Desenvolvimento de método e indicadores de avaliação do impacto ambiental das práticas de manejo em sistemas de produção intensivos.

No município de Guaíra, SP identificou-se a necessidade de realizar uma pesquisa interdisciplinar para avaliar o efeito das práticas de manejo em sistemas de produção. Dessa forma, em áreas irrigadas de agricultores desse município e do município de Suzano, SP, foi realizado um estudo metodológico, comparando-se dois tratamentos: um sistema de manejo alternativo (SA) e outro convencional(SC), utilizado pelo produtor, em sistema de preparo convencional do solo (PC) ou em sistema de plantio direto (PD), tendo a mata nativa(M) como um sistema referência auto-sustentável. Para avaliação, foram selecionados diversos parâmetros: físicos e químicos (compactação do solo, velocidade de infiltração básica da água, agregação de partículas do solo, pH, V%, CTC e teor de matéria orgânica), biológicos/bioquímicos (incidência de patógenos e pragas, grupos de microrganismos, atividade enzimática da desidrogenase, polissacarídeos e biomassa microbiana e de produtividade). Após três anos de aplicação dessa metodologia em Guaíra, os resultados mostraram que o PD reduziu em 50% a incidência de patógenos produtores de escleródios (Sclerotium rolfsii e Sclerotinia sclerotiorum). Também, melhoria das propriedades físicas e químicas do solo, verificadas pela maior quantidade de matéria orgânica incorporada, maior atividade microbiana e agregação de partículas do solo avaliadas pela quantificação de polissacarídeos, desidrogenase e biomassa em C e, por conseguinte, menor incidência dos patógenos. A análise dos custos de produção realizado de 1994- 97, ainda apresentaram vantagens do SC em relação ao SA em Guaíra, diferentemente de Suzano, que, após 6 anos, já mantém um sistema de produção equilibrado. No controle biológico, a bactéria Bacillus subtilis proporcionou uma redução de 50% de Fusarium solani, agente da podridão radicular do feijoeiro, um aumento de emergência de 20% em relação ao controle químico.

Caracterização de bactérias e fungos envolvidos na degradação de sulfentrazona em solos.

2008

Método molecular para estudos ecológicos de bactérias diazotróficas do gênero Paenibacillus em amostras ambientais.

O objetivo deste trabalho foi desenvolver e testar um protocolo de PCR específico para a amplificação de espécies de bactérias fixadoras de nitrogênio do gênero Paenibacillus, utilizando-se a estratégia de clonagem e sequenciamento do gene nifH. .

Análise da diversidade micorrízica na rizosfera de genótipos de milho (Zea mays L.) contrastantes para eficiência no uso de P utilizando eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE).

A diversidade genética de fungos micorrízicos arbusculares (FMA) presentes na rizosfera de genótipos de milho tropicais, selecionados como contrastantes para eficiência no uso de fósforo (P), foi avaliada pela técnica de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE). Fragmentos de DNA ribossômico (rDNA) foram amplificados por PCR, utilizando primers específicos para as famílias Acaulosporaceae e Glomaceae de fungos micorrízicos. Na análise por DGGE, os primers para as famílias Acaulosporaceae e Glomaceae foram eficientes na diferenciação das populações micorrízicas. Os genótipos de milho tiveram uma maior influência na comunidade de FMA da rizosfera do que o nível de P no solo. Os perfis de DGGE revelaram bandas que estavam presentes somente nos genótipos eficientes no uso de P (L3 e HT3060), sugerindo que alguns grupos de FMA foram estimulados por estes genótipos. As espécies Acaulospora longula, A. rugosa, A. scrobiculata, A. morrowiae e Glomus caledonium foram encontradas somente na rizosfera dos genótipos de milho eficientes no uso de P cultivados em solos com baixo teor de fósforo. Uma maior diversidade micorrízica foi encontrada nas amostras coletadas em solos de plantio direto, comparados com solos de plantio convencional. A efetiva colonização das raízes por FMA pode aumentar a eficiência de uso de P de cultivares em solos sob baixo P, influenciando a produção de milho em solos ácidos do Cerrado.

Análise molecular de fungos micorrízicos arbusculares em raízes de milho.

A comunidade nativa de fungos micorrízicos arbusculares (FMA), presente em amostras de raiz e de solo rizosférico de 15 genótipos de milho contrastantes para eficiência no uso de fósforo, foi avaliada pela técnica de eletroforese em gel de gradiente desnaturante (DGGE). Foram amplificados fragmentos do DNA ribossomal com primers específicos para as famílias Acaulosporaceae e Glomeraceae. Os primers para a família Glomeraceae foram eficientes em diferenciar a estrutura da população de fungos micorrízicos, indicando grande diversidade da comunidade entre os genótipos. No DGGE específico para Glomeraceae, foram observadas bandas exclusivas nas linhagens eficientes L228-3 e L3, ambas cultivadas sob baixo teor de fósforo, indicando uma associação preferencial entre os genótipos e os simbiontes, que pode resultar em melhor eficiência na aquisição de fósforo. Além disso, a presença de Glomus clarum nestas duas linhagens eficientes, cultivadas sob baixo P, indica uma possível relação dessa espécie à tolerância ao estresse de P nesse solo. Com relação à família Acaulosporaceae, a técnica de DGGE detectou pouca variação entre os genótipos cultivados em baixo P, além de menor diversidade de fungos micorrízicos dessa família colonizando as raízes de milho.

Resultados de pesquisa de soja 1986/87.

Agrometeorologia; Entomologia; Fertilidade do solo e microbiologia; Fitopatologia; Genetica e melhoramento; Manejo da cultura; Plantas daninhas; Tecnologia de sementes; Metodos quantitativos; Difusao de tecnologia; Informacao e documentacao; Assessoria de imprensa.

Dekkera e Brettanomyces: leveduras não competitivas que deterioram vinhos.

2003

Manejo da micorriza arbuscular por meio da rotacao de culturas.

2001

Manejo da micorriza arbuscular por meio da rotação de culturas nos sistemas agrícolas do Cerrado.

2001

Carbono da biomassa microbiana em solos de cerrado: comparacao dos metodos fumigacao-incubacao e fumigacao-extracao.

Dentre os metodos mais utilizados para determinacao do carbono da biomassa microbiana destacam-se: os de cloroformio-fumigacao-incubacao (CFI) e cloroformio-fumigacao-extracao (CFE). Trabalhos relatados na literatura tem comparado a eficiencia desses metodos em diversos locais. No entanto, para a regiao do cerrado nao existem informacoes a esse respeito. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiencia dos metodos CFE e CFI na determinacao do carbono da biomassa microbiana do solo (CBMS) em areas de cerrado sob cultura anual (rotacao soja-milho) e pastagem consorciada (Andropogon gayanus e Stylosanthes guianensis) e sob tres fitofisionomias - Mata de Galeria, Campo Sujo e Cerradao. Amostras de solo coletadas em duas profundidades, 0 a 5 cm e 5 a 20 cm, foram analisadas em quatro epocas: agosto de 1998, janeiro a agosto de 1999 e janeiro de 2000. Nas areas cultivadas, os resultados obtidos com os metodos CFE e CFI foram semelhantes independentemente dos tratamentos e das epocas amostradas; as pastagens consorciadas apresentaram maiores teores de CBMS do que as areas sob culturas anuais. A integracao profundidades x metodos foi significatica. Nao houve diferencas entre a profundidade 0 a 5 cm quando se utilizou o metodo CFI, mas as diferencas obtidas com o metodo CFE foram significativas. Os metodos CFI e CFE apresentaram as mesmas tendencias nas areas ativas, independentemente dos tratamentos, profundidades ou epocas analisados; a Mata de Galeria apresentou niveis de CBMS superiores aos do Cerradao e do Campo Sujo. As interacoes profundidades x metodos e epocas x metodos foram significativas devido ao fato de que as diferencas nos teores do carbono da bimassa microbiana, nas profundidades e epocas amostradas, foram mais acentuadas com o metodo CFE. Os resultados indicaram que os metodos CFI e CFE foram apropriados para determinacao da CBMS em solos de Cerrado sob cultivo e sob vegetacao nativa.

Isolamento, caracterização e seleção de estirpes de Azospirillum amazonense e Herbaspirillum seropedicae associadas a diferentes variedades de milho cultivadas no Cerrado.

2008

Levantamento exploratório-reconhecimento de alta intensidade e aptidão agrícola dos solos da área compreendida entre os km 81 e 152 da Rodovia Santarém-Cuiabá e o Rio Curua-Una.

Foram estudados os solos de uma area com 390.000 ha, situada a margem esquerda da Rodovia Santarem-Cuiaba, num trecho compreendido entre a cidade de Santarem e a Ruropolis Presidente Medici, no Estado do Para, com o objetivo de fornecer elementos basicos ao planejamento para ocupacao da area, atraves projetos de colonizacao. O trabalho constou do levantamento pedologico e posterior determinacao da aptidao agricola dos diferentes solos identificados e mapeados. Predominam na area os Latossolos e os podzolicos, ocorrendo em pequenas proporcoes as areias Quartzosas. As principais limitacoes se referem a fertilidade e a deficiencia de agua, enquanto que nos podzolicos, porquanto existam as limitacoes supracitadas, e o relevo que exerce em sua maioria, o principal papel de limitacoes das terras para o aproveitamento agropastoril. De acordo com o sistema de aptidao agricola adotado, os Latossolos, apesar de apresentarem baixa fertilidade e alta saturacao de aluminio, dada as suas propriedades fisicas, podem ser utilizados em empreendimentos agropecuarios com bons resultados, assim como os Podzolicos de relevo forte ondulado, recomenda-se a sua utilizacao para pastagem plantada ou silvicultura, e, para as Areais Quartzosas a melhor indicacao e a silvicultura.

Levantamento exploratório - reconhecimento de solos do Estado de Sergipe.

Este trabalho constitui o texto explicativo do levantamento dos solos do Estado de Sergipe, que abrange uma area de 21.994km2 e situa-se na Regiao Nordeste do Brasil, localizado entre os paralelos de 9 31'54" e 11 34'12" de latitude Sul e os meridianos de 36 11'20" de longitude a Oeste de Greenwich. O levantamento foi executado em nivel intermediario entre exploratorio e de reconhecimento, utilizando-se como bases o mapa topografico do Estado na escala 1:400.000 e foto-mosaicos nao controlados nas escalas de 1:100.000 e 1:80.000. Na zona umida costeira foram utilizadas tambem fotografias aereas verticais na escala de 1:60.000. No Estado de Sergipe prevalecem na zona costeira clima quente e umido; vegetacao florestal e cerrado; relevo plano, suave ondulado nosvales; sedimentos do Grupo Barreiras-Terciario, do Holoceno e do Cretaceo. O solo mais importante desta area e o Podzolico Vermelho Amarelo e em menor proporcao sao encontradas as Areias Quartzosas Distroficas e Latosol Vermelho Amarelo Distrofico, os quais sao derivados principalmente de sedimentos do Terciario. Relacionados com o Holoceno, sao encontrados as Areias Quartzosas Marinhas, Solos Indiscriminados de Mangues, Podzol e outros Solos Hidromorficos. Na parte oeste do Estado predominam: clima semi-arido muito quente; vegetacao de caatinga; relevo plano e suave ondulado; rochas cristalinas (xistos, gnaisses, granitos) e meta-siltitos. Destacam-se: Solos Litolicos Eutroficos, Brunos nao Calcicos, Planosol Solodico Eutrofico, Regosol, Solonetz Solodizado..

Exploitation of Ebola Virus VP35 Protein to identify new drugs counteracting its type I IFN antagonism

Ebolaviruses (EBOVs) are among the most virulent and deadly pathogens ever known, causing fulminant haemorrhagic fevers in humans and non-human primates. The 2014 outbreak of Ebola virus disease (EVD) in West Africa has claimed more lives than all previous EVD outbreaks combined. The EBOV high mortality rates have been related to the virus-induced impairment of the host innate immunity reaction due to two virus-coded proteins, VP24 and VP35. EBOV VP35 is a multifunctional protein, it is essential for viral replication as a component of the viral RNA polymerase and it also participates in nucleocapsid assembly. Early during EBOV infection, alpha-beta interferon (IFN-α/β) production would be triggered upon recognition of viral dsRNA products by cytoplasmic retinoic acid-inducible gene I (RIG-I)-like receptors (RLRs). However, this recognition is efficiently prevented by the double-stranded RNA (dsRNA) binding activity of the EBOV VP35 protein, which hides RLRs binding sites on the dsRNA phosphate backbone as well the 5’-triphosphate (5’-ppp) dsRNA ends to RIG-I recognition. In addition to dsRNA binding and sequestration, EBOV VP35 inhibits IFN-α/β production preventing the activation of the IFN regulatory factor 3 (IRF-3) by direct interaction with cellular proteins. Previous studies demonstrated that single amino acid changes in the VP35 dsRNA binding domain reduce EBOV virulence, indicating that VP35 is an attractive target for antiviral drugs development. Within this context, here we report the establishment of a novel method to characterize the EBOV VP35 inhibitory function of the dsRNA-dependent RIG-I-mediated IFN-β signaling pathway in a BLS2 cell culture setting. In such system, a plasmid containing the promoter region of IFN-β gene linked with a luciferase reporter gene was transfected, together with a EBOV VP35 mammalian expression plasmid, into the IFN-sensitive A549 cell line, and the IFN-induction was stimulated through dsRNA transfection. Through alanine scanning mutational studies with biochemical, cellular and computational methods we highlighted the importance of some VP35 residues involved in dsRNA end-capping binding, such as R312, K282 and R322, that may serve as target for the development of small-molecule inhibitors against EBOV. Furthermore, we identified a synthetic compound that increased IFN-induction only under antiviral response stimulation and subverted VP35 inhibition, proving to be very attractive for the development of an antiviral drug. In conclusion, our results provide the establishment of a new assay as a straightforward tool for the screening of antiviral compounds that target i) dsRNA-VP35 or cellular protein-VP35 interaction and ii) dsRNA-dependent RIG-I-mediated IFN signaling pathway, in order to potentiate the IFN response against VP35 inhibition, setting the bases for further drug development.

Soybean - Corn rotation : efect of the stubble mineralization on the nitrates production and corn yield

p.53-58