标本DNA研究进展

详细介绍了标本DNA的特性、提取方法、扩增、测序、甄别、时限及已经取得的一系列成果,并对其中存在的问题进行了分析和评述。

除虫菊和茼蒿核糖体DNA ITS区的序列

中国科学院基金;其它部委、高等院校基金

从线粒体DNA控制区核苷酸序列论达式鲟、亚洲和北美洲中吻鲟的分类地位

测定了线粒体DNA(mtDNA)控制区(D-loop)的核苷酸序列,并进行了分子系统学和遗传差异分析。研究结果表明:(1)UPGMA,NJ和MP分子系统学分析方法以及遗传差异分析都支持了亚洲远东地区中吻鲟和北美中吻鲟为一个有效种的观点;(2)同样研究方法并结合相关群体遗传资料表明,长江达式鲟与中华鲟关系最近,提出了达式鲟与中华鲟的一陆封类群的假说。

洱海四种鲤鱼线粒体DNA遗传相似性的初步研究

用6种限制性内切酶对洱海的四种鲤鱼--洱海鲤(C. barbatus)、春鲤(C. longipectoralis)、大眼鲤(C. megalophthalmus)和杞麓鲤(C. carpio chila),其中前三种为洱海特有,进行了线粒体DNA(mtDNA)的限制性片段长度多态性(RFLP)分析,构建了它们的mtDNA限制性内切酶图谱。结果表明,这四种鲤鱼在种内和种间均缺乏mtDNA RFLP。这种现象在鱼类种间的mtDNA的RFLP研究中是罕见的。分析这一现象的原因,可能在于这些物种是同域形成物种,并且其分化时间还相当短。

广西壮族人群线粒体DNA序列遗传多态性分析

测定了83例广西壮族人的线粒体DNA(mtDNA)第一高变区515bp的序列,并从这一母系遗传标记的角度对壮族人群的起源和群体的遗传结构进行了探讨。结合已相关报道的人群比较分析显示,壮族和我国北方民族群体亲缘关系较远,而与南方的少数民族及南方汉族亲缘关系较近。壮族人群中单倍型辐射群体分布频率、系统树中壮族人群与其他人群聚类先后次序都表明壮族是一个较为典型的南方群体。

贵州水族人群线粒体DNA序列多态分析

研究了我国贵州水族64个个体线粒体DNA控制区第一高变区序列的变异情况,在所测定的495bp序列中,共检测到73个位点存在变异,界定了48种不同的单倍型。单倍型的系统发育分析表明水族中存在一些古老的单倍型类型,并且其中的几个单倍型在欧亚人群中也存在分布,来自群体历史动态分析估算的水族群体扩张时间距今约6万年,这些结果提示水族是一个古老的民族群体。

鹿线粒体DNA的种属特异性片段研究

根据对不同产地梅花鹿、马鹿、水鹿、白唇鹿线粒体DNA进行PCR扩增和序列测定,并与亲缘关系较近的伪充药材来源动物线粒体DNA同位置序列比较,找到鹿的特征片段,经过实际检测,筛选出鹿的种属特异性片段。

云南保山猪线粒体DNA D loop区序列初步分析

为了解云南保山猪(Baoshan pig)的遗传多样性及其遗传背景，我们测定了19个个体线粒体DNA Dloop高变区1 1 5 363 - 1 5 801片段序列438帅。检测到1。种单倍型，包括8个多态位点，其中5次T/ C转换、1次G/ A转换、1次G/ C颠换和1次A/ T颠换，其A.T.GX碱基的平均含量分别为35.4%.26.9%.13.2%和24.5 %,A+ T含量(62 .3)明显高于G+ C含量(37 .7 %)。对于保山猪的保种及其持续利用有着重要的理论指导意义。

随机扩增多态DNA影响因素的研究

随机扩增多态 DNA(PAPD）分析受诸多因素的影响, 作者发现不同厂家制造的 PCR 扩增仪, 不同厂家出品的 TaqDNA 聚合酶和 PCR 缓冲液, PAPD 反应体系中的引物浓度, Mg~(2+)浓度, dNTP 浓度, BSA（牛血清白蛋白）和明胶, 以及模板 DNA的量等均可能对 PAPD 结果有不同程度的影响. 为了使 PAPD 结果在不同实验室间具有重复性和可比性, 提高 PAPD 数据的科学价值, 作者建议在 PAPD 分析过程和文章写作中应规范化. 方法部分, 除一般写明的引物浓度、TaqDNA 聚合酶单位数、dNTP 浓度、每一次 PCR 反应的循环条件和循环数等外, 还应注明 PCR 仪的制造厂家及型号、TaqDNA 聚合酶生产厂家 、PCR 缓冲液的成分、Mg~(2+)浓度, 模板 DNA 浓度等。

四川白鹅朗德鹅及杂交后代线粒体DNA多态研究

采用RFLP技术,对四川白鹅和朗德鹅及其杂交后代进行了线粒体DNA(mtDNA)多态分析。在所使用的19种限制性内切酶中,有4个酶(Eco RV、HaeII、HincII和KpnI)检测出多态,共获得两种mtDNA单倍型,四川白鹅和以四川白鹅为母本杂交后代的mtDNA为I型,朗德鹅的mtDNA为II型。以上结果为中国鹅和欧洲鹅存在两种不同起源学说提供了分子遗传学的证据。

云南4个马品种的随机扩增多态DNA(RAPD)分析

腾冲马和新丽江马品种内的遗传变异显著高于文山马和乌蒙马,遗传变异68.06%存在于群体内。系统聚类图中品种内大多数个体聚在一起,文山马和乌蒙马聚成一个大类,腾冲马和新丽江马又聚成一个大类,说明文山马和乌蒙马以及腾冲马和新丽江马有较近的亲缘关系。

云南地方猪种线粒体DNA多态性研究

用18种限制性内切酶分析云南猪种的mtDNA多态性。在全部18头个体中只检出一种限制性类型,结果表明,云南猪种的mtDNA变异度很低,遣传多样性贫乏。

鹿属动物线粒体DNA序列测定的研究

对9种鹿属动物的线粒体DNA进行引物扩增和序列测定,并与牛科、马科的DNA序列进行比较。找到了鹿属动物特异的DNA序列。利用该序列可对鹿类药材进行真伪区分。

东方蜜蜂DNA随机扩增多态及其遗传分化研究

该研究对云南及马来西亚的37个东方蜜蜂样本进行随机扩增多态DNA分析,从20个引物中筛选出11个引物,其中9个引物扩增出多态带。共检测到66条扩增片段,其中56条为多态带。用UPGMA聚类方法构建的分子系统树显示,云南的样本、马来西亚的样本各自分别聚在一起,说明两个样本间遗传差异较大,群体之间存在着遗传分化。但就云南的32个个体而言,虽然聚类图中大多数采自同一地区的样本聚在一起,但也存在一定交叉,提示云南地理群体间近期可能存在一定的基因流。