Plasmid DNA partitioning and separation using poly(ethylene glycol)/poly(acrylate)/salt aqueous two-phase systems

Phase diagrams of poly(ethylene glycol)/polyacrylate/Na2SO4 systems have been investigated with respect to polymer size and pH. Plasmid DNA from Escherichia coil can depending on pH and polymer molecular weight be directed to a poly(ethylene glycol) or to a polyacrylate-rich phase in an aqueous two-phase system formed by these polymers. Bovine serum albumin (BSA) and E. coil homogenate proteins can be directed opposite to the plasmid partitioning in these systems. Two bioseparation processes have been developed where in the final step the pDNA is partitioned to a salt-rich phase giving a total process yield of 60-70%. In one of them the pDNA is partitioned between the polyacrylate and PEG-phases in order to remove proteins. In a more simplified process the plasmid is partitioned to a PEG-phase and back-extracted into a Na2SO4-rich phase. The novel polyacrylate/PEG system allows a strong change of the partitioning between the phases with relatively small changes in composition or pH. (C) 2012 Elsevier B.V. All rights reserved.

Optimization of an amperometric biosensor for the detection of hepatitis C virus using fractional factorial designs

Fractional factorial design and factorial with center point design were applied to the development of an amperometric biosensor for the detection of the hepatitis C virus. Biomolecules were immobilized by adsorption on graphite electrodes modified with siloxane-poly(propyleneoxide) hybrid matrix prepared using the sol-gel method. Several parameters were optimized, such as the streptavidin concentration at 0.01 mg mL(-1) and 1.0% bovine serum albumin, the incubation time of the electrodes in the complementary DNA solution for 30 minutes and a 1: 1500 dilution of the avidin-peroxidase conjugate, among others. The application of chemometric studies has been efficient, since the best conditions have been established with a restricted number of experiments, indicating the influence of different factors on the system.

Determinação eletroanalítica de corante reativo presente como contaminante em proteínas purificadas por cromatografia de afinidade

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Biochemical traits useful for the determination of genetic variation in a natural population of Myracrodruon urundeuva

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Desnutrição protéico-energética no paciente gastrectomizado

Racional - A gastrectomia traz conseqüências nutricionais inevitáveis mas atenuáveis, dependendo da dietoterapia pós-operatória. Embora observada, essa desnutrição protéico-energética é pouco dimensionada, provavelmente, pela falta de consenso metodológico. Objetivo - Avaliar o grau de desnutrição protéico-energética do paciente gastrectomizado, utilizando-se de indicadores isolados ou combinados. Pacientes e Métodos - Foram estudados 71 pacientes com gastrectomia parcial (n = 53) ou total (n =18) em pós-operatório de 6 a 24 meses e 24-60 meses. Os dados dietéticos, composição corporal e bioquímicos foram analisados de acordo com o tipo de gastrectomia e tempo pós-operatório. Resultados - A cirurgia foi conseqüência de complicações de úlcera péptica (68%) ou a câncer gástrico (32%). A perda de peso foi referida por 70% dos pacientes, sendo maior no grupo gastrectomia total (16 ± 5 kg) do que no grupo gastrectomia parcial (10 ± 6 kg). em geral, os pacientes apresentaram déficit antropométrico, albuminemia normal e baixa ingestão calórica, sugerindo deficiência energética crônica. A redução de hemoglobina, hematócrito e ferro ocorreu em maior intensidade e mais precocemente no grupo gastrectomia total. Assim, quando se associou hemoglobina aos indicadores albumina, linfócitos circunferência do braço e prega cutânea subescapular, a prevalência de desnutrição protéico-energética foi maior e em maior intensidade do que na ausência da hemoglobina. Conclusão - A gastrectomia resultou em desnutrição protéico-energética do tipo marasmática, acompanhada de anemia, mais intensa e precoce na gastrectomia total e gradativa na gastrectomia parcial, assemelhando-se à gastrectomia total no pós-operatório tardio.

Sensibilidade de indicadores da desnutrição protéico-energética em cirróticos com vários graus de disfunção hepatocelular

OBJETIVO: A sensibilidade de indicadores antropométricos e laboratoriais, na detecção da desnutrição protéico-energética de cirróticos foi estudada em 117 adultos, com gravidades (Child-Pugh), Child A (18), B (42) e C (57). RESULTADOS: Os indicadores antropométricos mais alterados foram: a circunferência braquial 61%, a prega cutânea tricipital 55% e a prega cutânea subescapular 53%, e os laboratoriais: albumina 93% e hemoglobina 90%. Com a combinação de indicadores circunferência braquial + prega cutânea subescapular + albumina ou hemoglobina, alcançaram-se 29% de déficit, valor idêntico ao da associação apenas de circunferência braquial + prega cutânea subescapular. Essa combinação (circunferência braquial e prega cutânea subescapular) detectou 63% de desnutrição protéico-energética, com predominância das formas moderada e grave em todos os graus Child. CONCLUSÃO: A desnutrição protéico-energética na cirrose hepática é predominantemente protéica, podendo ser caracterizada por indicadores laboratoriais (mais sensíveis) ou, com maior especificidade, pela circunferência braquial, embora inespecífica à discriminação da gravidade da desnutrição protéico-energética entre os grupos Child B e C.

Níveis plasmáticos de taurina e de seus precursores em pacientes com câncer de esôfago

RACIONAL: O câncer de esôfago tem impacto relevante no metabolismo protéico do hospedeiro, mas pouco se conhece sobre as implicações no metabolismo protéico sulfurado. Deste, destaca-se a taurina, composto participante de várias funções fisiológicas importantes como a manutenção do sistema de defesa celular e possível sobrevida do paciente. OBJETIVO: Estudar as variações plasmáticas da taurina e de seus precursores em pacientes com câncer de esôfago. MÉTODO: em estudo transversal foram triados 16 pacientes (43-73 anos) com câncer de esôfago e 20 voluntários (27-65 anos) controles sadios que preencheram os critérios clínicos e éticos da pesquisa. Para caracterização do estado geral de saúde efetuou-se avaliação antropométrica, hematimétrica (Hb, Ht, glóbulos brancos, linfócitos) e bioquímica (albumina, glicose, lipídios, aminotransferases). Adicionalmente, foram realizadas, no plasma, análises cromatográficas de taurina e seus precursores cisteína e homocisteína. Foi registrado o tempo de sobrevivência dos pacientes, a partir do diagnóstico histopatológico. RESULTADOS: Os pacientes com câncer de esôfago foram predominantemente do sexo masculino, raça branca, classe socioeconômica baixa, tipo carcinoma espinocelular de localização no terço superior, em estádio IV, sobrevida de 7,8 ± 5,5 anos, referindo perda de peso em 16,4% e apresentando hipoalbuminemia em 50%, com massa muscular e adiposa semelhante ao controle. Os pacientes apresentaram valores estatisticamente menores do que os controles para Hb, Ht, colesterol total, HDL-colesterol e cisteína e maiores de AST, ALT, taurina e homocisteína. Dentre os pacientes houve correlação positiva da taurina tanto com a contagem total de linfócitos, como com a sobrevida dos pacientes. CONCLUSÃO: Os níveis reduzidos de cisteína e elevados de homocisteína, taurina e as associações positivas da taurina com os indicadores da imunocompetência celular e da mortalidade sugerem participação efetiva da taurina na sobrevida dos pacientes e, portanto, os cuidados nutricionais específicos com a sua via geradora (cisteína, metionina e vitaminas do complexo B).

Avaliação do estado nutricional precedente ao uso de nutrição enteral

CONTEXTO: O adequado diagnóstico do estado nutricional é de vital importância para a prescrição da terapia nutricional enteral no ambiente hospitalar. OBJETIVO: Avaliar indicadores do estado nutricional em pacientes ingressantes na terapia nutricional enteral em uma unidade hospitalar. MÉTODOS: Estudo transversal com 100 pacientes adultos, sendo analisado o estado nutricional de ingresso à terapia nutricional enteral, por meio do índice de massa corporal obtido do peso e estatura estimados a partir de fórmulas de predição, e de indicadores laboratoriais do estado metabólico e nutricional. RESULTADOS: do total, 29% dos pacientes foram classificados como desnutridos pelo índice de massa corporal, enquanto 80% dos mesmos apresentaram albumina abaixo do valor de referência (<3,2 g/dL). Não houve diferença na distribuição das causas de base da internação entre os grupos classificados quanto ao estado nutricional pelo índice de massa corporal, prevalecendo as doenças cardiovasculares e pulmonares entre as principais causas. As concentrações abaixo dos valores de referência de albumina não foram diferentes entre os grupos classificados pelo índice de massa corporal e pelo diagnóstico de internação. CONCLUSÃO: O índice de massa corporal estimado foi indicador específico do estado nutricional, porém pouco sensível, enquanto a albumina mostrou-se mais sensível, o que reafirma a necessidade da combinação de vários indicadores para obtenção de um adequado diagnóstico nutricional.

Grade of esophageal cancer and nutritional status impact on postsurgery outcomes

CONTEXTO: A desnutrição protéico-energética constitui causa previsível para o desenvolvimento de complicações pós-operatórias e pior prognóstico de pacientes cirúrgicos. OBJETIVO: Estudar a associação de indicadores de estado nutricional com estádio da doença e as principais complicações e mortalidade pós-operatória de pacientes com câncer de esôfago. MÉTODO: Foram avaliados retrospectivamente 100 prontuários de pacientes com câncer de esôfago (38-81 anos) de ambos os sexos (85% masculino e 15% feminino) submetidos a esofagectomia (n = 25) e gastrojejunostomia (n = 75), no período de 1995 a 2004. Os dados coletados foram: história clínica, exame endoscópico, estádio (TNM-UICC), estado nutricional (índice de massa corporal, percentual de perda de peso - %PP, albuminemia e contagem de linfócitos total) e evolução clínica pós-operatória. Houve composição dos grupos de acordo com o porte da cirurgia (grande x pequeno). Foi realizada a associação entre as complicações pós-operatórias e a mortalidade (após pós-operatório de 30 dias). As comparações entre médias dos dois grupos foram feitas pelo teste t de Student e a existência de associações entre variáveis testadas pelos testes de χ2 ou exato de Fisher com P = 0,05. RESULTADOS: Houve predomínio dos tumores avançados (estádio III e IV), com a presença de disfagia em 95% dos pacientes e perda ponderal >10%, anterior ao diagnóstico, em 78%. A obstrução esofágica, presente em 77 pacientes, foi associada (P = 0,0021) com o baixo índice de massa corporal (desnutrição protéico-energética). A %PP e a hipoalbuminemia associaram-se estatisticamente (P<0,05) com o estádio avançado da doença. As complicações pós-operatórias precoces ocorreram em 69,2% e 30,7% dos pacientes submetidos a esofagectomia e ostomias, respectivamente, com predomínio das infecciosas nas ostomias (80%) e as pleuropulmonares nas esofagectomias (61%). A albuminemia foi menor nos pacientes submetidos as ostomias, tendo sido a hipoalbuminemia associada (P<0,05) com a ocorrência de complicações pós-operatórias e mortalidade. A %PP e a contagem de linfócitos total associaram-se com as complicações pós-operatórias precoces e infeccionas nas ostomias e a contagem de linfócitos total, com a mortalidade operatória nas esofagectomias. CONCLUSÕES: O estado de DPE esteve associado às complicações pós-operatórias apenas nos pacientes submetidos a ostomias, sem presença destas associações nas esofagectomias.

Avaliação de contaminantes inorgânicos e orgânicos em álcool combustível utilizando eletroforese capilar

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Desenvolvimento e validação de método analítico para determinação simultânea de catecolaminas em órgãos reprodutores de ratos por cromatografia líquida de alta eficiência com detecção eletroquímica

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Toxicological evaluation of long-term intravenous administration of amitraz in horses

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)

Genotoxicity and mutagenicity of water contaminated with tannery effluents, as evaluated by the micronucleus test and comet assay using the fish Oreochromis niloticus and chromosome aberrations in onion root-tips

Cytotoxicity of metals is important because some metals are potential mutagens able to induce tumors in humans and experimental animals. Chromium can damage DNA in several ways, including DNA double strand breaks (DSBs) which generate chromosomal aberrations, micronucleus formation, sister chromatid exchange, formation of DNA adducts and alterations in DNA replication and transcription. In our study, water samples from three sites in the Córrego dos Bagres stream in the Franca municipality of the Brazilian state of São Paulo were subjected to the comet assay and micronucleus test using erythrocytes from the fish Oreochromis niloticus. Nuclear abnormalities of the erythrocytes included blebbed, notched and lobed nuclei, probably due to genotoxic chromium compounds. The greatest comet assay damage occurred with water from a chromium-containing tannery effluent discharge site, supporting the hypothesis that chromium residues can be genotoxic. The mutagenicity of the water samples was assessed using the onion root-tip cell assay, the most frequent chromosomal abnormalities observed being: c-metaphases, stick chromosome, chromosome breaks and losses, bridged anaphases, multipolar anaphases, and micronucleated and binucleated cells. Onion root-tip cell mutagenicity was highest for water samples containing the highest levels of chromium.

Digestibilidade total e parcial e balanço nitrogenado em bovinos em pastejo no período das águas recebendo suplementos com nitrogênio não-proteico e/ou proteína verdadeira

Objetivou-se avaliar o efeito de diferentes relações entre proteína verdadeira e nitrogênio não-proteico sobre a digestibilidade, a síntese de proteína microbiana e o balanço de compostos nitrogenados em bovinos em pastejo durante o período das águas. Foram utilizados cinco novilhos mestiços Holandês × Zebu, castrados, com peso vivo inicial de 335±35 kg fistulados no rúmen e no abomaso. Os tratamentos foram: controle (somente pasto); e suplementos com ureia; com 2/3 de compostos nitrogenados oriundos da ureia e 1/3 de compostos nitrogenados oriundos da albumina; com 1/3 de compostos nitrogenados oriundos da ureia e 2/3 de compostos nitrogenados oriundos da albumina; e com albumina. Foram fornecidos 200 g/dia de proteína bruta (PB) a partir dos suplementos. O experimento foi conduzido segundo delineamento em quadrado latino 5 × 5, com cinco períodos experimentais, cada um de 15 dias. A suplementação não afetou os coeficientes de digestibilidade total nem o teor de nutrientes digestíveis totais da dieta; elevou as estimativas do coeficiente de digestibilidade aparente ruminal da PB, que migraram de negativa, no tratamento controle, para positivas, porém não diferentes de zero, nos tratamentos envolvendo suplementação. O fornecimento de suplementos elevou a concentração de nitrogênio amoniacal ruminal. O balanço de compostos nitrogenados aumentou com a suplementação. A substituição de ureia por albumina influenciou de forma cúbica o balanço de compostos nitrogenados, cuja estimativa foi maior para o suplemento com 1/3 de PB oriunda da ureia. A eficiência de síntese microbiana no rúmen não foi influenciada pelo fornecimento ou pela composição dos suplementos. A suplementação de bovinos em pastejo com fontes de compostos nitrogenados degradáveis durante o período das águas amplia a eficiência de uso do pasto, principalmente por ampliar a retenção de compostos nitrogenados no organismo.

Follicular dynamics and production of oocytes in young Nellore heifers with energetic supplementation

To verify the effects of energy supplementation and fat on follicular dynamics, metabolic profile and the production of oocytes, 15 young heifers (Bos taurus indicus) with an average age of 14 months and with an initial weight of 256.35 kg were assigned to two treatments according to weight and follicular population as evaluated by ultrasonography: in T1 (1.0 × M), animals received 100% of the energy requirements for maintenance; in T2 (1.7 × M), animals received 170% of the energy requirements for maintenance, achieved by the addition of 200 g of Megalac®. After a period of adaptation to the diet, the treatments, blood collection and follicular aspirations were started using a randomized design. The dry matter intake and weight gain were lower in the 1.0 × M group than in the 1.7 × M group. No differences were found in the plasma progesterone concentrations, albumin, glucose, urea or gonadotropin (FSH and LH) levels between the groups. The mean concentrations of cholesterol were higher in the 1.7 × M group. The total number of small (<4 mm) and medium follicles (4-8 mm) was not altered by the treatments, but the number of small follicles increased on days 1 and 2 of the estrous cycle, with higher values found in the 1.7 × M group. The average of the oocytes also increased (9.50±2.1 and 12.5±4.4 for the 1.0 × M and 1.7 × M groups, respectively). The rapid increase in the amount of energy offered in the diet changes the amount of follicles and oocytes available for follicular aspiration (OPU) in young heifers without changing their metabolic profile.