Quand la politique et la génétique se rencontrent : comment le public interprète-t-il la recherche?

L’objectif général de cette thèse de doctorat est de mieux comprendre comment le public interprète les nouvelles scientifiques portant sur la génétique humaine, plus précisément les nouvelles portant sur la génétique des comportements et celles portant sur la génétique des groupes raciaux. L’ouvrage prend la forme d’une thèse par article. Le Chapitre 1 introduit le lecteur aux buts et aux pratiques de la vulgarisation scientifique, présente un sommaire de la recherche sur les effets des médias, résume les principaux travaux produits par le champ de la génopolitique, et définit la structure des croyances du public à l’égard de l’influence de la génétique sur les traits humains. Le Chapitre 2 présente les fondements de la méthode expérimentale, il en explique les atouts et il offre des exemples de différents types de devis expérimentaux utilisés en science politique. Toutes les recherches produites dans cette thèse reposent au moins en partie sur cette méthode. Le Chapitre 3 présente les résultats d’une expérience de sondage qui vise à mesurer l’effet de la lecture d’une nouvelle à propos de la recherche en génétique des comportements sur des participants. L’étude démontre que le public interprète la nouvelle avec maladresse et tend à généraliser l’influence de la génétique à d’autres traits humains qui n’y sont pas mentionnés. J’avance l’hypothèse qu’un raccourci psychologique amplement documenté puisse expliquer cette réaction : l’heuristique de l’ancrage et de l’ajustement. Le Chapitre 4 présente lui aussi les résultats d’une expérience de sondage. L’étude consiste à manipuler certaines informations du contenu d’une nouvelle sur la génopolitique de manière à vérifier si certains éléments sont particulièrement susceptibles de mener à la généralisation hâtive mise en évidence dans le Chapitre 3. Les analyses suggèrent que cette généralisation est amplifiée lorsque la nouvelle présente de hauts niveaux d’héritabilité tirés d’études de jumeaux, ainsi que lorsqu’elle présente des travaux de génétique des populations visant à étudier l’origine des différences géographiques. Ce chapitre présente des recommandations à l’égard des journalistes scientifiques. Le Chapitre 5 s’intéresse à un aspect différent de la génétique humaine : celui de la génétique des races. L’objectif de cette recherche est de comprendre comment le public réagit aux travaux qui invalident l’idée selon laquelle les humains sont divisés en différentes races génétiquement distinctes. Les analyses de données transversales ainsi que les résultats d’une expérience de sondage convergent et indiquent que les conservateurs et les libéraux réagissent de manière diamétralement opposée à cette information. D’un côté, les libéraux acceptent le constat scientifique et réduisent leur impression que la génétique explique en partie les inégalités sociales; de l’autre, les conservateurs rejettent l’argument avec une intensité si forte que le rôle qu’ils attribuent aux différences génétiques s’en voit bonifié. Ces résultats sont interprétés à partir de la théorie du raisonnement motivé. Enfin, le Chapitre 6 résume les principaux constats, met en évidence les contributions que ma thèse apporte à la science politique et à la communication scientifique, et présente quelques pistes pour la recherche future.

Mémoire de source, propension à halluciner et psychose : identification de marqueurs cognitifs et cliniques chez une population à haut risque génétique

Les déficits cognitifs sont centraux à la psychose et sont observables plusieurs années avant le premier épisode psychotique. L’atteinte de la mémoire épisodique est fréquemment identifiée comme une des plus sévères, tant chez les patients qu’avant l’apparition de la pathologie chez des populations à risque. Chez les patients psychotiques, l’étude neuropsychologique des processus mnésiques a permis de mieux comprendre l’origine de cette atteinte. Une altération des processus de mémoire de source qui permettent d’associer un souvenir à son origine a ainsi été identifiée et a été associée aux symptômes positifs de psychose, principalement aux hallucinations. La mémoire de source de même que la présence de symptômes sous-cliniques n’ont pourtant jamais été investiguées avant l’apparition de la maladie chez une population à haut risque génétique de psychose (HRG). Or, leur étude permettrait de voir si les déficits en mémoire de source de même que le vécu d’expériences hallucinatoires sont associés à l’apparition de la psychose ou s’ils en précèdent l’émergence, constituant alors des indicateurs précoces de pathologie. Afin d’étudier cette question, trois principaux objectifs ont été poursuivis par la présente thèse : 1) caractériser le fonctionnement de la mémoire de source chez une population HRG afin d’observer si une atteinte de ce processus précède l’apparition de la maladie, 2) évaluer si des manifestations sous-cliniques de symptômes psychotiques, soit les expériences hallucinatoires, sont identifiables chez une population à risque et 3) investiguer si un lien est présent entre le fonctionnement en mémoire de source et la symptomatologie sous-clinique chez une population à risque, à l’instar de ce qui est documenté chez les patients. Les résultats de la thèse ont permis de démontrer que les HRG présentent une atteinte de la mémoire de source ciblée à l’attribution du contexte temporel des souvenirs, ainsi que des distorsions mnésiques qui se manifestent par une fragmentation des souvenirs et par une défaillance de la métacognition en mémoire. Il a également été observé que les expériences hallucinatoires sous-cliniques étaient plus fréquentes chez les HRG. Des associations ont été documentées entre certaines distorsions en mémoire et la propension à halluciner. Ces résultats permettent d’identifier de nouveaux indicateurs cliniques et cognitifs du risque de développer une psychose et permettent de soulever des hypothèses liant l’attribution de la source interne-externe de l’information et le développement de la maladie. Les implications empiriques, théoriques, méthodologiques et cliniques de la thèse sont discutées.

Criblage génétique à la recherche de nouveaux gènes essentiels influençant l’homéostasie des télomères chez Saccharomyces cerevisiae : Un défi de tailles.

Résumé : Chez la levure Saccharomyces cerevisiae, la régulation de la longueur des télomères témoigne de la compensation entre mécanismes d'érosion (exonucléases, réplication semi-conservative et résection), facteurs d’élongation (la télomérase, transcriptase inverse à l'action retrouvée dans 90% des cancers humains) et actions de diverses protéines de régulation télomérique spécifiques, conférant aux télomères leur caractère de « capuchon » protégeant les extrémités des chromosomes eucaryotes. Afin de savoir si les gènes impossibles à déléter, car essentiels à la survie cellulaire, jouent aussi un rôle sur l’homéostasie télomérique, j'ai réalisé un criblage génétique utilisant des mutants tet-off de la levure pour lesquels la sous-expression considérable d'un gène essentiel a été induite de façon conditionnelle. Ceci permet d’étudier les effets qui en résultent sur l’homéostasie des télomères. Au total, mon travail a traité plus de 662 gènes essentiels pour lesquels j'ai analysé le phénotype de longueur des télomères de manière qualitative par comparaison des télomères de souches mutées par rapport à ceux de souches de type sauvage. Puis, grâce à l’amélioration technique que j'ai mise au point, la quantification de la taille des répétitions télomériques de 300 de ces souches a déjà pu être précisément analysée. Il est notable que tous les gènes essentiels étudiés ici ont des effets très différents qui résultent en des chromosomes possédant des télomères de longueur très inégale. Pour près de 40% des mutants analysés, les tailles de télomères sont apparues critiquement différentes de celles normalement présentées par la levure, beaucoup de ces gènes essentiels étant impliqués dans des mécanismes affectant le cycle cellulaire, la réparation, etc. La majorité des gènes criblés apporte un important complément d’information dans une littérature presque inexistante sur les effets de gènes essentiels de la levure au niveau de la biologie des télomères. C’est le cas des mutations de YHR122W (montrant des télomères long) et YOR262W (télomères courts), deux gènes qui sont apparus d'après mes résultats nécessaires au maintien de l'homéostasie télomérique (prenant place dans un grand ensemble de gènes que j’ai dénommé gènes ETL pour Essential for Telomere Length Maintenance).

‘You’re a bad driver but I just made a mistake’ : attribution differences between the ‘victims’ and ‘perpetrators’ of scenario-based aggressive driving incidents

Driver aggression is an increasing concern for motorists, with some research suggesting that drivers who behave aggressively perceive their actions as justified by the poor driving of others. Thus attributions may play an important role in understanding driver aggression. A convenience sample of 193 drivers (aged 17-36) randomly assigned to two separate roles (‘perpetrators’ and ‘victims’) responded to eight scenarios of driver aggression. Drivers also completed the Aggression Questionnaire and Driving Anger Scale. Consistent with the actor-observer bias, ‘victims’ (or recipients) in this study were significantly more likely than ‘perpetrators’ (or instigators) to endorse inadequacies in the instigator’s driving skills as the cause of driver aggression. Instigators were significantly more likely attribute the depicted behaviours to external but temporary causes (lapses in judgement or errors) rather than stable causes. This suggests that instigators recognised drivers as responsible for driving aggressively but downplayed this somewhat in comparison to ‘victims’/recipients. Recipients and instigators agreed that the behaviours were examples of aggressive driving but instigators appeared to focus on the degree of intentionality of the driver in making their assessments while recipients appeared to focus on the safety implications. Contrary to expectations, instigators gave mean ratings of the emotional impact of driving aggression on recipients that were higher in all cases than the mean ratings given by the recipients. Drivers appear to perceive aggressive behaviours as modifiable, with the implication that interventions could appeal to drivers’ sense of self-efficacy to suggest strategies for overcoming plausible and modifiable attributions (e.g. lapses in judgement; errors) underpinning behaviours perceived as aggressive.

Extending the task of diarization to speaker attribution

In this paper we extend the concept of speaker annotation within a single-recording, or speaker diarization, to a collection wide approach we call speaker attribution. Accordingly, speaker attribution is the task of clustering expectantly homogenous intersession clusters obtained using diarization according to common cross-recording identities. The result of attribution is a collection of spoken audio across multiple recordings attributed to speaker identities. In this paper, an attribution system is proposed using mean-only MAP adaptation of a combined-gender UBM to model clusters from a perfect diarization system, as well as a JFA-based system with session variability compensation. The normalized cross-likelihood ratio is calculated for each pair of clusters to construct an attribution matrix and the complete linkage algorithm is employed to conduct clustering of the inter-session clusters. A matched cluster purity and coverage of 87.1% was obtained on the NIST 2008 SRE corpus.

Integrity, attribution, and exploitation : contractual and normative moral rights protection in open licensing

Over the last twenty years, the use of open content licenses has become increasingly and surprisingly popular. The use of such licences challenges the traditional incentive-based model of exclusive rights under copyright. Instead of providing a means to charge for the use of particular works, what seems important is mitigating against potential personal harm to the author and, in some cases, preventing non-consensual commercial exploitation. It is interesting in this context to observe the primacy of what are essentially moral rights over the exclusionary economic rights. The core elements of common open content licences map somewhat closely to continental conceptions of the moral rights of authorship. Most obviously, almost all free software and free culture licences require attribution of authorship. More interestingly, there is a tension between social norms developed in free software communities and those that have emerged in the creative arts over integrity and commercial exploitation. For programmers interested in free software, licence terms that prohibit commercial use or modification are almost completely inconsistent with the ideological and utilitarian values that underpin the movement. For those in the creative industries, on the other hand, non-commercial terms and, to a lesser extent, terms that prohibit all but verbatim distribution continue to play an extremely important role in the sharing of copyright material. While prohibitions on commercial use often serve an economic imperative, there is also a certain personal interest for many creators in avoiding harmful exploitation of their expression – an interest that has sometimes been recognised as forming a component of the moral right of integrity. One particular continental moral right – the right of withdrawal – is present neither in Australian law or in any of the common open content licences. Despite some marked differences, both free software and free culture participants are using contractual methods to articulate the norms of permissible sharing. Legal enforcement is rare and often prohibitively expensive, and the various communities accordingly rely upon shared understandings of acceptable behaviour. The licences that are commonly used represent a formalised expression of these community norms and provide the theoretically enforceable legal baseline that lends them legitimacy. The core terms of these licences are designed primarily to alleviate risk in sharing and minimise transaction costs in sharing and using copyright expression. Importantly, however, the range of available licences reflect different optional balances in the norms of creating and sharing material. Generally, it is possible to see that, stemming particularly from the US, open content licences are fundamentally important in providing a set of normatively accepted copyright balances that reflect the interests sought to be protected through moral rights regimes. As the cost of creation, distribution, storage, and processing of expression continues to fall towards zero, there are increasing incentives to adopt open content licences to facilitate wide distribution and reuse of creative expression. Thinking of these protocols not only as reducing transaction costs but of setting normative principles of participation assists in conceptualising the role of open content licences and the continuing tensions that permeate modern copyright law.

Attribution of words versus attribution of responsibilities : Academic plagiarism and university practice

This paper examines a case of academic plagiarism and the subsequent treatment of the issues across several academic institutions. It calls for academic leaders in universities to act on what constitutes a serious breach of standards, engendered in part by broader institutional norms and values promoting the need for publications in a ‘publish or perish’ environment. While universities often promote high-sounding ideals and would generally wish to be seen to uphold high academic standards, it is argued that silence and complicity surround the way in which instances of plagiarism in academic publications are often dealt with. Actions (and inaction) by academic leaders in universities in dealing with cases of academic plagiarism speak volumes in terms of the values academic institutions profess, and those they actually uphold. The paper prompts readers to consider the need for a more consistent and proactive stance on the part of their own institutions to exercise ethical leadership in identifying and addressing academic plagiarism when it occurs.

Speaker attribution of multiple telephone conversations using a complete-linkage clustering approach

In this paper we propose and evaluate a speaker attribution system using a complete-linkage clustering method. Speaker attribution refers to the annotation of a collection of spoken audio based on speaker identities. This can be achieved using diarization and speaker linking. The main challenge associated with attribution is achieving computational efficiency when dealing with large audio archives. Traditional agglomerative clustering methods with model merging and retraining are not feasible for this purpose. This has motivated the use of linkage clustering methods without retraining. We first propose a diarization system using complete-linkage clustering and show that it outperforms traditional agglomerative and single-linkage clustering based diarization systems with a relative improvement of 40% and 68%, respectively. We then propose a complete-linkage speaker linking system to achieve attribution and demonstrate a 26% relative improvement in attribution error rate (AER) over the single-linkage speaker linking approach.

Robust automatic speaker linking and attribution

This research makes a major contribution which enables efficient searching and indexing of large archives of spoken audio based on speaker identity. It introduces a novel technique dubbed as “speaker attribution” which is the task of automatically determining ‘who spoke when?’ in recordings and then automatically linking the unique speaker identities within each recording across multiple recordings. The outcome of the research will also have significant impact in improving the performance of automatic speech recognition systems through the extracted speaker identities.

Speaker attribution of Australian broadcast news data

Speaker attribution is the task of annotating a spoken audio archive based on speaker identities. This can be achieved using speaker diarization and speaker linking. In our previous work, we proposed an efficient attribution system, using complete-linkage clustering, for conducting attribution of large sets of two-speaker telephone data. In this paper, we build on our proposed approach to achieve a robust system, applicable to multiple recording domains. To do this, we first extend the diarization module of our system to accommodate multi-speaker (>2) recordings. We achieve this through using a robust cross-likelihood ratio (CLR) threshold stopping criterion for clustering, as opposed to the original stopping criterion of two speakers used for telephone data. We evaluate this baseline diarization module across a dataset of Australian broadcast news recordings, showing a significant lack of diarization accuracy without previous knowledge of the true number of speakers within a recording. We thus propose applying an additional pass of complete-linkage clustering to the diarization module, demonstrating an absolute improvement of 20% in diarization error rate (DER). We then evaluate our proposed multi-domain attribution system across the broadcast news data, demonstrating achievable attribution error rates (AER) as low as 17%.

Cybercrime attribution : an Eastern European case study

Phishing and related cybercrime is responsible for billions of dollars in losses annually. Gartner reported more than 5 million U.S. consumers lost money to phishing attacks in the 12 months ending in September 2008 (Gartner 2009). This paper asks whether the majority of organised phishing and related cybercrime originates in Eastern Europe rather than elsewhere such as China or the USA. The Russian “Mafiya” in particular has been popularised by the media and entertainment industries to the point where it can be hard to separate fact from fiction but we have endeavoured to look critically at the information available on this area to produce a survey. We take a particular focus on cybercrime from an Australian perspective, as Australia was one of the first places where Phishing attacks against Internet banks were seen. It is suspected these attacks came from Ukrainian spammers. The survey is built from case studies both where individuals from Eastern Europe have been charged with related crimes or unsolved cases where there is some nexus to Eastern Europe. It also uses some earlier work done looking at those early Phishing attacks, archival analysis of Phishing attacks in July 2006 and new work looking at correlation between the Corruption Perception Index, Internet penetration and tertiary education in Russia and the Ukraine. The value of this work is to inform and educate those charged with responding to cybercrime where a large part of the problem originates and try to understand why.

Humanizing the self: Moderators of the attribution of lesser humanness to others

Three studies investigated moderators of the tendency to attribute greater humanness to the self than to others, an interpersonal counterpart of outgroup infra-humanization. Study 1 demonstrated that this self-humanizing effect is reduced when the other is the focus of comparison. Study 2 showed that the effect is reduced when the other is individuated. Study 3 indicated that empathy does not moderate self-humanizing: Self-humanizing failed to correlate negatively with dispositional empathy or perspective-taking. Study 3 also indicated that abstract construal moderates the self-humanizing effect using a temporal comparison. Participants rated their future self, but not their past self, as less human than their present self. Studies 1 and 3 also showed that selfhumanizing is greater for undesirable traits: People may view their failings as “only human.” All findings were distinct from those attributable to self-enhancement. Self-humanizing may reflect a combination of egocentrism, focalism, abstract representation of others, and motivated processes.