculares com o objetivo de contribuir com o tratamento de diversas doenças. Para a dor neuropática, por exemplo, o estudo de compostos que interagem com o receptor sigma-1 (Sig-1R) pode elucidar os principais fatores associados à atividade biológica dos mesmos. Nesse propósito, estudos de Relações Quantitativas Estrutura-Atividade (QSAR) utilizando os métodos de regressão por Mínimos Quadrados Parciais (PLS) e Rede Neural Artificial (ANN) foram aplicados a 64 antagonistas do Sig-1R pertencentes à classe de 1-arilpirazóis. Modelos PLS e ANN foram utilizados com o objetivo de descrever comportamentos lineares e não lineares, respectivamente, entre um conjunto de descritores e a atividade biológica dos compostos selecionados. O modelo PLS foi obtido com 51 compostos no conjunto treinamento e 13 compostos no conjunto teste (r² = 0,768, q² = 0,684 e r²teste = 0,785). Testes de leave-N-out, randomização da atividade biológica e detecção de outliers confirmaram a robustez e estabilidade dos modelos e mostraram que os mesmos não foram obtidos por correlações ao acaso. Modelos também foram gerados a partir da Rede Neural Artificial Perceptron de Multicamadas (MLP-ANN), sendo que a arquitetura 6-12-1, treinada com as funções de transferência tansig-tansig, apresentou a melhor resposta para a predição da atividade biológica dos compostos (r²treinamento = 0,891, r²validação = 0,852 e r²teste = 0,793). Outra abordagem foi utilizada para simular o ambiente de membranas sinápticas utilizando bicamadas lipídicas compostas por POPC, DOPE, POPS e colesterol. Os estudos de dinâmica molecular desenvolvidos mostraram que altas concentrações de colesterol induzem redução da área por lipídeo e difusão lateral e aumento na espessura da membrana e nos valores de parâmetro de ordem causados pelo ordenamento das cadeias acil dos fosfolipídeos. As bicamadas lipídicas obtidas podem ser usadas para simular interações entre lipídeos e pequenas moléculas ou proteínas contribuindo para as pesquisas associadas a doenças como Alzheimer e Parkinson. As abordagens usadas nessa tese são essenciais para o desenvolvimento de novas pesquisas em Química Medicinal Computacional.

Resolution of the chiral (1R,2S) enantiomer of cis-cyclohexane-1,2-dicarboxylic acid in the brucinium salt 2,3-dimethoxy-10-oxostrychnidinium (1R,2S)-2-carboxycyclohexane-1-carboxylate dihydrate

The structure of the 1:1 brucinium salt of cis-cyclohexane-1,2-dicarboxylic acid, 2,3-dimethoxy-10-oxostrychnidinium (1R,2S)-2-carboxycyclohexane-1-carboxylate dihydrate, has revealed the resolved (1R,2S) enantiomer of the acid. Crystals of the compound are orthorhombic, space group P212121, with unit cell dimensions a = 8.1955(3), b = 12.4034(3), c = 29.9073(9)Å, and Z = 4. The asymmetric unit comprises the brucinium cation, the hydrogen cis-cyclohexane-1,2-dicarboxylate cation, in which the carboxylate group is disordered over two sites (58, 42%), and two water molecules of solvation, one of which is occupies two 50% occupancy sites. The classic undulating brucinium cation substructures are present with the anion and the water molecules occupying the interstitial cavities and are hydrogen-bonded to them in a two-dimensional network structure.

A role for IGF-1R-targeted therapies in small-cell lung cancer?

Background: Small-cell lung cancer (SCLC) is an aggressive disease with a poor prognosis. The insulin-like growth factor-1 receptor (IGF-1R) is an autocrine growth factor and an attractive therapeutic target in many solid tumors, but particularly in lung cancer. Patients and Methods: This study examined tumor samples from 23 patients diagnosed with SCLC, 11 resected specimens and 12 nodal biopsies obtained by mediastinoscopy, for expression of IGF-1R using the monoclonal rabbit anti-IGF-1R (clone G11, Ventana Medical Systems, Tucson, AZ) and standard immunohistochemistry (IHC). Results: All 23 tumor samples expressed IGF-1R with a range of stain intensity from weak (1+) to strong (3+). Ten tumors had a score of 3+, 7 tumors 2+, and 6 tumors 1+. Patient survival data were available for all 23 patients. Two patients died < 30 days post biopsy, therefore, the intensity of anti-IGF-1R immunostaining for 21 patients was correlated to survival. Patients with 3+ immunostaining had a poorer prognosis (P = .003). The overall survival of patients who underwent surgical resection was significantly better (median survival not reached) than patients who were not resected (median survival, 7.4 months) (P = .006). Conclusion: IGF-1R targeted therapies may have a role in the treatment of SCLC in combination with chemotherapy or as maintenance therapy. Further studies on the clinical benefit of targeting IGF-1R in SCLC are needed.

Språkbad - ett effektivt sätt att lära sig språk? : Föräldrars och elevers tankar kring språkbad i Helsingfors

Tutkimuksen tarkoituksena oli selvittää helsinkiläisten perusopetuksen yläluokkien kielikylpy-oppilaiden ja heidän vanhempiensa käsityksiä ruotsinkielisestä kielikylvystä. Tarkoituksena oli tutkia syitä kielikylpymenetelmän tai vastaavasti perinteisen opetuksen valitsemiseksi sekä oppilaiden ja heidän vanhempiensa käsityksiä kielikylpyoppilaiden koulumenetyksestä ja kielitaidosta. Tarkoituksena oli myös selvittää, mikä asema kielikylvyllä on oppilaiden elämässä koulukontekstin ulkopuolella sekä miten oppilaat ja heidän vanhempansa suhtautuvat kielikylpyyn kokonaisuutena. Tutkimuksen perusjoukkoon kuuluivat kaikki lukuvuonna 2002−2003 Helsingin perusopetuksen yläluokkien ruotsinkielisessä kielikylvyssä olevat oppilaat sekä heidän vanhempansa. Otokseen saatiin 128 oppilasta ja 94 vanhempaa. Näiden lisäksi tutkimukseen osallistui 40 vanhempaa, joiden lapset osallistuivat yksikieliseen suomenkieliseen perusopetukseen. Tutkimusjoukon oppilaista osa on ollut alaluokilla varhaisessa täydellisessä kielikylvyssä ja osa varhaisessa osittaisessa kielikylvyssä. Tutkimus edustaa survey-tutkimusta, jossa aineistonhankintamenetelmänä on käytetty sekä lomakekyselyä että haastattelua. Teemahaastatteluun valittiin 10 oppilasta tutkimuksen perusjoukosta. Tutkimusaineisto kerättiin kevään 2003 aikana. Aineistosta laskettiin frekvenssejä, keskilukuja ja korrelaatioita sekä käytettiin ristiintaulukointeja. Keskiarvojen merkitsevyystestaukset suoritettiin yksisuuntaisilla varianssianalyyseillä F- ja t-testein. Tutkimuksen teoriaosuudessa käsitellään kielitaidon ja kaksikielisyyden käsitteitä sekä esitellään erilaisia pedagogisia menetelmiä, joilla pyritään kehittämään kielitaitoa. Teoriaosuudessa pohditaan myös asenteiden ja motivaation merkitystä kielen omaksumisessa. Tutkimustulokset osoittavat, että perusopetuksen yläluokkien kielikylpyoppilailla ja heidän vanhemmillaan on varsin yhdensuuntaisia käsityksiä kielikylvystä. Kielikylpyyn ollaan varsin tyytyväisiä kokonaisuutena, mutta kehitettävää ja parannettavaa on. Opiskelu kielikylpyluokalla miellettiin positiivisena, mutta ruotsinkielisen opetuksen määrään toivottiin muutosta. Vanhemmat arvostivat kielikylpyä erityisesti siinä käytettävien opetusmenetelmien ja saavutettavien tulosten perusteella. Sekä vanhemmat että oppilaat kokevat ruotsin kielen oppimisen erittäin tarpeelliseksi ja hyödylliseksi peilaten vastauksissaan tulevaisuuden opiskelu- ja työelämän tarpeita. Oppilaiden ruotsin kielen taidot arvioitiin erittäin korkeiksi. Kielikylpykielen asema oppilaiden elämässä koulun ulkopuolella oli erittäin vähäinen. Ruotsin kielen käyttötilanteet rajoittuivat matkoihin ja erilaisiin opastustilanteisiin. Omaehtoista kielen käyttöä ei juuri ilmennyt hyvästä kielitaidosta huolimatta. Oppilaiden käsityksissä ei ollut havaittavissa eroja eri sukupuolten välillä. Joissain tapauksissa luokka-asteella, mutta erityisesti oppilaan koululla ja kielikylpymuodolla oli vaikutusta tutkittuihin käsityksiin.

Chiral gels derived from secondary ammonium salts of (1R, 3S)-(+)-camphoric acid

In order to have access to chiral gels, a series of salts derived from (1R, 3S)-(+)-camphoric acid and various secondary amines were prepared based on supramolecular synthon rationale. Out of seven salts prepared, two showed moderate gelation abilities. The gels were characterized by differential scanning calorimetry, table top rheology, scanning electron microscopy, single crystal and powder X-ray diffraction. Structure property correlation based on X-ray diffraction techniques remain inconclusive indicating that some of the integrated part associated with the gelation phenomena requires a better understanding.

A convenient enantiospecific methodology for (-)-(1R,5S)-1,5-dimethylbicyclo[3.3.0]octa-2,7-dione: A formal total synthesis of (-)-ceratopicanol

An enantiospecific formal total synthesis of (-)-ceratopicanol starting from the readily and abundantly available monoterpene (R)-limonene is described. A combination of Claisen rearrangement-intramolecular diazo-ketone cyclopropanation-regiospecific reductive cyclopropane cleavage reactions are employed for the stereo- and regiospecific generation of the two vicinal ring junction quaternary carbon atoms.

On the SIG-dimension of trees under the L (a)-metric

Let where be a set of points in d-dimensional space with a given metric rho. For a point let r (p) be the distance of p with respect to rho from its nearest neighbor in Let B(p,r (p) ) be the open ball with respect to rho centered at p and having the radius r (p) . We define the sphere-of-influence graph (SIG) of as the intersection graph of the family of sets Given a graph G, a set of points in d-dimensional space with the metric rho is called a d-dimensional SIG-representation of G, if G is isomorphic to the SIG of It is known that the absence of isolated vertices is a necessary and sufficient condition for a graph to have a SIG-representation under the L (a)-metric in some space of finite dimension. The SIG-dimension under the L (a)-metric of a graph G without isolated vertices is defined to be the minimum positive integer d such that G has a d-dimensional SIG-representation under the L (a)-metric. It is denoted by SIG (a)(G). We study the SIG-dimension of trees under the L (a)-metric and almost completely answer an open problem posed by Michael and Quint (Discrete Appl Math 127:447-460, 2003). Let T be a tree with at least two vertices. For each let leaf-degree(v) denote the number of neighbors of v that are leaves. We define the maximum leaf-degree as leaf-degree(x). Let leaf-degree{(v) = alpha}. If |S| = 1, we define beta(T) = alpha(T) - 1. Otherwise define beta(T) = alpha(T). We show that for a tree where beta = beta (T), provided beta is not of the form 2 (k) - 1, for some positive integer k a parts per thousand yen 1. If beta = 2 (k) - 1, then We show that both values are possible.

Vita, et fatti dell'invitissimo imperatore Carlo Qvinto, et historie universali del mondo, de' suoi tempi... opera vitilissima a prencipi, signori, & capitani, & qual si voglia persona che d'historie si diletta composta dal Sig. Alfonso Ulloa, con la Pace, & Capitolationi seguite, tra li due potentissimi Prencipi Di Francia, & Spagna : & Con Toaule Copiosissime : & In questa ultima qditione in molti moughi mccresciuta, & migliorata

Afonso de Ulloa, escritor espanhol, nasceu em Zamora na primeira metade do século XVl e morreu em Veneza, Itália, em 1580. Filho de Francisco de Ulloa, oficial que esteve na África com Carlos V, seguiu também a carreira das armas, estabelecendo-se depois em Veneza. Desempenhou várias missões diplomáticas, escreveu muitas obras e traduziu para o italiano, língua que conhecia tanto quanto a materna, autores espanhóis e portugueses. Quanto à obra Vita, et fatti dell' invitissimo imperatore Carlo Qvinto.. . sabe-se que foi pela primeira vez impressa em Veneza em 1560 por Vincenzo Valgrisio e que foi muitas vezes reeditada. Salvo pela época, a edição supra referenciada não oferece grande interesse artístico, mas há uma interessante gravura com a efígie de Carlos V.

SIG Industrial: una herramienta para la gestión y la promoción de la industria. El caso de Álava

368 p.

SIG aplicado na identificação de áreas potenciais aos investimentos habitacionais Estudo de caso: porção oeste do Município do Rio de Janeiro.

A expansão industrial e o desenvolvimento territorial na porção oeste do Município do Rio de Janeiro trazem inúmeras modificações no cenário socioeconômico da região e adjacências. O destaque de investimentos na indústria de transformação é a implantação da Companhia Siderúrgica do Atlântico (CSA), que se mostra como o maior empreendimento privado em realização no país. Investimentos públicos e privados no setor de infraestrutura estão previstos, considerando as características naturais e a localização geográfica privilegiada da região. A influência do porto de Itaguaí e a construção do Arco Metropolitano configuram um corredor de desenvolvimento com reflexos positivos logísticos e socioeconômicos, não só para o estado do Rio de Janeiro, mas também para outros estados brasileiros. Os impactos da reordenação do espaço urbano, com a possibilidade de incremento populacional nas proximidades do novo eixo rodoviário e industrial, tende a gerar um aumento da demanda por serviços no setor terciário. Dessa forma, o planejamento territorial se faz obrigatório, apoiado por geotecnologias. O objetivo da pesquisa foi atender às necessidades do setor habitacional, analisando fatores relevantes e condições favoráveis à implantação de novas construções habitacionais. Baseando-se em dados provenientes do censo do IBGE de 2010 e do Instituto de Urbanismo Pereira Passos (IPP), a Tecnologia da Informação integrada com os dados de mapas digitais e imagens de satélite de alta resolução (World View-2), permitiram uma análise geral do contexto do crescimento regional. Além da análise das variáveis existentes nos dados socioeconômicos, outras variáveis de pesquisa foram empregadas em ambiente SIG, tais como: segurança, proximidades de logradouros principais, existências de escolas e hospitais municipais e estaduais, distância dos centros industriais e de shopping. Após as análises multicriteriais de dados socioeconômicos e bases cartográficas, relatórios na forma de mapas foram emitidos, com a finalidade de orientar o poder público e as construtoras nas tomadas de decisões.