Flippase (FLP) recombinase-mediated marker recycling in the dermatophyte Arthroderma vanbreuseghemii.

Biological processes can be elucidated by investigating complex networks of relevant factors and genes. However, this is not possible in species for which dominant selectable markers for genetic studies are unavailable. To overcome the limitation in selectable markers for the dermatophyte Arthroderma vanbreuseghemii (anamorph: Trichophyton mentagrophytes), we adapted the flippase (FLP) recombinase-recombination target (FRT) site-specific recombination system from the yeast Saccharomyces cerevisiae as a selectable marker recycling system for this fungus. Taking into account practical applicability, we designed FLP/FRT modules carrying two FRT sequences as well as the flp gene adapted to the pathogenic yeast Candida albicans (caflp) or a synthetic codon-optimized flp (avflp) gene with neomycin resistance (nptII) cassette for one-step marker excision. Both flp genes were under control of the Trichophyton rubrum copper-repressible promoter (PCTR4). Molecular analyses of resultant transformants showed that only the avflp-harbouring module was functional in A. vanbreuseghemii. Applying this system, we successfully produced the Ku80 recessive mutant strain devoid of any selectable markers. This strain was subsequently used as the recipient for sequential multiple disruptions of secreted metalloprotease (fungalysin) (MEP) or serine protease (SUB) genes, producing mutant strains with double MEP or triple SUB gene deletions. These results confirmed the feasibility of this system for broad-scale genetic manipulation of dermatophytes, advancing our understanding of functions and networks of individual genes in these fungi.

Efficient gene activation in cultured mammalian cells mediated by FLP recombinase-expressing recombinant adenovirus

A recombinant adenovirus (rAd) expressing Cre recombinase derived from bacteriophage P1 has already been extensively used for the conditional gene activation and inactivation strategies in mammalian systems. In this study, we generated AxCAFLP, a rAd expressing FLP recombinase derived from Saccharomyces cerevisiae and carried out quantitative comparisons with Cre-expressing rAd in both in vitro and in cultured cells to provide another efficient gene regulation system in mammalian cells. In the in vitro experiments, the relative recombination efficiency of FLP expressed in 293 cells infected with FLP-expressing rAd was approximately one-thirtieth that of Cre even at 30°C, the optimum temperature for FLP activity, and was approximately one-ninetieth at 37°C. Co-infection experiments in HeLa cells using a target rAd conditionally expressing LacZ under the control of FLP showed that an FLP-expressing rAd, infected at a multiplicity of infection (MOI) of 5, was able to activate the transgene in almost 100% of HeLa cells whereas the Cre-expressing rAd was sufficient at an MOI of 0.2. Since an MOI of 5 is ordinarily used in rAd experiments, these results showed that the FLP-expressing rAd is useful for gene activation strategies and is probably applicable to a sequential gene regulation system in combination with Cre-expressing rAd in mammalian cells.

Flp recombinase promotes site-specific DNA recombination in embryonic stem cells and transgenic mice.

Site-specific recombinases are being developed as tools for "in vivo" genetic engineering because they can catalyze precise excisions, integrations, inversions, or translocations of DNA between their distinct recognition target sites. Here it is demonstrated that Flp recombinase can effectively mediate site-specific excisional recombination in mouse embryonic stem cells, in differentiating embryonal carcinoma cells, and in transgenic mice. Broad Flp expression is compatible with normal development, suggesting that Flp can be used to catalyze recombination in most cell types. These properties indicate that Flp can be exploited to make prescribed alterations in the mouse genome.

Unraveling flp-11/flp-32 dichotomy in nematodes

FMRFamide-like peptide (FLP) signalling systems are core to nematode neuromuscular function. Novel drug discovery efforts associated with nematode FLP/FLP receptor biology are advanced through the accumulation of basic biological data that can reveal subtle complexities within the neuropeptidergic system. This study reports the characterisation of FMRFamide-like peptide encoding gene-11 (flp-11) and FMRFamide-like peptide encoding gene-32 (flp-32), two distinct flp genes which encode the analogous peptide, AMRN(A/S)LVRFamide, in multiple nematode species - the only known example of this phenomenon within the FLPergic system of nematodes. Using bioinformatics, in situ hybridisation, immunocytochemistry and behavioural assays we show that: (i) flp-11 and -32 are distinct flp genes expressed individually or in tandem across multiple nematode species, where they encode a highly similar peptide; (ii) flp-11 does not appear to be the most widely expressed flp in Caenorhabditis elegans; (iii) in species expressing both flp-11 and flp-32, flp-11 displays a conserved, restricted expression pattern across nematode clades and lifestyles; (iv) in species expressing both flp-11 and flp-32, flp-32 expression is more widespread and less conserved than flp-11; (v) in species expressing only flp-11, the flp-11 expression profile is more similar to the flp-32 profile observed in species expressing both; and (vi) FLP-11 peptides inhibit motor function in multiple nematode species. The biological significance and evolutionary origin of flp-11 and -32 peptide duplication remains unclear despite attempts to identify a common ancestor; this may become clearer as the availability of genomic data improves. This work provides insight into the complexity of the neuropeptidergic system in nematodes, and begins to examine how nematodes may compensate for structural neuronal simplicity. From a parasite control standpoint this work underscores the importance of basic biological data, and has wider implications for the utility of C. elegans as a model for parasite neurobiology.

Crianças com fissura labiopalatina e baixo peso ao nascimento em testes auditivos centrais

INTRODUÇÃO: Alterações neurológicas ou sensoriais, entre elas as alterações auditivas periféricas e/ou centrais, são enfatizadas na população com baixo peso ao nascimento (BP), assim como, na presença de malformação craniofacial, tal como a fissura labiopalatina (FLP). OBJETIVO: Verificar e comparar o resultado de testes de processamento auditivo, Teste Dicótico de Dígitos (TDD) e Teste de Fusão Auditiva-Revisado (AFT-R), de crianças com FLP com e BP ao nascimento, com o de crianças sem FLP e nascida com peso normal. MÉTODO: Estudo retrospectivo e comparativo de 73 prontuários, dos quais foram verificados o sexo, peso ao nascimento, presença/ausência de FLP e o resultado de TDD e AFT-R. Foram constituídos três grupos de acordo com a análise do peso ao nascimento e presença ou ausência de FLP. RESULTADOS: Para o TDD a Análise de Covariância não mostrou diferença entre os grupos e sexos, porém a co-variável idade mostrou relação estatisticamente significante. Para o AFT-R não mostrou diferença entre os grupos, sexos e idades. CONCLUSÃO: Crianças com FLP e BP, embora sem significância estatística, apresentam maiores alterações nos testes de processamento auditivo utilizados ao comparar com crianças com FLP isolada e com crianças sem esta malformação craniofacial e sem BP. Ressalta-se ainda que o aumento da idade melhorou o desempenho no TDD.

Avaliação audiológica pré-cirurgia otológica de indivíduos com fissura labiopalatina operada

OBJETIVO: descrever as características audiológicas de indivíduos com fissura labiopalatina operada (FLP) e indicação de cirurgia otológica, comparando os grupos quanto ao tipo e grau da perda auditiva, bem como a curva timpanométrica. MÉTODOS: análise de 150 prontuários, ambos os gêneros, idade igual ou superior a 4 anos, FLP e indicação de cirurgia otológica, divididos em 3 grupos: I - Tubo de ventilação (TV), II - Timpanoplastia e III - Timpanomastoidectomia, analisando aspectos quanto a entrevista audiológica, audiometria tonal limiar e imitanciometria. RESULTADOS: o grupo I apresentou porcentagem maior de cirurgia bilateral (86%), o que não ocorreu nos demais grupos. Na entrevista audiológica, 83% apresentou algum tipo de queixa auditiva, sendo a mais frequente a perda auditiva (64%) com p<0,05 entre os grupos I e II; I e III. O tipo de perda auditiva de maior ocorrência foi condutivo bilateral (56%) seguido de unilateral (35%), com p<0,05 entre os grupos I e II; I e III. A perda de grau leve unilateral foi a de maior ocorrência (41%), seguida de grau leve a moderada bilateral (20%), com p<0,05 entre os três grupos. A curva timpanométrica mais frequente foi a do tipo B bilateral (39%) com p<0,05 entre os três grupos. CONCLUSÃO: a maioria dos indivíduos apresentou algum tipo de queixa na entrevista audiológica e alterações na audiometria tonal limiar e imitanciometria. A maioria dessas alterações foi compatível com problemas de orelha média, com perda auditiva do tipo condutiva, de grau leve e bilateral, independentemente da indicação cirúrgica.

As atividades expressivas e recreativas em crianças com fissura labiopalatina hospitalizadas: visão dos familiares

Este estudo teve por objetivo verificar a visão dos familiares a respeito da importância das atividades expressivas e recreativas na hospitalização e recuperação cirúrgica de crianças com fissura labiopalatina (FLP), procurando identificar os benefícios dessas atividades nos períodos pré e pós-operatório. Foram entrevistados 138 familiares de crianças com FLP, na faixa etária de sete a 12 anos, hospitalizados no Hospital de Reabilitação de Anomalias Craniofaciais (HRAC/USP). Os resultados mostraram que a grande maioria dos entrevistados preferia desenvolver alguma atividade com a criança enquanto aguardava a cirurgia, tendo expressado sentimentos positivos durante esse período. Segundo os entrevistados, as atividades expressivas e recreativas no período pré-operatório deixam a criança mais calma, observando melhora na condição emocional da mesma. Essas atividades distraem, divertem, acalmam e contribuem para o desenvolvimento da criança, sendo importantes para a recuperação cirúrgica, amenizando os efeitos negativos da hospitalização. As atividades na brinquedoteca foram as preferidas pelas crianças e pelos familiares. Na visão dos familiares, as atividades expressivas e recreativas favorecem a criança e os pais, reduzindo o estresse, proporcionando sentimentos positivos a ambos e auxiliando a adaptação e o restabelecimento físico e emocional. Evidenciam a importância do brincar durante a hospitalização, contribuindo para um atendimento humanizado, principalmente no caso de crianças com fissura labiopalatina, sujeitas a um grande número de procedimentos cirúrgicos e hospitalizações.

Reconhecimento verbal de lactentes com fissura labiopalatina com e sem história de indicadores de risco para a audição

Os primeiros dois anos de vida são críticos para a aquisição e desenvolvimento de habilidades auditivas e linguagem. OBJETIVO: Verificar o desempenho de lactentes com fissura labiopalatina (FLP) com e sem indicadores de risco à audição (IRA) no teste de reconhecimento verbal (TRV). Estudo prospectivo. MATERIAL E MÉTODOS: Pais de 100 lactentes (9 a 18 meses) com FLP foram entrevistados para verificar a presença de IRA e à constituição dos grupos em estudo. Todos os lactentes foram submetidos ao TRV. Resultados: Doenças otológicas, não-amamentação natural, tabagismo dos pais, insuficiência das vias aéreas superiores, permanência na incubadora e antecedentes com surdez foram os IRA mais freqüentes. 85 lactentes apresentaram IRA e 40% deles TRV alterado. 15 não apresentaram IRA e 73% apresentaram desempenho no TRV esperado para a sua idade. Não foi encontrada significância (p=0,326) entre os grupos. 54 lactentes apresentaram história de otite média (OM) e 31% deles tiveram alteração no TRV. 46 não apresentaram OM e apresentaram desempenho no TRV esperado para a sua idade. Encontrada diferença significativa (p=0,000). CONCLUSÃO: Identificou-se a presença de outros IRA além FLP. O desempenho dos lactentes com e sem histórico de IRA não diferiu no TRV. A presença de doenças otológicas interferiu significativamente no TRV.

Teste Dicótico de Dígitos (etapa de escuta direcionada) em crianças com fissura labiopalatina

Perdas auditivas condutivas nos primeiros anos de vida podem levar a transtornos do processamento auditivo, de atenção e, conseqüentemente, dificuldades de aprendizado da comunicação. OBJETIVO: Verificar o desempenho de crianças com fissura labiopalatina no teste dicótico de dígitos, etapa de escuta direcionada; e compará-los aos de um grupo sem fissura labiopalatina. MATERIAL E MÉTODO: Fizeram parte deste estudo 52 crianças, de ambos os gêneros, na faixa etária de sete anos a sete anos e 11 meses, que foram distribuídas em dois grupos: um com crianças com fissura labiopalatina (n=27) e outro de crianças sem essa anomalia (n=25). O processo de avaliação constituiu da aplicação de um questionário, bateria de testes auditivos convencionais e aplicação do Teste Dicótico de Dígitos (etapa de escuta direcionada). RESULTADOS: No Teste Dicótico de Dígitos (etapa de escuta direcionada), foi possível observar que o grupo com FLP apresentou porcentagens de acerto inferiores ao grupo controle, tanto para a orelha direita quanto para a orelha esquerda. A análise estatística mostrou interação estatisticamente significativa para grupo versus gênero, p=0,026. CONCLUSÃO: No Teste Dicótico de Dígitos (etapa de escuta direcionada) somente as crianças do gênero feminino com fissura labiopalatina obtiveram índices de acerto inferiores às do grupo controle. Estudo prospectivo clínico.

Validação de limpeza de equipamentos para produção de fórmulas líquidas e pastosas

A utilização de equipamentos multiproduto é uma prática bastante comum em indústria farmacêutica. No entanto, a esta prática podem associar-se riscos de transferência de contaminantes sendo de extrema importância garantir a eficácia dos procedimentos de limpeza estabelecidos. Esta dissertação tem como objetivo a validação de limpeza dos equipamentos do setor das Formas Líquidas e Pastosas (FLP), dos Laboratórios Atral, SA por forma a evidenciar a eficácia e eficiência destes procedimentos na remoção de substâncias ativas (SA), excipientes e agentes de limpeza (tipos de contaminantes). Tendo em conta a diversidade de produtos e equipamentos do setor, recorreu-se a uma análise de risco para identificação de equipamentos e produtos pior-caso. A partir desta análise será também possível identificar os resíduos de substância ativa a procurar após higienização de um determinado equipamento. Para tal, foi necessário estabelecer e validar métodos de análise em HPLC (High Performance Liquid Chromatography) capazes de identificar e quantificar os resíduos das SAs em questão. A baixa frequência de produção de alguns dos produtos pior-caso impossibilitou o terminar dos estudos de validação de limpeza para o agitador de hélice e equipamentos de produção de cremes. O desenvolvimento destes procedimentos permitirá identificar potenciais riscos anteriormente desconhecidos, bem como a recolha e elaboração de documentos comprovativos da capacidade e adequabilidade dos procedimentos de limpeza aplicados.

Enxerto autógeno de crista ilíaca na reconstrução do processo alveolar em portadores de fissura labiopalatina: estudo de 30 casos

A reconstrução do processo alveolar em pacientes portadores de fissuras labiopalatais (FLP) é fundamental para erupção de dentes permanentes e para o restabelecimento estético através de implantes osteointegrados. Assim, considerado o alto grau de reabsorção do enxerto de osso autógeno puro e triturado, optou-se no Centro de Atendimento Integral ao Fissurado Labiopalatino, Curitiba, Paraná (1997 a 1999), pelo estabelecimento de dois grupos de 15 pacientes. No primeiro, foi utilizada crista ilíaca triturada e no outro combinada com hidroxiapatita biorreabsorvível. Ao fim de seis meses, os resultados cirúrgicos foram avaliados através de radiografia periapical digital, determinando quatro linhas limites para a reconstrução óssea. A primeira linha foi traçada na região cervical do dente adjacente à fissura que apresentava menor distorção. As outras linhas foram traçadas paralelamente à linha 1, distando 3mm entre cada uma delas. O espaço entre as linhas 1 e 2 foi denominado de A, entre 2 e 3 de B e 3 e 4 de C. Para critérios de avaliação, quando o enxerto permaneceu no espaço A, foi considerado de sucesso, em contraposição aos espaços B e C, quando foram denominados de procedimentos malsucedidos. Como resultados finais, o espaço A foi constatado em 46,7% dos pacientes submetidos ao procedimento controle com crista ilíaca e 80% para o grupo experimental, quando o enxerto ósseo foi empregado conjuntamente com o material aloplástico (hidroxiapatita).

DFT Studies of the Organocatalytic Aldol Reaction and a Frustrated Lewis Pair

The computational study, and in particular the density functional theory (DFT) study of the organocatalytic α-chlorination-aldol reaction and the chiral backbone Frustrated Lewis Pair (FLP) system served as a valuable tool for experimental purposes. This thesis describes methods to consider different transition states of the proline- catalyzed α-chlorination aldol reaction to determine the reasonable transition state in the reaction between the enamine and α-chloro aldehydes. Moreover, the novel intramolecular Frustrated Lewis pair based on a chiral backbone for the asymmetric hydrogenation of imines and enamines was designed and the ability of hydrogen splitting by this new FLP system was examined by computational modeling and calculating the hydrogen activation energy barrier.

Prácticas actuales y direcciones futuras para la enseñanza de la comprensión auditiva a los hablantes de inglés en el ambiente multimedia.

Resumen tomado de la publicación

Diversity, phylogeny and distribution of bean rhizobia in salt-affected soils of North-West Morocco

Different molecular methods: BOX-PCR fingerprinting, R-FLP-PCR and sequencing of the 16S rDNA as well as the symbiotic genes nodC and nifH, were used to study the genetic diversity within a collection of nodulating bean rhizobia isolated from five soils of North-West Morocco. BOX fingerprints analysis of 241 isolates revealed 19 different BOX profiles. According to the PFLP-PCR and sequencing of 16S rDNA carried out on 45 representative isolates, 5 genotypes were obtained corresponding to the species Rhizobium etli, R. tropici, R. gallicum, R. leguminosarum and Sinorhizobium meliloti. The most abundant species were R. etli and R. tropici (61% and 24%, respectively). A high intraspecific diversity was observed among the R. etli isolates, while the R. tropici group was homogeneous. Most of the rhizobia studied belong to species known to nodulate common bean, while 2 species were unconventional microsymbionts: R. leguminosarum biovar viciae and S. meliloti. Our results, especially the nodulation promiscuity of common bean and the relation between the predominance of some species of rhizobia in particular soils and the salt content of these soils, indicate that there is a real need for a better understanding of the distribution of common bean rhizobia species in the soils of Morocco before any inoculation attempt.