Characterization of the Aspergillus nidulans biotin biosynthetic gene cluster and use of the bioDA gene as a new transformation marker.

The genes involved in the biosynthesis of biotin were identified in the hyphal fungus Aspergillus nidulans through homology searches and complementation of Escherichia coli biotin-auxotrophic mutants. Whereas the 7,8-diaminopelargonic acid synthase and dethiobiotin synthetase are encoded by distinct genes in bacteria and the yeast Saccharomyces cerevisiae, both activities are performed in A. nidulans by a single enzyme, encoded by the bifunctional gene bioDA. Such a bifunctional bioDA gene is a genetic feature common to numerous members of the ascomycete filamentous fungi and basidiomycetes, as well as in plants and oömycota. However, unlike in other eukaryota, the three bio genes contributing to the four enzymatic steps from pimeloyl-CoA to biotin are organized in a gene cluster in pezizomycotina. The A. nidulans auxotrophic mutants biA1, biA2 and biA3 were all found to have mutations in the 7,8-diaminopelargonic acid synthase domain of the bioDA gene. Although biotin auxotrophy is an inconvenient marker in classical genetic manipulations due to cross-feeding of biotin, transformation of the biA1 mutant with the bioDA gene from either A. nidulans or Aspergillus fumigatus led to the recovery of well-defined biotin-prototrophic colonies. The usefulness of bioDA gene as a novel and robust transformation marker was demonstrated in co-transformation experiments with a green fluorescent protein reporter, and in the efficient deletion of the laccase (yA) gene via homologous recombination in a mutant lacking non-homologous end-joining activity.

Regulation of the Gac/Rsm pathway in "Pseudomonas fluorescens" CHA0

SUMMARY : Two-component systems are key mediators implicated in the response of numerous bacteria to a wide range of signals and stimuli. The two-component system comprised of the sensor kinase GacS and the response regulator GacA is broadly distributed among γ-proteobacteria bacteria and fulfils diverse functions such as regulation of carbon storage and expression of virulence. In Pseudomonas fluorescens, a soil bacterium which protects plants from root-pathogenic fungi and nematodes, the GacS/GacA two-component system has been shown to be essential for the production of secondary metabolites and exoenzymes required for the biocontrol activity of the bacterium. The regulatory cascade initiated by GacS/GacA consists of two translational repressor proteins, RsmA and RsmE, as well as three GacAcontrolled small regulatory RNAs RsmX, RsmY and RsmZ, which titrate RsmA and RsmE to allow the expression of biocontrol factors. Genetic analysis revealed that two additional sensor kinases termed RetS and Lads were involved as negative and positive control elements, respectively, in the Gac/Rsm pathway in P. fluoresens CHAO. Furthermore, it could be proposed that RetS and Lads interact with GacS, thereby modulating the expression of antibiotic compounds and hydrogen cyanide, as well as the rpoS gene encoding the stress and stationary phase sigma factor σ. Temperature was found to be an important environmental cue that influences the Gac/Rsm network. Indeed, the production of antibiotic compounds and hydrogen cyanide was reduced at 35°C, by comparison with the production at 30°C. RetS was identified to be involved in this temperature control. The small RNA RsmY was confirmed to be positively regulated by GacA and RsmA/RsmE. Two essential regions were identified in the rsmY promoter by mutational analysis, the upstream activating sequence (UAS) and the linker sequence. Although direct experimental evidence is still missing, several observations suggest that GacA may bind to the UAS, whereas the linker region would be recognized by intermediate RsmA/RsmEdependent repressors and/or activators. In conclusion, this work has revealed new elements contributing to the function of the signal transduction mechanisms in the Gac/Rsm pathway. RESUME : Les systèmes ä deux composants sont des mécanismes d'une importance notoire que beaucoup de bactéries utilisent pour faire face et répondre aux stimuli environnementaux. Le système à deux composants comprenant le senseur GacS et le régulateur de réponse GacA est très répandu chez les γ-protéobactéries et remplit des fonctions aussi diverses que la régulation du stockage de carbone ou l'expression de la virulence. Chez Pseudomonas fluorescens CHAO, une bactérie du sol qui protège les racines des plantes contre des attaques de champignons et nématodes pathogènes, le système à deux composants GacS/GacA est essentiel à la production de métabolites secondaires et d'exoenzymes requis pour l'activité de biocontrôle de la bactérie. La cascade régulatrice initiée pas GacS/GacA fait intervenir deux protéines répresseur de traduction, RsmA et RsmE, ainsi que trois petits ARNs RsmX, RsmY et RsmZ, dont la production est contrôlée par GacA. Ces petits ARNs ont pour rôle de contrecarrer l'action des protéines répressseur de la traduction, ce qui permet l'expression de facteurs de biocontrôle. Des analyses génétiques ont révélé la présence de deux senseurs supplémentaires, appelés Rets et Lads, qui interviennent dans la cascade Gac/Rsm de P. fluorescens. L'impact de ces senseurs est, respectivement, négatif et positif. Ces interactions ont apparenunent lieu au niveau de GacS et permettent une modulation de l'expression des antibiotiques et de l'acide cyanhydrique, ainsi que du gène rpoS codant pour le facteur sigma du stress. La température s'est révélée être un facteur environnemental important qui influence la cascade Gac/Rsm. Il s'avère en effet que la production d'antibiotiques ainsi que d'acide cyanhydrique est moins importante à 35°C qu'à 30°C. L'implication du senseur Rets dans ce contrôle par la température a pu être démontrée. La régulation positive du petit ARN RsmY par GacA et RsmA/RsmE a pu être confirmée; par le biais d'une analyse mutationelle, deux régions essentielles ont pu être mises en évidence dans la région promotrice de rsmY. Malgré le manque de preuves expérimentales directes, certains indices suggèrent que GacA puisse directement se fixer sur une des deux régions (appelée UAS), tandis que la deuxième région (appelée linker) serait plutôt reconnue par des facteurs intermédiaires (activateurs ou répresseurs) dépendant de RsmA/RsmE. En conclusion, ce travail a dévoilé de nouveaux éléments permettant d'éclairer les mécanismes de transduction des signaux dans la cascade Gac/Rsm.

Suboptimal Management of Coronary Risk in Daily Clinical Practice: Results from a Mediterranean Cohort of HIV-Infected Patients With Myocardial Infarction

Background: The incidence of cardiovascular events in HIV patients has fallen. Methods: We identified 81 patients with a history of coronary events from 2 hospitals in Spain to evaluate management of CVRF before and after the event. Results: The prevalence of coronary events was 2.15%. At the time of the coronary event, CVRF were highly prevalent. Decrease in total cholesterol (P=0.025) and LDLc(P=0.004) was observed. LDLc and HDLc were determined and the percentage of patients with LDLc &100 mg/dL remained stable at the last visit. Conclusions: The prevalence of coronary disease in our cohort was low. Although CVRF were highly.

A new continuous cell line from the mosquito Psorophora confinnis (Diptera: Culicidae) and its susceptibility to infections with some arboviruses

A new cell line, PC-0199-BR, was established from embryonated eggs of the mosquito Psorophora confinnis. To date (September 2000) it has had 62 continuous passages. This is the first report of a cell line of mosquitoes belonging to the genus Psorophora. Cell growth initially was achieved in the MM/VP12 medium, supplemented with 20% fetal bovine serum; however, the subcultures were later adapted to Grace's medium with 10% fetal bovine serum. Cell morphology in the primary cultures was heterogeneous; but later in the established cell line, the predominant cell type was epithelioid. Cultured cells were predominantly diploid (2n=6); however, chromosome abnormalities were observed in a small proportion of the cells in later passages. C and G band patterns were also determined in the karyotype. The cell line isozyme profiles coincided with pupae and adult samples of the species taken from the same colony. A preliminary arbovirus susceptibility study for the cell line was undertaken. No evidence was observed of contamination of the cell line with bacteria, fungi or mycoplasma.

PGC-1α regula la respuesta celular frente a estrés oxidativo en el miocardio tras síndrome coronario agudo

PGC-1α es un factor de transcripción maestro en la regulación mitocondrial de genes de protección frente a estrés oxidativo. Decidimos analizar el papel de la molécula en la regulación celular miocárdica tras infarto agudo. Evaluamos 38 pacientes con diagnóstico de SCACEST sometidos a estrategia de reperfusión. Encontramos que los pacientes con nivel basal de expresión reducido y mayor inducción de PGC-1α tras el evento presentaban infartos más extensos estimados por resonancia cardiaca. Concluimos que PGC-1α participa en la regulación de la respuesta celular frente a isquemia, en base a la activación de enzimas de protección mitocondrial.

Endocarditis infecciosa en un hospital terciario; aumento del número de casos asociados al medio hospitalario

Estudi prospectiu observacional realitzat entre gener 2003-juny 2010 amb casos diagnosticats de EI. Vam estudiar l’epidemiologia i els factors de risc de l'endocarditis infecciosa associada al medi hospitalari (EIAMH). Vam incloure 212 casos, el 34,9% eren EIAMH. Observarem un augment en la incidència en els darrers 4 anys (del 45,9% al 54,1%). La EIAMH s'ha associat a pacients grans i amb més comorbiditat. Staphylococcus aureus (21,7%) va ser el més freqüent. Aquests pacients van ser rebutjats per a la cirurgia amb major freqüència (40% vs 22%) i van presentar una major mortalitat (44,6% vs 19,6%) respecte al grup d'endocarditis comuniataria.

Aplicación de CPAP vs. BIPAP en pacientes con edema agudo de pulmón

Estudi clínic, prospectiu, randomizat, on d'un total de 59 pacients foren asignats a dos grups de soport ventilatori (CPAP (30) o BIPAP (29)). L' objectiu primari analizat fou la necessitat de IOT. Com objetius secundaris s'estudiaren la milloria de parámetres clínics, gasomètrics, el temps de soport ventilatori i d' estància en UCI, la supervivència a l' alta d' UCI i als 28 dies. No vam trobar diferències en cap dels paràmetres excepte en la pO2/FiO2 després de la primera hora (146,94CPAP vs 198,49BIPAP p=0.037).

Estacionalidad de la neumonía adquirida en la comunidad (NAC) y su influencia con el clima

La pneumònia adquirida a la comunitat (PAC) és una patologia molt prevalent, l´etiologia de la qual ve donada per les característiques de la regió geogràfica, de l'agent causal i del pacient. L'estudi de cadascuna d'elles és fonamental per al seu correcte abordatge terapèutic. Ens vam proposar estudiar els canvis de l'agent causal de la PAC en funció de l'estacionalitat i la influència dels canvis climàtics de la nostra àrea geogràfica. Material i mètode: Estudi prospectiu longitudinal de pacients ingressats per PAC des de Gener de 2008 a Desembre de 2009. Analitzem dades sociodemogràfiques, comorbiditat, gravetat, agent etiològic, complicacions i mortalitat. Correlacionem la temperatura mitjana, la precipitació acumulada mitjana i el caràcter de la precipitació per S. pneumoniae i Legionella pneumophila en cada estació de l'any. Anàlisi estadística: Xi quadrat, t de Student per mostres independents, anàlisi de la variància i correlació de Spearman. Resultats: Incloem 155 pacients, 63.9% homes i 54.8% majors de 65 anys. La major incidència de PAC va ser a l'hivern. Streptococcus pneumoniae va ser l'agent causal més freqüent en totes les estacions de l'any a excepció de l'estiu, que va ser Legionella pneumophila. Observem una correlació significativa entre la menor temperatura mitjana estacional i l'etiologia pneumocòccica i al revés quan l'agent causal va ser Legionella pneumophila. No obstant això, no trobem diferències etiològiques per estacions en relació amb la humitat ambiental. Conclusions: En la nostra àrea, Streptococcus pneumoniae és l'agent etiològic més freqüent a l'hivern amb baixes temperatures mentre que a l'estiu, amb altes temperatures, és Legionella pneumophila.

Utilidad de la ecografía abdominal con contraste en la valoración de la recurrencia quirúrgica en la enfermedad de Crohn.

En aquest estudi, s'ha intentat determinar si l'aplicació de contrast intravenós augmenta la rendibilitat de l'ecografia abdominal en l'estudi de la recurrència postquirúrgica de la malaltia de Crohn (EC). Per a això vam estudiar 40 pacients que complien uns determinats criteris d'inclusió, als quals se'ls va realitzar una colonoscopia (gold standar) i una ecografia abdominal (EA) amb contrast intravenós. Després d'analitzar els resultats, podem concloure, que l'ocupació de contrast durant la realització de l'ecografia abdominal permet augmentar la capacitat diagnòstica de la recurrència endoscópica en pacients amb EC i resecció intestinal, no obstant això la seva utilitat és menor per a valorar la gravetat de la recurrència

Estacionalidad de la tuberculosis en el área del Hospital Universitario Dr Peset de Valencia

La tuberculosi (TB) és una malaltia infecciosa. Diversos estudis han analitzat l'existència d'un patró estacional en la seva presentació amb resultats discordants. Ens vam proposar conèixer el patró estacional de diagnòstic de la malaltia en l'àrea del nostre hospital. Realitzem un estudi observacional prospectiu de tots els pacients, diagnosticats de TB durant el període 2002-2009 en el nostre Departament. Per a l'anàlisi estadística de les dades recollides s'ha utilitzat l'aplicació informàtica SPSS 15.0. amb un nivell de significació: p &0,05. En el nostre medi i clima, el diagnòstic de la tuberculosi pulmonar predomina durant els mesos càlids. Aquest predomini no s'ha relacionat amb les característiques socio-demogràfiques ni clíniques dels pacients.

Visualització de la interaccio entre la proteïnaG12 i la catenina p120

Els processos de senyalització a través de receptors acoplats a proteïnes G (GPCRs) estan implicats en una gran varietat de processos fisiològics i patològics. Els objectius de la meva recerca es centren en l’estudi de la funció de les proteïnes heterotrimèriques de la família G12, en particular, en el paper que aquestes proteïnes poden tenir en la inducció de la migració cel•lular. Des del seu descobriment, s’han descrit diversos efectors que s’uneixen i es regulen per aquestes proteïnes. Les proteïnes de la família de RhoGEF semblen ser els efectors més directes i que juguen un paper més important en els processos de senyalització de les proteïnes G12. Tanmateix, resultats recents semblen indicar que altres vies independent de l’activació de Rho són també necessàries perquè els efectes fisiològics de les vies de les proteïnes G12 tinguin lloc. En aquest camp, els resultats que he obtingut, juntament amb resultats previs del grup, han descrit una nova via d’activació independent de Rho. Hem trobat que la proteïna G12 s’uneix a una catenina: la catenina p120. La seva unió sembla tenir lloc a través l’extrem N-terminal de la catenina i condueix a la reducció de la fosforilació en algun dels seus residus de tirosina, ja sigui per la quinasa Src o per l’activació a través d’EGF. Per tant, aquests resultats suggereixen que una altra via d’acció de la proteïna G12 seria mitjançant la regulació de la catenina p120 i, com a conseqüència, alguns processos d’adhesió cel•lular es podrien veure afectats. A fi d’entendre millor la regulació i la interacció de la catenina p120 hem iniciat l’estudi de la seva distribució cel•lular en l’espai i temps mitjançant tècniques de microscopia. Així, vam intentar construir una sonda de G12 fluorescent amb GFP. Després de diversos intents i experiments amb proteïnes no funcionals hem aconseguit, amb la col•laboració de T. Meigs, una construcció funcional que activa Rho. Això ens permetrà acabar els experiments de seguiment in vivo.

Josep Pla i Miquel Bauçà davant l'espill de Nietzsche

En aquesta recerca vam provar de comparar les filosofies vitals dels autors J. Pla i M. Bauçà mitjançant la comparació amb la filosofia nietzschiana per a veure com aquesta els va influir al llarg de la vida. El resultat és prou interessant a l'hora d'entendre l'actualitat de les idees d'un pensador tan singular com el filòsof alemany en uns autors literaris del nivell dels esmentats.

Bloodstream infections in late-stage acquired immunodeficiency syndrome patients evaluated by a lysis centrifugation system

Opportunistic infections, which affect acquired immunodeficiency syndrome (Aids) patients, are frequently disseminated and may cause bloodstream infections (BSI). The aim of this study was to evaluate the main causes of BSI in Aids patients with advanced stage of the disease, with special emphasis on the identification of fungemia. During a 21 months period, all patients with Aids (CD4 < 200) and febrile syndrome admitted to 3 university hospitals were systematically evaluated. For each patient presenting fever, a pair of blood cultures was collected and processed by using a commercial lysis-centrifugation system. One hundred and eleven patients (75 males) with a mean age of 36 years (median 33 years) and mean CD4 count of 64 cells/ml were included. Among the 111 patients evaluated we documented 54 episodes of BSI, including 46 patients with truly systemic infections and 8 episodes considered as contaminants. BSI were caused by gram-positive bacteria (43%), fungi (20%), gram-negative bacteria (15%), mycobacteria (15%), and mixed flora (7%). The crude mortality rate of our patients was 39%, being 50% for patients with BSI and 31% for the others. In conclusion, BSI are a common related to systemic infections on Aids patients with advanced stage of disease and is associated with a high rate of mortality.

Factors Supporting Cysteine Tolerance and Sulfite Production in Candida albicans.

The amino acid cysteine has long been known to be toxic at elevated levels for bacteria, fungi, and humans. However, mechanisms of cysteine tolerance in microbes remain largely obscure. Here we show that the human pathogenic yeast Candida albicans excretes sulfite when confronted with increasing cysteine concentrations. Mutant construction and phenotypic analysis revealed that sulfite formation from cysteine in C. albicans relies on cysteine dioxygenase Cdg1, an enzyme with similar functions in humans. Environmental cysteine induced not only the expression of the CDG1 gene in C. albicans, but also the expression of SSU1, encoding a putative sulfite efflux pump. Accordingly, the deletion of SSU1 resulted in enhanced sensitivity of the fungal cells to both cysteine and sulfite. To study the regulation of sulfite/cysteine tolerance in more detail, we screened a C. albicans library of transcription factor mutants in the presence of sulfite. This approach and subsequent independent mutant analysis identified the zinc cluster transcription factor Zcf2 to govern sulfite/cysteine tolerance, as well as cysteine-inducible SSU1 and CDG1 gene expression. cdg1Δ and ssu1Δ mutants displayed reduced hypha formation in the presence of cysteine, indicating a possible role of the newly proposed mechanisms of cysteine tolerance and sulfite secretion in the pathogenicity of C. albicans. Moreover, cdg1Δ mutants induced delayed mortality in a mouse model of disseminated infection. Since sulfite is toxic and a potent reducing agent, its production by C. albicans suggests diverse roles during host adaptation and pathogenicity.

Trichomycetes (Zygomycota) in the digestive tract of arthropods in Amazonas, Brazil

Eight species of Harpellales and three species of Eccrinales (Zygomycota: Trichomycetes) were found associated with the digestive tract of arthropods from terrestrial and aquatic environments in the central Amazon region of Brazil. New species of Harpellales include: Harpella amazonica, Smittium brasiliense, Genistellospora tropicalis in Simuliidae larvae and Stachylina paucispora in Chironomidae larvae. Axenic cultures of S. brasiliense were obtained. Probable new species of Enterobryus (Eccrinales), Harpella, and Stachylina (Harpellales) are described but not named. Also reported are the previously known species of Eccrinales, Passalomyces compressus and Leidyomyces attenuatus in adult Coleoptera (Passalidae), and Smittium culisetae and Smittium aciculare (Harpellales) in Culicidae and Simuliidae larvae, respectively. Comments on the distribution of some of these fungi and their hosts in the Neotropics are provided.