Metal speciation dynamics in colloidal ligand dispersions. Part 3: Lability features of steady-state systems

A lability criterion is developed for dynamic metal binding by colloidal ligands with convective diffusion as the dominant mode of mass transport. Scanned stripping chronopotentiometric measurements of Pb(II) and Cd(II) binding by carboxylated latex core-shell particles were in good agreement with the predicted values. The dynamic features of metal ion binding by these particles illustrate that the conventional approach of assuming a smeared-out homogeneous ligand distribution overestimates the lability of a colloidal ligand system. Due to the nature of the spatial distribution of the binding sites, the change in lability of a metal species with changing ligand concentration depends on whether the ligand concentration is varied via manipulation of the pH (degree of protonation) or via the particle concentration. In the former case the local ligand density varies, whereas in the latter case it is constant. This feature provides a useful diagnostic tool for the presence of geometrically constrained binding sites.

Optical and mechanical analysis on a biological cell in optical tweezers

La réponse mécanique d’une cellule à une force externe permet d’inférer sa structure et fonction. Les pinces optiques s’avèrent une approche particulièrement attrayante pour la manipulation et caractérisation biophysique sophistiquée des cellules de façon non invasive. Cette thèse explore l’utilisation de trois types de pinces optiques couramment utilisées : 1) statiques (static), 2) à exposition partagée (time-sharing) et 3) oscillantes (oscillating). L’utilisation d’un code basé sur la méthode des éléments finis en trois dimensions (3DFEM) nous permet de modéliser ces trois types de piégeage optique afin d’extraire les propriétés mécaniques cellulaires à partir des expériences. La combinaison des pinces optiques avec la mécanique des cellules requiert des compétences interdisciplinaires. Une revue des approches expérimentales sur le piégeage optique et les tests unicellulaires est présentée. Les bases théoriques liant l’interaction entre la force radiative optique et la réponse mécanique de la cellule aussi. Pour la première fois, une simulation adaptée (3DFEM) incluant la diffusion lumineuse et la distribution du stress radiatif permet de prédire la déformation d’une cellule biconcave –analogue aux globules rouges—dans un piège statique double (static dual-trap). À l’équilibre, on observe que la déformation finale est donnée par l’espacement entre les deux faisceaux lasers: la cellule peut être étirée ou même comprimée. L’exposition partagée (time-sharing) est la technique qui permet de maintenir plusieurs sites de piégeage simultanément à partir du même faisceau laser. Notre analyse quantitative montre que, même oscillantes, la force optique et la déformation sont omniprésentes dans la cellule : la déformation viscoélastique et la dissipation de l’énergie sont analysées. Une autre cellule-type, la tige cubique, est étudiée : cela nous permet d’élucider de nouvelles propriétés sur la symétrie de la réponse mécanique. Enfin, l’analyse de la déformation résolue en temps dans un piége statique ou à exposition partagée montre que la déformation dépend simultanément de la viscoélasticité, la force externe et sa forme tridimensionnelle. La technique à force oscillante (oscillating tweezers) montre toutefois un décalage temporel, entre la force et la déformation, indépendant de la forme 3D; cette approche donnerait directement accès au tenseur viscoélastique complexe de la cellule.

Development of new approaches for the synthesis and decoding of one-bead one-compound cyclic peptide libraries

La plupart des processus cellulaires et biologiques reposent, à un certain niveau, sur des interactions protéine-protéine (IPP). Leur manipulation avec des composés chimiques démontre un grand potentiel pour la découverte de nouveaux médicaments. Malgré la demande toujours croissante en molécules capables d’interrompre sélectivement des IPP, le développement d’inhibiteurs d’IPP est fortement limité par la grande taille de la surface d’interaction. En considérant la nature de cette surface, la capacité à mimer des structures secondaires de protéines est très importante pour lier une protéine et inhiber une IPP. Avec leurs grandes capacités peptidomimétiques et leurs propriétés pharmacologiques intéressan-tes, les peptides cycliques sont des prototypes moléculaires de choix pour découvrir des ligands de protéines et développer de nouveaux inhibiteurs d’IPP. Afin d’exploiter pleinement la grande diversité accessible avec les peptides cycliques, l’approche combinatoire «one-bead-one-compound» (OBOC) est l’approche la plus accessible et puissante. Cependant, l’utilisation des peptides cycliques dans les chimiothèques OBOC est limitée par les difficultés à séquencer les composés actifs après le criblage. Sans amine libre en N-terminal, la dégradation d’Edman et la spectrométrie de masse en tandem (MS/MS) ne peuvent pas être utilisées. À cet égard, nous avons développé de nouvelles approches par ouverture de cycle pour préparer et décoder des chimiothèques OBOC de peptides cycliques. Notre stratégie était d’introduire un résidu sensible dans le macrocycle et comme ancrage pour permettre la linéarisation des peptides et leur largage des billes pour le séquençage par MS/MS. Tout d’abord, des résidus sensibles aux nucléophiles, aux ultraviolets ou au bromure de cyanogène ont été introduits dans un peptide cyclique et leurs rendements de clivage évalués. Ensuite, les résidus les plus prometteurs ont été utilisés dans la conception et le développement d’approches en tandem ouverture de cycle / clivage pour le décodage de chimiothèques OBOC de peptides cycliques. Dans la première approche, une méthionine a été introduite dans le macrocycle comme ancrage pour simultanément permettre l’ouverture du cycle et le clivage des billes par traitement au bromure de cyanogène. Dans la seconde approche, un résidu photosensible a été utilisé dans le macrocycle comme ancrage pour permettre l’ouverture du cycle et le clivage suite à une irradiation aux ultraviolets. Le peptide linéaire généré par ces approches peut alors être efficacement séquencé par MS/MS. Enfin, une chimiothèque OBOC a été préparée et criblée la protéine HIV-1 Nef pour identifier des ligands sélectifs. Le développement de ces méthodologies permttra l’utilisation de composés macrocycliques dans les chimiothèques OBOC et constitue une contribution importante en chimie médicinale pour la découverte de ligands de protéines et le développement d’inhibiteurs d’IPP.

Deciphering the molecular role of DJ-1 in the etiology of Parkinson’s and Huntingtons’s disease

Tese de doutoramento, Ciências Biomédicas (Neurociências), Universidade de Lisboa, Faculdade de Medicina, 2014

Development of new methodologies for C-H insertion

Tese de doutoramento, Farmácia (Química Farmacêutica e Terapêutica), Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2014

Interference of mycobacterium tuberculosis with the endocytic/ antigen presentation pathways on macrophages and dendritic cells

Tese de doutoramento, Farmácia (Biologia Celular e Molecular), Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2014

Actividades práticas : contributos na aprendizagem da temática microrganismos e indústria alimentar : um estudo com alunos do 12º ano

Relatório da prática de ensino supervisionada, Mestrado em Ensino de Biologia e de Geologia, Universidade de Lisboa, 2014

A aprendizagem da noção de derivada no 11º ano

Relatório da prática de ensino supervisionada, Mestrado em Ensino da Matemática, Universidade de Lisboa, 2014

Dificuldades na resolução de equações de 2º grau dos alunos do 8º ano

Relatório da Prática de Ensino Supervisionada, Ciências da Educação (Mestrado em Ensino da Matemática), Universidade de Lisboa, Instituto de Educação, 2014

Geoengineering : the ethical and social issues

Tese de doutoramento, Filosofia (Filosofia da Natureza e do Ambiente), Universidade de Lisboa, Universidade Nova de Lisboa, 2015

The Impact of Thought Speed and Variability on Psychological State and Threat Perception: Further Exploration of the Theory of Mental Motion

Thought speed and variability are purportedly common features of specific psychological states, such as mania and anxiety. The present study explored the independent and combinational influence of these variables upon condition-specific symptoms and affective state, as proposed by Pronin and Jacobs’ (Perspect Psychol Sci, 3:461–485, 2008) theory of mental motion. A general population sample was recruited online (N = 263). Participants completed a thought speed and variability manipulation task, inducing a combination of fast/slow and varied/repetitive thought. Change in mania and anxiety symptoms was assessed through direct self-reported symptom levels and indirect, processing bias assessment (threat interpretation). Results indicated that fast and varied thought independently increased self-reported mania symptoms. Affect was significantly less positive and more negative during slow thought. No change in anxiety symptoms or threat interpretation was found between manipulation conditions. No evidence for the proposed combinational influence of speed and variability was found. Implications and avenues for therapeutic intervention are discussed.

Structural Diversity in Antibody Interactions with HIV-1 Env Immunogens

Thesis (Ph.D.)--University of Washington, 2013

e-poltergeist

E-poltergeist takes over the user’s internet browser, automatically initiating Web searches without their permission. Web-based artwork which explores issues of user control when confronted with complex technological systems, questioning the limits of digital interactive arts as consensual reciprocal systems. e-poltergeist was a major web commission that marked an early stage of research in a larger enquiry by Craighead and Thomson into the relationship between live virtual data, global communications networks and instruction-based art, exploring how such systems can be re-contextualised within gallery environments. e-poltergeist presented the 'viewer' with a singular narrative by using live internet search-engine data that aimed to create a perpetual and virtually unstoppable cycle of search engine results, banner ads and moving windows as an interruption into the normal use of an internet browser. The work also addressed the ‘de-personalisation’ of internet use by sending a series of messages from the live search engine data that seemed to address the user directly: 'Is anyone there?'; 'Can anyone hear me?', 'Please help me!'; 'Nobody cares!' e-poltergeist makes a significant contribution to the taxonomy of new media art by dealing with the way that new media art can re-address notions of existing traditions in art such as appropriation and manipulation, instruction-based art and conceptual art. e-poltergeist was commissioned ($12,000) for 010101: Art in Technological Times, a landmark international exhibition presented by the San Francisco Museum of Modern Art, which bought together leading international practitioners working with emergent technologies, including Tatsuo Miyajima, Janet Cardiff, Brian Eno. Peer recognition of the project in the form of reviews include: Curating New Media. Gateshead: Baltic Centre for Contemporary Art. Cook, Sarah, Beryl Graham and Sarah Martin ISBN: 1093655064; The Wire; http://www.wired.com/culture/lifestyle/news/2000/12/40464 (review by Reena Jana); Leonardo (review Barbara Lee Williams and Sonya Rapoport) http://www.leonardo.info/reviews/feb2001/ex_010101_willrapop.html All the work is developed jointly and equally between Craighead and her collaborator, Jon Thomson, Slade School of Fine Art.

Characterization of adenosinergic system in Rett syndrome

Tese de mestrado, Neurociências, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2015

Consumers' willingness to pay for ethical attributes

Purpose: In recent years, there has been a big increase in the use of ethical attributes as marketing appeals. This paper examines consumers’ willingness to pay for three selected ethical attributes, namely ‘Organic’, ‘Recyclable Packaging’ and ‘Fairtrade’ in monetary terms. Design/Methodology/Approach: A modified choice-based experimental design with manipulation of the key constructs was used to estimate the mean value of how much consumers are willing to pay for the selected attributes attached to a box of premium chocolates. The results are based on the responses of a total of 208 consumers. Findings: Of the three attributes, ‘Recyclable Packaging’ has the strongest influence on the purchase decision, although this attribute generates the least additional value. The aggregated result shows that although consumers are willing to pay more for the product with ethical attributes than the one that is without, still around a half of them are not willing to pay more. In terms of demographics, the results show no significant differences between the two genders or different age groups in their willingness to pay for ethical attributes. As might be expected, willingness to pay was correlated with the level of consciousness of the ethical attributes. Originality/Value: The findings of this study help management to think practically about the value consumers willing to pay for the selected attributes. The results show a significant synergy in a combination of ethical attributes in products.