Prediction of drug targets in human pathogens

The identification of new and druggable targets in bacteria is a critical endeavour in pharmaceutical research of novel antibiotics to fight infectious agents. The rapid emergence of resistant bacteria makes today's antibiotics more and more ineffective, consequently increasing the need for new pharmacological targets and novel classes of antibacterial drugs. A new model that combines the singular value decomposition technique with biological filters comprised of a set of protein properties associated with bacterial drug targets and similarity to protein-coding essential genes of E. coli has been developed to predict potential drug targets in the Enterobacteriaceae family [1]. This model identified 99 potential target proteins amongst the studied bacterial family, exhibiting eight different functions that suggest that the disruption of the activities of these proteins is critical for cells. Out of these candidates, one was selected for target confirmation. To find target modulators, receptor-based pharmacophore hypotheses were built and used in the screening of a virtual library of compounds. Postscreening filters were based on physicochemical and topological similarity to known Gram-negative antibiotics and applied to the retrieved compounds. Screening hits passing all filters were docked into the proteins catalytic groove and 15 of the most promising compounds were purchased from their chemical vendors to be experimentally tested in vitro. To the best of our knowledge, this is the first attempt to rationalize the search of compounds to probe the relevance of this candidate as a new pharmacological target.

Promising blood-derived biomarkers for estimation of the postmortem interval

A precise estimation of the postmortem interval (PMI) is one of the most important topics in forensic pathology. However, the PMI estimation is based mainly on the visual observation of cadaverous pheno- mena (e.g. algor, livor and rigor mortis) and on alternative methods such as thanatochemistry that remain relatively imprecise. The aim of this in vitro study was to evaluate the kinetic alterations of several bio- chemical parameters (i.e. proteins, enzymes, substrates, electrolytes and lipids) during putrefaction of human blood. For this purpose, we performed kinetic biochemical analysis during a 264 hour period. The results showed a significant linear correlation between total and direct bilirubin, urea, uric acid, transferrin, immunoglobulin M (IgM), creatine kinase (CK), aspartate transaminase (AST), calcium and iron with the time of blood putrefaction. These parameters allowed us to develop two mathematical models that may have predictive values and become important complementary tools of traditional methods to achieve a more accurate PMI estimation

Candida tropicalis biofilms: biomass, metabolic activity and secreted aspartyl proteinase production

According to epidemiological data, Candida tropicalis has been related to urinary tract infections and haematological malignancy. Several virulence factors seem to be responsible for C. tropicalis infections, for example: their ability to adhere and to form biofilms onto different indwelling medical devices; their capacity to adhere, invade and damage host human tissues due to enzymes production such as proteinases. The main aim of this work was to study the behaviour of C. tropicalis biofilms of different ages (24120 h) formed in artificial urine (AU) and their ability to express aspartyl proteinase (SAPT) genes. The reference strain C. tropicalis ATCC 750 and two C. tropicalis isolates from urine were used. Biofilms were evaluated in terms of culturable cells by colony-forming units enumeration; total biofilm biomass was evaluated using the crystal violet staining method; metabolic activity was evaluated by XTT assay; and SAPT gene expression was determined by real-time PCR. All strains of C. tropicalis were able to form biofilms in AU, although with differences between strains. Candida tropicalis biofilms showed a decrease in terms of the number of culturable cells from 48 to 72 h. Generally, SAPT3 was highly expressed. C. tropicalis strains assayed were able to form biofilms in the presence of AU although in a strain- and time-dependent way, and SAPT genes are expressed during C. tropicalis biofilm formation.

The unity of the organism; or, The organismal conception of life, by William Emerson Ritter ...

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The Statistical Structure of Visibility in Tbilisi

შესწავლილია ხილვადობის სიშორის სტატისტიკური სტრუქტურა თბილისში 1980-დან 2008 წლამდე პერიოდისათვის. გამოყენებულია საქართველოს ჰიდრომეტეოროლოგიური დეპარტამენტის მონაცემები ხილვადობის სხვადასხვა ბალიანობის მქონე დღეების რიცხვის შესახებ წელიწადში 9, 12 და 15 საათზე დაკვირვებებისათვის.

Changeability of Surface Ozone Concentration in Tbilisi in 1984-2010

მოყვანილია ქალაქ თბილისში 1984-დან 2010 წლებში მიწისპირა ოზონის კონცენტრაციის საშუალო ნახევარწლიური და წლიური მონაცემების დეტალური სტატისტიკური ანალიზის შედეგები.

Estudos sôbre a fertilidade dos solos do cerrado: I. efeito da calagem na disponibilidade do fósforo (Nota pr��via)

O m��todo da diluição isotópica foi empregado com êxito para estudar a influência de doses crescentes de calcário na disponibilidade do fósforo do solo de cerrado. Os valores A foram determinados usando-se uma técnica simplificada; as amostras de solos de cerrado usadas no trabalho haviam sido submetidas pr��viamente ao tratamento com diferentes dosagens de calcário em condições de campo. Tais amostras foram colhidas nas localidades de Orlandia, Pirassununga e Matão, todas elas no Estado de São Paulo. As seguintes conclusões puderam ser tiradas: (1) os tr��s tipos de solos de cerrado apresentaram teores diferentes de fósforo assimilável; (2) nos casos das amostras de Pirassununga e Matão a calagem aumetou a disponibilidade do fósforo de modo linear; em Orlandia, entretanto, a dose mais alta de calcário diminuiu significativamente o teor de fósforo disponível.

Estudos sobre a alimentação mineral do cafeeiro: XIX. extração de micronutrientes na colheita pelas variedades "Mundo novo", "Caturra Amarelo" e "Bourbon Amarelo"

Foi determinado o teor de micronutrientes na casca (polpa) e no grão de café "cereja" das variedades "Caturra Amarelo", "Bourbon Amarelo" e "Mundo Novo" colhidos em plantas cultivadas em tr��s tipos de solos - terra roxa leg��tima, massapé-salmour��o e arenito de Bauru. A análise revelou que as tr��s variedades possuem a mesma composição mineral com respeito aos elementos determinados. O tipo de solo - ou o local - influiu na composição das amostras. Em um saco de café em coco existem quantidades aproximadamente iguais dos elementos na casca e no grão.

Absor��ão dos macronutrientes pelos capins colonião, gordura jaraguá, napier e pangola

Para determinar a absor��ão de nitrog��nio, fósforo, potássio, cálcio, magnésio e enxofre em 5 espécies de forragens, conduziu-se um ensaio em vasos ao ar livre. Cada 28 dias até aos 84 dias colhiam-se plantas para a determinação de pêso de matéria sêca, bem como para a análise quantitativa dos macronutrientes. Verificou-se que o m��ximo de crescimento foi atingido pelo capim napier seguido do colonião, jaraguá, gordura e pangola. O potássio e nitrog��nio são absorvidos em maior quantidade do que o cálcio, fósforo, magnésio e enxôfre. As quantidades de nutrientes extraídos pelas plantas aos 84 dias de idade em g por kg de matéria sêca se acham ilustradas abaixo.

Eficiência de alguns produtos químicos sobre a "lagarta do cartucho do milho" Spodoptera frugiperda (J.E.Smith, 1797)

A lagarta do cartucho do milho é um sério depredador da cultura do milho. Quase todos os anos, os danos ocasionados às plantas são grandes. Para se conhecer o efeito de alguns defensivos sobre a citada lagarta, realizou-se este trabalho experimental, instalado em Piracicaba, SP, a 09 de dezembro de l983. Os produtos foram aplicados com pulverizador costal, manual, de 20 litros de capacidade, provido de bico em leque Teejet 8002. Utilizaram-se 200 litros de água por hectare e 30 cm�� de "Extravon" (espalhante-adesivo) por 100 litros de calda. Os tratamentos foram nove: A - testemu nha; B - monocrotofós, 240 g; C - bifentrina, 10 g; D - triazofós, 200 g; E -carbamato UC 75118, 150 g; F - monocro tofós, 400 g; G - acefato, 375 g; H - cabamato UC 76724, 150 g; I - clofentezina, 250 g. As quantidades acima são de ingrediente ativo por hectare. Aos 02 dias da pulverização, os melhores foram o triazofós e a bifentrina. Aos 07 dias, nenhum produto apresentava boa eficiência.

Defensivos químicos no combate ao "ácaro rajado" Tetranychus urticae Koch, 1836, em algodão

Com o objetivo de se conhecer a ação de vários produtos químicos contra o ácaro rajado, principal praga algodão em diversas áreas do Estado de São Paulo, foi instalado campo de experimentação em Americana. A aplicação foi feita em 17.02.1984, por meio de atomizador costal de 12 litros de capacidade, à razão de 200 litros de água por hectare. Tratamentos: oito, com quatro repetições, em delineamento experimental de blocos ao acaso. Cada parcela (canteiro) media 150 m�� (portanto, 600 m�� por tratamento). A- testemunha; B - triazofós, 300 g; C - monocrotofós, 600 g; D- bifentrina, 55 g; E - fempropatrina , 150 g; - bifentrina, 60 g; G - binapacril, 800 g; H- clofentezina, 750 g. As quantidades citadas acima são de ingre diente ativo por hectare. Os melhores foram a clofentezina e a bifentrina (Quadros II e III).

Estudo sobre Flebotomus no Vale Amazonico: Parte I: Descrição de F. marajoensis, F. pilosus, F. souzacastroi e F. christophersoni: (Diptera: Psychodidae)

Na presente publicação são descritas quatro espécies novas de Flebotomus de Região Amazônica do Brasil. Estas espécies foram designadas como F. marajoensis, F. pilosus, F. souzacastroi e F. christophersoni. F. marajoensis parece ser mais pr��cimo de F. walkeri NEWSTEAD, 1914 e F. verrucarum TOWNSEND, 1913. Dêstes difere o F. marajoensis por apresentar na gonapófise superior, além do grupo basal de cerdas, implantadas em uma crista e comum a ambas aquelas espécies, um segundo grupo de cerdas esparsas, com morfologia idêntica à do primeiro grupo, implantadas na região mediana. F. pilosus com suas numerosas cerdas no segmento basal da gonapófise superior e uma combinação de outros cracteres da genitália do macho, difere por completo das demais especies conhecidas. F. souzacastroi é afim a F. shannoni DYAR, 1929, mas pode ser dêle fàcilmente separado por possuir a gonapófise mediana em forma de cutelo. F. christophersoni aproximas-se muito de F. lanei BARRETO e COUTINHO, 1941. No entanto F. christophersoni se difencia fàcilmente de F. lanei pela presença de cerdas finas e longas inseridas na face superior da região mediana, o que não se observa em F. lanei.

Estudo sôbre flebotomus no vale Amazônico: parte II. descrição de F. Dunhami, F. Melloi e F. Wagleyi (Diptera, Psychodidae)

Tr��s espécies novas de Flebotomus da Região Amazônica são descritas sob os nomes de F. dunhami, F. melloi e F. wagleyi. Tôdas apresentam quatro espinhos no segmento distal da gonapófise superior e gonapófise mediana não bifurcada mas provida de um apêndice na face superior que dá ao conjunto a apar��ncia de uma bifurcação.