Synthesis and structural analysis of the N-terminal domain of the thyroid hormone-binding protein transthyretin

Transthyretin (TTR) is a 55 kDa protein responsible for the transport of thyroid hormones and retinol in human serum. Misfolded forms of the protein are implicated in the amyloid diseases familial amyloidotic polyneuropathy and senile systemic amyloidosis. Its folding properties and stabilization by ligands are of current interest due to their importance in understanding and combating these diseases. To assist in such studies we developed a method for the solid phase synthesis of the monomeric unit of a TTR analogue and its folding to form a functional 55 kDa tetramer. The monomeric unit of the protein was chemically synthesized in three parts, comprising amino acid residues 151, 5499 and 102127, and ligated using chemoselective thioether ligation chemistry. The synthetic protein was folded and assembled to a tetrameric structure in the presence of the TTRs native ligand, thyroxine, as shown by gel filtration chromatography, native gel electrophoresis, TTR antibody recognition and thyroid hormone binding. In the current study the solution structure of the first of these fragment peptides, TTR(151) is examined to determine its intrinsic propensity to form beta-sheet structure, potentially involved in amyloid fibril formation by TTR. Despite the presence of extensive beta-structure in the native form of the protein, the Nterminal fragment adopts an essentially random coil conformation in solution.

Distribuições estatísticas, testes de ajuste e métodos para estimação de parâmetros na área da fiabilidade

Trabalho Final de Mestrado para obtenção do grau de Mestre em Engenharia Mecânica

Analysis of Forest Fires by means of Pseudo Phase Plane and Multidimensional Scaling Methods

Forest fires dynamics is often characterized by the absence of a characteristic length-scale, long range correlations in space and time, and long memory, which are features also associated with fractional order systems. In this paper a public domain forest fires catalogue, containing information of events for Portugal, covering the period from 1980 up to 2012, is tackled. The events are modelled as time series of Dirac impulses with amplitude proportional to the burnt area. The time series are viewed as the system output and are interpreted as a manifestation of the system dynamics. In the first phase we use the pseudo phase plane (PPP) technique to describe forest fires dynamics. In the second phase we use multidimensional scaling (MDS) visualization tools. The PPP allows the representation of forest fires dynamics in two-dimensional space, by taking time series representative of the phenomena. The MDS approach generates maps where objects that are perceived to be similar to each other are placed on the map forming clusters. The results are analysed in order to extract relationships among the data and to better understand forest fires behaviour.

Carregado de nichos culturais: estudo etnomusicológico de representações infantis de aprendizagem musical

Dissertação apresentada para cumprimento dos requisitos necessários à obtenção do grau de Mestre em Ciências Musicais – Etnomusicologia

Widespread occurrence of non-canonical transcription termination by human RNA polymerase III.

Human RNA polymerase (Pol) III-transcribed genes are thought to share a simple termination signal constituted by four or more consecutive thymidine residues in the coding DNA strand, just downstream of the RNA 3'-end sequence. We found that a large set of human tRNA genes (tDNAs) do not display any T(≥4) stretch within 50 bp of 3'-flanking region. In vitro analysis of tDNAs with a distanced T(≥4) revealed the existence of non-canonical terminators resembling degenerate T(≥5) elements, which ensure significant termination but at the same time allow for the production of Pol III read-through pre-tRNAs with unusually long 3' trailers. A panel of such non-canonical signals was found to direct transcription termination of unusual Pol III-synthesized viral pre-miRNA transcripts in gammaherpesvirus 68-infected cells. Genome-wide location analysis revealed that human Pol III tends to trespass into the 3'-flanking regions of tDNAs, as expected from extensive terminator read-through. The widespread occurrence of partial termination suggests that the Pol III primary transcriptome in mammals is unexpectedly enriched in 3'-trailer sequences with the potential to contribute novel functional ncRNAs.

Report on Ratna Corporation (Plaza Pantry) for the period January 1, 2006 through December 31, 2006

Report on Ratna Corporation (Plaza Pantry) for the period January 1, 2006 through December 31, 2006

L'Univers

1882/12/04 (Numéro 5499).

L'Écho de Paris

1899/06/16 (Numéro 5499).

Lettres de Jean Du Bellay et pièces relatives à ses ambassades en Angleterre et à Rome (1528-1535).

Contient : 1 « Articles d'instruction à messire Jehan Du Bellay, evesque de Baionne, ambassadeur pour le roy Françoys» Ier « vers le roy Henry » VIII « d'Angleterre, pour traicter une ligue deffensive entre eulx et le roy d'Escosse » Jacques V « y intervenant. 1528 » ; 2 « Double des oblations et offres proposées et ouvertes par le legat en Angleterre, pour parvenir au traicté de paix d'entre l'empereur Charles cinquiesme et le très chrestien roy Françoys, premier du nom, à luy envoyez et portez par le Sr de Morette, le XVIIIe avril 1528 » ; 3 « Memoyres contenans certaines remonstrances et persuasions conceues et proposées par les roy d'Angleterre et cardinal d'Yorth, legat, tendans à faire condescendre le roy très chrestien aux partis par eulx mis en avant pour estre proposez à l'empereur » Charles-Quint « et parvenir au traicté de paix d'entre luy et ledict roy très chrestien envoiés aussy par M. de Morette, le 18 avril 1528 » ; 4 « Discours et advis tenu, le moys de may 1528, entre monseigneur le legat d'Angleterre et le duc de Suffoch, sur le faict de la guerre qui se devoit entreprendre contre l'empereur, au cas que la paix ne se feist entre luy et le roy de France » ; 5 « Forme de traicté de tresve d'entre l'empereur, le roy très chrestien et le roy d'Angleterre, lequel traicté n'a sorty effect ny esté accordé. 14 may 1528 » ; 6 « Autre traicté de tresve, de la forme et manière que les Angloys et Flamens le consentoient, envoyé en France et depuis renvoyé en Angleterre, corrigé par monsieur le chancellier, en juing 1528 » ; 7 « Double du traicté de tresve, d'entre lesdits Srs empereur, roys très chrestien et d'Angleterre, corrigé au vray. Du XVe juing 1528 » ; 8 « Double de la ratiffication que devoit faire madame MARGUERITE, archiduchesse D'AUTRICHE, pour le faict de la tresve ». S. d ; 9 « Forme de ratiffication de ladicte tresve par l'evesque de Baionne JEHAN DU BELLAY ... au nom et comme ambassadeur et procureur dud. Sr roy très chrestien ». S. d ; 10 « Traicté faict par le Sr de Hargerye pour les biens de la duchesse douairière de Vendosme, comprinse au traicté de tresve cy devant ». 28 juillet 1528 ; 11 « Extraict d'un article des lettres du roy très chrestien envoyées à M. de Baionne, son ambassadeur vers le roy d'Angleterre ». S. d ; 12 « Memoyre au Sr de Morette, le secund voiage qu'il fut envoyé vers le roy d'Angleterre ». S. d ; 13 « Obligation d'une contribution accordée par le roy d'Angleterre au roy très chrestien de XXXIIm VIIIe XXVI escus... durant six moys, pour l'entretenement de la guerre contre l'empereur ». S. d. Acte de HENRI VIII ; 14 « Discours des conditions et moiens de paix practiquez par monsieur le legat en Angleterre pour icelle accorder entre l'empereur et le roy très chrestien ». S. d ; 15 « Abregé faict de l'esclarcissement qui se pourroit faire ès articles portez par messire Silvestre pour estre proposez à l'empereur ». S. d ; 16 « Pour respondre à certain advis contenant huict manières pour parvenir à la paix et delivrance de messieurs les enfans du roy très chrestien, dernièrement apporté par reverend père en Dieu monsieur l'evesque de Bade, ambassadeur du roy d'Angleterre, fault considérer ce qui s'ensuyt... » ; 17 « Memoyre de l'advis de monseigneur le legat sur les articles de la dificulté du diferent de Ferrare et de sçavoir si on devra divulguer la capitulation des imperiaulx avec nostre... sainct père » ; 18 « Finales oblatious faictes à l'empereur ». S. d. En latin ; 19 « Lectre de l'empereur, translatée d'espagnol en françoys, à l'ambassadeur estant en Angleterre... Domyngo de Mandoce,... pour luy. Du moys de fevrier 1528 » ; 20 « Pouvoir envoyé par l'empereur à madame Marguerite pour le faict de la paix ». S. d ; 21 « Lettres au roy Françoys, premier du nom, de la part de ses ambassadeurs en Angleterre, c'est asçavoir l'evesque de Bayone » Jean Du Bellay, « ambassadeur ordinaire, et le Sr de Brosse, envoié pour negociation particulière ». 2, 9 et 20 janvier 1528 ; 22 Lettres de JEAN DU BELLAY au grand maître Anne de Montmorency ; 1527 (?) 15 mai (fol. 163) ; 1528. 20 janvier (fol. 44), 6 février (fol. 50), 10 février (fol. 54), 12 mars (fol. 56), 19 mars (fol. 56), 24 mai (fol. 64), 28 mai (fol. 66), 18 juin (fol. 71), 21 juillet (fol. 74), 28 juillet (fol. 81), 8 août (fol. 83), 3 septembre (fol. 85), 20 septembre (fol. 87), 6 octobre (fol. 91), 17 octobre (fol. 92), 1er novembre (fol. 97), 8 novembre (fol. 105), 17 novembre (fol. 108 r° ), 17 novembre (fol. 108 v° ), 20 décembre (fol. 124) ; 1529. 5 mars (fol. 128), 18 mai (fol. 130), 15 juin (fol. 134), 22 juin (fol. 136), 30 juin (fol. 139), 3 juillet (fol. 140), 1er septembre (fol. 141), 17 septembre (fol. 142), 12 octobre (fol. 146), 17 octobre (fol. 147), 22 octobre (fol. 149), 27 octobre (fol. 150), 2 novembre (fol. 98) ; 1533. 8 février (fol. 189), 15 mars (fol. 195) ; 1535. 3 septembre (fol. 220), 23 septembre (fol. 232), 27 novembre (fol. 247) ; 23 Lettres du même au roi ; 1527. 14 décembre (fol. 120) ; 1528. 6 février (fol. 46), 10 février (fol. 52), 26 mars (fol. 57), juillet (?) (fol. 63), 28 juillet (fol. 78), 3 septembre (fol. 84), 24 septembre (fol. 88), 28 octobre (fol. 94) ; 1529. 30 mars (fol. 130), 15 juin (fol. 132), 22 juin (fol. 134), 30 juin (fol. 137 bis), 4 octobre (fol. 143), 12 octobre (fol. 145) ; 1533. 8 février (fol. 189), 24 février (fol. 193), 15 mars (fol. 193), 23 mars (fol. 200), 24 mars (fol. 201), 1er avril (fol. 201) ; 1535. 15 juillet (fol. 203), 18 juillet (fol. 204), 26 juillet (fol. 205), 3 septembre (fol. 215 et 215 bis), 23 septembre (fol. 234), 5 novembre (fol. 238), 5 novembre (fol. 241), 12 novembre (fol. 242 ter), 12 novembre (fol. 245), 27 novembre (fol. 254), 6 décembre (fol. 264), 22 décembre (fol. 267), 31 décembre (fol. 280) ; 1537 (?) 3 septembre (fol 215) ; 24 Lettres du grand maître ANNE DE MONTMORENCY à Jean Du Bellay ; 1527. 21 mai (fol. 164), 30 juillet (fol. 166) ; 1528. 5 janvier (fol. 153), 9 janvier (fol. 154), 20 janvier (fol. 154), 20 janvier (fol. 159), 24 janvier (fol. 159), 3 avril (fol. 161), 19 avril (fol. 162), 10 août (fol. 169), 10 août (fol. 170), 22 août (fol. 171), 24 septembre (fol. 171), 26 octobre (fol. 174), 1er novembre (fol. 175), 24 décembre (fol. 175) ; 1529. 1er septembre (fol. 183 v° ), 9 septembre (fol. 183 r°), 25 octobre (fol. 186) ; 25 Lettres de FRANÇOIS Ier à Jean Du Bellay, son ambassadeur en Angleterre d'abord, et à Rome ensuite ; 1528. 3 janvier (fol. 157), 3 mars (fol. 161), 23 mai (fol. 165), 8 août (fol. 167), 20 octobre (fol. 172) ; 1529. 17 juin (fol. 177), 9 juillet (fol. 179), 13 juillet (fol. 180), 26 juillet (fol. 182), 23 septembre (fol. 185). — Mémoire qu'il lui envoie, le 23 septembre 1529 (fol. 184-185) ; 26 Lettres de JEAN DU BELLAY : ; 27 Lettres diverses :

Resoluciones Cámara de Comercio de Bogotá

Doctrina

Niagara River (Ontario) Remedial Action Plan fonds, 1984-1997, n.d.

The Niagara River Remedial Action Plan was part of an initiative to restore the integrity of the Great Lakes Basin ecosystem. In 1972, the Great Lakes Water Quality Agreement was signed by both Canada and the United States to demonstrate their commitment to protecting this valuable resource. An amendment in 1987 stipulated that Remedial Action Plans (RAPs) be implemented in 43 ecologically compromised areas known as Areas of Concern. The Niagara River was designated as one of these areas by federal and provincial governments and the International Joint Commission, an independent and binational organization that deals with issues concerning the use and quality of boundary waters between Canada and the United States. Although the affected area included parts of both the Canadian and American side of the river, Remedial Action Plans were developed separately in both Canada and the United States. The Niagara River (Ontario) RAP is a three-stage process requiring collaboration between numerous government agencies and the public. Environment Canada, the Ontario Ministry of the Environment, and the Niagara Peninsula Conservation Authority are the agencies guiding the development and implementation of the Niagara River (Ontario) RAP. The first stage is to determine the severity and causes of the environmental degradation that resulted in the location being designated an Area of Concern; the second stage is to identify and implement actions that will restore and protect the health of the ecosystem; and the third stage is to monitor the area to ensure that the ecosystem’s health has been restored. Stage one of the RAP commenced in January 1989 when a Public Advisory Committee (PAC) was established. This committee was comprised of concerned citizens and representatives from various community groups, associations, industries and municipalities. After several years of consultation, the Niagara River (Ontario) Remedial Action Plan Stage 2 Report was released in 1995. It contained 16 goals and 37 recommendations. Among them was the need for Canadians and Americans to work more collaboratively in order to successfully restore the water quality in the Niagara River. Stage three of the Niagara River (Ontario) RAP is currently ongoing, but it is estimated that it will be completed by 2015. At that point, the Niagara River Area of Concern will be delisted, although monitoring of the area will continue to ensure it remains healthy.

Autoestima escolar en alumnos del bachillerato general y del bilingüe progresivo.

Tesis (Maestría en Docencia con Orientación en Educación Media Superior) UANL, 2012.

Discursos y manifiestos de Benito Juárez

UANL

Phylogénomique des Archées

Les transferts horizontaux de gènes (THG) ont été démontrés pour jouer un rôle important dans l'évolution des procaryotes. Leur impact a été le sujet de débats intenses, ceux-ci allant même jusqu'à l'abandon de l'arbre des espèces. Selon certaines études, un signal historique dominant est présent chez les procaryotes, puisque les transmissions horizontales stables et fonctionnelles semblent beaucoup plus rares que les transmissions verticales (des dizaines contre des milliards). Cependant, l'effet cumulatif des THG est non-négligeable et peut potentiellement affecter l'inférence phylogénétique. Conséquemment, la plupart des chercheurs basent leurs inférences phylogénétiques sur un faible nombre de gènes rarement transférés, comme les protéines ribosomales. Ceux-ci n'accordent cependant pas autant d'importance au modèle d'évolution utilisé, même s'il a été démontré que celui-ci est important lorsqu'il est question de résoudre certaines divergences entre ancêtres d'espèces, comme pour les animaux par exemple. Dans ce mémoire, nous avons utilisé des simulations et analyser des jeux de données d'Archées afin d'étudier l'impact relatif des THG ainsi que l'impact des modèles d'évolution sur la précision phylogénétique. Nos simulations prouvent que (1) les THG ont un impact limité sur les phylogénies, considérant un taux de transferts réaliste et que (2) l'approche super-matrice est plus précise que l'approche super-arbre. Nous avons également observé que les modèles complexes expliquent non seulement mieux les données que les modèles standards, mais peuvent avoir un impact direct sur différents groupes phylogénétiques et sur la robustesse de l'arbre obtenu. Nos résultats contredisent une publication récente proposant que les Thaumarchaeota apparaissent à la base de l'arbre des Archées.