SMSLib - biblioteca C++ do Sting Millennium Suite.

Organização lógica do SMS. Descrição da SMSLib. Leitura de arquivos PDB. Leitura de arquivos HSSP. Leitura de arquivos com parâmetros simples. Cálculo e leitura de contatos. Cálculo e leitura de Dihedral Angels.

Cálculo de área acessível por solvente utilizando SURFV - definição de interface intramolecular pelo SMS.

Definição de superfície acessível por solvente. Cálculo de AS. Utilização de SURFV para cálculo da área da AS e identificação de interface. Discussão e trabalhos futuros.

Análise do grau de conservação de resíduos em proteínas com estrutura 3D resolvida utilizando o SMS.

HSSP e entropia relativa. Módulos do SMS para análise de conservação. Discussão e trabalhos futuros.

Curvatura da superfície de proteínas no Java Protein Dossier.

Definição de superfície. Cálculo dos valores de curvatura com SurfRace.

Apresentação gráfica de parâmetros protéicos utilizando o Java Protein Dossier.

Parâmetros apresentados pelo JPD. Sequência de resíduos. Contatos. Contatos internos. Contatos na interface. Estrutura secundária. Dupla ocupância. Fator de temperatura. Entropia relativa. Confiabilidade. Acessibilidade de resíduos. Ângulos de torsão. Potencial eletrostático. Curvatura na superfície. Hidrofobicidade. Analisando com maior detalhes os parâmetros apresentados.

Criação de um núcleo para a pesquisa e descrição dos serviços oferecidos na área de Bioinformática estrutural.

Instalação e oferta de ferramentas.Computacionais sting millennium suite. (SMS) através da interface web. Criação de novos algoritmos e programas. Para análise estrutural das proteínas. Oferta de banco de dados públicos. Estabelecimento de um ambiente para.Pesquisa e oferta de serviços na área. De bioinformática. Formação de recursos humanos. Organização de cursos e congresso. Projetos em colaboração.

Primeiro curso STING Millennium Suite Chemogenomics: ferramentas para analisar estruturas macromoleculares e aplicações em chemogenomics.

O objetivo do curso foi familiarizar pesquisadores de áreas de biotecnologia, como genética, bioquímica, biologia molecular e bioinformática, com as novas ferramentas disponíveis para a análise de estruturas macromoleculares, juntamente com a explificação de novas abordagens e metodologias para o estudo das macromoléculares.

Cálculo de possíveis contatos atômicos internos a uma proteína ou entre proteínas no software SMS.

Contatos interatômicos são definidos no contexto deste trabalho como as forças de atração ou de repulsão existentes entre átomos distintos.

Identificando Pockets na superfície protéica usando o Java Protein Dossier - JPD.

2005

BRS Rúbea.

1999

Implantes em zircónio

Monografia apresentada à Universidade Fernando Pessoa para obtenção do grau de Licenciado em Medicina Dentária

Facetas de Porcelana VS Facetas de Resina Composta

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Medicina Dentária

Facetas sem preparo

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Medicina Dentária

Qual a eficácia clínica do sistema CEREC com os seus diferentes materiais para reabilitação em prótese fixa e sobre implantes?

Projeto de Pós-Graduação/Dissertação apresentado à Universidade Fernando Pessoa como parte dos requisitos para obtenção do grau de Mestre em Medicina Dentária

Histone deacetylase 7 controls endothelial cell growth through modulation of beta-catenin

Rationale: Histone deacetylase (HDAC)7 is expressed in the early stages of embryonic development and may play a role in endothelial function.

Objective: This study aimed to investigate the role of HDAC7 in endothelial cell (EC) proliferation and growth and the underlying mechanism.

Methods and Results: Overexpression of HDAC7 by adenoviral gene transfer suppressed human umbilical vein endothelial cell (HUVEC) proliferation by preventing nuclear translocation of ß-catenin and downregulation of T-cell factor-1/Id2 (inhibitor of DNA binding 2) and cyclin D1, leading to G1 phase elongation. Further assays with the TOPFLASH reporter and quantitative RT-PCR for other ß-catenin target genes such as Axin2 confirmed that overexpression of HDAC7 decreased ß-catenin activity. Knockdown of HDAC7 by lentiviral short hairpin RNA transfer induced ß-catenin nuclear translocation but downregulated cyclin D1, cyclin E1 and E2F2, causing HUVEC hypertrophy. Immunoprecipitation assay and mass spectrometry analysis revealed that HDAC7 directly binds to ß-catenin and forms a complex with 14-3-3 e, ?, and ? proteins. Vascular endothelial growth factor treatment induced HDAC7 degradation via PLC?-IP3K (phospholipase C?–inositol-1,4,5-trisphosphate kinase) signal pathway and partially rescued HDAC7-mediated suppression of proliferation. Moreover, vascular endothelial growth factor stimulation suppressed the binding of HDAC7 with ß-catenin, disrupting the complex and releasing ß-catenin to translocate into the nucleus.

Conclusions: These findings demonstrate that HDAC7 interacts with ß-catenin keeping ECs in a low proliferation stage and provides a novel insight into the mechanism of HDAC7-mediated signal pathways leading to endothelial growth