Hypersensitivity of hypoxia grown Mycobacterium smegmatis to DNA damaging agents: Implications of the DNA repair deficiencies in attenuation of mycobacteria

Mycobacteria are an important group of pathogenic bacteria. We generated a series of DNA repair deficient strains of Mycobacterium smegmatis, a model organism, to understand the importance of various DNA repair proteins (UvrB, Ung, UdgB, MutY and Fpg) in survival of the pathogenic strains. Here, we compared tolerance of the M. smegmatis strains to genotoxic stress (ROS and RNI) under aerobic, hypoxic and recovery conditions of growth by monitoring their survival. We show an increased susceptibility of mycobacteria to genotoxic stress under hypoxia. UvrB deficiency led to high susceptibility of M. smegmatis to the DNA damaging agents. Ung was second in importance in strains with single deficiencies. Interestingly, we observed that while deficiency of UdgB had only a minor impact on the strain's susceptibility, its combination with Ung deficiency resulted in severe consequences on the strain's survival under genotoxic stress suggesting a strong interdependence of different DNA repair pathways in safeguarding genomic integrity. Our observations reinforce the possibility of targeting DNA repair processes in mycobacteria for therapeutic intervention during active growth and latency phase of the pathogen. High susceptibility of the UvrB, or the Ung/UdgB deficient strains to genotoxic stress may be exploited in generation of attenuated strains of mycobacteria. (C) 2013 Elsevier Ireland Ltd. All rights reserved.

Adsorption study of silica gel particle for improvement in design of adsorption beds used in solar driven cooling units

Simulations using Ansys Fluent 6.3.26 have been performed to look into the adsorption characteristics of a single silica gel particle exposed to saturated humid air streams at Re=108 & 216 and temperature of 300K. The adsorption of the particle has been modeled as a source term in the species and the energy equations using a Linear Driving Force (LDF) equation. The interdependence of the thermal and the water vapor concentration field has been analysed. This work is intended to aid in understanding the adsorption effects in silica gel beds and in their efficient design. (C) 2013 The Authors. Published by Elsevier Ltd. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/).

Vertical electric field induced bacterial growth inactivation on amorphous carbon electrodes

The objective of the present work is to understand the vertical electric field stimulation of the bacterial cells, when grown on amorphous carbon substrates in vitro. In particular, the antibacterial activity against Gram-positive Staphylococcus aureus and Gram-negative Escherichia coli are studied using MTTassay, live/dead assay and inner membrane permeabilization assays. In our experiments, the carbon substrate acts as one electrode and the counter electrode is positioned outside the culture medium, thus suppressing the current, electrokinetic motions and chemical reactions. Guided by similar experiments conducted in our group on neuroblastoma cells, the present experimental results further establish the interdependence of field strength and exposure duration towards bacterial growth inactivation in vitro. Importantly, significant reduction in bacterial viability was recorded at the 2.5 V/cm electric field stimulation conditions, which does not reduce the neural cell viability to any significant extent on an identical substrate. Following electrical stimulation, the bacterial growth is significantly inhibited for S. aureus bacterial strain in an exposure time dependent manner. In summary, our experiments establish the effectiveness of the vertical electric field towards bacterial growth inactivation on amorphous carbon substrates, which is a cell type dependent phenomenon (Gram-positive vs. Gram-negative). (C) 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.

A quantitative imaging-based screen reveals the exocyst as a network hub connecting endocytosis and exocytosis

The coupling of endocytosis and exocytosis underlies fundamental biological processes ranging from fertilization to neuronal activity and cellular polarity. However, the mechanisms governing the spatial organization of endocytosis and exocytosis require clarification. Using a quantitative imaging-based screen in budding yeast, we identified 89 mutants displaying defects in the localization of either one or both pathways. High-resolution single-vesicle tracking revealed that the endocytic and exocytic mutants she4 Delta and bud6 Delta alter post-Golgi vesicle dynamics in opposite ways. The endocytic and exocytic pathways display strong interdependence during polarity establishment while being more independent during polarity maintenance. Systems analysis identified the exocyst complex as a key network hub, rich in genetic interactions with endocytic and exocytic components. Exocyst mutants displayed altered endocytic and post-Golgi vesicle dynamics and interspersed endocytic and exocytic domains compared with control cells. These data are consistent with an important role for the exocyst in coordinating endocytosis and exocytosis.

Conflitos temporais entre os processos legislativos ordinário e orçamentário

Analisa a interdependência, com ênfase no aspecto temporal, entre o processo legislativo ordinário, bicameral, produtor de normas permanentes, com prazos impróprios, em que se avalia o mérito e o processo orçamentário, congressual, prazos constitucionais, expedito e conciso. São usados como exemplos o PL 7749/10, que fixa o subsídio dos Ministros do Supremo Tribunal Federal por ato administrativo autorizado na LDO, e o entendimento comum de considerar-se como lacuna da Proposta Orçamentária da União para 2011, PL 59/10-CN, Lei 12.381/11, conforme Nota Técnica CONOF/CD nº 13/2010, a ausência de valores referentes a proposições em tramitação no processo legislativo bicameral, produtor de cogência normativa sob a forma de despesas obrigatórias continuadas.

The role of the terms of trade in the trade channel of transmission of oil price shocks

This paper highlights the role of the terms of trade in the trade channel of propagation of oil price shocks both empirically and theoretically. Empirically, I show that oil price shocks have a large, persistent and statistically significant impact on the US terms of trade. Theoretically, I add oil in the model by Corsetti and Pesenti (2005) and analyse under what conditions the terms of trade plays a relevant role in the international transmission of oil price shocks. With nominal price rigidities and full exchange rate pass-through positive oil price shocks depreciate the currency of the oil importing country. The subsequent negative wealth effect adds to the recessive effect of the supply channel and may trongly reduce the consumption in the oil importing country economy. Without exchange rate pass-through oil shocks transmit to the economy only through the supply channel. The model suggests that a change in the exchange rate pass-through might contribute to explain the evidence of a weaker impact of oil price shocks on the macroeconomic activity in recent times.

Analysis of volatility transmissions in integrated and interconnected markets: The case of the Iberian and French markets

This paper models the mean and volatility spillovers of prices within the integrated Iberian and the interconnected Spanish and French electricity markets. Using the constant (CCC) and dynamic conditional correlation (DCC) bivariate models with three different specifications of the univariate variance processes, we study the extent to which increasing interconnection and harmonization in regulation have favoured price convergence. The data consist of daily prices calculated as the arithmetic mean of the hourly prices over a span from July 1st 2007 until February 29th 2012. The DCC model in which the variances of the univariate processes are specified with a VARMA(1,1) fits the data best for the integrated MIBEL whereas a CCC model with a GARCH(1,1) specification for the univariate variance processes is selected to model the price series in Spain and France. Results show that there are significant mean and volatility spillovers in the MIBEL, indicating strong interdependence between the two markets, while there is a weaker evidence of integration between the Spanish and French markets. We provide new evidence that the EU target of achieving a single electricity market largely depends on increasing trade between countries and homogeneous rules of market functioning.

Science-based restoration monitoring of coastal habitats, Volume One: A framework for monitoring plans under the Estuaries and Clean Waters Act of 2000 (Public Law 160-457)

Executive Summary: The Estuary Restoration Act of 2000 (ERA), Title I of the Estuaries and Clean Waters Act of 2000, was created to promote the restoration of habitats along the coast of the United States (including the US protectorates and the Great Lakes). The NOAA National Centers for Coastal Ocean Science was charged with the development of a guidance manual for monitoring plans under this Act. This guidance manual, titled Science-Based Restoration Monitoring of Coastal Habitats, is written in two volumes. It provides technical assistance, outlines necessary steps, and provides useful tools for the development and implementation of sound scientific monitoring of coastal restoration efforts. In addition, this manual offers a means to detect early warnings that the restoration is on track or not, to gauge how well a restoration site is functioning, to coordinate projects and efforts for consistent and successful restoration, and to evaluate the ecological health of specific coastal habitats both before and after project completion (Galatowitsch et al. 1998). The following habitats have been selected for discussion in this manual: water column, rock bottom, coral reefs, oyster reefs, soft bottom, kelp and other macroalgae, rocky shoreline, soft shoreline, submerged aquatic vegetation, marshes, mangrove swamps, deepwater swamps, and riverine forests. The classification of habitats used in this document is generally based on that of Cowardin et al. (1979) in their Classification of Wetlands and Deepwater Habitats of the United States, as called for in the ERA Estuary Habitat Restoration Strategy. This manual is not intended to be a restoration monitoring “cookbook” that provides templates of monitoring plans for specific habitats. The interdependence of a large number of site-specific factors causes habitat types to vary in physical and biological structure within and between regions and geographic locations (Kusler and Kentula 1990). Monitoring approaches used should be tailored to these differences. However, even with the diversity of habitats that may need to be restored and the extreme geographic range across which these habitats occur, there are consistent principles and approaches that form a common basis for effective monitoring. Volume One, titled A Framework for Monitoring Plans under the Estuaries and Clean Waters Act of 2000, begins with definitions and background information. Topics such as restoration, restoration monitoring, estuaries, and the role of socioeconomics in restoration are discussed. In addition, the habitats selected for discussion in this manual are briefly described. (PDF contains 116 pages)

Cu2O substrates and epitaxial Cu2O/ZnO thin film hetero-structures for solar energy conversion

Future fossil fuel scarcity and environmental degradation have demonstrated the need for renewable, low-carbon sources of energy to power an increasingly industrialized world. Solar energy with its infinite supply makes it an extraordinary resource that should not go unused. However with current materials, adoption is limited by cost and so a paradigm shift must occur to get everyone on the same page embracing solar technology. Cuprous Oxide (Cu2O) is a promising earth abundant material that can be a great alternative to traditional thin-film photovoltaic materials like CIGS, CdTe, etc. We have prepared Cu2O bulk substrates by the thermal oxidation of copper foils as well Cu2O thin films deposited via plasma-assisted Molecular Beam Epitaxy. From preliminary Hall measurements it was determined that Cu2O would need to be doped extrinsically. This was further confirmed by simulations of ZnO/Cu2O heterojunctions. A cyclic interdependence between, defect concentration, minority carrier lifetime, film thickness, and carrier concentration manifests itself a primary reason for why efficiencies greater than 4% has yet to be realized. Our growth methodology for our thin-film heterostructures allow precise control of the number of defects that incorporate into our film during both equilibrium and nonequilibrium growth. We also report process flow/device design/fabrication techniques in order to create a device. A typical device without any optimizations exhibited open-circuit voltages Voc, values in excess 500mV; nearly 18% greater than previous solid state devices.

Características pessoais e institucionais e comportamentos de autocuidado de docentes de enfermagem segundo os modos adaptativos de Roy: estudo em Instituições Públicas do Estado do Rio de Janeiro

Este trabalho enfoca a promoção da vida através de comportamentos saudáveis, tendo como objetivos: delinear o perfil sociodemográfico e institucional/profissional dos docentes de enfermagem e analisar seus hábitos de vida, segundo os modos adaptativos de Roy. Foi utilizada a Teoria de Sister Callista Roy, destacando-se os modos de adaptação: fisiológico, autoconceito e interdependência. Implementou-se o método descritivo, quantitativo, transversal através da técnica de autorelato em amostra de 101 docentes. Para investigar esses aspectos, utilizou-se dois questionários, um deles com a escala de Likert, adaptado para a pesquisa. A produção de dados transcorreu de janeiro a março de 2009, após aprovação do Comitê de Ética em Pesquisa, Protocolo 2187, e concordância das quatro instituições públicas de ensino universitário, do Estado do Rio de Janeiro-Brasil, selecionadas. Os dados obtidos foram submetidos á estatística, aplicando-se medidas de tendência central. Quanto ao perfil docente: predomina a faixa etária de 40 a 59 anos, com 69,3%, de união estável. Relacionando cor e crença religiosa, constatou-se 37,6% de católicos brancos. Dos 50 docentes, 5% têm residência própria, na zona norte. Possuem renda individual acima de 8 salários mínimos, 67,32%, a maioria com vínculo trabalhista. No tempo de serviço, 22,94% situam-se entre 11 a 15 anos, com carga horária de 20 a 40 horas. Quanto à titulação, 42,56% são doutores e 80,2% possuem um tipo de regime estatutário. Concernente aos Modos Adaptativos de Roy foi atribuído, predominantemente, o conceito A- hábitos de vida saudável, aos modos Fisiológicos e de Autoconceito, seguindo-se o de Interdependência, que apresentou quatro conceitos B- em busca de hábitos de vida saudável, sendo o mais homogêneo dos três modos. Identificou-se que o Modo Fisiológico foi heterogêneo, pois os valores das medidas de tendência central se distanciam entre si. Concluindo-se que o pressuposto formulado atendeu parcialmente às expectativas dos docentes por utilizarem, em benefício próprio, seus saberes sobre o cuidar promovendo o bem-estar com qualidade. Considerou-se que a interdependência pode ser conquistada pelos sujeitos, visto que o enfrentamento das suas atividades profissionais, paralelamente ao viver pessoal, pode ser motivo de satisfação com o trabalho docente, remuneração recebida, ambiente institucional, relações de poder/saber no trabalho, além da possibilidade de atender sua necessidade gregária promovendo o convívio com a família e amigos. Lembra-se que lidar com pessoas cujas subjetividades devem ser objetivadas, visando sua compreensão para o atendimento de saúde, exige equilíbrio e progresso das dimensões corporais física, mental e espiritual do profissional.

Discursos de posse dos Presidentes do Supremo Tribunal Federal Brasil, capital Brasília: uma das faces do ethos do Poder Judiciário

O objeto deste estudo é a análise do comportamento da palavra nos discursos de posse dos Presidentes do Supremo Tribunal Federal, tendo como foco o enunciador e o lugar que ocupa no mundo em que constrói seu discurso, quando toma a palavra que lhe é de direito. Verificamos as relações de poder estabelecidas pela palavra e a ação que ela é capaz de realizar: a construção de imagens, a percepção do outro no momento do costuramento discursivo e os ajustamentos necessários entre o eu e o outro para o desenvolvimento da argumentação. Considerando que o poder imanente da palavra política é premissa fundamental para identificar o ethos dos enunciadores discursivos, demos, pois, enfoque ao modo como se dá a sua constituição nesses discursos, tendo em vista a representação histórica, social, linguística e discursiva dos sujeitos enunciadores, cuja identidade individual ou coletiva, bem como a do auditório a que se destina inscreve o binômio língua/sociedade como premissa fundamental para a realização do estudo da estrutura linguística utilizada em sua redação. Analisar os discursos de posse dos presidentes do Supremo Tribunal Federal, nos últimos 47 anos da República no Brasil, permite que apontemos uma das imagens do Poder Judiciário, forjada pelos membros do próprio Poder e o espelhamento inegável entre presidência e presidentes; que observemos as características que os inserem em determinados domínios discursivos e o contrato que confirma a interdependência e relevância de enunciador e auditório para a constituição do ethos de credibilidade nesses discursos, que tratamos como subgênero textual do gênero discurso de posse; que identifiquemos os ajustamentos e interação entre a tríade enunciador, discurso e auditório responsável pelo desenvolvimento da argumentação e da construção de uma das faces do ethos do Poder Judiciário

Transnacionais como veículo de investimento e o problema da corrupção: dois temas relevantes da atual agenda global

A expansão econômico-financeira do mercado, com a presença global das TNCs, dá a tônica da sociedade contemporânea, na qual, atividades sociais, políticas e econômicas adquirem facilmente uma dimensão mundial. Nesse sentido, eventos, decisões e atividades ocorridas em uma determinada localidade, quase que imediatamente, impactam a vida de indivíduos e comunidades em outras partes do globo, ainda que muito distantes geograficamente. Isso pode ser exemplificado pelas repercussões da recente crise econômica na Europa, nos Estados Unidos e em outros centros de pujança financeira, e que, em parte, foram desencadeadas por atos de corrupção. Dentro desse contexto, a bidimensionalidade clássica que contrapõe o Direito Internacional em ramos do DIP e do DIPr não é suficiente para compreender a conjuntura das situações atuais. Para tanto, a Transnational Law une o Direito Internacional Público e Direito Internacional Privado com novos temas do direito, tais como: Direito Administrativo Internacional, o Direito do Desenvolvimento Econômico, Direitos Humanos e as regras aplicáveis às empresas transnacionais, que passam a ser consideradas como atores do sistema internacional. Nesse sentido, o presente trabalho busca contextualizar, por meio da perspectiva da interdependência, o tema da responsabilidade das TNCs e dos investimentos dentro da ciência do Direito, contrapondo com o tema da corrupção, sua agenda global e seus efeitos nefastos. Com efeito, deu-se prioridade à análise do esforço internacional no combate à corrupção (tratados internacionais, leis, inclusive com efeitos extraterritoriais, e outras legislações internacionais com natureza de soft-law), para ao final comentar acerca das particularidades do Brasil quanto ao tema.

Implementação de um algoritmo numérico para solução da equação de Christoffel generalizada em acustoelasticidade.

Extensos estudos realizados nas últimas décadas sobre a propagação de ondas ultrassônicas em sólidos levaram ao desenvolvimento de técnicas não destrutivas para a avaliação da segurança e integridade de estruturas e componentes industriais. O interesse na aplicação de técnicas ultrassônicas para medição de tensões aplicadas e residuais decorre da mudança mensurável da velocidade das ondas ultrassônicas na presença de um campo de tensões, fenômeno conhecido como efeito acustoelástico. Uma teoria de acustoelasticidade fornece um meio atrativo e não destrutivo de medir a tensão média ao longo do caminho percorrido pela onda. O estudo da propagação das ondas ultrassônicas em meios homogêneos anisotrópicos sob tensão conduz a um problema não linear de autovalores dado pela equação de Christoffel generalizada. A característica não linear deste problema decorre da interdependência entre as constantes elásticas efetivas do material e as tensões atuantes. A medição experimental de tensões por técnicas ultrassônicas é um problema inverso da acustoelasticidade. Esta dissertação apresenta a implementação de um algoritmo numérico, baseado no método proposto por Degtyar e Rokhlin, para solução do problema inverso da acustoelasticidade em sólidos ortotrópicos sujeitos a um estado plano de tensões. A solução da equação de Christoffel generalizada apresenta dificuldades de natureza numérica e prática. A estabilidade e a precisão do algoritmo desenvolvido, bem como a influência das incertezas na medição experimental das velocidades das ondas ultrassônicas, foram então investigadas. Dados sintéticos para as velocidades das ondas ultrassônicas de incidência oblíqua em uma placa sujeita a um estado plano de tensões foram gerados pela solução direta da equação de Christoffel generalizada para ilustrar a aplicação do algoritmo desenvolvido. O objetivo maior desta dissertação é a disponibilização de uma nova ferramenta de cálculo para suporte às atividades experimentais de medição de tensões por ultrassom no país.

Os indicadores de desempenho instituídos pelo TCU para as Instituições Federais de Ensino Superior: análise empírica do período de 2008 a 2010,

A Gestão Pública tem incorporado boas práticas de administração mediante foco no resultado eficiente e na transparência. A utilização de indicadores de desempenho exerce um papel fundamental para espelhar a real situação do órgão e suas possibilidades de melhoria. No caso específico das universidades federais, o Tribunal de Contas da União (TCU) estabeleceu um conjunto de nove indicadores a serem medidos por essas unidades e divulgados através de seus relatórios de gestão. A dificuldade interpretativa advinda de visualizar, simultaneamente, esses critérios avaliativos contidos nesse conjunto e suas interdependências, fomentou a elaboração desta pesquisa. O estudo objetiva analisar e sintetizar o conjunto de indicadores de desempenho, atinentes a 53 universidades federais, referentes aos anos de 2008 a 2010, a fim de identificar um modelo de simplificação para auxiliar os controles interno e externo. A metodologia utilizada é a da Análise Fatorial, uma técnica estatística multivariada de interdependência, e pouco explorada em pesquisas anteriores nessa temática, além de testes de regressão linear e da Análise Envoltória de Dados (DEA), esta já amplamente utilizada na literatura, a fim de possibilitar ratificar as associações e interpretações dos resultados. Os testes mostraram uma aderência satisfatória da técnica aos dados coletados, permitindo identificar dois fatores que pudessem explicar 61,8% do conjunto informacional original. Com ratificação da DEA, esses fatores foram associados ao desempenho e ao custo, e a relação entre os dois foi interpretada como um índice de eficiência. O fator atrelado ao desempenho foi intitulado o indicador sumarizado de todo o conjunto estabelecido pelo TCU, tendo sido encontrado correlação alta e significativa com o Ranking Universitário Folha, mostrando que eles possuem semelhantes poderes discriminantes, mesmo tendo sido oriundos de bases de cálculo distintas. Ademais, destacam-se os seguintes resultados complementares: 1) Embora o custo influencie para o desempenho das universidades federais, ele não é preponderante, mas os indicadores de envolvimento com a pós-graduação e qualificação do corpo docente são os mais relevantes; 2) Os indicadores de resultado não sofrem muita influência do custo, sobretudo o de recursos humanos (funcionários), mostrando que de uma maneira geral há ineficiência na gestão de pessoal das universidades; 3) A utilização da DEA mostrou que a escolha das variáveis realmente pode redundar em resultados distintos e não correlatos significativamente, apresentando uma limitação quanto à certificação dos escores de eficiência obtidos.

Promoção de Segurança Alimentar e Nutricional na Estratégia Saúde da Família: uma aproximação a partir da escuta de diferentes atores sociais

A garantia de Segurança Alimentar e Nutricional (SAN) remete à necessidade de ações intersetoriais que articulem as dimensões alimentar e nutricional, além da questão contemporânea da sustentabilidade e da perspectiva do direito humano à alimentação adequada. O setor saúde tem funções específicas e importantes que contribuem para o conjunto das políticas de governo voltadas para a garantia da SAN a população. Desta forma, ações promotoras de SAN devem ser desenvolvidas em todos os níveis de atenção do Sistema Único de Saúde, sendo a Atenção Básica à Saúde, por meio da Estratégia Saúde da Família (ESF), um campo privilegiado de implementação dessas ações, uma vez que está configurada como a porta preferencial de entrada dos usuários no sistema de saúde e como o centro norteador da rede de assistência. Este é um estudo exploratório e descritivo de abordagem qualitativa que teve como objetivo conhecer o que profissionais de equipes de saúde da Família, gestores dos âmbitos federal e municipal ligados à ESF, além de representantes de organizações da sociedade civil atuantes no campo da SAN entendem sobre SAN e sobre práticas promotoras de SAN na ESF. A construção das informações ocorreu por meio de entrevistas semi-estruturadas e grupos focais. Os profissionais referiram-se a SAN como a garantia de uma alimentação que atenda às necessidades nutricionais e que seja segura para o consumo, enquanto que entre os representantes da sociedade civil organizada e gestores predominou uma compreensão mais ampla da SAN. Os diferentes atores identificaram a ESF com um espaço promotor de SAN a partir do levantamento de ações já desenvolvidas ou que possam vir a ser desenvolvidas, porém as ações citadas encontram-se majoritariamente ligadas à dimensão nutricional da SAN. Os atores referiram um conjunto de problemas estruturais que desencadeiam dificuldades no cotidiano da organização dos serviços e das práticas dos profissionais e consequentemente na execução de ações promotoras de SAN nessa estratégia. Este trabalho levantou a necessidade de difundir a interdependência entre saúde e SAN entre gestores e profissionais ligados à ESF para que estes possam identificar melhor nas ações dos serviços de saúde elementos promotores da SAN, e desta forma compreender seu papel de agentes promotores de saúde e SAN.