O papel do Estado no controle territorial e sua relação com a estruturação atividade pesqueira brasileira na Primeira República

No início do século XX, a pesca tornou-se uma atividade de importância ressaltada pelo Estado. A Marinha propôs mudanças na legislação, para regionalizar a atividade e legalizar a vida profissional do pescador, o qual adquiriu uma cidadania maior que a de boa parte da população do período da Primeira República. Deve-se ressaltar que só foi possível estruturar assim a atividade pesqueira, porque anteriormente, no período imperial, houve uma longa preparação, a qual, nos fins do século XIX, já na Primeira República, culminou em o Estado compenetrar-se de que precisava conhecer e controlar os recursos naturais e sociais brasileiros. A estruturação politico-administrativa da pesca ocorreu criando-se a Confederação de Pesca e as federações estaduais, com suas colônias de pesca em todo Brasil. A finalidade era marcar o território com estruturas fixas que rganizassem os pescadores em comunidades e permitissem ao Estado controlar a produção nacional de pescado. Neste contexto, caberia a Marinha formar uma reserva naval composta por pescadores que pudesse ser facilmente arregimentados para garantir a defesa naval brasileira em situações de guerra. Neste sentido, a presente dissertação tem por objeto tanto organizar as informações acerca de como atividade pesqueira foi estruturada pelas legislações e pelos relatos da expedição que lhe fundou e organizou a estrutura nacional no Brasil, quanto mostrar a necessidade do Estado de conhecer melhor o seu próprio território e de identificar os potenciais da economia da pesca. A dissertação visa também salientar como essas mudanças vieram a influir, durante a Primeira República, sobre os deveres e direitos dos pescadores, e de que modo tais direitos e deveres contrastavam com os do restante do povo brasileiro.

A organização social da colônia de pescadores de Imperatriz zona 29 (CPIZ-29), estado do Maranhão

Nesta dissertação se analisa o processo histórico da formação social, política e econômicada da Colônia de Pescadores de Imperatriz Zona 29 (CPI Z-29), estado do Maranhão. Inicialmente, apresenta-se a fundamentação teórica concernente aos movimentos sociais de uma forma geral e em seguida especifica-se as origens e a capacidade organizacional dos pescadores sindicalizados haja vista que as colônias possuam status de sindicato. Em seguida, estuda-se como se deu a evolução do movimento dos pescadores no sul do Maranhão e, consequentemente, na região de Imperatriz, ou seja, na área que corresponde à jurisdição dessa Colônia Z-29,detendo-se nos avanços conquistados pela classe principalmente no que diz respeito às políticas públicas voltadas para esse movimento social. Na reconstituição dos acontecimentos históricos e econômicos, procedeu-se não só o estudo da CPI Z-29 que se solidificou no final da década dos anos de 1970, mais precisamente no ano de 1978, quando é fundada a entidade mencionada, mas também dos diversos ciclos de produção que a região de Imperatriz atravessou ao longo dos anos, procedeu-se também a um levantamento do modus vivendi dos pescadores seus costumes, crenças e práticas adotadas pela classe antes e depois de se associarem de forma legal a uma entidade que nascia visando a organização e fomentando um crescimento para uma classe importante porém esquecida. No estudo do processo pertinente ao periodo de sugimento do movimento e capacidade organizacional dos pescadores, analisou-se as mudanças verificadas na vida econômica, política, cultural, ambiental e social motivadas pelas transformações da estrutura organizacioanal da classe dos pescadores intensificadas, principalmente, a partir da implantação dos projetos sociais incentivados pelo Governo Federal. E, ao final, trata-se de visibilidade política dos pescadores, sua participação no processo decisório em nível municipal e os avanços conquistados pela CPI Z-29 desde a sua fundação.

Dinâmica da economia e das relações do trabalho da pesca artesanal no município de Santarém

O Estudo de Caso do projeto ora apresentado tem como foco explicitar como se processa a dinâmica da economia e das relações do trabalho na cadeia da pesca artesanal que ocorre nas comunidades pesqueiras de Ituqui e Costa do Tapará, situadas no município de Santarém-PA, onde foram entrevistados e consultados os principais agentes mercantis que atuam nos elos da cadeia produtiva, desde a captura até o comércio atacadista. Após análise e tratamento dos dados que foram obtidos em trabalho de campo, demonstramos como ocorrem os fluxos comerciais e as relações de trabalho nas comunidades pesqueiras estudadas. A pesca é uma atividade voltada ao bem estar e sobrevivência dos pescadores e suas famílias. Os dados foram transcritos para tabelas, nas quais fica demonstrada a desenvoltura da atividade pesqueira naquelas comunidades, desde o processo de captura, passando pela comercialização direta no âmbito das comunidades e diante atuação dos barcos intermediários que interferem na cadeia do comércio do pescado no município de Santarém. Com a efetivação do estudo de caso, foi possível detectar os fatores relevantes que influenciam o nível organizacional das comunidades por meio da entidade que as representa, considerando os benefícios dispostos pelo governo e outras entidades não governamentais, resultando daí a vinculação de 100% dos pescadores à Colônia dos Pescadores Z-20. A totalidade de pescadores entrevistados é signatária dos acordos de pesca estabelecidos pelos mesmos e anuído pelo IBAMA. Registre-se ainda que 100% dos pescadores das comunidades pesqueiras Ituqui e Tapará Grande desenvolvem suas atividades utilizando recursos próprios e dependem da renda exclusivamente obtida da pesca, o que vem reforçar que no período da entressafra passam a depender do seguro desemprego para a manutenção da família e para recuperação de seus barcos e arreios para a próxima temporada de pesca.

Pesca artesanal no Parque Nacional do Cabo Orange: contextos de conflito socioambiental e estratégias de manejo alternativo

Este trabalho tem como objetivo principal compreender e descrever como pescadores artesanais, que tradicionalmente exploram as áreas do entorno e dentro de uma unidade de conservação, mais especificamente o Parque Nacional do Cabo Orange localizado no município do Oiapoque, costa do Amapá, têm se ordenado politicamente e ambientalmente no que se refere à cenários de conflito socioambiental em águas costeiras - por territórios de pesca. Para tanto, o trabalho utiliza uma metodologia qualitativa e privilegia os agentes envolvidos no cenário da pesca no município de Oiapoque, estes são: pescadores paraenses, ICMBio, pescadores amapaenses. Os resultados da pesquisa demonstram que boa parte dos pescadores artesanais associados à Colônia de Pescadores do Oiapoque são remanescentes de uma comunidade pesqueira que era localizada no interior do Parque, chamada Vila de Taperebá. Os Parques Nacionais são um modelo de unidade de conservação de proteção integral à natureza, não permitindo a presença humana ou exploração de seus recursos. Consequentemente, essa população foi expropriada e a partir das entrevistas realizadas foi possível perceber como os pescadores artesanais do Oiapoque, juntamente com a Colônia de Pescadores do Oiapoque, traçaram e propõem um manejo e uma medida compensatória pela expropriação que ocorreu a partir da criação do referido Parque.

Two “pillars” of cold-water coral reefs along Atlantic European margins: Prevalent association of Madrepora oculata with Lophelia pertusa, from reef to colony scale

The scleractinian coral Lophelia pertusa has been the focus of deep-sea research since the recognition of the vast extent of coral reefs in North Atlantic waters two decades ago, long after their existence was mentioned by fishermen. These reefs where shown to provide habitat, concentrate biomass and act as feeding or nursery grounds for many species, including those targeted by commercial fisheries. Thus, the attention given to this cold-water coral (CWC) species from researchers and the wider public has increased. Consequently, new research programs triggered research to determine the full extent of the corals geographic distribution and ecological dynamics of “Lophelia reefs”. The present study is based on a systematic standardised sampling design to analyse the distribution and coverage of CWC reefs along European margins from the Bay of Biscay to Iceland. Based on Remotely Operated Vehicle (ROV) image analysis, we report an almost systematic occurrence of Madrepora oculata in association with L. pertusa with similar abundances of both species within explored reefs, despite a tendency of increased abundance of L. pertusa compared to M. oculata toward higher latitudes. This systematic association occasionally reached the colony scale, with “twin” colonies of both species often observed growing next to each other when isolated structures were occurring off-reefs. Finally, several “false chimaera” were observed within reefs, confirming that colonial structures can be “coral bushes” formed by an accumulation of multiple colonies even at the inter-specific scale, with no need for self-recognition mechanisms. Thus, we underline the importance of the hitherto underexplored M. oculata in the Eastern Atlantic, re-establishing a more balanced view that both species and their yet unknown interactions are required to better elucidate the ecology, dynamics and fate of European CWC reefs in a changing environment.

Phage library screening for the rapid identification and in vivo testing of candidate genes for a DNA vaccine against Mycoplasma mycoides subsp. mycoides small colony biotype

A new strategy for rapidly selecting and testing genetic vaccines has been developed, in which a whole genome library is cloned into a bacteriophage λ ZAP Express vector which contains both prokaryotic (Plac) and eukaryotic (PCMV) promoters upstream of the insertion site. The phage library is plated on Escherichia coli cells, immunoblotted, and probed with hyperimmune and/or convalescent-phase antiserum to rapidly identify vaccine candidates. These are then plaque purified and grown as liquid lysates, and whole bacteriophage particles are then used directly to immunize the host, following which PCMV-driven expression of the candidate vaccine gene occurs. In the example given here, a semirandom genome library of the bovine pathogen Mycoplasma mycoides subsp. mycoides small colony (SC) biotype was cloned into λ ZAP Express, and two strongly immunodominant clones, λ-A8 and λ-B1, were identified and subsequently tested for vaccine potential against M. mycoides subsp. mycoides SC biotype-induced mycoplasmemia. Sequencing and immunoblotting indicated that clone λ-A8 expressed an isopropyl-β-d-thiogalactopyranoside (IPTG)-inducible M. mycoides subsp. mycoides SC biotype protein with a 28-kDa apparent molecular mass, identified as a previously uncharacterized putative lipoprotein (MSC_0397). Clone λ-B1 contained several full-length genes from the M. mycoides subsp. mycoides SC biotype pyruvate dehydrogenase region, and two IPTG-independent polypeptides, of 29 kDa and 57 kDa, were identified on immunoblots. Following vaccination, significant anti-M. mycoides subsp. mycoides SC biotype responses were observed in mice vaccinated with clones λ-A8 and λ-B1. A significant stimulation index was observed following incubation of splenocytes from mice vaccinated with clone λ-A8 with whole live M. mycoides subsp. mycoides SC biotype cells, indicating cellular proliferation. After challenge, mice vaccinated with clone λ-A8 also exhibited a reduced level of mycoplasmemia compared to controls, suggesting that the MSC_0397 lipoprotein has a protective effect in the mouse model when delivered as a bacteriophage DNA vaccine. Bacteriophage-mediated immunoscreening using an appropriate vector system offers a rapid and simple technique for the identification and immediate testing of putative candidate vaccines from a variety of pathogens.

Bat colony size reduction coincides with clear-fell harvest operations and high rates of roost loss in plantation forest

Clear-fell harvest of forest concerns many wildlife biologists because of loss of vital resources such as roosts or nests, and effects on population viability. However, actual impact has not been quantified. Using New Zealand long-tailed bats (Chalinolobus tuberculatus) as a model species we investigated impacts of clear-fell logging on bats in plantation forest. C. tuberculatus roost within the oldest stands in plantation forest so it was likely roost availability would decrease as harvest operations occurred. We predicted that post-harvest: (1) roosting range sizes would be smaller, (2) fewer roosts would be used, and (3) colony size would be smaller. We captured and radiotracked C. tuberculatus to day-roosts in Kinleith Forest, an exotic plantation forest, over three southern hemisphere summers (Season 1 October 2006–March 2007; Season 2 November 2007–March 2008; and Season 3 November 2008–March 2009). Individual roosting ranges (100% MCPs) post harvest were smaller than those in areas that had not been harvested, and declined in area during the 3 years. Following harvest, bats used fewer roosts than those in areas that had not been harvested. Over 3 years 20.7% of known roosts were lost: 14.5% due to forestry operations and 6.2% due to natural tree fall. Median colony size was 4.0 bats (IQR = 2.0–8.0) and declined during the study, probably because of locally high levels of roost loss. Post harvest colonies were smaller than colonies in areas that had not been harvested. Together, these results suggest the impact of clear-fell harvest on long-tailed bat populations is negative.

Melanoma cell colony expansion parameters revealed by approximate Bayesian computation

In vitro studies and mathematical models are now being widely used to study the underlying mechanisms driving the expansion of cell colonies. This can improve our understanding of cancer formation and progression. Although much progress has been made in terms of developing and analysing mathematical models, far less progress has been made in terms of understanding how to estimate model parameters using experimental in vitro image-based data. To address this issue, a new approximate Bayesian computation (ABC) algorithm is proposed to estimate key parameters governing the expansion of melanoma cell (MM127) colonies, including cell diffusivity, D, cell proliferation rate, λ, and cell-to-cell adhesion, q, in two experimental scenarios, namely with and without a chemical treatment to suppress cell proliferation. Even when little prior biological knowledge about the parameters is assumed, all parameters are precisely inferred with a small posterior coefficient of variation, approximately 2–12%. The ABC analyses reveal that the posterior distributions of D and q depend on the experimental elapsed time, whereas the posterior distribution of λ does not. The posterior mean values of D and q are in the ranges 226–268 µm2h−1, 311–351 µm2h−1 and 0.23–0.39, 0.32–0.61 for the experimental periods of 0–24 h and 24–48 h, respectively. Furthermore, we found that the posterior distribution of q also depends on the initial cell density, whereas the posterior distributions of D and λ do not. The ABC approach also enables information from the two experiments to be combined, resulting in greater precision for all estimates of D and λ.

Ant Colony Optimization Algorithms for Shortest Path Problems

We propose four variants of recently proposed multi-timescale algorithm in [1] for ant colony optimization and study their application on a multi-stage shortest path problem. We study the performance of the various algorithms in this framework. We observe, that one of the variants consistently outperforms the algorithm [1].