Simulação computacional do enovelamento de proteínas utilizando o Modelo HP

Pós-graduação em Ciência e Tecnologia de Materiais - FC

Algoritmos evolutivos e modelo HP para predição de estruturas de proteínas

Predição de estruturas de proteínas (PSP) é um problema computacionalmente complexo. Modelos simplificados da molécula proteica (como o Modelo HP) e o uso de Algoritmos Evolutivos (AEs) estão entre as principais técnicas investigadas para PSP. Entretanto, a avaliação de uma estrutura representada pelo Modelo HP considera apenas o número de contatos hidrofóbicos, não possibilitando distinguir entre estruturas com o mesmo número de contatos hidrofóbicos. Neste trabalho, é apresentada uma nova formulação multiobjetivo para PSP em Modelo HP. Duas métricas são avaliadas: o número de contatos hidrofóbicos e a distância entre os aminoácidos hidrofóbicos, as quais são tratados pelo AE Multiobjetivo em Tabelas (AEMT). O algoritmo mostrou-se rápido e robusto.

Integer Programming Approach to HP Folding

One of the most widely studied protein structure prediction models is the hydrophobic-hydrophilic (HP) model, which explains the hydrophobic interaction and tries to maximize the number of contacts among hydrophobic amino-acids. In order to find a lower bound for the number of contacts, a number of heuristics have been proposed, but finding the optimal solution is still a challenge. In this research, we focus on creating a new integer programming model which is capable to provide tractable input for mixed-integer programming solvers, is general enough and allows relaxation with provable good upper bounds. Computational experiments using benchmark problems show that our formulation achieves these goals.

Development of a thermoelectric generator for the exhaust of a vehicle

Dissertação de mestrado integrado em Engenharia Mecânica

Teste de raios x na avaliação da qualidade de sementes de abóbora

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Termodinâmica do enovelamento de cadeias heteropoliméricas através do algoritmo de Wang-Landau

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Organizational, intermediate (field), (direct and general support), and depot maintenance repair parts and special tools list : engine, gasoline, 6 HP, military standard models, DOD model 4A032-1, 4A032-2, NSN 2805-00-776-0483, 2805-00-068-7512.

"April 1977."

Operator's and organizational maintenance manual : water purification unit, van-type, body mounted, electric driven, AC, 115, 208 V, single- and 3-phase, 60 hertz, 1/20 to 2 hp, 3000 gph (MET-PRO model 3000V), NSN 4610-00-168-1799.

"18 June 1980."

Operators, organizational, direct support, and general support maintenance manual : water purification unit, 420 gallons per hour, electric driven, 115V, single phase, 60 hertz 1/20 to 1 1/4 hp (Litton Systems, Inc. model LPU 420-1), FSN 4610-012-5490.

"1 October 1969"--P. i.

Operator and organizational maintenance manual (including repair parts and special tools list) : cleaner, steam pressure, jet, trailer mounted, kerosene or light diesel oil fired, electric motor, 1 hp, 115 V, AC/DC, 60 C, SGLE-PH (Geranco Manufacturing Corporation, model GS-400) (4940-865-4738).

"June 1967."

Field and depot maintenance manual : propelling unit, marine outboard, diesel driven, 165 hp, design 9002 (Murray & Tregurtha Harbormaster model OA6(TC)) serial numbers 216 thru 305, FSN 2010-278-0793.

"February 1962."

Operator, organizational, intermediate (field), (direct support and general support), and depot level maintenance manual : engine, gasoline, 6 HP, military standard models, DOD model 4A032-1, 4A032-2, NSN 2805-00-776-0483, 2805-00-068-7512.

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