DLTS investigation of acceptor states in P3MeT Schottky barrier diodes

Deep Level Transient Spectroscopy (DLTS) has been used to investigate hole traps in the depletion region of Schottky barrier diodes formed from electropolymerised poly(3-methylthiophene). The capacitance transients appear to be composed of a fast and a slow component. Analysis of the slower component using the ''rate window'' technique yields isochronal differential capacitance curves that depend on temperature in the manner predicted by theory.

DLTS investigation of acceptor states in P3MeT Schottky barrier diodes

Deep Level Transient Spectroscopy (DLTS) has been used to investigate hole traps in the depletion region of Schottky barrier diodes formed from electropolymerised poly(3-methylthiophene). The capacitance transients appear to be composed of a fast and a slow component. Analysis of the slower component using the ''rate window'' technique yields isochronal differential capacitance curves that depend on temperature in the manner predicted by theory.

Phase I dose-finding study of cabazitaxel administered weekly in patients with advanced solid tumours.

BACKGROUND Cabazitaxel is approved in patients with metastatic hormone-refractory prostate cancer previously treated with a docetaxel-containing regimen. This study evaluated a weekly cabazitaxel dosing regimen. Primary objectives were to report dose-limiting toxicities (DLTs) and to determine the maximum tolerated dose (MTD). Efficacy, safety and pharmacokinetics were secondary objectives. METHODS Cabazitaxel was administered weekly (1-hour intravenous infusion at 1.5-12 mg/m2 doses) for the first 4 weeks of a 5-week cycle in patients with solid tumours. Monitoring of DLTs was used to determine the MTD and the recommended weekly dose. RESULTS Thirty-one patients were enrolled. Two of six patients experienced DLTs at 12 mg/m2, which was declared the MTD. Gastrointestinal disorders were the most common adverse event. Eight patients developed neutropenia (three ≥ Grade 3); one occurrence of febrile neutropenia was reported. There were two partial responses (in breast cancer) and 13 patients had stable disease (median duration of 3.3 months). Increases in Cmax and AUC0-t were dose proportional for the 6-12 mg/m2 doses. CONCLUSION The MTD of weekly cabazitaxel was 12 mg/m2 and the recommended weekly dose was 10 mg/m2. The observed safety profile and antitumour activity of cabazitaxel were consistent with those observed with other taxanes in similar dosing regimens. TRIAL REGISTRATION The study was registered with ClinicalTrials.gov as NCT01755390.

An European Organisation for Research and Treatment of Cancer phase I study of lapatinib and docetaxel as neoadjuvant treatment for Human Epidermal Growth Factor Receptor 2 (HER2) positive locally-advanced/inflammatory or large operable breast cancer.

BACKGROUND: Lapatinib is an effective anti-HER2 therapy in advanced breast cancer and docetaxel is one of the most active agents in breast cancer. Combining these agents in pre-treated patients with metastatic disease had previously proved challenging, so the primary objective of this study aimed to determine the maximum tolerated dose (MTD) in treatment-naive patients, by identifying acute dose-limiting toxicities (DLT) during cycle 1 in the first part of a phases 1-2 neoadjuvant European Organisation for Research and Treatment of Cancer (EORTC) trial. PATIENTS AND METHODS: Patients with large operable or locally-advanced HER2 positive breast cancer were treated with continuous lapatinib, and docetaxel every 21days for 4 cycles. Dose levels (DLs) were: 1000/75, 1250/75, 1000/85, 1250/85, 1000/100 and 1250/100 (mg/day)/(mg/m(2)). RESULTS: Twenty-one patients were included. Two DLTs occurred at dose level 5 (1000/100); one grade 4 neutropenia ⩾7days and one febrile neutropenia. A further 3 patients were therefore treated at the same dose with prophylactic granulocyte-colony stimulating factor (G-CSF), and 3 patients at dose level 6. No further DLTs were observed. CONCLUSIONS: Our recommended dose for phase II is lapatinib 1000mg/day and docetaxel 100mg/m(2) with G-CSF in HER2 positive non-metastatic breast cancer. The dose of lapatinib should have been 1250mg/day but we were mindful of the high rate of treatment discontinuation in GeparQuinto with lapatinib 1250mg/day combined with docetaxel. No grade 3-4 diarrhoea was observed. Pharmacodynamics analysis suggests that concomitant medications altering P-glycoprotein activity (in addition to lapatinib) can modify toxicity, including non-haematological toxicities. This needs verification in larger trials, where it may contribute to understanding the sources of variability in clinical toxicity and treatment discontinuation.

Rituximab, bendamustine, and lenalidomide in patients with aggressive B cell lymphoma not eligible for high-dose chemotherapy or anthracycline-based therapy: phase I results of the SAKK 38/08 trial.

This phase I trial was designed to develop a new effective and well-tolerated regimen for patients with aggressive B cell lymphoma not eligible for front-line anthracycline-based chemotherapy or aggressive second-line treatment strategies. The combination of rituximab (375 mg/m(2) on day 1), bendamustine (70 mg/m(2) on days 1 and 2), and lenalidomide was tested with a dose escalation of lenalidomide at three dose levels (10, 15, or 20 mg/day) using a 3 + 3 design. Courses were repeated every 4 weeks. The recommended dose was defined as one level below the dose level identifying ≥2/6 patients with a dose-limiting toxicity (DLT) during the first cycle. Thirteen patients were eligible for analysis. Median age was 77 years. WHO performance status was 0 or 1 in 12 patients. The Charlson Comorbidity Index showed relevant comorbidities in all patients. Two DLTs occurred at the second dose level (15 mg/day) within the first cycle: one patient had prolonged grade 3 neutropenia, and one patient experienced grade 4 cardiac adverse event (myocardial infarction). Additional grade 3 and 4 toxicities were as follows: neutropenia (31 %), thrombocytopenia (23 %), cardiac toxicity (31 %), fatigue (15 %), and rash (15 %). The dose of lenalidomide of 10 mg/day was recommended for a subsequent phase II in combination with rituximab 375 mg/m(2) on day 1 and bendamustine 70 mg/m(2) on days 1 and 2.

EORTC 26083 phase I/II trial of dasatinib in combination with CCNU in patients with recurrent glioblastoma.

The treatment of patients with recurrent glioblastoma remains a major oncologic problem, with median survival after progression of 7-9 months. To determine the maximum tolerated dose and dose-limiting toxicity (DLT), the combination of dasatinib and cyclonexyl-chloroethyl-nitrosourea (CCNU) was investigated in this setting. The study was designed as multicenter, randomized phase II trial, preceded by a lead-in safety phase. The safety component reported here, which also investigated pharmacokinetics and preliminary clinical activity, required expansion and is therefore considered a phase I part to establish a recommended dosing regimen of the combination of CCNU (90-110 mg/m(2)) and dasatinib (100-200 mg daily). Overall, 28 patients were screened, and 26 patients were enrolled. Five dose levels were explored. DLTs, mainly myelosuppression, occurred in 10 patients. Grade 3 or 4 neutropenia was recorded in 7 patients (26.9%) and thrombocytopenia in 11 patients (42.3%). No significant effect of CCNU coadministration on dasatinib pharmacokinetics was found. Median progression-free survival (PFS) was 1.35 months (95% confidence interval: 1.2-1.4) and 6-month PFS was 7.7%. In this phase I study of recurrent glioblastoma patients, the combination of CCNU and dasatinib showed significant hematological toxicities and led to suboptimal exposure to both agents.

Phase I trial combining temozolomide plus lapatinib for the treatment of brain metastases in patients with HER2-positive metastatic breast cancer: the LAPTEM trial.

BACKGROUND: Brain metastases (BMs) pose a clinical challenge in breast cancer (BC). Lapatinib or temozolomide showed activity in BM. Our study assessed the combination of both drugs as treatment for patients with HER2-positive BC and BM. METHODS: Eighteen patients were enrolled, with sixteen of them having recurrent or progressive BM. Any type of previous therapy was allowed, and disease was assessed by gadolinium (Gd)-enhanced magnetic resonance imaging (MRI). The primary end points were the evaluation of the dose-limiting toxicities (DLTs) and the determination of the maximum-tolerated dose (MTD). The secondary end points included objective response rate, clinical benefit and duration of response. RESULTS: The lapatinib-temozolomide regimen showed a favorable toxicity profile because the MTD could not be reached. The most common adverse events (AEs) were fatigue, diarrhea and constipation. Disease stabilization was achieved in 10 out of 15 assessable patients. The estimated median survival time for the 16 patients with BM reached 10.94 months (95% CI: 1.09-20.79), whereas the median progression-free survival time was 2.60 months [95% confidence interval (CI): 1.82-3.37]. CONCLUSIONS: The lapatinib-temozolomide combination is well tolerated. Preliminary evidence of clinical activity was observed in a heavily pretreated population, as indicated by the volumetric reductions occurring in brain lesions.

Lapatax: Safety profile of neoadjuvant lapatinib combined with docetaxel in Her 2/neu overexpressing breast cancer - EORTC protocol 10054

Objective: To assess the safety/tolerability of the combination lapatinib (L) and docetaxel (D) in patients with Her 2/neu overexpressing breast cancer (BC). This study is important as it will define how to deliver lapatinib with taxotere, a highly active drug in breast cancer. Patients and Methods: Female patients (pts) with locally advanced, inflammatory or large operable BC were treated with escalating doses of L from 1000 to 1250 mg/day, in combination with D given IV every 21 days at doses ranging from 75 to 100 mg/m2 for 4 cycles. At least 3 pts were treated at each dose level. The definition of dose limiting toxicity (DLT) is based on the toxicity assessed at cycle 1 as follows: any grade 3−4 non hematological toxicity, ANC < 0.5 G/L lasting for 7 days or more, febrile neutropenia or thrombocytopenia <25 G/L. GCSF was not permitted as primary prophylaxis. Core biopsies were mandatory at baseline and after cycle 4. Pharmcokinetic (PK) samples were collected on day 1 of cycles 1 and 2. Results: To date, 18 pts with a median age of 53 years (range 36−65) have been enrolled at 5 Dose Levels (DLs). The toxicity profile for 18 patients (68 documented cycles) is summarized below. At DL5 (1000/100), 2 pts had DLTs (neutropenia grade 4 _7 days and febrile neutropenia), and 3 additional pts were enrolled with primary prophylactic G-CSF. As expected, the safety profile improved and the dose escalation will continue with prophylactic G-CSF to investigate DL6 (1250/100). These findings are consistent with published Phase I data for this combination [1]. N= 18 patients n (%) Grade 1 Grade 2 Grade 3 Grade 4 neutropenia 1 (6) 3 (17) 13 (72) febrile neutropenia 2 (11) fatigue 8 (44) 7 (39) diarrhoea 9 (50) 3 (17) pain: joint/muscle/other 5 (28)/4 (22)/3 (17) 4 (22)/4 (22)/3 (17) 0/0/1 (6) constipation 2 (11) 3 (17) 1 (6) elevated transaminases SGPT/SGOT 7 (39)/5 (28) Conclusions: The main toxicity of the L + D combination is haematological and was reached at DL5 (1000/100), without primary GCSF. An additional DL6 with primary prophylactic GCSF is being investigated (1250/100). PK data will be presented at the meeting plus the recommended dose for phase II studies.

MOLECULAR MECHANISMS OF A ROOT SYSTEM TO SOIL ADAPTATION

Contrairement aux animaux, les plantes sont des organismes sessiles qui ne possèdent pas de mécanismes de fuite quand les conditions environnementales ne sont plus optimales. Les plantes sont physiquement ancrées à l'endroit où elles ont germées et aux conditions environnementales qui parfois peuvent être extrêmes. Les possibilités d'acclimatation de différentes espèces, parfois même de groupes de plantes au sein d'une même espèce, peuvent varier mais repose sur une adaptation génétique de la plante. L'adaptation est un long processus qui repose sur l'apparition spontanée de mutations génétiques, leur mise à l'épreuve face aux conditions environnementales, et dans le cas où la mutation a un impact positif sur la survie dans cet habitat particulier, elle sera maintenue dans une population donnée de plantes. De telles populations, appelées écotypes, sont le matériel de départ pour la découverte de gènes qui induisent un bénéfice pour la plante dans un environnement donné. La plante la plus étudiée en biologie moléculaire est Arabidopsis thaliana, l'arabette des prés. Dans une étude précédente, les racines d'écotypes naturels d'Arabidopsis ont été comparées et un écotype, Uk-1, avait le système racinaire le plus particulier. Cet écotype possède des racines beaucoup plus courtes et plus ramifiées que tous les autres écotypes. Des analyses plus poussées ont montré qu'une seule mutation dans un gène était la cause de ce phénotype, le gène BREVIS RADIX (BRX), mot latin signifiant 'racine courte'. Bien que l'on connaisse le gène BRX, on connaît finalement peu de choses sur son importance adaptative. Dans cette étude, nous avons montré que la mutation dans le gène BRX rend la plante plus résistante aux sols acides. Dans l'optique de mieux comprendre cette valeur adaptative du mutant brx, nous avons analysé dans quels tissus le gène BRX jouait un rôle important. Nous avons pu mettre en évidence que BRX est important pour le développement du protophloème. Le protophloème est un élément du système vasculaire de la plante. En général, les plantes supérieures possèdent deux systèmes de transport à longue distance. L'un d'eux, appelé xylème, transporte l'eau et les nutriments absorbés du sol par les racines vers les feuilles. Les feuilles sont le siège du processus de photosynthèse au cours duquel sont produits des sucres qui devront être distribués partout dans les autres parties de la plante. Le tissu cellulaire chargé de livrer les produits de la photosynthèse, ainsi que les régulateurs de croissance, est le phloème. Ce dernier regroupe le métaphloème et le protophloème. Le protophloème est essentiel pour la livraison des sucres synthétisés ainsi que des signaux de croissance aux pointes des racines, centres organogéniques responsables de la production de nouvelles cellules durant la phase de croissance de la racine. La structure du protophloème peut être décrite comme des tubes continus, vides et résistants, faits de cellules spécialisées qui permettent un transport efficace et rapide. Nous avons montré que dans les mutants brx ces canaux de transports sont discontinus car certaines cellules n'ont pas terminé leur cycle de différenciation. Ces cellules obstruent le conduit ce qui fait que les sucres et les signaux de croissance, comme l'auxine, ne peuvent plus être transportés aux méristèmes. En conséquence, la prolifération de l'activité des méristèmes est compromise, ce qui explique les racines courtes. Au lieu d'être délivré aux méristèmes, l'auxine se concentre en amont des méristèmes où cela provoque l'apparition de nouvelles racines branchées et, très probablement, l'activation des pompes à protons. Sur des sols acides, la concentration en ion H+ est très élevée. Ces ions entrent dans les cellules de la racine par diffusion et perturbent notablement la croissance des racines et de la plante en général. Si les cellules de la racine possédaient des pompes à protons hyperactives, elles seraient capable d'évacuer le surplus d'ions H+ en dehors de la cellule, ce qui leur assurerait de meilleures chances de survie sur sols acides. De fait, le mutant brx est capable d'acidifier le milieu de culture dans lequel il est cultivé plus efficacement que la plante sauvage. Ce mutant est également capable de donner plus de progéniture sur ce type de milieu de croissance que les plantes sauvages. Finalement, nous avons trouvé d'autres mutants brx en milieu naturel poussant sur sols acides, ce qui suggère fortement que la mutation du gène BRX est une des causes de l'adaptation aux sols acides. -- Plants as sessile organisms have developed different mechanisms to cope with the complex environmental conditions in which they live. Adaptation is the process through which traits evolve by natural selection to functionally improve in a given environmental context. An adaptation to the environment is characterized by the genetic changes in the entire populations that have been fixed by natural selection over many generations. BREVIS RADIX (BRX) gene was found through natural Arabidopsis accessions screen and was characterized as a root growth regulator since loss-of-function mutants exhibit arrested post-embryonic primary root growth in addition to a more branched root system. Although brx loss-of-function causes a complete alteration in root architecture, BRX activity is only required in the root vasculature, in particular in protophloem cell file. Protophloem is a part of the phloem transport network and is responsible for delivery of photo-assimilates and growth regulators, coming from the shoot through mature phloem component - metaphloem, to the all plant primary meristems. In order to perform its function, protophloem is the first cell file to differentiate within the root meristem. During this process, protophloem cells undergo a partial programmed cell death, during which they build a thicker cell wall, degrade nucleus and tonoplast while plasma membrane stays functional. Interestingly, protophloem cells enter elongation process only after differentiation into sieve elements is completed. Here we show that brx mutants fail to differentiate protophloem cell file properly, a phenotype that can be distinguished by a presence of a "gap" cells, non-differentiated cells between two flanking differentiated cells. Discontinuity of protophloem differentiation in brx mutants is considered to be a consequence of local hyperactivity of CLAVATA3/EMBRYO SURROUNDING REGION 45 (CLE45) - BARELY ANY MERISTEM 3 (BAM3) signaling module. Interestingly, a CLE45 activity, most probably at the level of receptor binding, can be modulated by apoplastic pH. Altogether, our results imply that the activity of proton pumps, expressed in non-differentiated cells of protophloem, must be maintained under certain threshold, otherwise CLE45-BAM3 signaling pathway will be stimulated and in turn protophloem will not differentiate. Based on vacuolar morphology, a premature cell wall acidification in brx mutants stochastically prevents the protophloem differentiation. Only after protophloem differentiates, proton pumps can be activated in order to acidify apoplast and to support enucleated protophloem multifold elongation driven by surrounding cells growth. Finally, the protophloem differentiation failure would result in an auxin "traffic jam" in the upper parts of the root, created from the phloem-transported auxin that cannot be efficiently delivered to the meristem. Physiologically, auxin "leakage" from the plant vasculature network could have various consequences, since auxin is involved in the regulation of almost every aspect of plant growth and development. Thus, given that auxin stimulates lateral roots initiation and growth, this scenario explains more branched brx root system. Nevertheless, auxin is considered to activate plasma membrane proton pumps. Along with this, it has been shown that brx mutants acidify media much more than the wild type plants do, a trait that was proposed as an adaptive feature of naturally occurring brx null alleles in Arabidopsis populations found on acidic soils. Additionally, in our study we found that most of accessions originally collected from acidic sampling sites exhibit hypersensitivity to CLE45 treatment. This implies that adaptation of plants to acidic soil involves a positive selection pressure against upstream negative regulators of CLE45-BAM3 signaling, such as BRX. Perspective analysis of these accessions would provide more profound understanding of molecular mechanisms underlying plant adaptation to acidic soils. All these results are suggesting that targeting of the factors that affect protophloem differentiation is a good strategy of natural selection to change the root architecture and to develop an adaptation to a certain environment. -- Les plantes comme organismes sessiles ont développé différents mécanismes pour s'adapter aux conditions environnementales complexes dans lesquelles elles vivent. L'adaptation est le processus par lequel des traits vont évoluer via la sélection naturelle vers une amélioration fonctionnelle dans un contexte environnemental donné. Une adaptation à l'environnement est caractérisée par des changements génétiques dans des populations entières qui ont été fixés par la sélection naturelle sur plusieurs générations. Le gène BREVIS RADIX (BRX) a été identifié dans le crible d'une collection d'accessions naturelles d'Arabidopsis et a été caractérisé comme un régulateur de la croissance racinaire étant donné que le mutant perte-de-fonction montre une croissance racinaire primaire arrêtée au stade post-embryonnaire et présente de plus un système racinaire plus ramifié que la plante sauvage. Bien que le mutant perte-de-fonction brx cause une altération complète de l'architecture racinaire, l'activité de BRX n'est requise que dans la vascularisation racinaire, en particulier au niveau du protophloème. Le protophloème est un composant du réseau de transport du phloème et est responsable du transit des dérivés de la photosynthèse ainsi que des régulateurs de croissances, venant de la partie aérienne par le phloème mature (métaphloème) vers tous les méristèmes primaires de la plante. Pour pouvoir réaliser sa fonction, le protophloème est la première file de cellules à se différencier à l'intérieur du méristème de la racine. Pendant ce processus, les cellules du protophloème subissent une mort cellulaire programmée partielle durant laquelle elles épaississent leur paroi cellulaire, dégradent le noyau et le tonoplaste tandis que la membrane plasmique demeure fonctionnelle. De manière intéressante, les cellules du protophloème entament le processus d'allongement seulement après que la différenciation en tubes criblés soit complète. Ce travail montre que le mutant brx est incapable de mener à bien la différenciation de la file de cellules du protophloème, phénotype qui peut être visualisé par la présence de cellules 'trous', de cellules non différenciées entourées de deux cellules différenciées. La discontinuité de la différenciation du phloème dans le mutant brx est considérée comme la conséquence de l'hyperactivité localisée du module de signalisation CLA VA TA3/EMBRYO SURROUNDING REGION 45 (CLE45) - BARELY ANY MERISTEM 3 (BAM3). De manière intéressante, l'activité de CLE45, très probablement au niveau de la liaison avec le récepteur, peut être modulé par le pH apoplastique. Pris ensemble, nos résultats impliquent que l'activité des pompes à protons, actives dans les cellules non différenciées du protophloème, doit être maintenue en dessous d'un certain seuil autrement la cascade de signalisation CLE45-BAM3 serait stimulée, en conséquence de quoi le protophloème ne pourrait se différencier. D'après la morphologie vacuolaire, une acidification prématurée de la paroi cellulaire dans le mutant brx empêche la différenciation du protophloème de manière stochastique. Une fois que le protophloème se différencie, les pompes à protons peuvent alors être activées afin d'acidifier l'apoplaste et ainsi faciliter l'allongement des cellules énuclées du protophloème, entraînées par la croissance des cellules environnantes. Finalement, la différenciation défectueuse du protophloème produit une accumulation d'auxine dans la partie supérieure de la racine car le phloème ne peut plus acheminer efficacement l'auxine au méristème. Physiologiquement, la 'fuite' d'auxine à partir du réseau vasculaire de la plante peut avoir des conséquences variées puisque l'auxine est impliquée dans la régulation de la majorité des aspects de la croissance et développement de la plante. Etant donné que l'auxine stimule l'initiation et développement des racines latérales, ce scénario pourrait expliquer le système racinaire plus ramifié du mutant brx. En plus, l'auxine est considérée comme un activateur des pompes à protons. Par ailleurs, nous avons montré que les mutants brx ont la capacité d'acidifier le milieu plus efficacement que les plantes sauvages, une caractéristique des populations sauvages <¥Arabidopsis poussant sur des sols acides et contenant les allèles délétés brx. De plus, dans nos résultats nous avons mis en évidence que la plupart des accessions collectées originellement sur des sites acidophiles montre une hypersensibilité au traitement par CLE45. Ceci implique que l'adaptation des plantes aux sols acides repose sur la pression de sélection positive à rencontre des régulateurs négatifs de CLE45- BAM3, situés en amont de la cascade, tel le produit du gène BRX. Les analyses de ces accessions pourraient aboutir à une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires responsables de l'adaptation des plantes aux sols acides. Tous nos résultats suggèrent que le ciblage des facteurs affectant la différenciation du protophloème serait une stratégie gagnante dans la sélection naturelle pour changer l'architecture de la racine et ainsi s'adapter efficacement à un nouvel environnement.

Identification de déterminants impliqués dans la différenciation des cellules souches embryonnaires

Les cellules souches ont attiré l’attention du public ces dernières années, grâce non-seulement à leur utilisation comme thérapies visant à s’attaquer à certains types de cancers, mais aussi en relation avec leur potentiel dans le domaine de la médecine regénérative. Il est établi que le destin cellulaire des cellules souches embryonnaires (ESC) est régulé de façon intensive par un groupe de facteur clés agissant sur leur pluripotence. Il est néanmoins envisageable que certains déterminants influençant l’auto-renouvellement et la différenciation de ces cellules soient toujours inconnus. Afin de tester cette hypothèse, nous avons généré, en utilisant une méthode par infections virales, une collection de ESC contenant des délétions chromosomales chevauchantes que nous avons baptisée DelES (Deletion in ES cells). Cette librairie contient plus de 1000 clones indépendants dont les régions délétées couvrent environ 25% du génome murin. À l’aide de cette ressource, nous avons conduit un criblage de formation de corps embryoïdes (EB), démontrant que plusieurs clones délétés avaient un phénotype de différenciation anormal. Nos études de complémentation sur un groupe de clones ont par la suite permis l’identification de Rps14 - un gène codant pour une protéine ribosomale (RP) comme étant haploinsuffisant pour la formation de EB. Dans un deuxième temps, l’analyse approfondie des résultats de notre crible a permis d’identifier un groupe de gènes codants pour des RP qui semblent essentiels pour la différenciation des ESC, mais dispensables pour leur auto-renouvellement. De manière intéressante, les phénotypes anormaux de formation en EB les plus marqués sont associés à des délétions de RP qui se retrouvent au site de sortie des ARN messagers (ARNm) du ribosome, soit Rps5, Rps14 et Rps28. Étonnament, alors qu’un débalancement des RP conduit généralement à une réponse de type p53, l’haploinsuffisance de ces trois gènes ne peut être renversée par une simple réduction des niveaux d’expression de ce gène suppresseur de tumeurs. Finalement, nos études de profilage polysomal et de séquençage à haut-débit montrent une signature spécifique de gènes liés au mésoderme chez un clone hétérozygote pour Rps5, suggérant ainsi une explication au phénotype de différenciation p53-indépendant identifié chez ces ESC. Nos travaux rapportent donc la création d’une ressource intéressante de génomique fonctionnelle qui a permis de mettre à jour le rôle essentiel que jouent les RP dans le processus de formation de EB. Nos résultats permettent aussi de documenter une réponse p53-indépendante suite à un débalancement de RP dans un contexte opposant l’auto-renouvellement et la différenciation des ESC.

Establishing a Robust In Vitro Embryonic Stem Cell Differentiation Assay to Monitor the Hematopoietic Potential of DELES Clones

Afin d’effectuer des études fonctionnelles sur le génome de la souris, notre laboratoire a généré une bibliothèque de clones de cellules souches embryonnaires (ESC) présentant des suppressions chromosomiques chevauchantes aléatoires – la bibliothèque DELES. Cette bibliothèque contient des délétions couvrant environ 25% du génome murin. Dans le laboratoire, nous comptons identifier de nouveaux déterminants du destin des cellules hématopoïétiques en utilisant cet outil. Un crible primaire utilisant la benzidine pour démontrer la présence d'hémoglobine dans des corps embryoïdes (EBS) a permis d’identifier plusieurs clones délétés présentant un phénotype hématopoïétique anormal. Comme cet essai ne vérifie que la présence d'hémoglobine, le but de mon projet est d'établir un essai in vitro de différenciation des ESC permettant de mesurer le potentiel hématopoïétique de clones DELES. Mon hypothèse est que l’essai de différenciation hématopoïétique publié par le Dr Keller peut être importé dans notre laboratoire et utilisé pour étudier l'engagement hématopoïétique des clones DELES. À l’aide d’essais de RT-QPCR et de FACS, j’ai pu contrôler la cinétique de différenciation hématopoïétique en suivant l’expression des gènes hématopoïétiques et des marqueurs de surface comme CD41, c-kit, RUNX1, GATA2, CD45, β-globine 1 et TER-119. Cet essai sera utilisé pour valider le potentiel hématopoïétique des clones DELES candidats identifiés dans le crible principal. Mon projet secondaire vise à utiliser la même stratégie rétro-virale a base de Cre-loxP utilisée pour générer la bibliothèque DELES pour générer une bibliothèque de cellules KBM-7 contenant des suppressions chromosomiques chevauchantes. Mon but ici est de tester si la lignée cellulaire leuémique humaine presque haploïde KBM-7 peut être exploitée en utilisant l'approche DELES pour créer cette bibliothèque. La bibliothèque de clones KBM-7 servira à définir les activités moléculaires de drogues anti-leucémiques potentielless que nous avons identifiées dans le laboratoire parce qu’elles inhibent la croissance cellulaire dans plusieurs échantillons de leucémie myéloïde aiguë dérivés de patients. Elle me permettra également d'identifier les voies de signalisation moléculaires qui, lorsque génétiquement perturbées, peuvent conférer une résistance à ces drogues.

Defeitos responsáveis pela isolação de GaAs irradiado com prótons

A Espectroscopia de Transientes de Níveis Profundos (DLTS – Deep Level Transient Spectroscopy) foi, detalhadamente, descrita e analisada. O processo de isolação por implantação em GaAs foi estudado. Sua dependência com a sub-rede, do As ou do Ga, em que o dopante é ativado foi investigada para material tipo-p. Semelhantes doses de implantação de prótons foram necessárias para se tornar semi-isolantes camadas de GaAs dopadas com C ou com Mg possuindo a mesma concentração de pico de lacunas livres. A estabilidade térmica da isolação nestas amostras foi medida. Diferenças no comportamento de recozimento destas apontaram a formação, provavelmente durante a referida etapa térmica, de uma estrutura diferente de defeitos em cada caso. Medidas de DLTS foram realizadas em amostras de GaAs tipo-n e tipo-p implantadas com prótons de 600 keV. A estrutura de picos observada apresentou, além de boa parte dos defeitos introduzidos para o caso de irradiação com elétrons, defeitos mais complexos. Um novo nível, com energia superior em ~0,64 eV ao valor correspondente ao topo da banda de valência, foi identificado nos espectros medidos em material tipo-p. A variação da concentração dos centros de captura introduzidos com diferentes etapas de recozimento foi estudada e comparada com o comportamento previamente observado para a resistência de folha em camadas de GaAs implantadas com prótons. Simulações foram feitas, indicando que a interpretação adotada anteriormente, associando o processo de isolação diretamente à formação de defeitos relacionados a anti-sítios, pode não estar completa.

4H silicon carbide particle detectors: study of the defects induced by high energy neutron irradiation

During the last decade advances in the field of sensor design and improved base materials have pushed the radiation hardness of the current silicon detector technology to impressive performance. It should allow operation of the tracking systems of the Large Hadron Collider (LHC) experiments at nominal luminosity (1034 cm-2s-1) for about 10 years. The current silicon detectors are unable to cope with such an environment. Silicon carbide (SiC), which has recently been recognized as potentially radiation hard, is now studied. In this work it was analyzed the effect of high energy neutron irradiation on 4H-SiC particle detectors. Schottky and junction particle detectors were irradiated with 1 MeV neutrons up to fluence of 1016 cm-2. It is well known that the degradation of the detectors with irradiation, independently of the structure used for their realization, is caused by lattice defects, like creation of point-like defect, dopant deactivation and dead layer formation and that a crucial aspect for the understanding of the defect kinetics at a microscopic level is the correct identification of the crystal defects in terms of their electrical activity. In order to clarify the defect kinetic it were carried out a thermal transient spectroscopy (DLTS and PICTS) analysis of different samples irradiated at increasing fluences. The defect evolution was correlated with the transport properties of the irradiated detector, always comparing with the un-irradiated one. The charge collection efficiency degradation of Schottky detectors induced by neutron irradiation was related to the increasing concentration of defects as function of the neutron fluence.

Studio delle proprieta ottiche ed elettriche di dispositivi led a confinamento quantico

In questa tesi viene descritto il funzionamento delle sorgenti di luce LED (Light Emitting Diode) a confinamento quantico, che rappresentano la nuova frontiera dell'illuminazione ad alta efficienza e durata. Nei capitoli introduttivi è descritta brevemente la storia dei LEDs dalla loro invenzione agli sviluppi più recenti. Il funzionamento di tali dispositivi fotonici è spiegato a partire dal concetto di sorgente di luce per elettroluminescenza, con particolare riferimento alle eterostrutture a confinamento quantico bidimensionale (quantum wells). I capitoli centrali riguardano i nitruri dei gruppi III-V, le cui caratteristiche e proprietà hanno permesso di fabbricare LEDs ad alta efficienza e ampio spettro di emissione, soprattutto in relazione al fatto che i LEDs a nitruri dei gruppi III-V emettono luce anche in presenza di alte densità di difetti estesi, nello specifico dislocazioni. I capitoli successivi sono dedicati alla presentazione del lavoro sperimentale svolto, che riguarda la caratterizzazione elettrica, ottica e strutturale di LEDs a confinamento quantico basati su nitruri del gruppo III-V GaN e InGaN, cresciuti nei laboratori di Cambridge dal Center for Gallium Nitride. Lo studio ha come obiettivo finale il confronto dei risultati ottenuti su LEDs con la medesima struttura epitassiale, ma differente densità di dislocazioni, allo scopo di comprendere meglio il ruolo che tali difetti estesi ricoprono nella determinazione dell'effcienza delle sorgenti di luce LED. L’ultimo capitolo riguarda la diffrazione a raggi X dal punto di vista teorico, con particolare attenzione ai metodi di valutazioni dello strain reticolare nei wafer a nitruri, dal quale dipende la densità di dislocazioni.

Studio di livelli profondi in nanofili di silicio

Si riassumono le principali proprietà e applicazioni di dispositivi basati su nanofili. Si descrivono le tecniche utilizzate in laboratorio per analizzare livelli profondi in nanofili di Silicio con particolare attenzione ai concetti teorici alla base di questi metodi.