Carios mimon (Acari: Argasidae): description of adults and redescription of larva

Carios mimon is an argasid tick common on Chiroptera, originally described from larvae collected on bats Mimon crenulatum from Bolivia and Eptesicus brasiliensis from Uruguay. Later it was also registered from Argentina and recently included among the Brazilian tick fauna. In Brazil, this species is very aggressive to man, resulting in intense inflammatory response and pain. It is known only by the larval description and its morphology resembles that from other species currently included into the genus Carios, formerly classified into the subgenus Alectorobius, genus Ornithodoros. Here we describe adults and redescribe the larva of C. mimon, based on light and scanning electron microscopy. Remarks about its morphological similarity with other species of this genus are also discussed. Molecular analysis inferred from a portion of the 16S rRNA mitochondrial gene placed C. mimon in a cluster supported by maximal bootstrap value (100%) with other argasid species (mostly bat parasites in the New World), which have been classified into either the genus Ornithodoros or Carios, depending on the Argasidae classification adopted by different authors.

Detection and molecular characterization of a canine piroplasm from Brazil

In the beginning of the 20th century, a new canine disease was reported in Brazil under the name ""nambiuvu"", whose etiological agent was called Rangelia vitalii, a distinct piroplasm that was shown to parasitize not only erythrocytes, but also leucocytes and endothelial cells. In this new century, more publications on R. vitalii were reported from Brazil, including an extensive study on its ultrastructural analysis, in addition to clinical, pathological, and epidemiological data on nambiuvu. However, a molecular analysis of R. vitalii has not been performed to date. In the present study, we performed molecular phylogenetic analyses of R. vitalii based on fragments of the genes 18S rRNA and the heat shock protein 70 (hsp70), amplified by PCR performed on blood samples derived from five clinical cases of dogs presumably infected with R. vitalii in southern Brazil. In addition, we examined Giemsa-stained thin blood smears from these same dogs. DNA sequences (604-bp) of the 18S rRNA gene obtained from the five dogs were identical to each other, and by Blast analysis, this sequence shared the highest degree of sequence identity (95%) with Babesia sp. China-BQ1. DNA sequences (1056-bp) of the hsp70 gene obtained from the five dogs were identical to each other, and by Blast analysis, this sequence shared the highest degree of sequence identity (87%) with Babesia bigemina. Phylogenetic analyses inferred from either of the two genes resulted in the newly genotype being placed in the Babesia spp.sensu stricto clade with very high bootstrap support (95-100%) in three analyses (Neighbor-Joining, Maximum parsimony, and Maximum likelihood). Giemsa-stained thin blood smears from the dogs were shown to contain piroplasm organisms within erythrocytes, monocytes and neutrophils (individual forms), and schizont-like forms within neutrophils, in accordance with literature reports of R. vitalii. Based on these results, we conclude that R. vitalii, the etiological agent of ""nambiuvu"" in southern Brazil, is a valid species of piroplasm. Further studies are required to evaluate the validity of the genus Rangelia. (C) 2011 Elsevier B.V. All rights reserved.

Phylogenetic analysis of the Monocotylidae (Monogenea) inferred from 28S rDNA sequences

The current classification of the Monocotylidae (Monogenea) is based on a phylogeny generated from morphological characters. The present study tests the morphological phylogenetic hypothesis using molecular methods. Sequences from domains C2 and D1 and the partial domains C1 and D2 from the 28S rDNA gene for 26 species of monocotylids from six of the seven subfamilies were used. Trees were generated using maximum parsimony, neighbour joining and maximum likelihood algorithms. The maximum parsimony tree, with branches showing less than 70% bootstrap support collapsed, had a topology identical to that obtained using the maximum likelihood analysis. The neighbour joining tree, with branches showing less than 70% support collapsed. differed only in its placement of Heterocotyle capricornensis as the sister group to the Decacotylinae clade. The molecular tree largely supports the subfamilies established using morphological characters. Differences are primarily how the subfamilies are related to each other. The monophyly of the Calicotylinae and Merizocotylinae and their sister group relationship is supported by high bootstrap values in all three methods, but relationships within the Merizocotylinae are unclear. Merizocotyle is paraphyletic and our data suggest that Mycteronastes and Thaumatocotyle, which were synonymized with Merizocotyle after the morphological cladistic analysis, should perhaps be resurrected as valid genera. The monophyly of the Monocotylinae and Decacotylinae is also supported by high bootstrap values. The Decacotylinae, which was considered previously to be the sister group to the Calicotylinae plus Merizocotylinae, is grouped in an unresolved polychotomy with the Monocotylinae and members of the Heterocotylinae. According to our molecular data, the Heterocotylinae is paraphyletic. Molecular data support a sister group relationship between Troglocephalus rhinobatidis and Neoheterocotyle rhinobatidis to the exclusion of the other species of Neoheterocotyle and recognition of Troglocephalus renders Neoheterocotyle,le paraphyletic. We propose Troglocephalus incertae sedis. An updated classification and full species list of the Monocotylidae is provided. (C) 2001 Australian Society for Parasitology Inc. Published by Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

Inferring genome trees by using a filter to eliminate phylogenetically discordant sequences and a distance matrix based on mean normalized BLASTP scores

Darwin's paradigm holds that the diversity of present-day organisms has arisen via a process of genetic descent with modification, as on a bifurcating tree. Evidence is accumulating that genes are sometimes transferred not along lineages but rather across lineages. To the extent that this is so, Darwin's paradigm can apply only imperfectly to genomes, potentially complicating or perhaps undermining attempts to reconstruct historical relationships among genomes (i.e., a genome tree). Whether most genes in a genome have arisen via treelike (vertical) descent or by lateral transfer across lineages can be tested if enough complete genome sequences are used. We define a phylogenetically discordant sequence (PDS) as an open reading frame (ORF) that exhibits patterns of similarity relationships statistically distinguishable from those of most other ORFs in the same genome. PDSs represent between 6.0 and 16.8% (mean, 10.8%) of the analyzable ORFs in the genomes of 28 bacteria, eight archaea, and one eukaryote (Saccharomyces cerevisiae). In this study we developed and assessed a distance-based approach, based on mean pairwise sequence similarity, for generating genome trees. Exclusion of PDSs improved bootstrap support for basal nodes but altered few topological features, indicating that there is little systematic bias among PDSs. Many but not all features of the genome tree from which PDSs were excluded are consistent with the 16S rRNA tree.

Desigualdades sociodemográficas e suas conseqüências sobre o peso do recém-nascido

OBJETIVO: Analisar as desigualdades sociodemográficas, na assistência pré-natal e ao parto e suas conseqüências sobre o peso ao nascer. MÉTODOS: Estudo realizado em amostra de 10.072 puérperas atendidas em maternidades públicas, conveniadas com o Sistema Único de Saúde, e particulares do Município do Rio de Janeiro, no período de 1999-2001. Para verificar a associação entre peso ao nascer e características maternas, sociodemográficas, biológicas e da assistência pré-natal (índice de Kotelchuck modificado), realizaram-se regressões lineares múltiplas, estratificando as puérperas segundo nível de instrução. Foi utilizada a técnica de bootstrap com intervalos de confiança acurados para as estimativas dos efeitos. RESULTADOS: Na análise bivariada, para quase todas as variáveis estudadas, as médias de peso ao nascer foram menores entre as mães de escolaridade mais baixa. Na análise da regressão múltipla para o grupo de baixa escolaridade, o peso ao nascer associou-se diretamente com o índice de Kotelchuck modificado e a idade gestacional, e inversamente com as variáveis cor da pele preta, hábito de fumar e a experiência de filhos prematuros anteriores. Idade materna e paridade tiveram comportamentos distintos nos extremos e na faixa central dos dados. No grupo de maior escolaridade somente a paridade, a idade gestacional e o índice de Kotelchuck modificado foram significativos e se associaram diretamente com o peso ao nascer. Verificou-se o papel protetor da assistência pré-natal, assim como o efeito negativo do hábito de fumar independente do nível de escolaridade das mães. CONCLUSÕES: As variáveis que explicaram o peso ao nascer dos neonatos de mães com elevada escolaridade foram de natureza biológica, em contraste com os determinantes sociais encontrados no grupo de baixa escolaridade.

Azorean Agriculture Efficiency by PAR

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Prognostic modelling of breast cancer patients: a benchmark of predictive models with external validation

Dissertação apresentada para obtenção do Grau de Doutor em Engenharia Electrotécnica e de Computadores – Sistemas Digitais e Percepcionais pela Universidade Nova de Lisboa, Faculdade de Ciências e Tecnologia

Projecto solvência II - Modelação do risco de subscrição numa companhia de seguros não vida

Dissertação apresentada na Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa para obtenção do grau de Mestre em Matemática e Aplicações - Actuariado, Estatística e Investigação Operacional

Utilização da metodologia de bootstraap em inferência estatística

Neste artigo, apresentamos o bootstrap como metodologia de inferência estatística. Após apresentar o princípio teórico que fundamenta, analisamos as propriedades assimptóticas. São desenvolvidos também os vários métodos de cálculo de intervalos de confiança: método bootstrap -t, método dos percentis e métodos BCa e ABC.

Portfolio optimization with options

A Work Project, presented as part of the requirements for the Award of a Masters Degree in Finance from the NOVA – School of Business and Economics

Take Care4All: Gestor Pessoal para o Bem-Estar na Saúde, Exercício Físico e Alimentação

Este trabalho de Projecto consiste numa plataforma online que possibilita ao seu utilizador gerir simultaneamente a saúde, o exercício físico e o regime alimentar. A plataforma é uma ferramenta que ajuda a promover o bem-estar do indivíduo, porque auxilia a monitorizar a toma de medicação e a agendar consultas e/ou exames. Permite ainda identificar o exercício físico e a dieta adequada para o estado de saúde do utilizador, através do teste de aptidão física e das calculadoras de IMC, TMB e NCD. Para o desenvolvimento da plataforma foram considerados os princípios da usabilidade e acessibilidade heurística de Jacob Nielsen. O desenvolvimento do projecto assenta nas linguagens de Programação de HTML5, CSS3, PHP, MySQL, Javascript (JQuery) e na plataforma de RWD do Twitter-Bootstrap.

Modelos determinísticos e estocásticos aplicados ao cálculo de provisões para sinistros

A estimação das provisões para sinistros é de extrema importância na atividade de uma seguradora do ramo Não Vida, porque, por um lado, são necessários recursos suficientes para garantir o pagamento de qualquer sinistro que ocorra e, por outro, o excesso de provisões pode condicionar a rentabilidade da companhia. Assim, faz parte do papel do atuário garantir a adequação destas provisões técnicas. Com esse propósito, é habitualmente utilizado o método determinístico Chain Ladder para a estimação das provisões para sinistros. Contudo, de forma a contornar as limitações desta metodologia, recorre-se a modelos estocásticos, como o modelo proposto por Thomas Mack, uma aplicação dos Modelos Lineares Generalizados, a técnica Bootstrap, entre outros. Dos modelos estocásticos é de salientar um dos mais recentemente estudados, Double Chain Ladder, que está diretamente associado ao método Chain Ladder, trazendo algumas vantagens sobre esse último e possibilitando também a aplicação da técnica Bootstrap e uma simples associação ao método Bornhuetter-Ferguson. O objetivo desta dissertação consiste na aplicação e análise destes modelos na estimação de provisões para sinistros no ramo Não Vida.

Shiva's dance: Crisis, local institutions and private firms

The uneven spatial distribution of start-ups and their respective survival may reflect comparative advantages resulting from the local institutional background. For the first time, we explore this idea using Data Envelopment Analysis (DEA) to assess the relative efficiency of Portuguese municipalities in this specific context. We depart from the related literature where expenditure is perceived as a desirable input by choosing a measure of fiscal responsibility and infrastructural variables in the first stage. Comparing results for 2006 and 2010, we find that mean performance decreased substantially 1) with the effects of the Global Financial Crisis, 2) as municipal population increases and 3) as financial independence decreases. A second stage is then performed employing a double-bootstrap procedure to evaluate how the regional context outside the control of local authorities (e.g. demographic characteristics and political preferences) impacts on efficiency.

Diversidade de Arctiinae (Lepidoptera, Arctiidae) em área alterada em Altamira, Amazônia Oriental, Pará, Brasil

Este trabalho avaliou a fauna de Arctiinae em Altamira, Pará, numa área com forte ação antrópica, por meio de armadilhas luminosas, com capturas de duas noites a cada fase de lua nova por mês, no período de dezembro de 2007 a novembro de 2008. Na avaliação foram utilizados os parâmetros: riqueza, abundância, constância, índices de diversidade e uniformidade de Shannon (H’ e E’) e Brillouin (H e E), dominância de Berger-Parker (BP). As estimativas de riqueza foram feitas através dos procedimentos não paramétricos, “Bootstrap”, “Chao 1”, “Chao 2”, “Jackknife 1”, “Jackknife 2” e “Michaelis-Mentem”. Foram capturados 420 espécimes pertencentes a 64 táxons de Arctiinae, sendo 19 espécies registradas pela primeira vez no estado do Pará. Os valores dos parâmetros analisados para todo o período foram: H’= 4,69, E’= 0,781, H= 4,37, E= 0,732 e BP= 0,183. Durante o período menos chuvoso (junho-novembro) foram encontrados os valores mais significativos para todos os parâmetros analisados. No período mais chuvoso (dezembro-maio) foram encontrados os mais significativos percentuais de similaridade entre os meses. Os estimadores previram o encontro de mais espécies, entre 18,7% a 60,9%.