Algoritmos evolutivos e modelo HP para predição de estruturas de proteínas
Contribuinte(s) |
UNIVERSIDADE DE SÃO PAULO |
---|---|
Data(s) |
04/11/2013
04/11/2013
2012
|
Resumo |
Predição de estruturas de proteínas (PSP) é um problema computacionalmente complexo. Modelos simplificados da molécula proteica (como o Modelo HP) e o uso de Algoritmos Evolutivos (AEs) estão entre as principais técnicas investigadas para PSP. Entretanto, a avaliação de uma estrutura representada pelo Modelo HP considera apenas o número de contatos hidrofóbicos, não possibilitando distinguir entre estruturas com o mesmo número de contatos hidrofóbicos. Neste trabalho, é apresentada uma nova formulação multiobjetivo para PSP em Modelo HP. Duas métricas são avaliadas: o número de contatos hidrofóbicos e a distância entre os aminoácidos hidrofóbicos, as quais são tratados pelo AE Multiobjetivo em Tabelas (AEMT). O algoritmo mostrou-se rápido e robusto. |
Identificador |
Revista de Controle e Automação, Porto Alegre, RS, v. 23, n. 1, p. 25-37, 2012 0103-1759 http://www.producao.usp.br/handle/BDPI/39091 10.1590/S0103-17592012000100003 http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_pdf&pid=S0103-17592012000100003&lng=en&nrm=iso&tlng=en |
Idioma(s) |
por |
Publicador |
Sociedade Brasileira de Automática |
Relação |
Revista de Controle e Automação |
Direitos |
openAccess |
Palavras-Chave | #Predição de estrutura de proteínas #Algoritmos evolutivos #Otimização multiobjetivo #Modelo HP #Protein structure prediction #Evolutionary algorithms #Multi-objective optimization #HP Model #SISTEMAS EMBUTIDOS #COMPUTAÇÃO EVOLUTIVA #ROBÓTICA |
Tipo |
article original article |