Relative protein quantification by isobaric SILAC with immonium ion splitting (ISIS)

Metabolic labeling techniques have recently become popular tools for the quantitative profiling of proteomes. Classical stable isotope labeling with amino acids in cell cultures (SILAC) uses pairs of heavy/light isotopic forms of amino acids to introduce predictable mass differences in protein samples to be compared. After proteolysis, pairs of cognate precursor peptides can be correlated, and their intensities can be used for mass spectrometry-based relative protein quantification. We present an alternative SILAC approach by which two cell cultures are grown in media containing isobaric forms of amino acids, labeled either with 13C on the carbonyl (C-1) carbon or 15N on backbone nitrogen. Labeled peptides from both samples have the same nominal mass and nearly identical MS/MS spectra but generate upon fragmentation distinct immonium ions separated by 1 amu. When labeled protein samples are mixed, the intensities of these immonium ions can be used for the relative quantification of the parent proteins. We validated the labeling of cellular proteins with valine, isoleucine, and leucine with coverage of 97% of all tryptic peptides. We improved the sensitivity for the detection of the quantification ions on a pulsing instrument by using a specific fast scan event. The analysis of a protein mixture with a known heavy/light ratio showed reliable quantification. Finally the application of the technique to the analysis of two melanoma cell lines yielded quantitative data consistent with those obtained by a classical two-dimensional DIGE analysis of the same samples. Our method combines the features of the SILAC technique with the advantages of isobaric labeling schemes like iTRAQ. We discuss advantages and disadvantages of isobaric SILAC with immonium ion splitting as well as possible ways to improve it

CDS/ISIS

Este documento visa essencialmente fazer uma apresenta¸c˜ao sucinta do CDS/ISIS, destacando a suas potencialidades na gest˜ao e utiliza¸c˜ao de recursos bibliogr´aficos. ´E dada uma particular ˆenfase `a vers˜ao Windows deste sistema com o intuito de elucidar alguns conceitos e funcionalidades que caracterizam o CDS/ISIS.

Disseny i creació de bases de dades bibliogràfiques amb CDS/ISIS: l'experiència de SABA-DOC

Es descriu el procés de disseny i creació de bases de dades bibliogràfiques amb el programa CDS/ISIS. Es tracta de la base de dades SABA-DOC, principal producte del projecte Centres de Documentació i Biblioteques de Sabadell en Xarxa. La base de dades conté referències bibliogràfiques dels fons documentals de diverses entitats de Sabadell i els registres referits a Sabadell provinents de la base de dades del Servei d'Història Local de Catalunya, de la UAB. Es comenten aspectes de l'estructura de la base de dades, del seu manteniment i de la interfície de consulta des del web. S'hi inclou també una primera avaluació dels resultats obtinguts fins ara.

CDS/ISIS: un bon producte a un preu regalat

Presentació de la base de dades que conté la col·lecció del Laboratori de l'Escola Universitaria Jordi Rubió i Balaguer de Biblioteconomia i Documentació amb el gestor CDS/ISIS -desenvolupat per la Unesco-. Després d'una explicació general sobre CDS/ISIS, s'exposa amb detall el procés del disseny de la base de dades: definició dels camps del registre seguint una adaptació del Format Comú de Comunicació (CCF); definició de les pantalles d'entrada de dades; selecció dels camps a indexar i métodes d'indexacióemprats, i definició del format de sortida. Finalment, es fa una avaluació del producte.

GenIsisWeb: l'eina per publicar a Internet les bases de dades CDS/ISIS

L'objectiu de la ressenya és presentar GenIsisWeb, un programa que assisteix en la publicació de bases de dades a Internet. Després d'una breu descripció tècnica i partint d'una base de dades prèviament creada amb CDS/ISIS, es mostra el procés complet per a la seva publicació al Web.

GenIsisWeb: la herramienta para publicar en Internet las bases de datos CDS/ISIS

El objetivo de la reseña es presentar GenIsisWeb, un programa que asiste en la publicación de bases de datos en Internet. Tras una breve descripción técnica y partiendo de una base de datos previamente creada con CDS/ISIS, se muestra el proceso completo para su publicación en el Web.

[Voyage en Italie : 1824-1830]. , Temple d'Isis : [plan d'ensemble, plan de la partie centrale] : [dessin] / h. L. [Henri Labrouste]

Référence bibliographique : Weigert, 367

[Voyage en Italie : 1824-1830]. , Temple d'Isis, sur une Echelle de 001 PM : [coupe transversale, coupe longitudinale, détail ornemental] : [dessin] / h. L. [Henri Labrouste]

Référence bibliographique : Weigert, 368

O Isis und Osiris

Soitinnus: lauluääni, kuoro, orkesteri.

ISIS reading group

Reading group on diverse topics of interest for the Information: Signals, Images, Systems (ISIS) Research Group of the School of Electronics and Computer Science, University of Southampton.

El problema de Isis : interés educativo de sus variadas soluciones, algunas generalizaciones.

Resumen del autor