The EGOIST Overlay Routing System

A foundational issue underlying many overlay network applications ranging from routing to peer-to-peer file sharing is that of connectivity management, i.e., folding new arrivals into an existing overlay, and rewiring to cope with changing network conditions. Previous work has considered the problem from two perspectives: devising practical heuristics for specific applications designed to work well in real deployments, and providing abstractions for the underlying problem that are analytically tractable, especially via game-theoretic analysis. In this paper, we unify these two thrusts by using insights gleaned from novel, realistic theoretic models in the design of Egoist – a distributed overlay routing system that we implemented, deployed, and evaluated on PlanetLab. Using extensive measurements of paths between nodes, we demonstrate that Egoist’s neighbor selection primitives significantly outperform existing heuristics on a variety of performance metrics, including delay, available bandwidth, and node utilization. Moreover, we demonstrate that Egoist is competitive with an optimal, but unscalable full-mesh approach, remains highly effective under significant churn, is robust to cheating, and incurs minimal overhead. Finally, we use a multiplayer peer-to-peer game to demonstrate the value of Egoist to end-user applications. This technical report supersedes BUCS-TR-2007-013.

Studies of rhodium, platinum and palladium derivatives of some arsena-, carba- and telluraboranes

The research described in this thesis involved the synthesis and characterisation of rhodium, platinum and palladium derivatives of arsena-, carba- and telluraboranes.

A king for the queene: Samuel Sheppard's the faerie king and his reception of Spenser's epic authority

This thesis is the study of the use and abuse of Edmund Spenser as an authority in native English epic literature of the early seventeenth century, within fifty years of his death. It focuses on attempts to emulate or adapt his seminal text, The Faerie Queene (1596), and offers a comparative analysis of two such approaches by the liminal authors, Ralph Knevet and Samuel Sheppard. The former, a tutor to the wealthy Norfolk Paston family, produced his A Supplement of the Ferie Queene in the pre-Civil War period (c.1630-1635), while the latter wrote The Faerie King at the very end of the social upheaval of the war (c.1648-54). The thesis privileges the study of the holograph manuscripts (Cambridge University Library, MS Ee.3.53 and Bodleian Library MS Rawl. Poet. 28 respectively) over the basic editions of these neglected texts. It argues for the need to re-evaluate the significance of such texts within the Spenserian canon and, through new readings of the texts' structures and contexts, the thesis questions the legitimacy of canon formation and continuation, as well as the influence editorial policies and decision making can have on subsequent readers and receptions of the text

Urbanisation and sport participation in townships in China

Urbanisation as a phenomenon is a complex social process which can be quite difficult to define and understand. In recent years, urbanisation in China has developed at an ever increasing rate. Urban population rates have now surpassed 50% (figure from 2011). Based on the growing importance placed on the increasing number of urbanised/urbanising townships, the issue of people’s lives within the townships has also become an important feature in regard to the impact that urbanisation is having upon China. Clearly this links China’s urban development to the transformation of sport participation in China. This research aims to examine what the reality of the sport participation on-the-ground is within six selective townships in China and examine the reasons for the reality through the lens of figurational theory. In order to do so, some features of Norbert Elias’s figurational theory (involvement and detachment, power) are employed as the theoretical framework. Two townships in Lüliang of Shanxi province, two townships in Jincheng of Shanxi Province and two townships in Huizhou of Guangdong province were selected in order to answer these key questions. The three cities which the townships are located are in different stages of urbanisation. Semi-structured interview were conducted. The current situation were described from the aspects of age, gender, occupation and income aspects and the transformation of sport participation. This research concludes that the current sport participation situation within these six townships is due to the influences stemming from several aspects: sport policy and sport organisation; economy condition, culture, urbanisation, and self-requirement and individual interest towards sport. This power forms a network of interdependency which also aids our understanding of the current sport participation within these six selected Chinese townships.

The ELDERMET biobank: Isolation and characterization of the intestinal microbiota from elderly Irish subjects

The human gastrointestinal (GI) tract is colonized by a dense and diverse bacterial community, the commensal microbiota, which plays an important role in the overall health of individuals. This microbiota is relatively stable throughout adult life, but may fluctuate over time with aging and disease. The adaptation of the gut microbiota to our changing life-style is probably the reason for the large inter-individual variation observed among different people. Since the gut microbiota plays an essential role in interactions with host metabolism, it is of utmost importance to explore this relationship. The elderly intestinal microbiota has been the subject of a number of studies in recent years. The results presented in this thesis have further contributed to the expansion of knowledge related to gut microbiota research highlighting the combined effect of culture based and molecular methods as powerful tools for understanding the true impact of microbes. The degree of correlation between measurements from both methods suggested that a single method is capable of profiling intestinal Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp. and Enterobacteriaceae populations. Bacteriocins have shown great promise as alternatives to traditional antibiotics. In this respect, the isolation and characterisation of bacteriocinogenic strains are important due to growing evidence indicating bacteriocin production as a potential probiotic trait by virtue of strain dominance and/or pathogen inhibition in the mammalian intestine. The selection pressure applied on the bacterial population during antibiotic usage is the driving force for the emergence of antibiotic resistant bacteria. Identification of antibiotic resistant isolates opens up the possibility of using such probiotics to offset the problems caused by antibiotics to the gut microbiota and to improve the intestinal microbial environment. Future work is required to explore the culture collection housing thousands of bacterial isolates as a valuable source of potential probiotics for use for the elderly Irish community.

Polymorphisms at the microRNA binding-site of the stem cell marker gene CD133 modify susceptibility to and survival of gastric cancer.

CD133 is one of the most common stem cell markers, and functional single nucleotide polymorphisms (SNPs) of CD133 may modulate its gene functions and thus cancer risk and patient survival. We hypothesized that potentially functional CD133 SNPs are associated with gastric cancer (GC) risk and survival. To test this hypothesis, we conducted a case-control study of 371 GC patients and 313 cancer-free controls frequency-matched by age, sex, and ethnicity. We genotyped four selected, potentially functional CD133 SNPs (rs2240688A>C, rs7686732C>G, rs10022537T>A, and rs3130C>T) and used logistic regression analysis for associations of these SNPs with GC risk and Cox hazards regression analysis for survival. We found that compared with the miRNA binding site rs2240688 AA genotype, AC + CC genotypes were associated with significantly increased GC risk (adjusted OR = 1.52, 95% CI = 1.09-2.13); for another miRNA binding site rs3130C>T SNP, the TT genotype was associated with significantly reduced GC risk (adjusted OR = 0.68, 95% CI = 0.48-0.97), compared with CC + CT genotypes. In all patients, the risk rs3130 TT variant genotype was significantly associated with overall survival (OS) (adjusted P(trend) = 0.016 and 0.007 under additive and recessive models, respectively). These findings suggest that these two CD133 miRNA binding site variants, rs2240688 and rs3130, may be potential biomarkers for genetic susceptibility to GC and possible predictors for survival in GC patients but require further validation by larger studies.

High-coverage sequencing and annotated assemblies of the budgerigar genome.

BACKGROUND: Parrots belong to a group of behaviorally advanced vertebrates and have an advanced ability of vocal learning relative to other vocal-learning birds. They can imitate human speech, synchronize their body movements to a rhythmic beat, and understand complex concepts of referential meaning to sounds. However, little is known about the genetics of these traits. Elucidating the genetic bases would require whole genome sequencing and a robust assembly of a parrot genome. FINDINGS: We present a genomic resource for the budgerigar, an Australian Parakeet (Melopsittacus undulatus) -- the most widely studied parrot species in neuroscience and behavior. We present genomic sequence data that includes over 300× raw read coverage from multiple sequencing technologies and chromosome optical maps from a single male animal. The reads and optical maps were used to create three hybrid assemblies representing some of the largest genomic scaffolds to date for a bird; two of which were annotated based on similarities to reference sets of non-redundant human, zebra finch and chicken proteins, and budgerigar transcriptome sequence assemblies. The sequence reads for this project were in part generated and used for both the Assemblathon 2 competition and the first de novo assembly of a giga-scale vertebrate genome utilizing PacBio single-molecule sequencing. CONCLUSIONS: Across several quality metrics, these budgerigar assemblies are comparable to or better than the chicken and zebra finch genome assemblies built from traditional Sanger sequencing reads, and are sufficient to analyze regions that are difficult to sequence and assemble, including those not yet assembled in prior bird genomes, and promoter regions of genes differentially regulated in vocal learning brain regions. This work provides valuable data and material for genome technology development and for investigating the genomics of complex behavioral traits.

Modelos animales para caracteres con efectos maternos, madres no identificadas e información incompleta

La evaluación genética para caracteres de crecimiento pre - destete requiere ajustar modelos animales con efectos maternos (MAM). Tanto la estimación paramétrica de la variabilidad como la evaluación genética mediante MAM son realizadas empleando datos de campo, muchos de los cuales no poseen información completa para todas las variables explicativas maternas. Es común no contar con la identificación de madres (biológicas y/o receptoras), de abuelas maternas y, consecuentemente, de la edad de la madre (EM). Este problema es bien marcado en razas compuestas como Brangus y Braford que tienen políticas para registrar animales de pedigrí "abierto". Además, no existe un consenso sobre cuál es el mejor modelo de predicción, y existen interrogantes sobre la magnitud de los componentes de (co) varianza genético-aditivos y ambientales del modelo de evaluación. La primera investigación de esta tesis consistió en la estimación, mediante métodos bayesianos de los parámetros de dispersión en MAMs con distintas estructuras de (co) varianza, para datos de peso al destete de animales Angus de pedigrí. El análisis se caracterizó por la originalidad en los muestreos de las distribuciones marginales posteriores de las covarianzas genéticas aditivas y de la correlación entre los efectos ambientales maternos permanentes de una vaca y sus hijas también madres. Con el objeto de especificar correctamente la fracción aditiva de las (co) varianzas cuando se desconocen las madres y/o abuelas maternas de los animales con datos, en otro capítulo se desarrollaron MAMs equivalentes que no requieren alargar los vectores de los valores de cría con madres o abuelas fantasmas. Finalmente, se desarrolló un modelo mixto que atenúa el sesgo por error de medición clásico en el efecto EM, e introduce splines penalizadas y una estructura de (co) variación autoregresiva de orden 1 para suavizar las covarianzas residuales Este modelo es apropiado para ajustar datos de animales nacidos por transplante embrionario con madres receptoras desconocidas

Estudio del sistema de agronegocios lechero de la Región Sierra del Ecuador : identificación de restricciones y oportunidades para mejorar su competitividad

La creciente ola de prosperidad y urbanización en Asia, África y América Latina fomenta el aumento en la demanda de productos lácteos. Una investigación realizada por Tetra PakDairyIndex en el 2011, proyecta un aumento de cerca de 25 por ciento en el consumo global de leche entre 2010 y 2020. América Latina reúne condiciones insuperables para aumentar sus producciones de leche y ser proveedor de la demanda del propio continente En Ecuador, se ha incrementado la producción de leche y productos lácteos, aunque sólo exporta el 1 por ciento de su producción, mientras que la población ecuatoriana todavía mantiene un bajo nivel de consumo de lácteos. Este hecho mantiene latentes las oportunidades para el desarrollo de la industria láctea y la ganadería nacional. El presente trabajo tiene por objetivo realizar un estudio del Sistema de Agronegocios lechero de la Región Sierra de Ecuador, el cuál permita conocer su desarrollo y limitaciones, y a partir de las mismas proponer alternativas de mejora competitiva. Se utiliza el método EPESA el cual establece los lineamientos para el estudio de sistemas de agronegocios desde una óptica sistémica y utilizando como marco teórico de la nueva economía institucional. Se realizó un análisis de fuentes de información secundaria así como también se realizaron entrevistas con informantes calificados dada la escasez de información a nivel nacional. El SAG lechero de la Región Sierra cuenta con dos subsistemas: el subsistema formal y el informal, surgen a partir del bajo enforcement institucional y una demanda local que prefiere lácteos no pasteurizados y "directo del campo". Es por ello que se observan mayores niveles de tecnificación, productividad, inocuidad, sanidad y calidad en el subsistema formal, lo que lleva a competencia desleal entre ambos subsistemas. Otro aspecto se refiere a las transacciones, las cuales en general todas las transacciones del sistema (y en ambos subsistemas) son de altos niveles de incertidumbre y costos de transacción, a pesar que en el subsistema formal se observan contratos. Del análisis competitivo se observa en comparación con el SAG lechero del Uruguay, el SAG lechero cuenta desventajas competitivas en factores tecnológicos avanzados (status sanitario, genética, disponibilidad y uso de maquinaria), también en la demanda (dado el bajo consumo per cápita y una demanda de baja exigencia en calidad, y bajas exportaciones), la baja presencia en el sistema de organismos de investigación y organizaciones gremiales, y la ausencia de cooperativas sumado a una alta atomización de los productores. Este estudio ha sido clave para proponer una alternativa de mejora competitiva del sistema, el cual se resume en la creación de un organismo público-privado (CONALECH) que coordine y dictamine las estrategias que el sistema debe seguir.

Riesgos laborales y uso responsable de plaguicidas en el acopio de granos : estudio de caso : planta de semillas del INTA Anguil

Según estimaciones de la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO) el mundo duplicará la demanda de alimentos para el año 2050. La mitad de este crecimiento se explica por el aumento de la población mundial, mientras que la restante responde al incremento de los ingresos per cápita en países de bajos recursos (FAO, 2009). En este contexto, la solución viable a futuro es duplicar la productividad de aquellas zonas que todavía conservan algún potencial de expansión. Las grandes superficies de suelos de alta calidad con posibilidades de aumentar su productividad se encuentran en Estados Unidos, Ucrania y la Argentina. Una mayor producción requiere de productos fitosanitarios que representan un beneficio innegable garantizando estabilidad en los rendimientos. Sin embargo, la utilización de estos insumos entraña riesgos tóxicos, ya sea por un manejo inapropiado o por la ocurrencia de accidentes (CASAFE, 2009). El uso de los plaguicidas debe ser responsable a fin de evitar producir efectos adversos inmediatos y de largo plazo en la salud humana y el medio ambiente. Estos efectos pueden aparecer en todo el ciclo de vida del plaguicida, es decir durante la producción, transporte, almacenamiento, aplicación y disposición final. En la realización de su trabajo las personas pueden quedar expuestas a altos niveles de sustancias tóxicas. Actualmente la intoxicación con plaguicidas es un serio problema de salud que afecta a los trabajadores rurales, a la familia rural, y a la población en general. Se sabe que se producen millones de casos de intoxicación aguda por año a nivel mundial. Sin embargo, en nuestro país existe poca información sobre accidentes y se desconoce cuál es la contribución de los plaguicidas al desarrollo de enfermedades crónicas. Los principales riesgos con plaguicidas ligados a la salud humana se relacionan con la aparición de cáncer, defectos de nacimiento, afecciones del sistema nervioso y del funcionamiento del sistema endócrino (Ministerio de Salud, 2007). Para minimizar los efectos negativos, el uso de plaguicidas debe realizarse en el marco del Manejo Integrado de Plagas (MIP). En la selección debe considerarse la peligrosidad de los ingredientes activos, coadyuvantes y acompañantes, su potencial de persistencia y bioacumulación. Los trabajadores que manipulan plaguicidas deben recibir capacitación sobre riesgos, protecciones, y procedimientos de trabajo seguro. En el acopio de granos se combaten diversas plagas, principalmente insectos, ácaros, hongos y roedores. Estos organismos tienen altas tasas de reproducción y su presencia en el ámbito comercial se considera objetable debido a los daños y mermas que producen (López Mérida et al, 2001). En el control químico de estas plagas se utilizan sustancias peligrosas para la salud, por ejemplo fumigantes que actúan como vapores en concentraciones letales para el ser humano e insecticidas de alta toxicidad y gran poder residual capaces de ingresar al organismo por las vías inhalatoria y dérmica. En el presente trabajo se analizan los riesgos laborales en el acopio de granos con particular interés en el uso de plaguicidas de esta actividad. Adicionalmente, se realizó un estudio de caso en la Planta de Semillas de la Estación Experimental INTA Anguil. En este estudio se desarrollaron procedimientos de trabajo seguro (PTS) para el uso deplaguicidas y el trabajo en espacios confinados en dicho establecimiento (Anexos 1-5).

Estudio del sistema de agronegocios lechero de la Región Sierra del Ecuador : identificación de restricciones y oportunidades para mejorar su competitividad

La creciente ola de prosperidad y urbanización en Asia, África y América Latina fomenta el aumento en la demanda de productos lácteos. Una investigación realizada por Tetra PakDairyIndex en el 2011, proyecta un aumento de cerca de 25 por ciento en el consumo global de leche entre 2010 y 2020. América Latina reúne condiciones insuperables para aumentar sus producciones de leche y ser proveedor de la demanda del propio continente En Ecuador, se ha incrementado la producción de leche y productos lácteos, aunque sólo exporta el 1 por ciento de su producción, mientras que la población ecuatoriana todavía mantiene un bajo nivel de consumo de lácteos. Este hecho mantiene latentes las oportunidades para el desarrollo de la industria láctea y la ganadería nacional. El presente trabajo tiene por objetivo realizar un estudio del Sistema de Agronegocios lechero de la Región Sierra de Ecuador, el cuál permita conocer su desarrollo y limitaciones, y a partir de las mismas proponer alternativas de mejora competitiva. Se utiliza el método EPESA el cual establece los lineamientos para el estudio de sistemas de agronegocios desde una óptica sistémica y utilizando como marco teórico de la nueva economía institucional. Se realizó un análisis de fuentes de información secundaria así como también se realizaron entrevistas con informantes calificados dada la escasez de información a nivel nacional. El SAG lechero de la Región Sierra cuenta con dos subsistemas: el subsistema formal y el informal, surgen a partir del bajo enforcement institucional y una demanda local que prefiere lácteos no pasteurizados y "directo del campo". Es por ello que se observan mayores niveles de tecnificación, productividad, inocuidad, sanidad y calidad en el subsistema formal, lo que lleva a competencia desleal entre ambos subsistemas. Otro aspecto se refiere a las transacciones, las cuales en general todas las transacciones del sistema (y en ambos subsistemas)son de altos niveles de incertidumbre y costos de transacción, a pesar que en el subsistema formal se observan contratos. Del análisis competitivo se observa en comparación con el SAG lechero del Uruguay, el SAG lechero cuenta desventajas competitivas en factores tecnológicos avanzados (status sanitario, genética, disponibilidad y uso de maquinaria), también en la demanda (dado el bajo consumo per cápita y una demanda de baja exigencia en calidad, y bajas exportaciones), la baja presencia en el sistema de organismos de investigación y organizaciones gremiales, y la ausencia de cooperativas sumado a una alta atomización de los productores. Este estudio ha sido clave para proponer una alternativa de mejora competitiva del sistema, el cual se resume en la creación de un organismo público-privado (CONALECH)que coordine y dictamine las estrategias que el sistema debe seguir.

Análisis de la sensibilidad de distintos índices del ENSO para explicar los rendimientos de maíz en la región pampeana

p.53-60

Respuesta del cultivo de Moha al sistema de implantación

p.59-67

Comportamiento de cultivares de soja para consumo humano como grano verde

p.183-192