Insights into Himalayan biogeography from geckos: A molecular phylogeny of Cyrtodactylus (Squamata: Gekkonidae)

The India-Asia collision profoundly influenced the climate, topography and biodiversity of Asia, causing the formation of the biodiverse Himalayas. The species-rich gekkonid genus Cyrtodactylus is an ideal clade for exploring the biological impacts of the India-Asia collision, as previous phylogenetic hypotheses suggest basal divergences occurred within the Himalayas and Indo-Burma during the Eocene. To this end, we sampled for Cyrtodactylus across Indian areas of the Himalayas and Indo-Burma Hotspots and used three genes to reconstruct relationships and estimate divergence times. Basal divergences in Cyrtodactylus, Hemidactylus and the Palaearctic naked-toed geckos were simultaneous with or just preceded the start of the India-Asia collision. Diversification within Cyrtodactylus tracks the India-Asia collision and subsequent geological events. A number of geographically concordant clades are resolved within Indo-Burmese Cyrtodactylus. Our study reveals 17 divergent lineages that may represent undescribed species, underscoring the previously undocumented diversity of the region. The importance of rocky habitats for Cyrtodactylus indicates the Indo-Gangetic flood plains and the Garo-Rajmahal Gap are likely to have been important historical barriers for this group. (C) 2014 Elsevier Inc. All rights reserved.

Pluronic copolymer encapsulated SCR7 as a potential anticancer agent

Nonhomologous end joining (NHEJ) of DNA double strand breaks (DSBs) inside cells can be selectively inhibited by 5,6-bis-(benzylideneamino)-2-mercaptopyrimidin-4-ol (SCR7) which possesses anticancer properties. The hydrophobicity of SCR7 decreases its bioavailability which is a major setback in the utilization of this compound as a therapeutic agent. In order to circumvent the drawback of SCR7, we prepared a polymer encapsulated form of SCR7. The physical interaction of SCR7 and Pluronic (R) copolymer is evident from different analytical techniques. The in vitro cytotoxicity of the drug formulations is established using the MTT assay.

Low thermal conductivity of endogenous manganese silicide/Si composites for thermoelectricity

Higher manganese silicide (HMS) based alloys with eutectic composition (Si-33.3 at% Mn) were prepared by arc-melting, melt-spinning and ball milling in order to evaluate the effect of microstructure on the thermal conductivity. Powder X-ray diffraction, SEM, EPMA and TEM analysis confirmed the presence of Si as a secondary phase distributed in the HMS matrix phase. Thermal properties of the samples were studied in the temperature range of 300-800 K. The microstructure refinement resulting from ball milling leads to a decrease of the thermal conductivity from 4.4 W/mK to 1.9 W/mK, whereas meltspinning is inefficient to this respect. The results show an opportunity to produce bulk higher manganese silicide alloys with reduced thermal conductivity in order to enhance its thermoelectric performance. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

Twinning induced enhancement of fracture toughness in ultrafine grained Hydroxyapatite-Calcium Titanate composites

Despite being highly bioactive and biocompatible, the limitations of monolithic hydroxyapatite (HA) include extremely low fracture toughness, poor electrical conductivity. While addressing these issues, the present study demonstrates how CaTiO3 (CT) addition to HA can be utilized to obtain a combination of long crack fracture toughness (1.7 MPa m(1/2) SEVNB technique) and flexural strength of 98-155 MPa (3-point bending) and a moderate tensile strength (diametral compression) of 17-36 MPa. The enhancement in fracture resistance in spark plasma sintered HA-CT composites has been explained in reference to the observed twin morphology. TEM reveals the presence of twins in CT grains due to 1800 rotation about 101]. The measured properties along with our earlier reports on biocompatibility and electrical properties make HA-CT suitable for bone tissue engineering applications. When compared with other competing HA-based biocomposites, HA-CT composites are found to have a better combination of properties useful for medium load bearing implant applications. (C) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.

Differential proteomic and genomic profiling of mouse striatal cell model of Huntington's disease and control; probable implications to the disease biology

Huntington's disease (HD) is an autosomal dominant disorder of central nervous system caused by expansion of CAG repeats in exon1 of the huntingtin gene (Htt). Among various dysfunctions originated from the mutation in Htt gene, transcriptional deregulation has been considered to be one of the most important abnormalities. Large numbers of investigations identified altered expressions of genes in brains of HD patients and many models of HD. In this study we employed 2D SDS-PAGE/MALDI-MS coupled with 2D-DIGE and real-time PCR experiments of an array of genes focused to HD pathway to determine altered protein and gene expressions in STHdh(Q111)/Hdh(Q111) cells, a cell model of HD and compared with STHdh(Q7)/Hdh(Q7) cells, its wild type counterpart. We annotated 76 proteins from these cells and observed differential expressions of 31 proteins (by 2D-DIGE) involved in processes like unfolded protein binding, negative regulation of neuron apoptosis, response to superoxides etc. Our PCR array experiments identified altered expressions of 47 genes. Altogether significant alteration of 77 genes/proteins could be identified in this HD cell line with potential relevance to HD biology. Biological significance: In this study we intended to find out differential proteomic and genomic profiles in HD condition. We used the STHdh cells, a cellular model for HD and control. These are mouse striatal neuronal cell lines harboring 7 and 111 knock -in CAG repeats in their two alleles. The 111Q containing cell line (STHdh(Q111)/Hdh(Q111)) mimics diseased condition, whereas the 7Q containing ones (STHdh(Q7)/Hdh(Q7)), serves as the proper control cell line. Proteomic experiments were performed earlier to obtain differential expressions of proteins in R6/2 mice models, Hdh(Q) knock -in mice and in plasma and CSF from HD patients. However, no earlier report on proteomic alterations in these two HD cell lines and control was available in literature. It was, therefore, an important objective to find out differential expressions of proteins in these two cell lines. In this study, we annotated 76 proteins from STHdh(Q7)/Hdh(Q7) and STHdh(Q111)/Hdh(Q111) cells using 2D-gel/mass spectrometry. Next, by performing 2D-DIGE, we observed differential expressions of 31 proteins (16 upregulated and 15 downregulated) between these two cell lines. We also performed customized qRT-PCR array focused to HD pathway and found differential expressions of 47 genes (8 gene exptessions increased and 39 genes were decreased significantly). A total of 77 genes/proteins (Htt downregulated in both the studies) were found to be significantly altered from both the experimental paradigms. We validated the differential expressions of Vim, Hypk, Ran, Dstn, Hspa5 and Sod2 either by qRT-PCR or Western blot analysis or both. Out of these 77, similar trends in alteration of 19 out of 31 and 38 out of 47 proteins/genes were reported in earlier studies. Thus our study confirmed earlier observations on differential gene/protein expressions in HD and are really useful. Additionally, we observed differential expression of some novel genes/proteins. One of this was Hypk, a Htt-interacting chaperone protein with the ability to solubilize mHtt aggregated structures in cell lines. We propose that downregulation of Hypk in STHdh-Qm (Q111)/Hdh(Q111) has a causal effect towards HD pathogenesis. Thus the novel findings from our study need further research and might be helpful to understand the molecular mechanism behind HD pathogenesis. (C) 2015 Elsevier B.V. All rights reserved.

Physiological role of FolD (methylenetetrahydrofolate dehydrogenase), FchA (methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase) and Fhs (formyltetrahydrofolate synthetase) from Clostridium perfringens in a heterologous model of Escherichia coli

Most organisms possess bifunctional FolD 5,10-methylenetetrahydrofolate (5,10-CH2-THF) dehydrogenase-cyclohydrolase] to generate NADPH and 10-formyltetrandrofolate (10-CHO-THF) required in various metabolic steps. In addition, some organisms including Clostridium perfringens possess another protein, Fhs (formyltetrahydrofolate synthetase), to synthesize 10-CHO-THF. Here, we show that unlike the bifunctional FolD of Escherichia coli (Eco FolD), and contrary to its annotated bifunctional nature, C. perfringens FolD (Cpe FoID) is a monofunctional 5,10-CH2-THF dehydrogenase. The dehydrogenase activity of Cpe FoID is about five times more efficient than that of Eco FolD. The 5,10-methenyltetrahydrofolate (5,10-CH+-THF) cyclohydrolase activity in C. perfringens is provided by another protein, FchA (5,10-CH+-THF cyclohydrolase), whose cyclohydrolase activity is similar to 10 times more efficient than that of Eco FolD. Kinetic parameters for Cpe Fhs were also determined for utilization of all of its substrates. Both Cpe FoID and Cpe FchA are required to substitute for the single bifunctional FolD in E. coli. The simultaneous presence of Cpe FoID and Cpe FchA is also necessary to rescue an E coli folD deletion strain (harbouring Cpe Fhs support) for its formate and glycine auxotrophies, and to alleviate its susceptibility to trimethoprim (an antifolate drug) or UV light. The presence of the three clostridial proteins (FolD, FchA and Fhs) is required to maintain folate homeostasis in the cell.

Order-disorder phase transition and multiferroic behaviour in a metal organic framework compound (CH3)(2)NH2Co(HCOO)(3)

We have investigated the multiferroic and glassy behaviour of metal-organic framework (MOF) material (CH3)(2)NH2Co(CHOO)(3). The compound has perovskite-like architecture in which the metal-formate forms a framework. The organic cation (CH3)(2)NH2+ occupies the cavities in the formate framework in the framework via N-H center dot center dot center dot O hydrogen bonds. At room temperature, the organic cation is disordered and occupies three crystallographically equivalent positions. Upon cooling, the organic cation is ordered which leads to a structural phase transition at 155 K. The structural phase transition is associated with a para-ferroelectric phase transition and is revealed by dielectric and pyroelectric measurements. Further, a PE hysteresis loop below 155 K confirms the ferroelectric behaviour of the material. Analysis of dielectric data reveal large frequency dispersion in the values of dielectric constant and tan delta which signifies the presence of glassy dielectric behaviour. The material displays a antiferromagnetic ordering below 15 K which is attributed to the super-exchange interaction between Co2+ ions mediated via formate linkers. Interestingly, another magnetic transition is also found around 11 K. The peak of the transition shifts to lower temperature with increasing frequency, suggesting glassy magnetism in the sample. (C) 2016 AIP Publishing LLC.

Metabolite and transcriptome analysis of Campylobacter jejuni in vitro growth reveals a stationary-phase physiological switch.

Campylobacter jejuni is a prevalent cause of food-borne diarrhoeal illness in humans. Understanding of the physiological and metabolic capabilities of the organism is limited. We report a detailed analysis of the C. jejuni growth cycle in batch culture. Combined transcriptomic, phenotypic and metabolic analysis demonstrates a highly dynamic 'stationary phase', characterized by a peak in motility, numerous gene expression changes and substrate switching, despite transcript changes that indicate a metabolic downshift upon the onset of stationary phase. Video tracking of bacterial motility identifies peak activity during stationary phase. Amino acid analysis of culture supernatants shows a preferential order of amino acid utilization. Proton NMR (1H-NMR) highlights an acetate switch mechanism whereby bacteria change from acetate excretion to acetate uptake, most probably in response to depletion of other substrates. Acetate production requires pta (Cj0688) and ackA (Cj0689), although the acs homologue (Cj1537c) is not required. Insertion mutants in Cj0688 and Cj0689 maintain viability less well during the stationary and decline phases of the growth cycle than wild-type C. jejuni, suggesting that these genes, and the acetate pathway, are important for survival.

Parámetros y evaluación genética preliminar de hembras de un hato criollo reyna en el Trópico Seco, Rivas, Nicaragua

Con el objetivo de evaluar el efecto de distintos factores ambientales (año de parto, época de parto y número de parto) sobre el comportamiento productivo de un hato Criollo Reyna y su preliminar categorización genética bajo condiciones de trópico seco en la finca "El Pino" Rivas Nicaragua. En general, se analizaron 470 lactancias provenientes de 155 vacas en el periodo 1998-2005. Las características Producción de leche a 305 días (PL305), producción de leche por día a 305 días (PLDL305) y largo de lactancia (LARLA) fueron analizadas mediante la utilización de modelos lineales fijos que en general incluyeron efectos de año de parto (APART), número de parto (NUMPA), época de parto (EP), Manejo del ordeño (MAN). Los índices de herencia (h2) y constancia (r) para PL305, PLD305 Y LARLA se obtuvieron a partir de modelos lineales mixtos que incluyeron efectos aleatorios de semental (S) y vaca (V), así como los efectos fijos APART, NUMPA, EP, MAN. De los factores ambientales se encontró efecto significativo del APART (P< 0.01) para todas las características al igual que NUMPA, EP y la interacción APART* EP, exceptuando MAN el cual afectó únicamente a LARLA P< 0.01). Se obtuvieron medias de mínimos cuadrados de 1630.56±59.56 kg. 260.24±6.39 días y 5.34±0.19 para (PL305), (LARLA) y PLD305, respectivamente. El parto número 3 mostró los máximos valores (1804.04±67.46) para PL305 días y parto 8 con 273.90±17.49 días para LARLA respectivamente. La EP 2 presentó máximos valores de 1707.93±67.00 kg., 5.59±0.21 kg. y 266.66±7.19 días para PL305, PLDL305 y LARLA, respectivamente. Los APART 1998, 2000 y 2001 mostraron los mayores promedios para PL305, PLDL305, con 1896.37±97.71 kg., 6.21±0.32 kg.; 1963.77±112.65 kg., 6.43 ± 0.36 kg; 1884.90±107.95 kg., 6.18±0.35 kg. respectivamente. El MAN no presentó tendencia definida en su comportamiento. Los valores de repetitividad fueron 0.46±0.05, 0.46±0.05 y 0.078±0.05 y los heredabilidad de 0.25±0.13, 0.253±0.134 y 0.002±0.083, para PL305, PLD305 y LARLA, respectivamente. Del valor genético se pudo constatar la normalidad y distribución de los valores; las vacas en producción con valores genéticos superiores en parte ya estaban identificadas por el productor en su proceso de selección, reflejando así que el sistema de selección del productor ha sido relativamente efectivo. Los promedios de producción de leche obtenidos demuestran la capacidad del Reyna para su explotación en condiciones similares al del lugar de estudio y los parámetros r y h2 revelan claramente la existencia de variabilidad genética, posible de utilizar en mejoramiento genético a mediano y largo plazo para producción de leche.

Experimental Study on Benard-Marangoni Convection by PIV and TCL

An experimental investigation of Benard-Marangoni convection has been performed in double immiscible liquid layers of rectangular configuration. The two kinds of liquid are 10cst silicon oil and FC-70 respectively. The velocity fields in the vertical cross-section are obtained by PIV. Flow patterns and/or temperature distributions on the horizontal interface are displayed by using thermal color liquid crystal (TLC), and the velocity distributions on the interface were also obtained with the help of the serial particle image of TCL. The evolution processes of convection are observed in the differential thickness ratio of two liquid layers, and the convection styles are discussed.

Diagnóstico de la entomofauna presente en el cultivo de tomate (Lycopersicum esculentum) y manejo de mosca blanca (Bemisia tabaci) y gusano del fruto, a través de Nim ochenta (Azadirachta indica), Dipel (Bacillus thuringiensis) y Filitox en el municipio de Estelí en época de apante

Los problemas con mosca blanca en particular Bemicia Tabaci han alcanzado una magnitud mundial en los últimos años lo cual ha requerido una dedicación extraordinaria de esfuerzos de investigación básica y en métodos para su combate. Al inicio de la presente década la situación precaria del cultivo del tomate se debió básicamente al problema de mosca blanca B Tabaci al extremo que muchas zonas tomateras abandonaron el cultivo (CATIE, 1990). Existen pocos estudios rigurosos y sistemáticos sobre la incidencia e impacto de los enemigos naturales de B tabaci en Nicaragua, solamente en algunos cultivos se han encontrado los estados inmaduros de este insecto, y en cantidades muy bajas, lo cual dificulta realizar estudios de control biológico (CATIE, 1992). Con el objetivo de evaluar la presencia de enemigos naturales de la plaga del cultivo de tomate B tabaci se realizó este experimento en la época del apante Diciembre - Marzo, 1998 • 1999 en la Almaciguera, Estelí donde se evaluaron 3 tratamientos en una misma finca. Se mantuvieron las evaluaciones de enemigos naturales y de las plagas semanalmente así como las aplicaciones de los tratamientos Ni m, Nim+Dipel y Filitox, con un criterio de aplicación de O.1 ninfas o adultos por plantas, para lo cual fue necesario hacer recuentos en plantas tomándose cinco sitios fijos y en cada uno de los sitios se revisaron 1 O plantas haciendo un total de 50 plantas muestreadas, así como la colocación de trampas amarillas para la captura de los insectos los cuales fueron identificados por orden, familia y género. Al realizar el estudio de cuadros y gráficas de insectos la presencia de enemigos naturales (Eneyrtide, Avispas, Arañas, Cycloneada, Celenophoras, etc.) fue notoria en el cultivo siendo mayor su porcentaje en el tratamiento Nim y menor en el tratamiento Nim+Dipel, es importante mencionarlos ya que intervienen en el equilibrio del ecosistema dentro del cultivo (Plagas­ Tomate) Al realizar el análisis estadístico del ecosistema dentro de mosca blanca fue mayor en el tratamiento Nim+Dipel, encontrándose sus menores poblaciones en el tratamiento de mayor rentabilidad en Nim, el cual presente una tasa de retorno marginal de 155.42%, en cambio los tratamientos Nim+Dipel y Filitox no son recomendables para el control de B. tabaci

Las llagas de lo imaginario : un encuentro entre Juliana de Norwich y Adolphe Gesché

El objetivo de estas líneas es crear un ámbito de encuentro entre Juliana de Norwich, mística inglesa que vivó entre los años 1342-¿1416? y Adolphe Gesché, teólogo contemporáneo, muerto recientemente. Proponemos este encuentro a través de la categoría “imaginario”. Este imaginario puede ser vía de salida de la estrechez racionalista, de la razón desligada de otras dimensiones de lo humano. El imaginario de la herida de la mística medieval, y la pregunta por el sentido a través del imaginario que plantea el teólogo del siglo XX, pueden ser puertas abiertas y sugerentes también para la filosofía y la teología de hoy.

Características de los patrones de lluvia y su relación con los índices de erosividad para predecir erosión hídrica en tres municipios de Boaco, Nicaragua

Los patrones de la lluvia en el departamento de Boaco y específicamente en los municipios de San José de los Remates, Boaco y Santa Lucía, fueron registrados desde 2006–2008 en intervalos de 10, 20 y 30 minutos, con el propósito de lograr caracterizar un Índice de erosividad que se ajustara a los diferentes sitios de estudios, utilizando como herramienta metodológica el cálculo del Índice de erosividad propuesto por Wischmeier et al. 1978. Los eventos promedio para el municipio de San José de los Remates fue de 155 evento/a los cuales alcanzan una precipitación anual de 916mm un valor de energía cinética de 166.98 Mj/ha.mm y un índice de erosividad de 3,978.19 Mj.mm/ha.h siendo este el municipio que presenta los niveles más alto de erosividad. Seguido por el municipio de Santa Lucia que presento una cantidad de 110 eventos una lamina precipitada de 804.7 mm/a una energía cinética de 151.71 Mj/ha.mm y un índice de erosividad de 2,463.09 Mj.mm/ha.h y por ultimo encontramos el municipio de Boaco con un promedio de 141 eventos sumando una precipitación de 719.49mm/a un valor de energía cinética de 131.71Mj/ha.mm y un índice de erosividad de 3,065.94 todos estos datos calculado en intensidades de 30 minutos (I30) debido a que nuestro análisis de correlación de los patrones de la lluvia evaluados, nos indica que es el índice que mejor se ajusta a nuestra área de estudio a como lo establece Wischmeier en su investigación de más de 30 años. El área que presenta los mayores índices de riesgo de erosión potencial es el municipio de Santa lucia debido a que es el área más susceptible a la erosión por presentar los mayores valores de Erodabilidad y por ser la zona más accidentada.

Influencia de los momentos de limpia sobre la dinámica de arvenses, entomofauna y el rendimiento del nopal (Opuntia ficus indica L.) en Diriamba, Carazo, 2008

El nopal (Opuntia ficus indica L.), cultivo capaz de crecer en zonas donde apenas existe suelo y unido a su resistencia a la sequía la hace especialmente interesante para muchas zonas de Nicaragua. El nopal es una alternativa alimenticia para animales y humanos; la importancia es generar información agronómica acerca del cultivo sobre su potencial para adaptarse a zonas marginales donde las precipitaciones pluviales resultan ser mínimas como es la zona de Diriamba. El estudio se estableció en la Finca Guadarrama, ubicada en el kilómetro 56 ½ carretera Casares-La Boquita, Diriamba-Carazo, en julio 2008, para determinar el momento óptimo de control de malezas y su influencia ejercida en el cultivo del nopal. El área experimental fue de 104 m 2, realizado en un diseño de BCA (Bloques Completos al Azar) con 6 tratamientos, diferentes momentos de limpia (45 dds; 60 dds; 30 y 75 dds; 45 y 90 dds; 30, 60 y 90 dds) y el testigo sin limpia para malezas. Se evaluaron variables: Abundancia, diversidad de especies, dominancia, entomofauna y rendimiento. A los 105 dds presenta la mayor cobertura el T1 (sin limpia) y la menor cobertura el T6 (limpia a los 30,60 y 90 dds) con 78%, y 0% respectivamente; biomasa para monocotiledóneas, el mayor el T1 (sin limpia) y el menor el T6 (limpia a los 30, 60 y 90 dds) con 2, 380 kg.ha-1 y 8 kg.ha-1 respectivamente, para dicotiledóneas el mayor fue el T1 (sin limpia) y el menor el T6 (limpia a los 30, 60 y 90 dds) con 155 kg.ha-1 y 3 kg.ha-1 respectivamente; abundancia, el mayor número de plantas por especie monocotiledóneas fue Cynodon dactylon L. con 78 plantas en el T1 (sin limpia), para dicotiledóneas, Euphorbia hirta L. con 4 plantas en el T4 (limpia a los 30 y 75 dds); diversidad, encontramos 8 especies en el T1 (sin limpia) y 0 especie en el T6 (limpia a los 30,60 y 90 dds). Los insectos más representativos, fueron: Mariposas palomilla (Eurema sp), grillos (Acheta sp) yhormigas (Attasp), además de diferentes arácnidos. Según el análisis económico el tratamiento más rentable es con limpia a los 30 y 75 dds ya que presenta el mayor beneficio neto (C$ 73 948) y la mayor tasa de retorno marginal (2 634 %).